由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 做RNA-seq有 3‘ bias怎么办
相关主题
包子请教怎么拿到Mus musculus一个基因的cDNA请教3‘ RACE, 做了N 久没有目的条带,崩溃了。。
Re: 请教real-time PCR问题
Can anyone make comments on RNA sequence?请问大家 RNA-Seq assembly 都用啥软件呢?
有关qRT-PCR一问,请大家帮忙To zhangben8888
问一个比较白痴的问题,关于stop codon的引入请教realtime的问题
请教有人做RACE吗?奇怪的RT-PCR问题,只能扩增出短片段
【求助】PCR为什么目的基因有,但S16基因就几乎看不到?自己动手做全长cDNA的问题
如何绝对定量mRNA拷贝数?有人尝试过SINGLE-CELL RT-PCR么?
相关话题的讨论汇总
话题: bias话题: rna话题: seq话题: 怎么办话题: analysis
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
z****q
发帖数: 18
1
做RNA-seq有3’bias,这种结果可以被接受吗
d********n
发帖数: 15
2
You probably used polydT to reverse transcrible them into cDNA, then
performed fragmentation. this gives huge bias on 3/utr. not reliable for
expression level, even worse for analysis of exon junctions.But, it'll be
very good for pcpa (premature cleavage and poly adenylation) analysis.
l********e
发帖数: 415
3
看有多严重
很多建library的方法都会有3'-bias. 轻微的bias是完全没关系的.

【在 z****q 的大作中提到】
: 做RNA-seq有3’bias,这种结果可以被接受吗
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
有人尝试过SINGLE-CELL RT-PCR么?问一个比较白痴的问题,关于stop codon的引入
菜鸟请教 RNA-seq请教有人做RACE吗?
what's the efficency of RTase?【求助】PCR为什么目的基因有,但S16基因就几乎看不到?
有没有做Northern blot 出现很多信号在18S 28S上的如何绝对定量mRNA拷贝数?
包子请教怎么拿到Mus musculus一个基因的cDNA请教3‘ RACE, 做了N 久没有目的条带,崩溃了。。
Re: 请教real-time PCR问题
Can anyone make comments on RNA sequence?请问大家 RNA-Seq assembly 都用啥软件呢?
有关qRT-PCR一问,请大家帮忙To zhangben8888
相关话题的讨论汇总
话题: bias话题: rna话题: seq话题: 怎么办话题: analysis