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Biology版 - 求助关于RACE的问题
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y******g
发帖数: 3
1
小弟目前在做关于lncRNA的研究,在做race鉴定一些lncRNA的全长。遇到了一些问题。
求助各位高手。
我用目前的方法做出了2条全长以后,接下来怎么做都做不出来了。
我RACE完的产物每一次都能跑出很亮的1-1.5KB的条带,切胶回收连接到T载体以后测序
。发现序列都是错的,序列两端有制作模板时候加的接头序列,但是中间的片段在基因
组里都找不到,或是一些错的片段。我自己检查了引物,酶,DNTP,水都没有污染,也
不知道为什么会这样,求高手指点.
k****l
发帖数: 279
2
5' 还是 3',这个不知道不好提供建议

【在 y******g 的大作中提到】
: 小弟目前在做关于lncRNA的研究,在做race鉴定一些lncRNA的全长。遇到了一些问题。
: 求助各位高手。
: 我用目前的方法做出了2条全长以后,接下来怎么做都做不出来了。
: 我RACE完的产物每一次都能跑出很亮的1-1.5KB的条带,切胶回收连接到T载体以后测序
: 。发现序列都是错的,序列两端有制作模板时候加的接头序列,但是中间的片段在基因
: 组里都找不到,或是一些错的片段。我自己检查了引物,酶,DNTP,水都没有污染,也
: 不知道为什么会这样,求高手指点.

y******g
发帖数: 3
3
5' 和 3‘都是同样的情况,泡胶都很亮的单一条带,但是测序是错的。

【在 k****l 的大作中提到】
: 5' 还是 3',这个不知道不好提供建议
y******g
发帖数: 3
4
我最近几天重复了几次曾经做出来的东西,加入上下游的引物的可以P出单一的亮条带
。但是对照组我只加了接头引物也P出了亮的单一条带,位置都差不多。只加入基因特
异性引物不能够扩增出条带
求高人解答。谢谢!
s*****3
发帖数: 20
5
If you wish, you can send me the image of your RACE results with more
detailed description. I happened to identified a lncRNA using 5'- and 3'-
RACE, Northern, and long range RT-PCR.
s*****[email protected]
Z******5
发帖数: 435
6
会不会有剪切呀? blast也搞不定? RNA编辑有没有可能?
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