o***e 发帖数: 12 | 1 自己设计的用来做qPCR的引物,primer 5.0设计的,理论上的产物应该是98bp。我先是
用PCR对cDNA进行了三十个cycle测试了一下引物,结果P出来很纯的一条带,在300bp附
近,去测了一下序列,结果258bp,而且还是同一个基因。。。。。。。。。
这是咋回事啊?大家说说看?
难道是RNA里面可能含有DNA,然后做RT-PCR的时候还在,导致PCR就直接在DNA的基础上
扩了?
汗死了 |
C**S 发帖数: 522 | |
o***e 发帖数: 12 | 3 查了一下,基本上在正向引物开始的那部分,只是结束的不是反向的那一点,是往后延
了一百多个bp
【在 C**S 的大作中提到】 : 那测序得到的序列是基因的哪一部分?
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b******n 发帖数: 4225 | 4 你的细胞在目的基因有alternative splicing?
就是说你P到一个原来target的isoform
【在 o***e 的大作中提到】 : 自己设计的用来做qPCR的引物,primer 5.0设计的,理论上的产物应该是98bp。我先是 : 用PCR对cDNA进行了三十个cycle测试了一下引物,结果P出来很纯的一条带,在300bp附 : 近,去测了一下序列,结果258bp,而且还是同一个基因。。。。。。。。。 : 这是咋回事啊?大家说说看? : 难道是RNA里面可能含有DNA,然后做RT-PCR的时候还在,导致PCR就直接在DNA的基础上 : 扩了? : 汗死了
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Z******5 发帖数: 435 | 5 有这种可能。我前一段时间扩增了一个小肽段,在同一个细胞中就有两种表达量相近的
isoform,都是经过剪接后的,其中一个比另一个少了15bp,在其中一个剪接位点处有
不同。 |