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Biology版 - 试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
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话题: 结晶话题: 蛋白话题: nmr话题: 结构话题: 拿到
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1 (共1页)
l******r
发帖数: 31
1
这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。
a***a
发帖数: 40617
2
拜佛

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

p*******r
发帖数: 4048
3
找一公。

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

a********k
发帖数: 2273
4
拜生物学家

【在 a***a 的大作中提到】
: 拜佛
e****s
发帖数: 1125
5
把蛋白切掉点再试试

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

a***a
发帖数: 40617
6
那你给我说不结晶除了拜佛还有啥办法。lol

【在 a********k 的大作中提到】
: 拜生物学家
e****s
发帖数: 1125
7
把蛋白切掉点再试试

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

a***a
发帖数: 40617
8
哥试过100多个constructs,都不work

【在 e****s 的大作中提到】
: 把蛋白切掉点再试试
T**********t
发帖数: 1604
9
一直听说结晶是门art,而不是science。。。
O******e
发帖数: 4845
10
介个主意好

【在 p*******r 的大作中提到】
: 找一公。
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一公时代的到来zz
一公其实也就是一个二流生物学家
真正药物的革命,全是北欧和瑞士领导的
颜宁会因为Glut1结构获诺贝尔奖?
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O******e
发帖数: 4845
11
100多个??
累都要累死了。

【在 a***a 的大作中提到】
: 哥试过100多个constructs,都不work
a********k
发帖数: 2273
12
有些蛋白根本无法work啦,找一公,gouaux这种人也没办法

【在 a***a 的大作中提到】
: 哥试过100多个constructs,都不work
T**********t
发帖数: 1604
13
不能做NMR结构么?
弱弱的问一下,x-ray解结构比NMR解结构优越之处在哪里?我总觉得结晶的蛋白结构和
生理条件下的蛋白结构应该是不一样的,倒是测NMR因为是在溶液里,可能更接近生理
条件一些吧。
当然我对于解结构基本属于门外汉,所以万一说错了不要笑话我。

【在 a********k 的大作中提到】
: 有些蛋白根本无法work啦,找一公,gouaux这种人也没办法
a***a
发帖数: 40617
14
NMR大于20kd的玩不转

【在 T**********t 的大作中提到】
: 不能做NMR结构么?
: 弱弱的问一下,x-ray解结构比NMR解结构优越之处在哪里?我总觉得结晶的蛋白结构和
: 生理条件下的蛋白结构应该是不一样的,倒是测NMR因为是在溶液里,可能更接近生理
: 条件一些吧。
: 当然我对于解结构基本属于门外汉,所以万一说错了不要笑话我。

a***a
发帖数: 40617
15
不是art,是gambling

【在 T**********t 的大作中提到】
: 一直听说结晶是门art,而不是science。。。
O******e
发帖数: 4845
16
其它领域,gambling的东西也不少啊。

【在 a***a 的大作中提到】
: 不是art,是gambling
a***a
发帖数: 40617
17
100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命

【在 O******e 的大作中提到】
: 其它领域,gambling的东西也不少啊。
s******r
发帖数: 2876
18
一公的人品这么好,连手底下的小弟全都沾光了。

100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命

【在 a***a 的大作中提到】
: 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
: 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命

s******y
发帖数: 28562
19
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【在 a***a 的大作中提到】
: 拜佛
a********k
发帖数: 2273
20
人是下了苦功的,天道酬勤。

【在 s******r 的大作中提到】
: 一公的人品这么好,连手底下的小弟全都沾光了。
:
: 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
: 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命

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MacKinnon 也开始用冰冻电镜了
问个蛋白结晶的问题~~
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真诚求教外加吐槽,老板思路有问题,自己不想浪费时间,怎么办
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p*****m
发帖数: 7030
21
积极的办法,多换几个物种
消极的办法,想想没结晶能不能发个小functional的paper

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

a***a
发帖数: 40617
22
换物种是王道

【在 p*****m 的大作中提到】
: 积极的办法,多换几个物种
: 消极的办法,想想没结晶能不能发个小functional的paper

a***a
发帖数: 40617
23
一公手下敢情人人都有结构?

【在 s******r 的大作中提到】
: 一公的人品这么好,连手底下的小弟全都沾光了。
:
: 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
: 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命

l*******k
发帖数: 361
24
说个小道消息
syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白...
不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤
w****8
发帖数: 36
25
如果是什么enzyme的话,有时候加点substrate也是有用的。我们这边有个人做一个管
DNA damage的酶,一开始怎么做都做不出来,后来加了点DNA就出来了。
l******u
发帖数: 936
26
找11公去。

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

w******n
发帖数: 168
27
这个 那这帮人去试试GPCR。。。。多少年了 多少postdoc死在上面
好不容易才解出一个。。。。。

【在 l*******k 的大作中提到】
: 说个小道消息
: syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白...
: 不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤

T**********t
发帖数: 1604
28
哦,是这样啊。为什么玩不转呢?技术不够发达?计算能力达不到?

【在 a***a 的大作中提到】
: NMR大于20kd的玩不转
a********k
发帖数: 2273
29
一公对了啊,GPCR还是解出来了,也不止一个。他又没说没有他解不出来的,也没说花
多少精力解出来。。。

【在 w******n 的大作中提到】
: 这个 那这帮人去试试GPCR。。。。多少年了 多少postdoc死在上面
: 好不容易才解出一个。。。。。

s******y
发帖数: 28562
30
The main issue is the power of the NMR machine: a low power NMR cannot resolve the difference between bonds. Therefore the raw data will not be able to back-
track assigned to different molecular force.
A bigger molecule of course also require much large scale of computation, but this is less an issue nowaday.

【在 T**********t 的大作中提到】
: 哦,是这样啊。为什么玩不转呢?技术不够发达?计算能力达不到?
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结构生物学在制药研发的作用
[合集] 看了上面的讨论,向作结构的请教一下
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O******e
发帖数: 4845
31
在这个筛的问题上,会不会有啥技术突破能加快这个过程?

【在 a***a 的大作中提到】
: 100个candidate,最后能拿到结构的一半3~5个
: 而且没什么特别快的筛的方法,所以谁拿到,能不能拿到,花多久拿到,都是命

O******e
发帖数: 4845
32
理论上来说,当然所有蛋白都是可以结晶的。

【在 l*******k 的大作中提到】
: 说个小道消息
: syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白...
: 不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤

a***a
发帖数: 40617
33
更nb的是去年还是前年cell的某结构,90年就有晶体了
十几年后才发了文章。lol

【在 w******n 的大作中提到】
: 这个 那这帮人去试试GPCR。。。。多少年了 多少postdoc死在上面
: 好不容易才解出一个。。。。。

a***a
发帖数: 40617
34
结构预测
可以快速筛掉那些有不稳定,flexible region的
HT,合成,机器人克隆,HT small scale 表达
可以快速筛掉不表达,或者表达不折叠的

【在 O******e 的大作中提到】
: 在这个筛的问题上,会不会有啥技术突破能加快这个过程?
l*******k
发帖数: 361
35
传说中的尸山血海?
发信人: anoia (high estrogen man), 信区: Biology
标 题: Re: 试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 4 18:08:36 2010, 美东)
更nb的是去年还是前年cell的某结构,90年就有晶体了
十几年后才发了文章。lol
a***a
发帖数: 40617
36
en,肯定无数postdoc被该老板忽悠,你看,现在都有晶体了,你过来,很快就能做出来
保守估计至少中间死了5批人

【在 l*******k 的大作中提到】
: 传说中的尸山血海?
: 发信人: anoia (high estrogen man), 信区: Biology
: 标 题: Re: 试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 4 18:08:36 2010, 美东)
: 更nb的是去年还是前年cell的某结构,90年就有晶体了
: 十几年后才发了文章。lol

n******d
发帖数: 680
37
换人试试
可惜楼主不是老板

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

k********u
发帖数: 2209
38
看你结晶什么蛋白了。
如果像你所说的,自己是外行,还是相信你的合作者吧,实在不行,就多找几个
合作者,如果你能大量提供纯度够的蛋白样品。
普遍来说,做结晶成功的第一步,纯化后的蛋白量要上去。。。
如果真的想要自己搞,先去amazon上买几本书看看,再看自己有没有这个决心。

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

p******i
发帖数: 1092
39


出来

【在 a***a 的大作中提到】
: en,肯定无数postdoc被该老板忽悠,你看,现在都有晶体了,你过来,很快就能做出来
: 保守估计至少中间死了5批人

b*******r
发帖数: 1073
40
数据需要稍微更新一点了.
如果有人CARE的话.

【在 a***a 的大作中提到】
: NMR大于20kd的玩不转
相关主题
蛋白晶体结构分析该发在哪个杂志上?
蛋白结构还多人做吗?
请教:怎样找到跟研究蛋白特定结合的小分子化合物
crystallography 还是 nmr?
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g*****p
发帖数: 451
41
这个问题你可以跟合作方多讨论一下
如果他们有什么需要你可以根据你自己实验的紧张程度尽量满足
现在的题目如果不是新基因发现
容易做结晶的重要蛋白已经不多了
做不出来才正常
不要对做结构的人报期望值太高
对于这种只能证实,不能证伪的东西
你可以去试,但是不要认为试了就可能有结果
如果是拼了命想做出来
那就试试不同的construct
如果你一个月试20个,估计一年之内拿到晶体的机会还是很大的
不过你合作方得被你逼死了
因为正常情况下,这相当于一个非常勤奋的学生8年的活吧

【在 l******r 的大作中提到】
: 这个蛋白很重要,所以十分想拿到晶体结构,但是试了很多条件,都没有晶体长出来。
: 有什么解决办法吗?自己对这个是外行,结晶这部分工作是合作伙伴在做。

a***a
发帖数: 40617
42
勤奋学生3年的活儿
而且这学生还脑残,还信忽悠

【在 g*****p 的大作中提到】
: 这个问题你可以跟合作方多讨论一下
: 如果他们有什么需要你可以根据你自己实验的紧张程度尽量满足
: 现在的题目如果不是新基因发现
: 容易做结晶的重要蛋白已经不多了
: 做不出来才正常
: 不要对做结构的人报期望值太高
: 对于这种只能证实,不能证伪的东西
: 你可以去试,但是不要认为试了就可能有结果
: 如果是拼了命想做出来
: 那就试试不同的construct

g*****p
发帖数: 451
43
这话说得非常不科学
因为这个论点既不能被证实,也不能被证伪
不过这也许是以讹传讹吧
没听说一公说过这话
况且他的技术策略是以最快的速度做相对比较容易的重要蛋白发cns
而不是挑战有技术难度的题目
说这个话跟他的技术理念是背道而驰的
倒是听人传过晓东说蛋白都能被提纯之类的话,只是不是亲耳所闻,不知真假了

【在 l*******k 的大作中提到】
: 说个小道消息
: syg曾经夸下海口,说天底下没有不能提纯/结晶的蛋白...
: 不过也有一位生化大牛也说过类似的话,据说当时的围观群众们很受伤

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