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Biology版 - 求助土壤古细菌16S鉴定
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话题: 古细菌话题: 引物话题: dna话题: 16s话题: 文献
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c*********r
发帖数: 181
1
正在做土壤古细菌鉴定,DNA已经提取出来了,现在用了一个文献的方法用巢式PCR扩增
16SDNA,但是一直不成功。用别的文献方法,别的引物能够扩增出来条带,说明里面应
该是有古细菌DNA的。
我用的文献方法是:cindy H. Nakatsu (2000): soil community analysis using
DGGE of 16S rDNA Polymerase Chain reaction products.
请教各位大仙,能否给我一点指导?
谢谢!
p****n
发帖数: 9263
2
古细菌这种狗东西皮尔厚馅儿小,你有没有用爆米花方法破裂细胞壁?

【在 c*********r 的大作中提到】
: 正在做土壤古细菌鉴定,DNA已经提取出来了,现在用了一个文献的方法用巢式PCR扩增
: 16SDNA,但是一直不成功。用别的文献方法,别的引物能够扩增出来条带,说明里面应
: 该是有古细菌DNA的。
: 我用的文献方法是:cindy H. Nakatsu (2000): soil community analysis using
: DGGE of 16S rDNA Polymerase Chain reaction products.
: 请教各位大仙,能否给我一点指导?
: 谢谢!

c*********r
发帖数: 181
3
我用别的引物发现能P出来,现在的问题是为什么这个特异的引物对做不出来?好几篇
文献都用这个P出来了。加BSA,ACETAMIDE,各种方法我都试过了。
c*********r
发帖数: 181
4
顺便问一下,什么是爆米花方法?
p****n
发帖数: 9263
5
铁罐子里加高压,然后“砰”...

【在 c*********r 的大作中提到】
: 顺便问一下,什么是爆米花方法?
C*******e
发帖数: 4348
6
你用通用引物p过么
出不出条带?

【在 c*********r 的大作中提到】
: 正在做土壤古细菌鉴定,DNA已经提取出来了,现在用了一个文献的方法用巢式PCR扩增
: 16SDNA,但是一直不成功。用别的文献方法,别的引物能够扩增出来条带,说明里面应
: 该是有古细菌DNA的。
: 我用的文献方法是:cindy H. Nakatsu (2000): soil community analysis using
: DGGE of 16S rDNA Polymerase Chain reaction products.
: 请教各位大仙,能否给我一点指导?
: 谢谢!

c*********r
发帖数: 181
7
我试过别的引物,出条带!
h**********r
发帖数: 671
8
用nanodrop看一下DNA浓度和质量,然后严格的控制加入的模板量。好像太多也不容易
出来,默认你是用kit提的DNA
仅供参考。
c*********r
发帖数: 181
9
非常感谢你的建议!
A*******e
发帖数: 284
10
别的引物是啥引物? 要不是古细菌特异引物, 十有八九扩出来的是真细菌。
g***j
发帖数: 40861
11
不保守?
换更短的引物?
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