h******y
发帖数: 351 | 1 请问大家在设计shRNA的时候，target靶序列的antisense应该放在loop的哪边？前面？
后面？还是
无所谓？
对于shRNA转变成siRNA，请问下面所示的两种情况，哪种（loop在双链的左边或者在双
链的右边）形
式更容易与Dicer结合，从而被切割成siRNA？
/￣\
5'-sense-----strand－ | loop
3'-antisense-strand－\_/
/￣\
loop | -sense-----strand－3'
\_/-antisense-strand－5'
我看到很多人把antisense放在loop的后面，很多文献上也是这样示意的，但是
Genscript的人告诉
我放在哪边都无所谓。请问是这样吗？
多谢。 |
w******e
发帖数: 1187 | 2 bryan cullen has a paper on designing shRNA
【在 h******y 的大作中提到】
: 请问大家在设计shRNA的时候，target靶序列的antisense应该放在loop的哪边？前面？
: 后面？还是
: 无所谓？
: 对于shRNA转变成siRNA，请问下面所示的两种情况，哪种（loop在双链的左边或者在双
: 链的右边）形
: 式更容易与Dicer结合，从而被切割成siRNA？
: /￣\
: 5'-sense-----strand－ | loop
: 3'-antisense-strand－\_/
: /￣\
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h******y
发帖数: 351 | 3 Can you tell me which paper it is? Thank you very much.
【在 w******e 的大作中提到】
: bryan cullen has a paper on designing shRNA
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y****m
发帖数: 37 | 4 design your shRNA look like pre-miR-451,
I guarantee your knockdown effect unless your target is not accessible |
