l******r 发帖数: 31 | 1 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。 |
a***a 发帖数: 40617 | 2 拜佛
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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p*******r 发帖数: 4048 | 3 找一公。
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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a********k 发帖数: 2273 | 4 拜生物学家
【在 a***a 的大作中提到】 : 拜佛
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e****s 发帖数: 1125 | 5 把蛋白切掉点再试试
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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a***a 发帖数: 40617 | 6 那你给我说不结晶除了拜佛还有啥办法。lol
【在 a********k 的大作中提到】 : 拜生物学家
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e****s 发帖数: 1125 | 7 把蛋白切掉点再试试
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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a***a 发帖数: 40617 | 8 哥试过100多个constructs,都不work
【在 e****s 的大作中提到】 : 把蛋白切掉点再试试
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T**********t 发帖数: 1604 | 9 一直听说结晶是门art,而不是science。。。 |
O******e 发帖数: 4845 | 10 介个主意好
【在 p*******r 的大作中提到】 : 找一公。
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O******e 发帖数: 4845 | 11 100多个??
累都要累死了。
【在 a***a 的大作中提到】 : 哥试过100多个constructs,都不work
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a********k 发帖数: 2273 | 12 有些蛋白根本无法work啦,找一公,gouaux这种人也没办法
【在 a***a 的大作中提到】 : 哥试过100多个constructs,都不work
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T**********t 发帖数: 1604 | 13 不能做NMR结构么?
弱弱的问一下,x-ray解结构比NMR解结构优越之处在哪里?我总觉得结晶的蛋白结构和
生理条件下的蛋白结构应该是不一样的,倒是测NMR因为是在溶液里,可能更接近生理
条件一些吧。
当然我对于解结构基本属于门外汉,所以万一说错了不要笑话我。
【在 a********k 的大作中提到】 : 有些蛋白根本无法work啦,找一公,gouaux这种人也没办法
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a***a 发帖数: 40617 | 14 NMR大于20kd的玩不转
【在 T**********t 的大作中提到】 : 不能做NMR结构么? : 弱弱的问一下,x-ray解结构比NMR解结构优越之处在哪里?我总觉得结晶的蛋白结构和 : 生理条件下的蛋白结构应该是不一样的,倒是测NMR因为是在溶液里,可能更接近生理 : 条件一些吧。 : 当然我对于解结构基本属于门外汉,所以万一说错了不要笑话我。
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a***a 发帖数: 40617 | 15 不是art,是gambling
【在 T**********t 的大作中提到】 : 一直听说结晶是门art,而不是science。。。
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O******e 发帖数: 4845 | 16 其它领域,gambling的东西也不少啊。
【在 a***a 的大作中提到】 : 不是art,是gambling
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a***a 发帖数: 40617 | 17 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命
【在 O******e 的大作中提到】 : 其它领域,gambling的东西也不少啊。
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s******r 发帖数: 2876 | 18 一公的人品这么好,连手底下的小弟全都沾光了。
100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命
【在 a***a 的大作中提到】 : 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个 : 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命
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s******y 发帖数: 28562 | 19 Support this
【在 a***a 的大作中提到】 : 拜佛
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a********k 发帖数: 2273 | 20 人是下了苦功的,天道酬勤。
【在 s******r 的大作中提到】 : 一公的人品这么好,连手底下的小弟全都沾光了。 : : 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个 : 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命
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p*****m 发帖数: 7030 | 21 积极的办法,多换几个物种
消极的办法,想想没结晶能不能发个小functional的paper
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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a***a 发帖数: 40617 | 22 换物种是王道
【在 p*****m 的大作中提到】 : 积极的办法,多换几个物种 : 消极的办法,想想没结晶能不能发个小functional的paper
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a***a 发帖数: 40617 | 23 一公手下敢情人人都有结构?
【在 s******r 的大作中提到】 : 一公的人品这么好,连手底下的小弟全都沾光了。 : : 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个 : 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命
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l*******k 发帖数: 361 | 24 说个小道消息
syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白...
不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤 |
w****8 发帖数: 36 | 25 如果是什么enzyme的话,有时候加点substrate也是有用的。我们这边有个人做一个管
DNA damage的酶,一开始怎么做都做不出来,后来加了点DNA就出来了。 |
l******u 发帖数: 936 | 26 找11公去。
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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w******n 发帖数: 168 | 27 这个 那这帮人去试试GPCR。。。。多少年了 多少postdoc死在上面
好不容易才解出一个。。。。。
【在 l*******k 的大作中提到】 : 说个小道消息 : syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白... : 不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤
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T**********t 发帖数: 1604 | 28 哦,是这样啊。为什么玩不转呢?技术不够发达?计算能力达不到?
【在 a***a 的大作中提到】 : NMR大于20kd的玩不转
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a********k 发帖数: 2273 | 29 一公对了啊,GPCR还是解出来了,也不止一个。他又没说没有他解不出来的,也没说花
多少精力解出来。。。
【在 w******n 的大作中提到】 : 这个 那这帮人去试试GPCR。。。。多少年了 多少postdoc死在上面 : 好不容易才解出一个。。。。。
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s******y 发帖数: 28562 | 30 The main issue is the power of the NMR machine: a low power NMR cannot resolve the difference between bonds. Therefore the raw data will not be able to back-
track assigned to different molecular force.
A bigger molecule of course also require much large scale of computation, but this is less an issue nowaday.
【在 T**********t 的大作中提到】 : 哦,是这样啊。为什么玩不转呢?技术不够发达?计算能力达不到?
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O******e 发帖数: 4845 | 31 在这个筛的问题上,会不会有啥技术突破能加快这个过程?
【在 a***a 的大作中提到】 : 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个 : 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命
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O******e 发帖数: 4845 | 32 理论上来说,当然所有蛋白都是可以结晶的。
【在 l*******k 的大作中提到】 : 说个小道消息 : syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白... : 不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤
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a***a 发帖数: 40617 | 33 更nb的是去年还是前年cell的某结构,90年就有晶体了
十几年后才发了文章。lol
【在 w******n 的大作中提到】 : 这个 那这帮人去试试GPCR。。。。多少年了 多少postdoc死在上面 : 好不容易才解出一个。。。。。
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a***a 发帖数: 40617 | 34 结构预测
可以快速筛掉那些有不稳定,flexible region的
HT,合成,机器人克隆,HT small scale 表达
可以快速筛掉不表达,或者表达不折叠的
【在 O******e 的大作中提到】 : 在这个筛的问题上,会不会有啥技术突破能加快这个过程?
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l*******k 发帖数: 361 | 35 传说中的尸山血海?
发信人: anoia (high estrogen man), 信区: Biology
标 题: Re: 试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 4 18:08:36 2010, 美东)
更nb的是去年还是前年cell的某结构,90年就有晶体了
十几年后才发了文章。lol |
a***a 发帖数: 40617 | 36 en,肯定无数postdoc被该老板忽悠,你看,现在都有晶体了,你过来,很快就能做出来
保守估计至少中间死了5批人
【在 l*******k 的大作中提到】 : 传说中的尸山血海? : 发信人: anoia (high estrogen man), 信区: Biology : 标 题: Re: 试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办? : 发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 4 18:08:36 2010, 美东) : 更nb的是去年还是前年cell的某结构,90年就有晶体了 : 十几年后才发了文章。lol
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n******d 发帖数: 680 | 37 换人试试
可惜楼主不是老板
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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k********u 发帖数: 2209 | 38 看你结晶什么蛋白了。
如果像你所说的,自己是外行,还是相信你的合作者吧,实在不行,就多找几个
合作者,如果你能大量提供纯度够的蛋白样品。
普遍来说,做结晶成功的第一步,纯化后的蛋白量要上去。。。
如果真的想要自己搞,先去amazon上买几本书看看,再看自己有没有这个决心。
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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p******i 发帖数: 1092 | 39 唉
出来
【在 a***a 的大作中提到】 : en,肯定无数postdoc被该老板忽悠,你看,现在都有晶体了,你过来,很快就能做出来 : 保守估计至少中间死了5批人
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b*******r 发帖数: 1073 | 40 数据需要稍微更新一点了.
如果有人CARE的话.
【在 a***a 的大作中提到】 : NMR大于20kd的玩不转
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g*****p 发帖数: 451 | 41 这个问题你可以跟合作方多讨论一下
如果他们有什么需要你可以根据你自己实验的紧张程度尽量满足
现在的题目如果不是新基因发现
容易做结晶的重要蛋白已经不多了
做不出来才正常
不要对做结构的人报期望值太高
对于这种只能证实,不能证伪的东西
你可以去试,但是不要认为试了就可能有结果
如果是拼了命想做出来
那就试试不同的construct
如果你一个月试20个,估计一年之内拿到晶体的机会还是很大的
不过你合作方得被你逼死了
因为正常情况下,这相当于一个非常勤奋的学生8年的活吧
【在 l******r 的大作中提到】 : 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。 : 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
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a***a 发帖数: 40617 | 42 勤奋学生3年的活儿
而且这学生还脑残,还信忽悠
【在 g*****p 的大作中提到】 : 这个问题你可以跟合作方多讨论一下 : 如果他们有什么需要你可以根据你自己实验的紧张程度尽量满足 : 现在的题目如果不是新基因发现 : 容易做结晶的重要蛋白已经不多了 : 做不出来才正常 : 不要对做结构的人报期望值太高 : 对于这种只能证实,不能证伪的东西 : 你可以去试,但是不要认为试了就可能有结果 : 如果是拼了命想做出来 : 那就试试不同的construct
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g*****p 发帖数: 451 | 43 这话说得非常不科学
因为这个论点既不能被证实,也不能被证伪
不过这也许是以讹传讹吧
没听说一公说过这话
况且他的技术策略是以最快的速度做相对比较容易的重要蛋白发cns
而不是挑战有技术难度的题目
说这个话跟他的技术理念是背道而驰的
倒是听人传过晓东说蛋白都能被提纯之类的话,只是不是亲耳所闻,不知真假了
【在 l*******k 的大作中提到】 : 说个小道消息 : syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白... : 不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤
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