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Biology版 - 做RNAi 的时候,能不能把三个shRNA的lentivirus同时感染?
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o**4
发帖数: 35028
1
我也不确定那个比较有效果,所以我想同时加进去,会不会效果更好点?
同一个细胞会不会同时感染三个不同的lentivirus?
谢谢
r***e
发帖数: 2539
2
会。

【在 o**4 的大作中提到】
: 我也不确定那个比较有效果,所以我想同时加进去,会不会效果更好点?
: 同一个细胞会不会同时感染三个不同的lentivirus?
: 谢谢

o**4
发帖数: 35028
3
O(∩_∩)O谢谢,
也就是说会有叠加效应是吧?

【在 r***e 的大作中提到】
: 会。
n********k
发帖数: 2818
4
u would have to prove individually first before pool them...or you would
have to design ways to control for the off target effects...

【在 o**4 的大作中提到】
: 我也不确定那个比较有效果,所以我想同时加进去,会不会效果更好点?
: 同一个细胞会不会同时感染三个不同的lentivirus?
: 谢谢

v***a
发帖数: 1242
5
弱弱地问一下,一般大家都用什么方法来说明有没有off target effects?

【在 n********k 的大作中提到】
: u would have to prove individually first before pool them...or you would
: have to design ways to control for the off target effects...

r***e
发帖数: 2539
6
叠加效应不知道,但是能同时感染没问题。

【在 o**4 的大作中提到】
: O(∩_∩)O谢谢,
: 也就是说会有叠加效应是吧?

w***a
发帖数: 4361
7
换几种不同的siRNA against同一个target,
然后看phenotype是否一致?
其实任何siRNA或多或少都有off target effect,特别是siRNA浓度大的时候。

【在 v***a 的大作中提到】
: 弱弱地问一下,一般大家都用什么方法来说明有没有off target effects?
n********k
发帖数: 2818
8
Rescue experiment...

【在 w***a 的大作中提到】
: 换几种不同的siRNA against同一个target,
: 然后看phenotype是否一致?
: 其实任何siRNA或多或少都有off target effect,特别是siRNA浓度大的时候。

c******r
发帖数: 3778
9
不确定就分开三个试试好了,混一起有几个问题:
1. 增加了off target的机会。
2. 发paper的时候,如果是critical experiment还是需要证明单独的siRNA起效。
3. 混一起,如果virus的效率很高也就罢了。如果效率比较差,那么会有很多cell只感
染一个,两个的。你最后的phenotype就会比较moderate,以后的实验就比较麻烦。
这个跟pool的siRNA transfection一样。如果只是一个比如说pilot experiment,其实
倒是无所谓,混着就混着用好了。

【在 o**4 的大作中提到】
: 我也不确定那个比较有效果,所以我想同时加进去,会不会效果更好点?
: 同一个细胞会不会同时感染三个不同的lentivirus?
: 谢谢

o**4
发帖数: 35028
10
其实都是同一个基因的设计的3哥不同的lentivirus啊,
如果哪个基因有表型,我再分开分析就可以了吧?

【在 c******r 的大作中提到】
: 不确定就分开三个试试好了,混一起有几个问题:
: 1. 增加了off target的机会。
: 2. 发paper的时候,如果是critical experiment还是需要证明单独的siRNA起效。
: 3. 混一起,如果virus的效率很高也就罢了。如果效率比较差,那么会有很多cell只感
: 染一个,两个的。你最后的phenotype就会比较moderate,以后的实验就比较麻烦。
: 这个跟pool的siRNA transfection一样。如果只是一个比如说pilot experiment,其实
: 倒是无所谓,混着就混着用好了。

s**********r
发帖数: 1120
11
难道不是细胞被一个病毒感染后会“关闭”自己,其他病毒不容易再感染了吗?

【在 r***e 的大作中提到】
: 会。
r***e
发帖数: 2539
12
我以前也听说过这个,但是事实证明细胞能被反复感染的。

【在 s**********r 的大作中提到】
: 难道不是细胞被一个病毒感染后会“关闭”自己,其他病毒不容易再感染了吗?
v***a
发帖数: 1242
13
为啥混在一起会增加off target?我以前听说的是(我只做过siRNA)混在一起反而降
低了off target effect。

【在 c******r 的大作中提到】
: 不确定就分开三个试试好了,混一起有几个问题:
: 1. 增加了off target的机会。
: 2. 发paper的时候,如果是critical experiment还是需要证明单独的siRNA起效。
: 3. 混一起,如果virus的效率很高也就罢了。如果效率比较差,那么会有很多cell只感
: 染一个,两个的。你最后的phenotype就会比较moderate,以后的实验就比较麻烦。
: 这个跟pool的siRNA transfection一样。如果只是一个比如说pilot experiment,其实
: 倒是无所谓,混着就混着用好了。

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