B*****e
发帖数: 657 | 1 CRISPR专利是应该给Broad研究院还是给Berkeley大学？ |
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l*****7
发帖数: 8463 | 2 根据目前已知的,CRISPR和ngAGO的作用机制有相似之处。
它们的相似之处在于:
作用位点都是 DNA－RNA hybrid （双链）
这样的话，从理论上讲，无论用DNA 或RNA 做引物，应该都有作用。
用RNA做引物切DNA；用DNA做引物切RNA。
可能有遗漏和忽略之处，还请指正。 |
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v********e
发帖数: 1597 | 3 我们模拟一个场景来分析这场专利斗争。
UC家的Doudna大妈从野外捕获了两只鸡（一公一母），她向政府进行了申报，一般情况
这群鸡就是Doudna大妈所有，变成她家养的鸡。
邻居Broad家的小张也从野外捕获了一只母鸡，小张也向政府申报，小张申称他早于
Doudna大妈就发现了这只母鸡，这只母鸡可以下金蛋（张锋申称其先发明）。
Doudna大妈发现自己家的鸡落在邻居小张手里，所以向政府申诉，说小张偷了她的下金
蛋的母鸡。
政府派出三名法官审理这个申诉案子，法官发现，小张捕获这只母鸡的时候并不知道这
只鸡已经被Doudna大妈申报，因为申报都是延迟再公布的，所以法官裁决小张并没有偷
这只鸡。
因为Doudna大妈申诉的事由是小张偷鸡这件事，而法官依据科学证据和常识判断，小张
捕获这只母鸡并没有构成偷盗，法官的裁决也只是否定小张的偷盗行为，但是并没有说
小张捕获这只母鸡就一定合法，其所有权一定不会被剥夺。也就是说，小张在这场官司
中只能说没有失败，但说胜利有点牵强。
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这个比喻太业余了， 一点专利的常识都没有。张峰的专利申请会不会被专利局受理，
跟他知不知道UC... 阅读全帖 |
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v********e
发帖数: 1597 | 4 One of the inventors on that patent, molecular biologist Jennifer Doudna of
the University of California, Berkeley, likened the situation to licensing
permission to someone who wants to use green tennis balls. “They will have
a patent on the green tennis balls,” she said, referring to the Broad
patents. “We will have a patent on all tennis balls.”
http://www.nature.com/news/broad-institute-wins-bitter-battle-over-crispr-patents-1.21502 |
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发帖数: 1 | 5
In May 2012, the Doudna/Charpentier group filed a patent application
covering the use of CRISPR-Cas9 gene-editing technology in all cells,
你说这是不是事实？UC哪里贪心了？ |
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l*******1
发帖数: 16217 | 6 问题就出在这里了，不然大家都大嘴一张就claim专利，都得拿她们science 的第一篇
文章就是阐述了Crispr-Cas9在细菌中的作用原理，没有任何在其他细胞种类里的应用，
新专利法比较苛刻，你光是claim保护范围，却不能证明你申请的专利在其申请保护范 |
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c*******i
发帖数: 951 | 7 作为业内人士可以负责任的说，这篇文章狗屁不通，逻辑混乱。
CRISPR |
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s*******1
发帖数: 188 | 8 用RT-PCR来检测CRISPR KO是否可以？ |
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k*****q
发帖数: 4 | 9 请教大牛， 可以用CRISPR KO primary immune cells 吗？怎么做。 谢谢。 |
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发帖数: 1 | 10 try to use virus systems.
Method for Dual Viral Vector Mediated CRISPR-Cas9 Gene Disruption in Primary
Human Endothelial Cells
Haixia Gong, Menglin Liu, Jeff Klomp, Bradley J. Merrill, Jalees Rehman &
Asrar B. Malik
http://www.nature.com/articles/srep42127 |
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l*********1
发帖数: 351 | 11 请教各位，
现在发明了那么多种crispr activation技术，哪种技术的激活效果最好？
谢谢 |
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发帖数: 1 | 13 这篇文章说明以前很多发表的关于CRISPR的文章存在严重的数据偏好筛选的现象。很想
提议之前的实验室将所得到的edited的细胞系全部递交到ATCC，让权威机构对这些细胞
进行全部测序，包括那几个大牛实验室，现在的东西实在是吹嘘的太厉害而忘记了去正
视技术本身存在的缺陷。
我一直都认为这种结果的文章一定是真实的，只要有unwanted的突变，就表明了技术本
身就是有问题，除非他们的测序公司有技术上的失误。有人会跳出来说他用了质粒或者
只用了一个guideRNA，甚至会说他选的target特异不高，试图推翻这篇文章的结论，但
是你去看看之前的文章，有几篇不是用的质粒，有几篇不是用的一个guideRNA， 又有
几篇客观报道off-target。这篇文章估计是绕开了几个编辑大牛的review，这很好，
Nature Methods终于做了一次正确的事情。 |
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发帖数: 1 | 14 我倒不那么认为，我不觉得作者会那么low。问题是人家就那么随随便便一测就能发现
如此多的随机突变，这个从概率上来说，已经可以说明问题了。不要因为不喜欢别人的
结果而坚持要推翻别人的结论。
在supplementary的数据中写道：FVB/NJ mice, which are inbred and homozygous
for the retinal degeneration 1 (rd1) allele of Pde6b, were purchased from
The Jackson Laboratory, (Bar Harbor, ME). Co-housed FVB/NJ mice without
CRISPR-mediated correction were used as the functional-deficient control.
Briefly, an sgRNA- expressing plasmid had been coinjected, into FVB/NJ
zygotes, with the single-stranded oligodeoxynucle... 阅读全帖 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 15 没用CRISPR作过动物。记得是直接注射sgRNA/Cas9 mRNA到受精卵里面？测DNA序列就是
尾巴拿一节下来提genomic DNA？这个过程我有点担心的是，Cas9是在受精卵水平就发
生了，还是在后面一段时间里都可能发生。我个人在细胞水平作的时候，有这个考虑，
就是Plamisd（含guide/Cas9/HDR-template)transfect到细胞之后，等了五天，再
split，然后等单克隆。我担心的就是一个细胞接受了plasmid，但这个cas9/HDR过程不
是马上发生，不等几天（我个人经验是expression plasmid表达的基因至少有四天往上
的活性）split，很可能挑出来的克隆是不单一的。
我五天后split，挑的单克隆里，有一个克隆至少后面confirm了，是一个single-
replacement/double-replacement的mix。这个之所以发现了，是因为single-
replacement的细胞最后长得快，过了两个月发现表型有些不一样，再作genotyping，
才确定的。回头看了我两个月前的genotyping图片，确实有一条很... 阅读全帖 |
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m****a
发帖数: 270 | 16 Cas9 表达得越久越多，当然 产生的 off target 越多。
这篇文章最恶心的地方就是注射受精卵同时用了Cas9的质粒和Cas9 蛋白，明知故犯不
可思议。
但是一想也对，作者的动机不就是要 off target多好搞个大文章么？
应该去查查这几个人有没有在做空几个CRISPR相关股票。
看到过相关文献转染细胞24h的时候编辑大部分已经完成了，48h略有增加，48h到72h基
本没再增加。所以一般的protocol就推荐转染后两天split。
质粒的问题在于持续长时间的表达会增加off target 的概率。所以不如用蛋白，进入
细胞立即起作用，作用完以后就降解。 |
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m****a
发帖数: 270 | 17 药还有个剂量，吃适量的量能治病，吃多了会挂。
CRISPR off-target 不是什么新闻了，直接在体编辑风险比体外编辑好了再输回去风险
大。
对于快挂的人来说，只要风险可控，收益远大于风险就值得一试。
1000个突变也就是这篇文章的新发现，缺少合理的解释。
是否可信也得需要设计更多的实验来验证。 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 18 镰刀性贫血症，通过干细胞好像在作了？还有那个艾滋病，白人里有1%的人是天然带一
种突变，病毒不能感染，这个点突变应该可以通过干细胞改造来完成。
上面各位，CRISPR的off-target不是新鲜事，不然就不会有人作那个Cas9n了。这个是
切一条DNA链的，一个切点不会出现DBS,就没有indel了。只有设计的两个guide-seq比
较接近（200bp以内？）时，才有可能出现DBS,才有修补和突变的机会。这个应该大量
减少off-target的突变。 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 19 张峰应该找我，我昨天数了数，我有至少八个100￥sure不同的克隆，都是用了两个
Guide Sequences但不同的HDR template出来的，只要whole genome sequencing，大约
就知道答案了。：）。
我是用细胞作的CRISPR/HDR来create mutation,，和干细胞genetic校正后再放回病人
体内治病更相近一些。
:))). |
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发帖数: 1 | 20 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: CornucopiaX (小土豆), 信区: Military
标 题: Re: CRISPR的高超技巧
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 31 16:09:37 2017, 美东)
这个我要好好的研究一下，我已经转生物版了。。。
这个技术到底是解决什么问题啊。。
我要问一下我的徒子徒孙。。。。
我离开学术界整整8年了 。
这8年啊。。。。 |
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j******i
发帖数: 939 | 21 有个CRISPR screening课题 感染library后 细胞加药筛选 确实有1000个左右的细胞能
活下来 但是活下来的细胞也长不了了 这1000个细胞怎么做二代测序好呢 |
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z*******9
发帖数: 112 | 22 我想用CRISPR直接tag host蛋白。我的细胞是HEK293T。想问各位推荐一个直接高效的
protocol。
谢谢 |
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i***9
发帖数: 106 | 23 3月9日，美国沃伦·阿尔珀特奖授予五位科学家
上排：Rodolphe Barrangou（左）、Philippe Horvath（右）
下排：Jennifer Doudna（左）、Emmanuella Charpentier（中）、Virginijus
Siksnys（右）。图片来源：阿尔珀特基金会官网
编译 | 陈晓雪
● ● ●
美国麻省理工学院的张锋博士是当今最为关注的华人生物学家之一。这位年轻有为的科
学家最著名的工作是基因修饰技术CRISPR-Cas9的发展和应用。他为此率先获得了美国
专利，并被视为诺贝尔奖的热门人选之一。
然而，张锋却无缘新近颁发的、专门奖励这一革命性技术的科学大奖阿尔珀特奖（
Warren Alpert Prize），获奖的五位科学家中也没有另一位热门人选、哈佛医学院遗
传学家乔治·切奇（George Church）。
今年1月，国际基因测序先驱埃里克·兰德（Eric Lander）在国际学术期刊《细胞》（
Cell）发表综述文章，总结CRISPR技术的发展历程，并认为在张锋利用CRISPR在真核细
胞生物实现基因编辑之后，CRISPR技术带来了“暴风骤... 阅读全帖 |
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i***9
发帖数: 106 | 24 3月9日，美国沃伦·阿尔珀特奖授予五位科学家
上排：Rodolphe Barrangou（左）、Philippe Horvath（右）
下排：Jennifer Doudna（左）、Emmanuella Charpentier（中）、Virginijus
Siksnys（右）。图片来源：阿尔珀特基金会官网
编译 | 陈晓雪
● ● ●
美国麻省理工学院的张锋博士是当今最为关注的华人生物学家之一。这位年轻有为的科
学家最著名的工作是基因修饰技术CRISPR-Cas9的发展和应用。他为此率先获得了美国
专利，并被视为诺贝尔奖的热门人选之一。
然而，张锋却无缘新近颁发的、专门奖励这一革命性技术的科学大奖阿尔珀特奖（
Warren Alpert Prize），获奖的五位科学家中也没有另一位热门人选、哈佛医学院遗
传学家乔治·切奇（George Church）。
今年1月，国际基因测序先驱埃里克·兰德（Eric Lander）在国际学术期刊《细胞》（
Cell）发表综述文章，总结CRISPR技术的发展历程，并认为在张锋利用CRISPR在真核细
胞生物实现基因编辑之后，CRISPR技术带来了“暴风骤... 阅读全帖 |
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l*****7
发帖数: 8463 | 25 http://www.nature.com/news/the-unsung-heroes-of-crispr-1.20272?WT.mc_id=TWT_NatureNews
The unsung heroes of CRISPR
The soaring popularity of gene editing has made celebrities of the principal
investigators who pioneered the field — but their graduate students and
postdocs are often overlooked.
Heidi Ledford20 July 2016
When Blake Wiedenheft started studying microbes, his work was both remote
and obscure.
He spent his PhD sampling hot springs in Yellowstone National Park, then
created artificial ... 阅读全帖 |
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w********h
发帖数: 12367 | 26 80后的华人学霸: 明天他会得诺贝尔吗?
他在中国度过童年时光，高中时便荣获 Intel 大奖。刚过而立之年的他，以光遗传学
博士论文、TALEN技术编辑基因组博后研究，以及 独立后的CRISPR/Cas9 三项里程碑式
的工作载入史册。他是张锋、华人生物学界最耀眼的新星，风投竞相追逐的对象，诺贝
尔奖的大热门。明天凌晨，他会收到来自斯德哥尔摩的电话吗？
先看看他简单的履历吧：
1983年出生中国石家庄
2004年毕业于哈佛大学化学物理专业
2009年取得斯坦福大学化学与生物工程博士
2011年加入麻省理工学院
2013年发现CRISPR/Cas系统可用来编辑DNA，使基因疗法成为可能。获得美国瓦利基金
青年研究家奖（Vallee Foundation YoungInvestigator Award），奖金 25 万美元。
2014年被《Nature》杂志评为2013年年度十大科学人物之一；获得National Science
Foundation (NSF)最高荣誉Alan T. Waterman Award，Jacob Heskel Gabbay Award in
Biotechn... 阅读全帖 |
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a***s
发帖数: 12296 | 27 一封18个月前的邮件，搅动了一场涉及数亿美元的官司，给一场科学家之间的专利之争添加波澜。
打官司的两方是加州大学伯克利分校生物学家詹妮弗·杜德娜博士（Jennifer Doudna）和麻省理工学院博德研究所（Broad Institute）实验室主任张锋，他们争夺的对象是当前最为主流的基因编辑技术——被誉为“基因魔剪”的CRISPR-Cas9的专利。
基因编辑技术可以实现对DNA片段的敲除、加入等，在可预计的未来，将在治疗疑难杂症上大有市场。目前已有数个关于CRISPR的生物技术公司成立，涉及数亿元的风险投资。其中就包括张锋创立的、已经公开募股筹得9440万美元的公司Editas Medicine和杜德娜创立的、获得诺华两轮共计8500万美元投资的公司Intellia Therapeutics。
近日，一封来自张峰实验室前工作人员林帅亮倒戈的邮件被公开，让CRISPR的专利之争升级。这是一封带着求职意向的邮件，发送时间是2015年2月28日，收件人正是杜德娜。信中，林帅亮表示，仔细核对博德的专利申请文件后，他发现“张锋不仅对我不公平，对科学史也不公平”。林帅亮认为，张锋和丛乐（张锋当时... 阅读全帖 |
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M*******n
发帖数: 10087 | 28 一封18个月前的邮件，搅动了一场涉及数亿美元的官司，给一场科学家之间的专利之争
添加波澜。
打官司的两方是加州大学伯克利分校生物学家詹妮弗·杜德娜博士（Jennifer
Doudna）和麻省理工学院博德研究所（Broad Institute）实验室主任张锋，他们争夺
的对象是当前最为主流的基因编辑技术——被誉为“基因魔剪”的CRISPR-Cas9的专利。
基因编辑技术可以实现对DNA片段的敲除、加入等，在可预计的未来，将在治疗疑
难杂症上大有市场。目前已有数个关于CRISPR的生物技术公司成立，涉及数亿元的风险
投资。其中就包括张锋创立的、已经公开募股筹得9440万美元的公司Editas Medicine
和杜德娜创立的、获得诺华两轮共计8500万美元投资的公司Intellia Therapeutics。
近日，一封来自张峰实验室前工作人员林帅亮倒戈的邮件被公开，让CRISPR的专利
之争升级。这是一封带着求职意向的邮件，发送时间是2015年2月28日，收件人正是杜
德娜。信中，林帅亮表示，仔细核对博德的专利申请文件后，他发现“张锋不仅对我不
公平，对科学史也不公平”。林帅亮认为，张锋... 阅读全帖 |
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r*s
发帖数: 2555 | 29 参考消息网1月24日报道美媒称，从3月份开始，现年53岁的杭州肿瘤医院的院长兼肿瘤
医生吴式琇就一直在尝试用一种很有希望的新型基因编辑工具Crispr-Cas9来治疗癌症
患者。这种工具由美国科学家设计，从2012年媒体报道说可以用来编辑DNA之后就引发
了全球关注。
据美国《华尔街日报》网站1月23日报道，吴式琇所在医院的团队从食道癌患者身
上抽取血液，用高铁将血液送到一间实验室，该实验室使用Crispr-Cas9删除一段干扰
免疫系统抗癌能力的基因，从而改进抗病细胞，然后将这些细胞注回到患者体内，希望
重新编程的DNA能消灭癌症。相比之下，中国以外的首例Crispr人体试验还没开始。美
国宾夕法尼亚大学用了近两年时间来解决联邦机构等部门的要求，其中包括尽可能减小
患者风险的种种安全检查。
报道称，中国无疑是第一个将Crispr用于人体试验的国家，美国国家医学图书馆数
据库中记录了中国的九次试验。《华尔街日报》发现至少还有两次医院试验，至少有86
名中国患者接受了基因编辑，这些试验也符合中国的产业政策。中国正力争使国内一些
产业走上国际舞台，基因编辑更是被列入中国2016年制定的五年... 阅读全帖 |
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l*****7
发帖数: 8463 | 30 主导，控制和利益的对决:
韩春雨的阿狗,
不管结局如何，
都已牵涉到了各方,各路大小神仙们的利益,
决不是什么小事
References:
1
CRISPR/Cas9 - Academics fight over patent rights to an important technology
Stephanie Wroe
Two groups of academic researchers are battling in various jurisdictions
around the world to secure patent rights to a revolutionary gene-editing
technology. For the reasons discussed below, it is possible that there could
be a different winner in different jurisdictions. One group is lead by
Professor Doudna (University of California)... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 31 CRISPR babies: the Chinese government may have known more than it let on
When scientist He Jiankui announced he’d conducted an experiment that led
to the birth of twin girls with CRISPR-edited genomes in November, the
international scientific community swiftly condemned him. In the uproar that
followed, the Chinese government, He’s university, and the hospital where
the babies were born distanced themselves from the researcher, who claimed
he was the first scientist known to use CRISPR to edit h... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 32 中国学者发布靶向基因编辑里程碑成果 首对编辑猴在中国出生
字号:小中大2014-02-16 15:38:40
更多
71
关键字 >> 基因靶向基因编辑靶向基因编辑猴CrisperCrisper技术灵长类动物基因治疗
基因疾病中国基础研究
1月30日，《细胞》杂志网站报道，全球首对靶向基因编辑猴子已在中国出生，完成这
一工作的科学家来自南京医科大学、云南省灵长类生物医药研究重点实验室、南京大学
等机构。猴子属于灵长类动物，非常接近于人，猴基因编辑的成功将有助于建立猴疾病
模型，这更接近人类疾病的情况，可大大降低药物研究的风险；同时证明，未来有望定
向治疗人类基因疾病。科学家采用的是最新基因编辑技术Crispr，编辑成功的几率比其
他手段高得多，最有希望应用于临床。
在过去的一年里，Crispr/Cas9技术如暴风般横扫整个基因工程领域，研究人员已将这
一技术成功用于体外人类细胞，也成功对小鼠、大鼠和斑马鱼进行在体基因编辑。中国
科学家的实验证明这种技术在灵长类动物中也可以发挥作用。麻省理工学院合成生物学
家张峰（Feng Zhang）是Crispr技术领域的先锋人物，他表示：“这是重要... 阅读全帖 |
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d********f
发帖数: 43471 | 33 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: mahmet (里约大冒险), 信区: Biology
标 题: 知识分子独家专访：面对质疑的韩春雨
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Oct 17 21:05:25 2016, 美东)
独家专访：面对质疑的韩春雨
原创2016-10-18 陈晓雪、李晓明 知识分子
►韩春雨任教的河北科技大学门口。摄影：陈晓雪
内文提要：
独家专访：面对质疑的韩春雨
韩春雨NgAgo论文可重复性争议考验科学界
编者按：
5月初，《知识分子》以国际科学媒体的标准，第一时间报道依据国际科学同行
评议的学术刊物上发表的韩春雨论文以及当时多位科学家评论，并说明其是发展了荷兰
科学家的工作。此后，国内媒体和单位纷纷跟进，因为没有新的工作进展，《知识分子
》未继续报道。从网上开始有声音质疑韩春雨文章结果，《知识分子》一直保持追踪国
内外学术界最新的动态，但不依据私下匿名来源为主作报道，直到13位中国科学家公开
实名发言后，《知识分子》才有可以较为完整、公开的事实可以报道。
NgAgo实验的可重复性争议历经数月之... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 34 独家专访：面对质疑的韩春雨
原创2016-10-18 陈晓雪、李晓明 知识分子
►韩春雨任教的河北科技大学门口。摄影：陈晓雪
内文提要：
独家专访：面对质疑的韩春雨
韩春雨NgAgo论文可重复性争议考验科学界
编者按：
5月初，《知识分子》以国际科学媒体的标准，第一时间报道依据国际科学同行
评议的学术刊物上发表的韩春雨论文以及当时多位科学家评论，并说明其是发展了荷兰
科学家的工作。此后，国内媒体和单位纷纷跟进，因为没有新的工作进展，《知识分子
》未继续报道。从网上开始有声音质疑韩春雨文章结果，《知识分子》一直保持追踪国
内外学术界最新的动态，但不依据私下匿名来源为主作报道，直到13位中国科学家公开
实名发言后，《知识分子》才有可以较为完整、公开的事实可以报道。
NgAgo实验的可重复性争议历经数月之久，至今虽有多方表态，但仍然没有迹象显示很
快会得到解决。如何在学术规范下寻找解决之道，是摆在中国科学界面前的重要挑战。
10月10日晚，12位科学家实名呼吁调查（后增加一名科学家），《知识分子》
当晚连线韩春雨，并于第二日中午赶赴河北科... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 35 【记录历史】谁重复验证了NgAgo？
项目 结题
date： 2017年8月2日
updated: 2017年8月4日
Note2017080401: added a few notable reviews/summaries
---------------------------------------
- NBT retraction note：
http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n7/full/nbt.3547.html#correction2
原文引用
“Retracted online 02 August 2017
We are retracting our study because of the continued inability of the
research community to replicate the key results in Figure 4, using the
protocols provided in our paper. In this figure we report that the
Natro... 阅读全帖 |
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i***s
发帖数: 39120 | 36 韩春雨实验室所在的四层老楼新安装上智能门。
韩春雨论文中的关键实验环节。
韩春雨瘦了，一位接近他的人说，最近韩春雨经常做实验到凌晨两三点钟。
他的实验室在河北科技大学一座四层老楼里，红色的外墙伏满了爬墙虎，韩春雨在这一待就是10年。今年5月2日，一篇关于新基因编辑技术NgAgo的论文在国际顶级期刊《自然·生物技术》（Nature Biotechnology）在线发表（后在该刊第34册7月号纸质版发表），作者是河北科技大学副教授韩春雨领衔的课题组。发表后，不仅他个人，连他所在的实验室，都获得了前所未有的关注。为了安全，学校不得不给实验楼安装上刷卡入内的智能门，还布了摄像头。
韩春雨有两间研究室在三楼走廊的尽头。在接待过一波又一波记者，甚至有长江学者来访的房间里，一张白色纸片嵌在插座缝里，上面写着“Arrival of the Argonautes 1.0T and 2.0 Smart! （Ago1.0T和2.0Smart版本的到来！）”，后缀为两个笑脸。实验室在等NgAgo优化版2.0尽快问世。
但NgAgo1.0仍然摇摇欲坠。由于多个实验室无法重复实验，被认为可以超越时兴的CRISPR... 阅读全帖 |
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l******0
发帖数: 150 | 38 在微生物面前，人类还是一个自以为是的小孩子！
细菌在几十亿年之前就已经在地球上面生存，几十亿年的进化让细菌在地球上大获成功
，如今，细菌无处不在，空气、水、土壤、动植物身上都有细菌的身影！
细菌在地球上持续攻占了山川河流、植物、低等生物、甚至恐龙、哺乳动物，最后攻占
了人类的肚子！
是的，人类从出生那一刻开始就注定和细菌携手一辈子！（见本公众号原创文章Nature
！胎儿到底有没有细菌？）
别以为人类了不起，若是没有细菌在你肚子里面玩耍，你要想愉快地生活那是绝对不可
能的！如今的微生物研究可以揭示一定的道理：你需要伺候好你肚子里面的细菌，否则
它们要是闹腾起来，你的整个身体运转恐怕会出问题！
▲艺术家设计的一种模拟细菌培养皿中绘画艺术（图片来自网络）
看到这里，是不是以为颠覆了你的想象？这是一个细菌统治的世界！
▶噬菌体的进攻◀
然而，好就好在这个地球有一个所有的物种都逃不过的自然规律，那就是：相生相杀！
这正是我们中国的古话说的：一物降一物。
这正是生态平衡的概念！自然界的一切都是维持生态平衡，你细菌若是强大到无人能敌
，强大到肆掠地球，无法无天，那还得了？因... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 39 本来是不想说什么的，整个事件发展到今天这个地步，大部分真正做生物懂生物都已经
不再怎么关注NgAgo，而且结论已经非常清晰：那就是迄今为止没有一个实名实验室可
以重复出NgAgo的实验结果。没有多少人会愿意再在上面浪费时间。事先声明，实在看
不下去mitbbsrobot 和wang9这两个人（或者是同一个人）在这里搅浑水。此帖欢迎任
何人阅读和讨论，唯独不欢迎mitbbsrobot 和wang9这两个ID，所以请不要阅读或者留
言，我不愿意和你们浪费时间。
我是因为我的两个好朋友做不出来NgAgo才关注这个事情，当时韩老师刚发出NBT paper
时，我也跟着读了，也为韩老师的工作感到开心。大概在6月份，我在国内的一个朋友
告诉我重复不出来，我才在我的圈子和朋友们讨论这个事情，发现我的两个好朋友在试
图重复NgAgo（他们开始都是想发展这个technique，但是发现不work，才开始重复NBT
paper里的实验想去找原因），结果发现paper里报导的也重复不了，而且是重复了多次
。他们都是用CRISPR做对照，每次都是CRISPR works as expected， but no... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 40 http://chuansong.me/n/1765488551032
2017年4月13日Science期刊在线发表论文标题为“Nucleic acid detection with
CRISPR-Cas13a/C2c2”的文章，引发了全球公共卫生领域的广泛关注。来自美国哈佛大
学-麻省理工学院布罗德研究所（以下简称布罗德研究所）、麻省理工学院麦戈文脑研
究所、麻省理工学院医学工程与科学研究所、哈佛大学怀斯生物启发工程研究所（Wyss
Institute for Biologically Inspired Engineering）的研究人员，将一种靶向RNA
（而不是DNA）的CRISPR相关酶（即Cas13a）改造为一种快速的、廉价的和高度灵敏的
诊断工具，能够指示最少至一个靶RNA或DNA分子的存在。这种新的工具被称为“
SHERLOCK（Specific High-sensitivity Enzymatic Reporter unLOCKing）”。这种技
术可能有朝一日被用来应对病毒性和细菌性流行病爆发、监控抗生素耐药性和检测癌症。
CRISPR-Cas13a/C2c2系统由... 阅读全帖 |
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i***s
发帖数: 39120 | 41 韩春雨
一直默默无闻的河北科技大学副教授韩春雨，恐怕不会想到，自己成了2016年生物学界的焦点人物之一。
从被部分媒体捧为“中国下一个诺奖获得者”，到陷入国际性的学术造假争议，虽然韩春雨本人基本保持低调，但围绕他及其新基因编辑技术NgAgo的风暴却越演越烈。
较早将这一学术争议引入大众视线的方舟子，则在今天31日上午，直指韩春雨博士学位论文造假。
新一轮国际风暴
韩春雨的NgAgo基因编辑技术，被认为有潜力取代目前的CRISPR技术，在国际上引发了一定的反响，并被部分国内媒体称为“诺奖级”技术。
然而，数月以来，全球科学家几乎都没能重复他的实验结果，同行的质疑声越来越强烈。
直到7月29日，“友军”的倒戈引发了新一轮国际风暴。
澳大利亚国立大学的法国基因学家Gaetan Burgio，曾凭间接证据宣称重复韩春雨的结果，非常高效。这一度让韩春雨的支持者看到了希望，但Gaetan Burgio谨慎地表示要等待基因测序的直接结果。
29日，Gaetan Burgio发布长文最终否定了先前的结论，表示在多种细胞上反复尝试后，没有发现证据能够真正证明NgAgo发生基因编辑。
而且，他还质疑如果不... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 42 国际转基因技术协会原主席Montoliu博士建议不要再试图重复韩春雨实验结果
澳大利亚国立大学Gaetan Burgion今天撰写长文介绍他试图重复河北科大韩
春雨创立的NgAgo基因编辑技术的经过，得出结论：韩春雨的实验无法重复，而
且与韩在论文所说矛盾；《自然·生物技术》应要求韩公布原始数据；该技术显
然没有前途。
国际转基因技术协会创建者和原主席Lluis Montoliu博士根据这一结果以
及其本人实验室的实验结果，向国际转基因技术协会会员发出一封公开信，建议
停止继续试图验证韩春雨的实验，不要再浪费时间、金钱、人员和项目。
CRISPR谷歌群针对这项技术和韩春雨的文章的调查表明，140个调查回复中，
只有一个（中国神经所仇子龙？）回答该技术起作用，73个回答无效，63个回答
在验证。
From: [email protected]/* */ on behalf of Lluis
Montoliu To: ISTT List
Subject: [ISTT_list] Great disappointment with Ago: Long life to
CRISPR... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 43 一直默默无闻的河北科技大学副教授韩春雨，恐怕不会想到，自己成了2016年生物学界
的焦点人物之一。
从被部分媒体捧为“中国下一个诺奖获得者”，到陷入国际性的学术造假争议，虽然韩
春雨本人基本保持低调，但围绕他及其新基因编辑技术NgAgo的风暴却越演越烈。
较早将这一学术争议引入大众视线的方舟子，则在今天31日上午，直指韩春雨博士学位
论文造假。
韩春雨
新一轮国际风暴
韩春雨的NgAgo基因编辑技术，被认为有潜力取代目前的CRISPR技术，在国际上引发了
一定的反响，并被部分国内媒体称为“诺奖级”技术。
然而，数月以来，全球科学家几乎都没能重复他的实验结果，同行的质疑声越来越强烈。
直到7月29日，“友军”的倒戈引发了新一轮国际风暴。
澳大利亚国立大学的法国基因学家Gaetan Burgio，曾凭间接证据宣称重复韩春雨的结
果，非常高效。这一度让韩春雨的支持者看到了希望，但Gaetan Burgio谨慎地表示要
等待基因测序的直接结果。
29日，Gaetan Burgio发布长文最终否定了先前的结论，表示在多种细胞上反复尝试后
，没有发现证据能够真正证明NgAgo发生基因编辑。
而且，... 阅读全帖 |
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m****a
发帖数: 270 | 45 看来学术界已经逐渐达成了共识，如果连张锋和Doudna都重复不出来，还有
啥话好讲？
“在数百个基因中都重复失败，韩春雨的基因编辑技术恐遭弃用”
澎湃新闻见习记者 王盈颖
http://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_1538953
因为大面积无法重复实验，作者和所在单位又不出面应对质疑声，河北科技大学副教授
韩春雨领衔的NgAgo基因编辑技术的重复工作已经遇冷。
自2016年5月2日在《自然-生物技术》在线发表论文，NgAgo已经问世5个月，韩春雨在
论文中描述的NgAgo是一项和目前主流的“基因魔剪”CRISPR拥有同样效率的基因编辑
技术，能高效地实现对特定DNA片段的敲除、加入。
但在近日哥本哈根举办的“CRISPR Genome Editing（CRISPR基因编辑）”大会上，美
国、丹麦、德国在基因编辑领域顶尖的实验室参会，却无人提及NgAgo。
美国生物学家张锋、詹妮弗·杜德娜（Jennifer Doudna）、乔治·丘奇（George
Church）各自所在的实验室是基因编辑领域的权威。知情人士向澎湃新闻（www.
thepaper... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 46 中国科学家黄军就因在“基因剪刀”方面的研究入选《自然》年度十大人物。
“基因编辑”治好女婴白血病
依靠“基因编辑”疗法摆脱白血病病魔后，英国一岁女婴理查德兹（上图前左）一家拍摄的全家福。据英媒11月报道，理查德兹被诊断患上白血病后，治疗过程中传统疗法失效，在其生命进入倒数最后几个月时，医生尝试把基因编辑过的血液细胞注入她体内，成功消灭癌魔，开创全球首例。 据中国日报网
美国《科学》杂志17日公布了其评选的2015年十大科学突破，被业内誉为“基因剪刀”的CRISPR基因组编辑技术当选今年头号突破。
问世3年曾入选《科学》年度十大突破
《科学》杂志执行新闻编辑约翰·特拉维斯说，这是一个“前所未有的选择”，因为这项技术过去两次入选《科学》年度十大突破，今年“晋升”到头号突破。
CRISPR全名为“成簇的、规律间隔的短回文重复序列”，是细菌防御病毒入侵的一种机制，2012年才被科学家发现并加以利用。这项技术问世仅3年，就已被全世界生物医学实验室和制药企业广泛应用。
打造“基因驱动”系统 有助根除疟疾等疾病
今年，CRISPR技术在多个方向迈出意义重大的一步。首先，成功打造“基因驱动”系统。“基... 阅读全帖 |
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t**x
发帖数: 20965 | 47 Chet Seligman Point Reyes Station, Ca 1 hour ago
Why do so many Chinese study physics and math relative to Americans?
The answer may be similar to why Germans, Swiss and Danes studied physics
and math, relative to Americans, prior to WWII.
That being, a long history of intellectual cultures in those other countries
and the lack of one here.
It is hard to be a cowboy and a physicist simultaneously.
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John Mardinly Chandler, AZ 1 hour ago
Hi-tech companies like Intel could not f... 阅读全帖 |
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d****n
发帖数: 10034 | 48 今天很多人都被一则“一对名为露露和娜娜的基因编辑婴儿于11月在中国诞生”的消息
震撼了。旋即掀起了一阵舆论热潮。
事情大致是这样的，深圳一位科学家使用名为CRISPR-Cas9的基因编辑技术修改了一对
人体胚胎的基因，来达到预防HIV病毒的目的。
提到CRISPR-Cas9，正如它的主要发明者之一，加州大学伯克利分校的生物化学家詹妮
弗·杜德娜（Jennifer Doudna）所说的，这项技术的灵感来源于细菌。它可以驾驭细
菌的免疫系统、截断甚至破坏单个基因，然后在它们的相应位点上插入新的基因。它是
当前最强大的、实用化的基因修改工具。
这么说吧，科学家用它创造出不长角的牛已经根本不是难事。一切的限制，只在于伦理
道德和监管政策。
2017年，美国国家科学院就发布过一份题为《人类基因编辑：科学、伦理和治理》的研
究报告，是迄今该领域最全面的相关研究报告之一。非常非常令人意外，报告认为在条
件高度受限的情况下，应该允许科学家从事编辑人类活胚胎的研究。这一结论引起了巨
大的争议。
关于中国基因编辑婴儿这一事件，曾光临造就做过专题演讲的中科院生物化学与细胞生
物学研究所研究员、博士生导师吴立... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 49 转自Bloomberg：
https://www.bloomberg.com/amp/opinion/articles/2018-11-27/crispr-fears-
designer-baby-outrage-won-t-last-as-ethics-evolve
It’s too soon to know whether a Chinese researcher who claims to have
successfully edited the genomes of newly born twins is telling the truth.
But if he is, and if the girls turn out to be healthy and normal, it heralds
a significant change in the scientific and ethical status of human gene
editing. The outrage might not last long.
The consensus in the scientifi... 阅读全帖 |
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p******g
发帖数: 498 | 50 CRISPR系统的主要组件，包括Cas9，crRNA 和 TracrRNA等,被发现后，由于系统的简单
性，成为下一代genome-editing tool只是时间问题。正如DNA双螺旋模型提出前夜，时
机已经成熟，就看谁是那个幸运儿。
张锋就是这个CRISPR的幸运儿。
张锋在2011年初就开始着手尝试用CRISPR系统在人细胞中编辑基因。此时Charpentier
实验室刚刚将CRISPR系统的最后一个关键组件tracrRNA发表。2012年初（这个时间点不
太确定，可能更早）张锋实验室已经成功地在人细胞中编辑了基因。如果仔细读一下张
锋的第一篇CRISPR文章，可以发
现他们是完完全全模拟了细菌中的四个组件，连RNase都加了。然而，当时他并没有立
即发表文章，也没有申请专利。这也导致了以后他的尴尬。因为2012年五月
Charpentier and Doudna发表了在离体及细菌中的基因编辑工作。张锋同学居然还没有
着急，施施然比较了Charpentier Doudna用的两组件系统。这时全世界的同志们都扑上
来了。不过好在当时美国专利局还是采用的谁先发明，谁得专利。这个就给了... 阅读全帖 |
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