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全部话题 - 话题: crispr
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p******g
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1
来自主题: Biology版 - 我来为张锋说句公道话
CRISPR系统的主要组件,包括Cas9,crRNA 和 TracrRNA等,被发现后,由于系统的简单
性,成为下一代genome-editing tool只是时间问题。正如DNA双螺旋模型提出前夜,时
机已经成熟,就看谁是那个幸运儿。
张锋就是这个CRISPR的幸运儿。
张锋在2011年初就开始着手尝试用CRISPR系统在人细胞中编辑基因。此时Charpentier
实验室刚刚将CRISPR系统的最后一个关键组件tracrRNA发表。2012年初(这个时间点不
太确定,可能更早)张锋实验室已经成功地在人细胞中编辑了基因。如果仔细读一下张
锋的第一篇CRISPR文章,可以发
现他们是完完全全模拟了细菌中的四个组件,连RNase都加了。然而,当时他并没有立
即发表文章,也没有申请专利。这也导致了以后他的尴尬。因为2012年五月
Charpentier and Doudna发表了在离体及细菌中的基因编辑工作。张锋同学居然还没有
着急,施施然比较了Charpentier Doudna用的两组件系统。这时全世界的同志们都扑上
来了。不过好在当时美国专利局还是采用的谁先发明,谁得专利。这个就给了... 阅读全帖
c********n
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2
【周末随笔】方舟子●张锋●韩春雨●水军
_______________________________________________________________
引子:近年来生物界出现了两大革新,他们为天生好奇的人类开启了fast
forward path to discover life
- 稳、准、快的CRISPR/Cas9基因组编辑技术
- 高通量、高速度、精确的NGS基因组解读技术
有了这两把利器,生物研究人员们现在可以迅速的“修改”并“解读”生命的密
码,“所向披靡”了!
这,也引出了今天的话题。
(注:文章题目以文中“人物(现象)”出现的顺序排列)
_______________________________________________________________
科研是个非常烧钱的事情,风险也很大。科研烧的钱从哪里来呢?在学术界,大
多数来源于各个政府部门,纳税人们的钱,所以产生的结果和实验细节需要对大
众公开透明,必要时以Patent来保护;而且基础科研是无国界的,大部分结果需
要在国际认可的杂志上,通过peer review process... 阅读全帖
s********x
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3
这里先不谈人品,就先分析一下ZF和Lin到底谁可能在说谎?
1. 在专利之争中,Zhangfeng认为从Doutna的体外实验到in vivo应用是个需要天才
创意和智力投入的过程,而Doutna则认为这一步只不过是水到渠成的结果。这个就不在
这深入了,相信任何做过CRISPR的人都有自己的评论。
显然ZF觉得需要更强的evidence,这时Lin的工作就显得非常重要了,因为在Doutna发
出paper之前,只有Lin的实验数据作为证据(这个可见ZF在专利局公示的文件)。而ZF
一直在声明中说他早就认识到CRISPR的巨大应用潜力,长期以来对CRISPR的研究非常重
视,同时他在声明中又把Lin的实验技术和水平贬低得很厉害(具体可以看ZF在专利局
公示的文件),这就本身就很奇怪,如果你是PI,发现一个巨大的金矿,而又非常有信
心,你会只让一个exchange student自己在那里试验吗,而且是你不看好的学生?只要
有点儿野心的PI都会自己跳进去做试验吧。根据这些事实,恐怕ZF当时就把CRISPR当成
一个high risk的项目,自己并没有信心能够做成,所以才会让一个交换学... 阅读全帖
s*********y
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4
5月底,国际期刊《自然·方法学》刊登了CRISPR-Cas9技术会导致小鼠体内数百个非目
标突变的文章。在引起人们对有“基因魔剪”之称的基因编辑技术CRISPR脱靶性担忧的
同时,这一论文也遭到生物界广泛的批评,认为该发表论文存在实验设计不科学、数据
不充分等问题。
当地时间7月25日,《自然·方法学》就该篇论文发表编辑部关注,“以提醒读者关于
其数据解读的担忧”。
“由于对照组小鼠和接受CRISPR/Cas9编辑的小鼠的背景基因多样性差异不明确,出现
以上结果的另一种可能是正常的遗传多样性。”《自然·方法学》在“编辑部关注”中
引用了驳斥这一论文科学性的一方观点。
“我们在与提出质疑的团体和论文作者保持联系,进一步调查此事。调查一结束,我们
便会通知读者。所有作者均不赞同本期刊发表编辑部关注的决定。”《自然·方法学》
表示。
该论文的作者来自美国哥伦比亚大学医学中心等机构,论文题目为《体内CRISPR-Cas9
编辑引发的不可预测基因突变》。基因编辑指的是人为地对基因进行剔除、插入、修复
。论文称,两只接受CRISPR-Cas9编辑的小鼠的全基因组序列中出现的单核苷酸变化,
是CRI... 阅读全帖

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5
作者:汤波
来源:中国科学报
2017年8月2日,《自然-生物技术》发布声明称,撤回韩春雨团队于2016年5
月2日发表在该期刊的论文,该论文撤回是韩春雨团队主动申请的,这一轰动一
时,争议长久的事件终于可以平息了,但是科学家们探寻新的基因编辑技术的脚
步不会停息。
基因编辑技术不断创新
今天,基因编辑技术看起来“无所不能”,其实它也是一步步不断发展完善
起来的。
上世纪九十年代,一种名为锌指核酸酶(ZFN)技术诞生,锌指核酸酶包括
锌指蛋白和核酸内切酶两个组成部分,前者负责识别基因组DNA中特异序列,后
者则负责将DNA切断,利用细胞自身DNA损伤修复功能,实现对目的基因的修饰。
由于ZFN技术能像Word软件编辑文字一样对目的基因进行修改,较之前的同
源重组技术大幅提高了基因敲除的效率,从而被称为第一代基因编辑技术,其在
随后十多年里独领风骚。
不过ZFN技术并不能对基因组中任何位点进行修改,脱靶效应较高,也就是
存在较多的非特异编辑,而且构建成本高且费时费力,到2009年,科学家们又开
发出另一种与其类似的基因编辑技术体系,即类转录激活样效应因子核酸酶
(TALEN)技术,是第二... 阅读全帖
w*******e
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6
新闻来源: 光明网 于 2016-05-23
原标题:韩春雨:磨出基因编辑“新剪刀”
利用凝结在琥珀中的史前蚊子体内的恐龙血液,科学家提取出了恐龙的遗传基因。绝迹
6500万年的庞然大物开始复生,整个努布拉岛也由此成为恐龙的乐园……
当年坐在电影院里,韩春雨津津有味地看完了电影《侏罗纪公园》。这个年轻人怎么也
不会想到,有一天,自己会取得基因编辑技术的重大突破,成为一位“磨出基因编辑新
剪刀”的科学家。
土博士放的“核弹”
初夏,河北省药用分子化学重点实验室楼的外墙上,爬山虎又开始了一年的生长。这栋
位于河北科技大学老校区的四层小楼,再一次被绿色和生机所覆盖。
一楼门厅的成果展示栏里,还没来得及添上基因编辑技术的相关内容。但是,这座省部
共建国家重点实验室的“主人”——韩春雨,已带着他的科研成果一夜之间成为“名人
”。
5月2日,韩春雨研发出基因编辑新技术NgAgo-gDNA的成果发表在英国《自然·生物技
术》上。论文刊发几小时后,学术圈里的朋友开始打电话向他祝贺。没多久,千里之外
的麻省理工学院(MIT)的BBS上开始讨论这个话题了。而零星的报道也逐渐见诸“生物
通”等国内专业网站。... 阅读全帖
n********g
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7
基于人的多能干细胞而不是老鼠细胞研究。
典型的 CRISPR-Cas9 的工作原理涉及剪切双螺旋 DNA 链的两条链,这导致细胞内“急
救基因” p53 的活化:修复 DNA 断裂或者导致细胞“自杀”。然而,不论是哪种途径
,p53 活化的结果将使 CRISPR 技术无法发挥作用,因为剪切后的 DNA 链不是被重新
连接起来就是细胞死亡。诺华研究组还证明 p53 基因的活化使得 CRISPR 在多能干细
胞中的效率降低了十七分之一。这大概就解释了为何 CRISPR 技术效率极低,即使是在
病毒载体的帮助下,也只有极少数细胞的基因组被成功编辑。
换一个角度思考,细胞能被 CRISPR 技术成功编辑,是因为 p53 功能的失常导致细胞
失去修复 DNA 的能力和失去程序性死亡的能力。但问题是 p53 功能失常也意味着癌症
的发生,并且这不是一个偶然的现象:几乎一半的卵巢癌患者,43% 的结直肠癌患者,
38% 的肺癌患者,将近 1/3 的胰腺癌、胃癌和肝癌患者,以及 1/4 的乳腺癌患者都具
有 p53 突变。
结论:CRISPR-Cas9只对p53缺陷(癌/前)细胞有效。
d****n
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8
南方科技大学副教授贺建奎,在第二届人类基因组编辑峰会召开前一天(11月26日)宣
布:一对名为露露和娜娜的基因编辑婴儿于11月在中国健康诞生。
报道还表示,露露和娜娜在胚胎形成时经过基因剪刀CRISPR/Cas9对其生殖细胞核中一
个基因(CCR5)进行了编辑修改,这使得她们出生后即能天然抵抗艾滋病(世界首例)
,也意味着中国在基因编辑技术用于疾病预防领域实现历史性突破。
消息发出后,全网立马引发了“基因编辑婴儿”的热议。
基因编辑,究竟是怎样一门科学技术
基因编辑神器CRISPR
我们知道人类的遗传信息都是存储在DNA中,而DNA是由ATCG四种核苷酸来编码遗传信息
。人类的基因组里一共有30亿个碱基,30亿个核苷酸,可以编码两万五千个基因,而每
一个基因都编码一种蛋白质。
蛋白质是我们生命活动的执行者,它不仅组成了我们的身体,也决定了我们如何运动和
思考。因此,基因上的差别会造成我们每个人的差异。而一旦这些基因发生突变,就会
导致一些遗传疾病。
但如果我们能想办法将突变的那个碱基纠正的话,就意味着可以治疗这种疾病。所以,
科学家一直对基因编辑技术非常着迷,只是苦于长时间无法突破。
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c****r
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9
来自主题: Biology版 - 我来为张锋说句公道话
http://www.tang-prize.org/media_detail.php?cat=23&id=494
2016 Jun. 19
唐獎生技醫藥獎得主基因編輯技術 有望治療各種疾病
唐獎評選委員會總召集人、中研院院長李遠哲今公布唐獎生技醫藥獎得主,由法國的伊
曼紐.夏彭提耶(Emmanuelle Charpentier)、美國的珍妮佛.道納(Jennifer A.
Doudna)與華裔美籍的張鋒(Feng Zhang)三人共同獲得,表彰其在CRISPR/Cas9基因
編輯技術上的貢獻,將大幅改革生醫研究與疾病治療的策略,極具潛力治療人類各種疾
病。
李遠哲總召集人表示,這三位得獎人在基因編輯技術上的突破與影響深遠,除疾病治療
上,也將影響生醫、製藥及農業的發展,如玉米中有些人體無法消化的澱粉,在尊重自
然法則運作、不人為添加的前題下,透過這個編輯技術,即可把不能消化的基因去除掉
,因此,在未來農業的發展與影響會更快更直接。
擔任得獎者介紹人的中研院院士龔行健表示,基因體是人類生命的藍圖,結構上的缺失
或基因表現的異常,釀成許多人類疾病,長久以來,科學家夢想有朝一日可以精準有效
... 阅读全帖
s*********y
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10
来自主题: Biology版 - 热议韩春雨
海内外学者、读者热议“韩春雨”现象
原创 2016-05-10 知识分子 知识分子
韩春雨(右)及其合作者沈啸(左)、高峰(中)。供图:沈啸
编者按:
5月8日,《知识分子》发文(详见《韩春雨:“一鸣惊人”的中国科学家发明世界一流
新技术 | 特稿》)介绍了河北科技大学副教授韩春雨团队发表的NgAgo-gDNA基因编辑
技术的学术贡献和意义后,引发巨大反响。文章发表仅一天,通过《知识分子》在微信
、微博、今日头条、知乎上的传播渠道,就获得超过320万阅读量,近2600条评论。国
内外生命科学界学者纷纷就这项技术的突破性意义发表评论,各方读者也就韩春雨的“
另类出身”在网络上展开评论。《知识分子》搜集并摘编了部分精彩观点,与读者分享。
● ● ●
01
高屋建瓴派
饶毅:北京大学讲席教授
韩春雨的工作对基因编辑技术的推进作用是国际一流的。与现有CRISPR相比,可以看到
的优点是新技术使用DNA,因而更稳定,但还需要更多的研究才能真正比较二者优缺点
以及适用范围的异同。此外,韩春雨在条件有限的情况下做出这样的工作,让我们更加
关注中国广大科技工作者。
鲁白:清华大学医学院教授
在一所不太... 阅读全帖
t**m
发帖数: 158
11
13位科学家实名呼吁对韩春雨启动调查:为了中国学界的名声
澎湃新闻记者 王盈颖 康宁 王灿 虞涵棋
2016-10-10 23:17 来自 能见度
这是一场和时间的赛跑。这场赛跑赌上的,是中国学术界在国际上的名声。
一切源于2016年5月2日,河北科技大学副教授韩春雨课题组在国际顶级期刊《自然-生
物技术》上发表了NgAgo基因编辑技术的论文。刚发表时,NgAgo被认为是新一代基因编
辑工具,可媲美此前有“基因魔剪”美称的CRISPR技术,被国内部分媒体誉为“诺奖级
”学术成果。 然而,之后的故事急转直下,全球数百家实验室,历时5个月的时间,没
有一家宣布能重复成功。质疑声越来越大,韩春雨不作正面回应,却收获接连的荣誉:
河北科协副主席、美丽河北最美教师、100万元国家自然科学基金……受惠于NgAgo技术
,河北科大获得了河北发改委2.24亿元的财政拨款,用于建设河北科技大学基因编辑技
术研究中心。
“是时候了,”北京大学生命科学学院教授魏文胜对澎湃新闻(www.thepaper.com)、
中国青年报表示,科学家有必要站出来表达看法。“处理不好的话,会严重影响中国科
学家的声誉。”魏... 阅读全帖

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12
著名科学杂志《自然》的子刊《自然 方法》日前(2018年3月30日)撤销了一篇发表于
2017年5月30日的招致诸多批评的论文。该研究论文的题目为“
Unexpectedmutations after CRISPR–Cas9 editing in vivo” (用
CRISPR–Cas9 编辑小鼠基因
出现一些意外突变)。撤销的理由是,该研究设计的对照组不当,在试验组两只小鼠基
因组中观察到的一些变异,不能得出是由于CRISPR–Cas9 编辑而引起的结论。该
论文有6位作者,其中两位通讯作者分别是美国的斯坦福大学的副教授Vinit B Mahajan
博士 和 爱荷华大学的副教授Alexander G Bassuk 博士。
该论文发表后,引起同行们的强烈质疑和批评,纷纷发表文章指出该研究设计存在的问
题和得出错误结论的原因。论文的错误结论加剧了人们对基于CRISPR技术治疗人类遗传
疾病的潜在的不精准,高风险和不安全的疑虑,造成开发这项技术的公司们的股票下跌
。论文的结论与其他的研究者结论不一致。作者在改进了试验设计后,再次... 阅读全帖
i***s
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13
"诺奖级"学者韩春雨研究遭疑
论文中的图
截至2016年8月8日,三个多月过去了,全球仍没有一家实验室对外宣布,能够完全成功重复河北科技大学副教授韩春雨的实验。
5月2日,英国《自然》杂志子刊《自然·生物技术》杂志在线发表了韩春雨团队发明的一项新的基因编辑技术NgAgo-gDNA。根据论文,NgAgo-gDNA技术与现在主流的基因编辑技术CRISPR/Cas9相比,在一些方面具有优势。
基因编辑是当前的热门领域,分别在2012、2013和2015年三次入选美国《科学》杂志评选的“世界十大科学进展”,并被视为诺贝尔奖的有力竞争者。因而,韩春雨的论文一发表,便引起全球生物学界巨大关注,特别是在国内,韩春雨受到媒体的热捧,NgAgo甚至被誉为“诺奖级”成果。
然而,自6月以来,很多研究者都在抱怨,无法重复韩春雨论文中的实验。当一位科学家通过实验宣称在某领域获得一项重要发现时,判断这项发现是否可信的最好理由是他人能否重复其实验,并得到相同的结果。随着时间推移,韩春雨论文数据的真实性,也开始被质疑了。
而面对这些质疑,韩春雨接受媒体采访时表示,他自己对能重复实验结果充满信心,不回应就是最好的回应... 阅读全帖
t*****g
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14
中国女孩杨璐菡领衔清除猪器官人体移植障碍 被称“基因剪刀手”
美国哈佛大学和生物技术公司eGenesis研究人员最近利用一种新的基因编辑技术,敲除
了猪基因组中可能有害的病毒基因,从而扫清猪器官用于人体移植的重大难关,为全世
界亟需器官移植的上百万病人带来希望。今年29岁的杨璐菡是异种器官移植课题带头人
,她2008年本科毕业于北京大学,目前在哈佛大学攻读博士后。她曾因第一个利用
CRISPR-Cas9技术修改细胞基因组,并与导师、基因编辑大牛乔治·丘奇领导eGenesis
,在2014年被福布斯杂志评为30岁以下30个科学医疗领域领军人物之一。
川籍女孩杨璐菡再上《成都商报》头条
12年停滞
上世纪90年代,猪器官移植项目一度在全球受到追捧,但没想到后来发现猪的基因组里
面有内源性逆转录病毒存在,最终被明令在找到解决办法前,停止一切异种器官移植的
临床试验。
杨璐菡说:“由于无法预期什么时候,以及用什么方法来解决这些问题,异种器官移植
行业遭到了重创,经历了12年的停滞。”从2014年起,杨璐菡作为异种器官移植课题带
头人,带领10个人的科研团队利用新发明的“基因剪刀”技术,敲除猪基... 阅读全帖
D**s
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15
来源:科学网丁广进博客、BioArt微信公众号
引言:《韩非子·喻老》一文中曾有言曰:“楚庄王莅政三年,无令发,无政为也。右
司马御座而与王隐曰:“有鸟止南方之阜,三年不翅,不飞不鸣,嘿然无声,此为何名
?”王曰:“三年不翅,将以长羽翼;不飞不鸣,将以观民则。虽无飞,飞必冲天;虽
无鸣,鸣必惊人。”
5月2日,Nature系列顶级刊物Nature Biotechnology在线发表了来自河北科技大学生物
科学与工程学院青年教师韩春雨副教授题为“DNA-guided genome editing using the
Natronobacterium gregoryi Argonaute”的重大原创性成果。文章甫一发表,瞬间刷
爆微信朋友圈,这里面有两层原因,其一,该项新的基因编辑手段对目前热火朝天的
CAS9技术提出了挑战;其二,领导该项研究的青年老师所在的单位和个人基本上籍籍无
名(抱歉,请允许我用了这个词)。
“不鸣则已,一鸣惊人”韩春雨老师在Nature?Biotech上发表诺奖级原创成果
Nature Biotechnology文章截图
小编先引用河北科技大学生物科学与工程学院官... 阅读全帖
x****6
发帖数: 4339
16
错你个头,这里是朵得娜2012年以前发表的跟crispr相关的文章,最早的是2010,张就
是看到这里的某些工作开始动手做crispr的:
Wiedenheft B, Lander GC, Zhou K, Jore MM, Brouns SJ, van der Oost J,
Doudna JA, Nogales E. (2011) Structures of the RNA-guided surveillance
complex from a bacterial immune system. Nature. Sep 21; 477(7365): 486-9.
PMID: 21938068

Sashital, DG, Jinek M, Doudna JA. (2011) An RNA-induced conformational
change required for CRISPR RNA cleavage by the endoribonuclease Cse3. Nat.
Struct. Mol. Biol. Jun; 18(6):680-7. PMID: 2... 阅读全帖

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17
韩春雨开小号假装网友为自己站台 官位未受影响(组图)
新闻来源: 澎湃新闻 于 2017-12-22 8:49:31 大字阅读 敬请注意:新闻取自网络,观
点不代表本网立场!
“我赢了。”2016年11月的最后一天,身陷论文可重复性危机的韩春雨对河北科技
大学的同事说。
240多天后,让他一战成名、发表在国际期刊《自然-生物技术》的论文由韩春雨团
队主动申请撤回。那一天是2017年8月3日。在撤稿声明中,韩春雨团队写道:“我们会
继续调查该研究缺乏可重复性的原因,以提供一个优化的实验方案。”同日,韩春雨所
在的河北科技大学表示:“决定启动对韩春雨该项研究成果的学术评议及相关程序。”
撤稿,不是这一学术事件的句号。但自此之后,韩春雨与期刊之间、与国内外无一
例外无法重复他实验的科学家同行之间、与媒体之间,被他称为有输赢之分的较量,进
入停滞期。
河北科技大学副教授韩春雨
12月中旬,澎湃新闻记者再次来到河北科大时,发现河北科技大学承诺的针对韩春
雨论文的学术评议至今仍无结果。韩春雨个人凭此论文所获得的河北省科学技术协会副
主席头衔未受任何影响。
澎湃新闻记者多次申请就学术评议进展一事采... 阅读全帖
d****n
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18
人民网消息,11月26日,来自中国深圳的科学家贺建奎宣布,一对名为露露和娜娜的基
因编辑婴儿于11月在中国健康诞生。这对双胞胎的一个基因经过修改,使她们出生后即
能天然抵抗艾滋病。当天,贺建奎正在香港参加第二届国际人类基因组编辑峰会。
这是世界首例免疫艾滋病的基因编辑婴儿,也意味着中国在基因编辑技术用于疾病预防
领域实现历史性突破。
但是,这则科学成果的报道只带来了短暂兴奋,很快便引发了公众对人类基因编辑的伦
理、安全担忧。
基因编辑用于人类生殖细胞是科学界的禁区,就像克隆技术不能用于人身上一样,在各
国都有一条不可随意逾越的伦理红线。
“真的感觉这个太冒进了。”中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员朱桢告诉《财
经》记者,这次科研完全可以用其他灵长类动物,以其作为抗艾滋病动物模型。你能用
基因编辑人作艾滋病攻毒对象吗?!可以说从实验设计和科学目标上,追求的即是新闻
性,而不是实验总体的完整性;突破的不是科学前沿,而是伦理学的底线,造成人们对
生物技术的恐惧和抵制。
难避伦理追问
基因编辑婴儿诞生的消息传出,被科普作家、生物化学博士方舟子称为,“关键是一开
始就错了”,科学界最关心的莫... 阅读全帖

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19
Argonaute (Ago) proteins are complexed with small DNA or RNA guides and
cleave nucleic 24
acid targets whose sequences are complementary with the guides1. Agos in
eukaryotes bind 25
to small interfering RNAs (siRNAs) or microRNAs (miRNAs) to suppress gene
expression by 26
degrading mRNAs in a targeted manner, a regulatory process known as RNA
interference 27
(RNAi). Agos in eubacteria and archaea are complexed with DNA or RNA guides
and function 28
as defense systems against foreign mobile genet... 阅读全帖
c*********r
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20
来自主题: Biology版 - 转行 bioinformatics
你说的都很对。我表示赞同。我同样觉得实验验证是非常重要的,所以才想把生物中有
意思的问题和生物信息学中有用的工具真正的结合起来。而不是单纯的只做bench work
或者只从一堆atcg上研究生物。
编码基因目前都还没研究完没研究透彻呢。非编码区的研究,尤其是是实验研究,更慢
更难是肯定的。这是目前的问题所在。我的想法是,既然有这样的问题,有什么好的解
决方法去解决这些问题?如果没有现成的,需要开发哪些技术手段用来解决这些问题?
CRISPR肯定是个很好的工具。如果能结合上游的测序和生物信息学的分析、比较和预测
,下游通过CRISPR来manipulate这些非编码区,来看性状、表型什么的,我觉得可行。
瓶颈在于需要提高下游的效率、通量和缩短周期。上游可以做很快很多,但是下游做起
来就很费事。(当然上游也存在一些问题,比如Illumina测序有bias,生物信息学还没
有尽善尽美等等。我现在尤其觉得,如果只做transcriptome和只看SNPs,对于某些问
题还是太局限。)CRISPR才出现三四年吧,本身还在发展中,具体应用到我们这些冷门
的Evo-Devo领域还是需要点时间的。(... 阅读全帖
c*********r
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21
来自主题: Biology版 - 转行 bioinformatics
你说的都很对。我表示赞同。我同样觉得实验验证是非常重要的,所以才想把生物中有
意思的问题和生物信息学中有用的工具真正的结合起来。而不是单纯的只做bench work
或者只从一堆atcg上研究生物。
编码基因目前都还没研究完没研究透彻呢。非编码区的研究,尤其是是实验研究,更慢
更难是肯定的。这是目前的问题所在。我的想法是,既然有这样的问题,有什么好的解
决方法去解决这些问题?如果没有现成的,需要开发哪些技术手段用来解决这些问题?
CRISPR肯定是个很好的工具。如果能结合上游的测序和生物信息学的分析、比较和预测
,下游通过CRISPR来manipulate这些非编码区,来看性状、表型什么的,我觉得可行。
瓶颈在于需要提高下游的效率、通量和缩短周期。上游可以做很快很多,但是下游做起
来就很费事。(当然上游也存在一些问题,比如Illumina测序有bias,生物信息学还没
有尽善尽美等等。我现在尤其觉得,如果只做transcriptome和只看SNPs,对于某些问
题还是太局限。)CRISPR才出现三四年吧,本身还在发展中,具体应用到我们这些冷门
的Evo-Devo领域还是需要点时间的。(... 阅读全帖
c*********r
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22
来自主题: Biology版 - 我来为张锋说句公道话
这篇文章太好了,干货很多~
关于Francisco Mojica提出CRISPR是细菌对抗病毒的免疫系统的故事真值得写出来,摘
录一下Eric Lander的给大家看看:
“Recognizing the importance of the discovery, Mojica sent the paper to
Nature. In November 2003, the journal rejected the paper without seeking
external review; inexplicably, the editor claimed the key idea was already
known. In January 2004, the Proceedings of the National Academy of Sciences
decided that the paper lacked sufficient “novelty and importance” to
justify sending it out to review. Molecular Microb... 阅读全帖
c*********r
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23
来自主题: Biology版 - 我来为张锋说句公道话
这篇文章太好了,干货很多~
关于Francisco Mojica提出CRISPR是细菌对抗病毒的免疫系统的故事真值得写出来,摘
录一下Eric Lander的给大家看看:
“Recognizing the importance of the discovery, Mojica sent the paper to
Nature. In November 2003, the journal rejected the paper without seeking
external review; inexplicably, the editor claimed the key idea was already
known. In January 2004, the Proceedings of the National Academy of Sciences
decided that the paper lacked sufficient “novelty and importance” to
justify sending it out to review. Molecular Microb... 阅读全帖
i***9
发帖数: 106
24
Crispr: Scientist who awarded patents on gene-editing excluded from Warren
Alpert Foundation Prize
Move seen as a blow to the Broad Institute’s on-going claims of scientific
priority in a bitter patent dispute with other American universities over
the Crispr technique
The scientist who was awarded most of the patents on a revolutionary method
of gene editing called Crispr has been excluded from a list of five winners
of a distinguished science prize in the United States who were found to have
do... 阅读全帖
i***9
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25
Crispr: Scientist who awarded patents on gene-editing excluded from Warren
Alpert Foundation Prize
Move seen as a blow to the Broad Institute’s on-going claims of scientific
priority in a bitter patent dispute with other American universities over
the Crispr technique
The scientist who was awarded most of the patents on a revolutionary method
of gene editing called Crispr has been excluded from a list of five winners
of a distinguished science prize in the United States who were found to have
do... 阅读全帖
j******i
发帖数: 939
26
其实吧 韩老师是取了个巧 可以发个好文章 但实用性方面没法取代CRISPR/Cas9 虽然
可以在有些地方起补充作用 CRISPR/Cas9太方便太好用了 以至于大多数科学家潜意识
里都认为没有再找一个基因编辑系统的必要 这个也只有远在深山的韩老师才能跳出这
个主流意识束缚
这个工作当然是原创 而且是非常漂亮的原创 不能因为这个工作受到CRISPR和65度活性
的Ago启发就否定原创性 所有的工作都是based on something的嘛 国内宣传火 也是因
为国内原创的东西还是太少了
那么其他科学家在想什么呢 做基础研究的 忙着用CRISPR做ko细胞系动物模型 做
screening 做转化的在想 如何deliver 如何提高同源重组的效率-不能光切一下DNA就
了事了啊 基因编辑转化临床应用最大的两个困境也是一直以来的困境就是deliver和提
高同源重组的方法 NgAgo是CRISPR的很好补充 但是 它的出现改变了什么吗 基本没有
以前可以轻松做到的还是可以轻松做到 以前困难的现在还是一样困难 但是 可以发好
文章 因为这个概念新 虽然没有解决老问题

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27
很多人都说,你们为什么要质疑韩春雨,你们质疑他有重复过他的文章吗,等等等等,
都是用一种非正常的方式来讽刺挖苦提出疑问的人,甚至于别人花了大量的时间和金钱
却无法重复的情况下,这些人居然还说人家是故意重复不出来,或者说人家水平太low
重复不出来很正常。我无法理解这些人的心理。
质疑不需要理由,任何人都会对于未知的东西提出疑问,是正常合理的,你韩春雨偏偏
要来一个走自己的路让别人说去吧,你安的是什么心啊,是想让科研界还要花更多的冤
枉钱吗,这种变态的做法,实在匪夷所思。对于CRISPR,你有听到任何人质疑过吗?哪
怕是不从事CRISPR相关工作的人,都知道大伙很轻松就能重复出CRISPR,这是事实摆在
那里,想质疑也没有办法。
你一个NgAgo就想搞特殊,想用皇帝的新衣来糊弄大众,你以为现在还是20年前吗?你
不是也知道你自己的电脑都能接到MIT吗,那你认为大伙怎么可能会不通过各种渠道交
流对于你NgAgo的看法和结论吗?你可以去糊弄河北科技大学和河北省的管经费的,他
们愿意给你多少钱让你烧那是他们的事情,但是请不要来糊弄本领域的人。
不管最后有没有找到可以起作用的Ago蛋白,这篇Ng... 阅读全帖
c********n
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28
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
引子
我们生活在一个幸运的时代,我们生活在一个变化的时代。
历史就在我们每一天不经意的时候悄悄地留了下来。
世界各地的2016年都不同寻常,记录一下有些瞬间即逝的印记。
Ago 和CRISPR/Cas 是两个世代相传的家族,各自有各自的功能,各自在各自
的地盘上行使着自己的职责。
CRISPR/Cas率先冲出功能区禁锢,领跑出了基因组编辑的新天地。
Ago家族呢?有没有也隐藏着可以编辑基因组的黑马?
2014年2月,荷兰John van der Oost组在Nature杂志上发表了关于Ago家族
成员TtAgo的研究,为Ago功能区域拓展,照进了一线光亮。
2016年5月,中国的韩春雨组在Nature Biotechnology 杂志上,发表了关于
这个家族成员NgAgo的科研论文,用实验数据论证,NgAgo就是Ago家族基因组
编辑的一匹黑马,而且是一匹可以与CRISPR/Cas9 齐头并进的黑马。
俗话说,是骡子是马,拉出来溜溜才能分得清。
任何此类“发现”,特别是带有工具性质的技术,一旦以科研论文形式发表,
就会被世界各地的业界同仁们重复实验... 阅读全帖
c********n
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【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
引子
我们生活在一个幸运的时代,我们生活在一个变化的时代。
历史就在我们每一天不经意的时候悄悄地留了下来。
世界各地的2016年都不同寻常,记录一下有些瞬间即逝的印记。
Ago 和CRISPR/Cas 是两个世代相传的家族,各自有各自的功能,各自在各自
的地盘上行使着自己的职责。
CRISPR/Cas率先冲出功能区禁锢,领跑出了基因组编辑的新天地。
Ago家族呢?有没有也隐藏着可以编辑基因组的黑马?
2014年2月,荷兰John van der Oost组在Nature杂志上发表了关于Ago家族
成员TtAgo的研究,为Ago功能区域拓展,照进了一线光亮。
2016年5月,中国的韩春雨组在Nature Biotechnology 杂志上,发表了关于
这个家族成员NgAgo的科研论文,用实验数据论证,NgAgo就是Ago家族基因组
编辑的一匹黑马,而且是一匹可以与CRISPR/Cas9 齐头并进的黑马。
俗话说,是骡子是马,拉出来溜溜才能分得清。
任何此类“发现”,特别是带有工具性质的技术,一旦以科研论文形式发表,
就会被世界各地的业界同仁们重复实验... 阅读全帖
z*******o
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30
这事我还真愿意相信林说的是事实。他作为一个交换学生,张峰一开始显然不会把好的
马上出活的project给他做。张应该是看到D那边出来了后觉得这是个机会所以把全部身
家押上,张这边你不得不佩服他的眼光,但到了林这边显然是变成了抢课题。不过话说
回来,林这个邮件发得确实欠考虑,当然极品的是D,居然把这种邮件拿出来炒作造势
也是够狠。
elix (Tod) 的大作中提到:]
:这里先不谈人品,就先分析一下ZF和Lin到底谁可能在说谎?
:1. 在专利之争中,Zhangfeng认为从Doutna的体外实验到in vivo应用是个需要天
才创意和智力投入的过程,而Doutna则认为这一步只不过是水到渠成的结果。这个就不
在这深入了,相信任何做过CRISPR的人都有自己的评论。
:显然ZF觉得需要更强的evidence,这时Lin的工作就显得非常重要了,因为在Doutna发
:出paper之前,只有Lin的实验数据作为证据(这个可见ZF在专利局公示的文件)。而
ZF一直在声明中说他早就认识到CRISPR的巨大应用潜力,长期以来对CRISPR的研究非常
重视,同时他在声明中又把Lin的实验技术... 阅读全帖
w****e
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31
能不能把Doudna拼对?强迫症看着难受死了

:这里先不谈人品,就先分析一下ZF和Lin到底谁可能在说谎?
:1. 在专利之争中,Zhangfeng认为从Doutna的体外实验到in vivo应用是个需要天
才创意和智力投入的过程,而Doutna则认为这一步只不过是水到渠成的结果。这个就不
在这深入了,相信任何做过CRISPR的人都有自己的评论。
:显然ZF觉得需要更强的evidence,这时Lin的工作就显得非常重要了,因为在Doutna发
:出paper之前,只有Lin的实验数据作为证据(这个可见ZF在专利局公示的文件)。而
ZF一直在声明中说他早就认识到CRISPR的巨大应用潜力,长期以来对CRISPR的研究非常
重视,同时他在声明中又把Lin的实验技术和水平贬低得很厉害(具体可以看ZF在专利局
:公示的文件),这就本身就很奇怪,如果你是PI,发现一个巨大的金矿,而又非常有
信心,你会只让一个exchange student自己在那里试验吗,而且是你不看好的学生?只
要有点儿野心的PI都会自己跳进去做试验吧。根据这些事实,恐怕ZF当时就把CRISPR当
成一个high r... 阅读全帖

发帖数: 1
32
韩春雨再调查|河北科大避谈学术评议,被曝曾组织论文买卖
澎湃新闻记者 王盈颖 韩声江
2017-12-20 21:08 来源:澎湃新闻
字号
“我赢了。”2016年11月的最后一天,身陷论文可重复性危机的韩春雨对河北科技大学
的同事说。
240多天后,让他一战成名、发表在国际期刊《自然-生物技术》的论文由韩春雨团队主
动申请撤回。那一天是2017年8月3日。在撤稿声明中,韩春雨团队写道:“我们会继续
调查该研究缺乏可重复性的原因,以提供一个优化的实验方案。”同日,韩春雨所在的
河北科技大学表示:“决定启动对韩春雨该项研究成果的学术评议及相关程序。”
撤稿,不是这一学术事件的句号。但自此之后,韩春雨与期刊之间、与国内外无一例外
无法重复他实验的科学家同行之间、与媒体之间,被他称为有输赢之分的较量,进入停
滞期。
河北科技大学副教授韩春雨
12月中旬,澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者再次来到河北科大时,发现河北科技大
学承诺的针对韩春雨论文的学术评议至今仍无结果。韩春雨个人凭此论文所获得的河北
省科学技术协会副主席头衔未受任何影响。
澎湃新闻记者多次申请就学术评议进展一事采访... 阅读全帖

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来自主题: Biology版 - 黑韩春雨的长文 (转载)
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: microfish (<。)#)))≦), 信区: Military
标 题: 黑韩春雨的长文
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 22 15:08:01 2017, 美东)
韩春雨开小号假装网友为自己站台 官位未受影响(组图)
新闻来源: 澎湃新闻 于 2017-12-22 8:49:31 大字阅读 敬请注意:新闻取自网络,观
点不代表本网立场!
“我赢了。”2016年11月的最后一天,身陷论文可重复性危机的韩春雨对河北科技
大学的同事说。
240多天后,让他一战成名、发表在国际期刊《自然-生物技术》的论文由韩春雨团
队主动申请撤回。那一天是2017年8月3日。在撤稿声明中,韩春雨团队写道:“我们会
继续调查该研究缺乏可重复性的原因,以提供一个优化的实验方案。”同日,韩春雨所
在的河北科技大学表示:“决定启动对韩春雨该项研究成果的学术评议及相关程序。”
撤稿,不是这一学术事件的句号。但自此之后,韩春雨与期刊之间、与国内外无一
例外无法重复他实验的科学家同行之间、与媒体之间,被他称为有输赢之分的较量,进
入停滞... 阅读全帖

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记者:王盈颖 韩声江
来源:澎湃新闻
“我赢了。”2016年11月的最后一天,身陷论文可重复性危机的韩春雨对河
北科技大学的同事说。
240多天后,让他一战成名、发表在国际期刊《自然-生物技术》的论文由韩
春雨团队主动申请撤回。那一天是2017年8月3日。在撤稿声明中,韩春雨团队写
道:“我们会继续调查该研究缺乏可重复性的原因,以提供一个优化的实验方
案。”同日,韩春雨所在的河北科技大学表示:“决定启动对韩春雨该项研究成
果的学术评议及相关程序。”
撤稿,不是这一学术事件的句号。但自此之后,韩春雨与期刊之间、与国内
外无一例外无法重复他实验的科学家同行之间、与媒体之间,被他称为有输赢之
分的较量,进入停滞期。
河北科技大学副教授韩春雨
12月中旬,澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者再次来到河北科大时,发现
河北科技大学承诺的针对韩春雨论文的学术评议至今仍无结果。韩春雨个人凭此
论文所获得的河北省科学技术协会副主席头衔未受任何影响。
澎湃新闻记者多次申请就学术评议进展一事采访韩春雨,均被实验室内人员
拒之门外。“韩老师不在”、“我们不会开门的”,实验室楼道中模糊的人影这
样回... 阅读全帖
l*****n
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35
为什么有那么多专业人士在质疑甚至反对这一项目?整理了一些基础的背景知识。
【1】人的一个基因可能同时影响多个性状,编辑一个基因,可能带来好处,也可能带
来已知或未知的风险。
比如人体内某个能抵抗疟疾的基因,却同时会增加镰形细胞贫血症的患病风险;某个能
保护人体免受伤寒的突变基因,却同时又会增加遗传病囊肿性纤维化的发病概率。也就
是说,对人体内的某一个基因进行编辑,的确可能得到某种好处,但也有可能搞出新的
已知的或未知的问题。已经有研究者提出,此次编辑的CCR5基因,虽然能加强人体对艾
滋病毒的抗性,但由于该基因也与人体的免疫细胞功能相关,所以进行编辑可能会加重
人体在遭受感染后的炎症症状。当然,还可能会出现更多无法预料的情况。由于目前人
类对基因的了解还不够充分,出于谨慎考虑,展开人体基因编辑实验务必要十分小心。
【2】目前最有效的基因编辑手段是CRISPR,你可以简单地把CRISPR理解为“基因剪刀
”,人类可以利用这把剪刀来对基因进行编辑。
但问题是,CRISPR这把剪刀虽然高效,但还不够精准。原新闻中提到了一个词,叫“脱
靶”,意思就是说,CRISPR编辑了错误的地方。对于人体来... 阅读全帖

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36
China a leading player
China spent a record 1.76 trillion yuan ($254 billion) on
research and development, and the country is catching up with the US's
investment in the same area, spurring a genetic arms race that has been
labeled "Sputnik 2.0" by Dr. Carl June, an immunotherapy specialist at the
University of Pennsylvania.
China has invested heavily in gene-editing technology, bankrolling research
into a number of world "firsts," including the first use of the gene-editing
tool CRISPR-Cas9 in ... 阅读全帖
Z**********g
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37
【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: xiaxianyue (下弦月), 信区: Joke
标 题: 本钱老来点评基因编辑人类实验
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 30 14:48:36 2018, 美东)
刚花了半小时码了个长文,丢了,生无可恋……先占个坑。
你们,包括什么杀生丸都没说到重点。
先说一下贺的逻辑吧。多方证据显示携带CCR5delta32突变的人具有抗艾滋能力。而最
近大热的CRISPR/Cas9 genome editing技术使科学家现在有了“相对”定向修改DNA序
列的能力。所以利用CRISPR制造含有CCR5突变的人,会使该人获得抗hiv的能力。
这个逻辑门外汉看着会觉得相当很合理。很多在生物学界分一杯羹的物理/工程学家也
确实是按这个逻辑搞钱搞文章。可惜,贺还有贺的老板都缺乏真正的生物学背景。他们
和生物学家合作的时候没问题,但当他们自己开始搞生物,就会搞出大篓子。如果他们
在小鼠或者猴子里做这个实验,也就发一个二三流paper。但是他们野心太大,居然先
斩后奏做了人体实验。
接下来分几个点讲这个实验为什么破绽百出狗屁不通。
首... 阅读全帖

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38
前段时间的基因编辑婴儿事件还没落下帷幕,近期又有媒体曝出:哈佛大学干细胞研究
所将用CRISPR基因编辑工具,对精子细胞内的ApoE基因进行编辑,以培养出不易患上阿
尔茨海默病的试管婴儿,降低阿尔茨海默病风险。
同样的CRISPR基因编辑工具,同样的人类生殖细胞编辑,同样的可遗传性,唯一不同的
是,此次试验不涉及胚胎,不会试图培养出一个真正的婴儿——因为时机还不成熟。我
们无法设想,当时机成熟之后,基因编辑技术会获得怎样的应用?人类又会被改造成什
么样子?从眼睛颜色到智商的“商业定制”是否会成为现实?当人成为“人造人”时,
又会衍生出怎样的社会问题?
如果说CRISPR基因编辑工具的开发打通了技术通道,那么“基因编辑婴儿”则开启了道
德之门,以“改善疾病预防为目标的人类生殖干预”一旦开启,必然会涌现出更多的胚
胎基因相关研究。此次精子基因编辑就是一个实例。
CRISPR基因编辑工具自2012年被开发以来,就引发了包括著名人类学家胡家奇在内的科
学家们的忧心,担心这项技术会被滥用与改变一切,甚至使用于基因强化下一代。终于
在2018年,一语成谶。
虽然这两次事件的出发点都是为了对抗疾病,... 阅读全帖

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39
一项突破性的研究首次证明艾滋病是一种有可能被治愈的疾病。
美国一个跨多学科的科学家团队,将抑制艾滋病毒的药物和 CRISPR-Cas9 基因编辑技
术结合,在 9 只小鼠的基因组中完全消除了艾滋病毒。
研究成果 7 月 2 日发表在了《自然・通讯》杂志上,这标志着人类对抗艾滋病
的路上又迈出了关键一步。
人们一直在研究一种能够完全清除体内艾滋病毒的办法。
在这期间,跨学科研究团队里来自内布拉斯加大学的研究人员 Howard Gendelman 开发
出来一种被称为 LASER ART 的新方法,能够将药物分子通过纳米颗粒缓慢在 HIV 感染
的细胞内释放,做到更长时间地抑制住病毒复制。
而团队里来自坦普尔大学的研究人员 Kamel Khalili 曾用基因编辑技术 CRISPR-Cas9
来对抗病毒性疾病长达 5 年,已经可以通过基因编辑来添加、去除和改变某些遗传物
质。
因此这个团队想到了一种新的解决方案:结合 CRISPR 基因编辑技术和 ART 治疗方法
对抗艾滋病毒。
所以他们对经过工程改造的 23 只小鼠开展了实验。先使用 LASER ART 抑制病毒在小
鼠身... 阅读全帖
B******e
发帖数: 16928
40
来自主题: Military版 - WSJ雄文:生物的世纪
A Spur to the Biotech Century Ahead
The effort to defeat the coronavirus will focus the attention of a new
generation of scientific pioneers
The coronavirus plague will hasten our transition to the third great
innovation revolution of modern times. These revolutions arose from the
discovery, beginning just over a century ago, of the three fundamental
kernels of our existence: the atom, the bit and the gene.
The first half of the 20th century, beginning with Albert Einstein’s 1905
papers on relat... 阅读全帖
s*******o
发帖数: 951
41
赞分析。CRISPR确实是生物科技里的革新性标杆,可能会掀起下一步浪潮。但股票可能
是另一回事。这个技术门槛低,也许CRISPR出药的时候EDIT已经死翘翘了。


: 这只股起飞只是个时间问题,CRISPR这个技术是实打实的好用,而且不是好用一
点点。

: 当然,NTLA还有CRSP这俩也是竞争对手,但这个市场一旦发车饼是完全够分的。
这是为

: 数不多的需要long很久的医药股。

: 随便举个例子吧,CART现在这么火,识别位点用的还是zinc finger,等换了
CRISPR以

: 后效果只可能更好。


发帖数: 1
42
来自主题: Stock版 - EDIT是不是又套住了一批人?
我不是大牛:)
生物从本质上就是在试错,CRISPR优势在于价廉易操效率极高,但意外总是不可避免的
,由于太多技术细节就不展开说了。所以我说失败的可能性虽然很小,但是不能排除,
需要很谨慎,这也是为什么EDIT推迟了临床实验。但即使失败,事后原因也会很容易分
析,因为归根结底这个技术的系统一点儿都不复杂。所以说长远来看风险极小。
从历史上来看,生物科研界从某种程度上来说,和商界也差不多,市场可以在很大程度
上作为试金石。以前每隔一段时间就会有个所谓的“爆炸性新发现”,但很快就销声匿
迹。可你回头去查查自从CRISPR-Cas9被发现以后,整个学界瞬间多了多少相关的研究
,而且越来越火?道理很简单,之前大部分的所谓“新技术”,刚出来以后大家也都会
去跟风尝试,但大家往往最后会发现,这些东西很多都是包装的比较好,实际效果并没
有claim的那么好。CRISPR呢?大家试完以后,基本都是一个反应:惊奇地发现效果非
凡,感叹这么多年了终于搞生物的有个不忽悠人的东西了。于是一传十十传百,大家都
开始用都开始跟进,造成现在的大火大热。所以结论就是,从技术上来说,这个投资几
乎没有风险。
但是,你说... 阅读全帖
L*1
发帖数: 11537
43
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: loadingdye (Enter), 信区: Biology
标 题: 8万5的博后位置,背景合适的可以考虑。
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 23 20:13:54 2014, 美东)
Sandia National Laboratories has an immediate and exciting opportunity for a
Post- Doctoral Appointee in Livermore, CA.
Candidates may contact Cathy Scott anytime for further information: cascot@
sandia.gov
___________________________________________________________________________
_______________________________________________________

Job Posting for Sandia Na... 阅读全帖
l********e
发帖数: 415
44
Sandia National Laboratories has an immediate and exciting opportunity for a
Post- Doctoral Appointee in Livermore, CA.
Candidates may contact Cathy Scott anytime for further information: cascot@
sandia.gov
___________________________________________________________________________
_______________________________________________________

Job Posting for Sandia National Laboratories in Livermore, CA. We are
seeking a Post doc in Virology, Immunology, Microbiology, Bioengineering or
relevant Ph... 阅读全帖
S***J
发帖数: 1210
45
来自主题: Biology版 - 我来为张锋说句公道话
同意,学术界和专利不同。如果lz说的信息最后被采纳,这场专利官司zhang赢定了。
发奖则很难预测,我之前讨论过有两种发的方式:
1、genome editing大领域发奖,zinc/tallent/crispr各一人。那么crispr里面的这个
人最有可能的是charpentier,因为她是既有基础生物学贡献,又有genome editing贡
献。zhang得奖可能性很低。doudna一点可能性也没有(只要有charpentier,doudna就
不可能得奖)。
2、crispr单独得奖。crispr早期基础生物学研究至少有一人,剩下的charpentier必然
还是会得奖,理由同上。最后一个人zhang的希望巨大,因为zhang对这项技术的推动是
无人能比的(还鉴定了其他一些更有效的工具),也就是说应用方面发奖的代表就是
zhang。这种发奖方式,doudna还是无任何希望,很遗憾还是因为有charpentier。
其实doudna的最大竞争对手根本不是zhang,而是charpentier,她自己却寄希望于靠着
charpentier分一杯羹,呵呵。当然也不是没可能,diudn... 阅读全帖
S***J
发帖数: 1210
46
来自主题: Biology版 - 我来为张锋说句公道话
同意,学术界和专利不同。如果lz说的信息最后被采纳,这场专利官司zhang赢定了。
发奖则很难预测,我之前讨论过有两种发的方式:
1、genome editing大领域发奖,zinc/tallent/crispr各一人。那么crispr里面的这个
人最有可能的是charpentier,因为她是既有基础生物学贡献,又有genome editing贡
献。zhang得奖可能性很低。doudna一点可能性也没有(只要有charpentier,doudna就
不可能得奖)。
2、crispr单独得奖。crispr早期基础生物学研究至少有一人,剩下的charpentier必然
还是会得奖,理由同上。最后一个人zhang的希望巨大,因为zhang对这项技术的推动是
无人能比的(还鉴定了其他一些更有效的工具),也就是说应用方面发奖的代表就是
zhang。这种发奖方式,doudna还是无任何希望,很遗憾还是因为有charpentier。
其实doudna的最大竞争对手根本不是zhang,而是charpentier,她自己却寄希望于靠着
charpentier分一杯羹,呵呵。当然也不是没可能,diudn... 阅读全帖
H**T
发帖数: 3007
47
来自主题: Biology版 - 艾滋病可以治愈了
不收是因为之前已经有人做过类似的工作啦:
此前京都大学在Nature杂志上发表的一篇文章:Harnessing the CRISPR/Cas9 system
to disrupt latent HIV-1 provirus,Yoshio Koyanagi和他的同事也是利用CRISPR/
Cas9 方法来干扰艾滋病毒。
PNAS艾滋病研究突破:CRISPR技术根除病毒 2014年7月,发表在《美国国家科学院院刊
》上的一篇文章中,研究人员利用基因组编辑技术的精确剪切,将艾滋病毒从人类基因
组中剔除。 利用CRISPR/Cas9技术对抗艾滋病。
z*t
发帖数: 863
48
前一段时间和一个pi聊天,最后得出结论crispr的出现大大降低了以前的技术门槛。以
前只有大牛实验室做得了的东西现在普通lab也可以涉足,大牛的资源优势在某种程度
上被瓦解了。
现在风起云涌的crispr 运动其实有一点微生物学复兴的意思,crispr之前微生物只有
metagenomics因为可以和健康扯起来算是一个大热方向。现在这波在微生物里找类似
crispr机制的热潮让我想起了当年找抗生素的大潮,希望更多更好的系统能被找到:)
m*********D
发帖数: 1727
49
来自主题: Biology版 - zz颜宁对韩春雨的评论
哈,我们这礼拜的组会也因学生放假,老板指定我介绍这篇文章。我总结一下我们的评
论。老板说: I know his pain--no money, no high-end equipments, no people...
Good work! The turn-down by Science is understandable. No big name in the
paper, and Science may ask a lot of experiments simply they can not do, just
like what happened to us 2 years ago.
大家都觉得:
1。这篇文章的重点是和CRISPR比,几个比CRISPR的优点,如低off-target,就有待其
他实验室的证实。很多新发现都会在随后的跟进研究中证实没有最初的那么乐观。
2。把它变成一个成熟的technology还需要大量的金钱和投入的。CRISPR没有MIT 那么
投入不会走这么快。中国政府虽然容易大量投钱,但没有比CRISPR特别的优势,要赶上
来会不容易。
c********n
发帖数: 225
50
蛋白比较复杂,有时候真是需要去做各种尝试,才能知道它对各种条件的喜好。
从经典的生化实验中,我们可以看到,对于一个蛋白,特别是一个酶,一定要有非常好
的,稳定性,重复性都很高的assay,才能真正地了解它的功能与特性。
每个好的assay,都是酶的真实功能的显示。
如果一个酶缺乏一个assay想要测到的功能,不是assay没设对,就很可能是这个酶没有
这个想要达到的功能了。
比如Taq酶,其实它的一个很好的assay,也是它的应用,就是PCR。
这个assay 很robust, 成功率很高,应用就广了。
Taq酶辅助了PCR, PCR成就了Taq酶;
Cas9这个酶也是相似的,加上 CRISPR成为一个系统,CRISPR/Cas9也有一个很好的
assay, 也是它的应用, 这就是基因编辑了。
这个assay 也很robust, 成功率也很高,应用就更广了。
CRISPR/Cas9辅助了基因编辑,基因编辑也成就了CRISPR/Cas9
从现在这么高的不可重复的几率来看,韩春雨的NgAgo/gDNA,用基因编辑的assay来测量
,无法测到基因编辑的功能,更别谈robust和重复性了。
... 阅读全帖
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