shRNA/crsipr screen后deep sequencing - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - shRNA/crsipr screen后deep sequencing

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f*****f 发帖数: 195	1 看哪些shRNA/guide RNA被富集，deep sequencing depth一般不需要RNA-seq那么高吧，一个样品一般价格多少？有公司测序链接么？
s******r 发帖数: 1245	2 不用很deep，miseq就行，不少实验室都有机器自己跑，要不问问学校facility呗【在 f*****f 的大作中提到】 : 看哪些shRNA/guide RNA被富集，deep sequencing depth一般不需要RNA-seq那么高吧 : ，一个样品一般价格多少？有公司测序链接么？
f*****f 发帖数: 195	3 谢谢【在 s******r 的大作中提到】 : 不用很deep，miseq就行，不少实验室都有机器自己跑，要不问问学校facility呗
d****u 发帖数: 1553	4 看你的library有多大，通常reads number保证你screen的representation就好。如果是genome wide screen的话miseq可能不够。

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