由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: nmr
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g**********n
发帖数: 4
1
工作描述如下, 本人的背景跟这个位置非常match,简历基本cover所有discription,
已经在线投简历,还请有关前辈多多指点,帮忙再push一下简历给Hiring Manager就太
好了!先谢了.
(在线简历是个德文网站,还要browser翻译成英文,最离谱的是还提示要用“原始语
言”投简历,以便recruiter筛选,算是奇葩经历了)
Job Description A health care company with global reach. A product pipeline
filled to the brim. A team committed to scientific advancement. Think what's
possible. Novartis and its associated companies are always looking for
talented employees globally. We are engaged in advance preparation for
potential position openings.... 阅读全帖
p****s
发帖数: 3153
2
你说得不对,他所说的CRINEPT-HMQC-TROSY是一个谱而不是几个。
我不太了解xray需要多少蛋白,不过做液相NMR就算是很大的蛋白我想几mg就够用了。
NMR和xray是互补的实验而不是相互竞争,真正做NMR的人也不会直接跟xray竞争。NMR
可以提供很多dynamics的信息,这是xray无法做到的;而且NMR可以做溶液里甚至是细
胞组织内的状态,而xray需要单晶(似乎也有用微晶的,我不懂了)。现在NMR已经发
展成了一个很强大的方法,通过single scan NMR,以后做real time估计都是可以实现
的。
从本质上来说NMR当然是不灵敏的方法,远没有其他光谱方法灵敏,但是我认为(当然
是我自己的观点)它能提供最接近生理条件的结构信息。“不用NMR也可以用xray"这说
法有点好笑,有些蛋白就长不出晶体,你怎么做xray呢,呵呵。当然NMR有分子量的限
制,要做大的体系首先还是应该考虑xray。我自己认为NMR是更有灵活性的方法,而且
就算解不出高分辨率的三维结构还是一样可以提供很多有用的信息。
p****s
发帖数: 3153
3
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
谁说NMR不能筛药?做SAR的人多的是,不过我是不懂。还有人用NMR做代谢呢。
NMR一个好处是就算解不出结构也能解决一些关键问题,比如最近Influenza M2 proton
channel在nature和science上的
paper,xray没晶体能干毛?NMR还能做细胞里的蛋白,xray不行吧。两个技术的针对性
和特长不同,没法说哪个更好,
只不过xray成功的历史更悠久罢了。说实话NMR想发CNS比xray难多了,我估计主要还是
历史原因。现在最前沿的进展是
可以很快收集NMR数据,甚至可以做real time kinetics,这个常规晶体学方法肯定不
能做到吧。我不懂xray,也没怎么看
过xray文章,所以我不评价xray怎么样,当然了,大家都有辉煌的历史,都在科学研究
中做过巨大的贡献,一个看不起另
一个又何必呢。工业界我不了解,但是我相信NMR也有一席之地,毕竟我老板当时还拿
到过某公司的offer,要说drug
discovery, NMR也是重要方法之一吧,用NMR做GPCR的公司我也听过。
U**********b
发帖数: 13
4
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: UofLlaserlab (UofLlaserlab), 信区: Chemistry
标 题: postdoctoral researcher in solution NMR for protein conformational dynamics
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jan 21 19:01:07 2017, 美东)
The Li lab in the Department of Chemistry at University of Louisville is
seeking a highly motivated postdoctoral researcher to join our lab
immediately.
Our research interests focus on applying solution NMR techniques to
understand the functional roles of protein conformational dynamics in the
deu... 阅读全帖
m****s
发帖数: 18160
5
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: towerguy (towerguy), 信区: Chemistry
标 题: Opening-PhD level, organic Chemist, NMR maintain
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Mar 26 08:19:40 2013, 美东)
Sorry for cannot typing Chinese as work. (the job post will be on the
company website shortly)
A fortune 500 chemical company is looking for a PhD level chemist for
polymer analysis. Key Responsibilities: Apply a fundamental understanding of
NMR Spectroscopic techniques to the characterization of complex synthetic
polymeric materia... 阅读全帖
d******s
发帖数: 231
6
石油公司,位置在得克萨斯休斯敦,有意请站内联系。
提醒一下, 这个位置需要比较强的NMR背景,不光是会用NMR。目前这个位置指定找在校
博士生和博士后,但如果工作2年以下的有可能也考虑。
NMR analytical chemist position:
Specifically, we are seeking a new graduate or post-doc with a PhD focused
on NMR. This person will support various business areas in a global leader
in oil exploration/production through chemicals, refining, and biomass.
Candidates are required to have a strong grounding in NMR theory, the
ability to apply NMR spectroscopy (H, C, F, Al, Si; solid & liquid) to a
broad r... 阅读全帖
U**********b
发帖数: 13
7
The Li lab in the Department of Chemistry at University of Louisville is
seeking a highly motivated postdoctoral researcher to join our lab
immediately.
Our research interests focus on applying solution NMR techniques to
understand the functional roles of protein conformational dynamics in the
deubiquitinase family. We’re especially interested in deubiquitinases that
are involved in signaling pathways implicated in cancer and autoimmune
diseases. To accomplish our research goals, we complement s... 阅读全帖
c*s
发帖数: 2145
8
来自主题: Macromolecules版 - zz:NMR谱图名称和大致功能
发信人: dudz (ddz), 信区: ChemMatSci
标 题: NMR谱图名称和大致功能
发信站: 瀚海星云 (Tue Mar 4 21:50:12 2003)
NMR系列之九
300MHz谱仪的名字、型号、共振频率、实验条件、NMR谱图名称和大致功能
最近一段时间,已有几位同学为发表论文需要知道300MHz谱仪的名字、型号和共振频率等
,这里写出如下,以飨同仁:
●名字:超导核磁共振谱仪
●型号:BRUKER AVANCE 300 (或 Bruker Av 300 或Bruker Avance 300)
●1H NMR 共振频率:300.13 MHz
●13C NMR 共振频率:75.47 MHz (或75.5MHz)
●定标:有四甲基硅(TMS)时用它定标;没有TMS时,用氘代溶剂中的残留氢峰定氢的化
学位移,用氘代溶剂中的碳峰定碳的化学位移。最好写出该溶剂的以TMS为内标时的化学

移值,因为引用不同的资料其化学位移值会略有不同。
●脉冲程序:一般都出现在参数表中:“PULPROG: ”
该谱仪的脉冲程序库中有680多种可供选择的脉冲程序,还不包括
g*****n
发帖数: 36
9
每一个amino acid 在你说的CRINEPT 或HMQC谱图上对应一个cross peak,
这些只能给出蛋白的backbone信息,
如要解结构,这还远远不够,还得做很多3D实验。
另外也不一定用NMR,可以用X-Ray,
NMR灵敏度不太高,需要大量蛋白。
推荐一个NMR中文wiki
http://www.nmrwiki.cn
这里还有一个专业的NMR论坛
http://www.chinanmr.cn/forum.php
b******e
发帖数: 88
10
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
nmr做的好也能cns,不过做的不好就歇了
crystallography的不做学术了好歹还能做做base on structure的target screen
nmr好像就没戏了
但是反过来说
能做crystallography的人一大把,做的好的也一大把,能做nmr还懂得比较透的不多吧
?听说做nmr肯定能保一个位置,也有人愿意来合作
p****s
发帖数: 3153
11
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
还好了,呵呵,用HD exchange大概也能知道什么地方有水,况且Xray看到的是水中的O
,NMR用的大部分是H,所以分
辨率有差异。
NMR发展到现在做25 kD以下的蛋白应该已经算常规了,大的也有人做,不过难点,需要
特殊标记。我好像见过上百 kD的
文章,但是这个不是NMR的特长,所以NMR很多精力都在动力学方面。反正就做别人不能
做的呗
p*********n
发帖数: 556
12
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
人家问前途,瞧这楼歪到纯技术去了。
我的phd thesis就是做dynamics。我有同实验室的用NMR解结构,还不是什么很大的蛋
白,就痛苦的不行了。所以我觉得protein NMR适合跟人搞合作,有特定的问题用NMR的
方法很有用。另外一个不能忽视的问题就是要把蛋白表达到比较高的浓度,又不沉淀也
不是那么容易的。很多人3,4年都用在表达蛋白上,剩下1,2年真正做NMR实验。
m********r
发帖数: 124
13
问个专业方向的问题。由于第四年结束了,开始考虑postdoc的方向。大家觉得做NMR的
前途咋样?怎么看了许多所谓的领域大牛,其实做的也都是JMB水平的文章居多。我自
己做一些x-ray的东西,也做NMR(dynamics 以及titration之类),生化的东西就是做
binding,定量蛋白相互作用。突然间感觉自己做的东西没啥前途,唉。看有些NMR牛人
,要不做复制修复的蛋白,病毒的包装,都是DNA binding protein。是不现在做蛋白-
蛋白相互作用已经dead area了? 还是我们这种biophysics或者NMR已经夕阳化了?话说
是不就算日后不放弃工业界这条路,x-ray也要坚持做下去?
m********r
发帖数: 124
14
来自主题: Biology版 - crystallography 还是 nmr?
老生长谈。谁能指点下自己关于crystallography 和NMR的困惑啊?现在自己解了两个
晶体结构,也在做别的生化的实验。还有一年就毕业。但是还有个课题中的蛋白长不出
晶体,一直再纠结要不要学习NMR去解结构。因为这个应该还算耗时吧。不知道将来是
不是用得上。因为自己想postdoc还是侧重crystallography方向,可能稍微会用NMR做
点titration, dynamics之类的吧。另外,有没人能给推荐个结合做crystallography
and nmr牛人啊,又是比较nice的?
g*****n
发帖数: 36
15
来自主题: Chemistry版 - 有人对2D-NMR比较了解嘛?
每一个amino acid 在你说的CRINEPT 或HMQC谱图上对应一个cross peak,
这些只能给出蛋白的backbone信息,
如要解结构,这还远远不够,还得做很多3D实验。
另外也不一定用NMR,可以用X-Ray,
NMR灵敏度不太高,需要大量蛋白。
推荐一个NMR中文wiki
http://www.nmrwiki.cn
这里还有一个专业的NMR论坛
http://www.chinanmr.cn/forum.php
h********g
发帖数: 143
16
Thank you very much!
Are you talking about the triplet of CDCl3 in C-NMR?
Actually, I don't think it is due to C-CL coupling.
I searched the triplet of CDCl3 in C-NMR and found this:
http://u-of-o-nmr-facility.blogspot.com/2007/09/isotope-shifts-
The CDCl3 signal is a 1:1:1 triplet due to the J coupling to the deuteron
which is a spin I=1 nucleus having three energy levels. The chemical shift
difference between the CHCl3 and CDCl3 isotopomers is called an isotope
shift.
Question 1: Since chlorin... 阅读全帖
v*********r
发帖数: 184
17
来自主题: Chemistry版 - 请教一个NMR问题
以前学NMR,基本就是solution state NMR, 从来没想过为什么要用溶剂,后来知道也
有solid state NMR,到底这个溶剂起什么作用?为什么不全用solid state NMR? 是不
是S/N ratio更高还是其他什么原因? 谢谢!
v*********r
发帖数: 184
18
来自主题: Chemistry版 - 请教一个NMR问题
以前学NMR,基本就是solution state NMR, 从来没想过为什么要用溶剂,后来知道也
有solid state NMR,到底这个溶剂起什么作用?为什么不全用solid state NMR? 是不
是S/N ratio更高还是其他什么原因? 谢谢!
w********h
发帖数: 12367
19
来自主题: Macromolecules版 - 问个NMR的问题
大概是这样的,三嵌段ABA共聚物,
在H NMR中能看到比较清楚的B上的氢,
而在C NMR中却看不到相应B上面的碳,
H NMR 400扫描32次,C NMR 100扫描5000次。
这种现象正常么?
问题二:
AB的random共聚得到的共聚物在做TGA的时候只有
一个热降解平台,而三嵌段ABA中的有一些却有两个
平台,正常么?读到过类似的文献,却不知如何合理
解释,我不想简单归因为两个组分。
M*********2
发帖数: 549
20
来自主题: Macromolecules版 - NMR vs GPC determine molecular weight?
看来很多同学都觉得NMR测的分子量比较准。这个其实是不对。polymer chemists通常
更偏爱GPC data一些。首先,NMR只能给出数均MW,而GPC可以给出数均,质均MW和
polydispersity index等很多信息。其次,由于高分子聚合反应的termination的复杂
性,会造成端基的不同。即使其中一种termination占主导地位,但也不能保证为100%
,肯定会引入一定的误差。最后,当MW比较大的时候,端基数量相对减小,NMR的精确
度极为重要。大家想一下我们做小分子时积分的误差有多大,即使是高频的NMR,用来
确定polymer的MW实际上也是很困难,误差很大的。
a*****4
发帖数: 986
21
NMR的T1和T2是最基本的,通常指特定的nucleus具有的 relaxation times,NMR的发展
基于研究T1T2开始。建议你读一下polymer NMR 的书。在研究固体的polymer,T1T2都
可以用来研究chain dynamics 和 domain size,这些都基于高分子多相,它们具有不
同relaxation times。在高分子溶液,理论上T1T2可能一样。Spiess和 Schmidt-Rohr
的multidimensional NMR polymer是一本很好的书。在这本书的致谢里提到了“
Yuliang Yang”杨玉良,现在复旦大学的现任校长(搞高分子物理),还提到了我老板
。呵呵,这世界很小
p****s
发帖数: 3153
22
你说有机化学上面的NMR么?和protein NMR两码事。其实很多做有机的人并不知道NMR
的原理的说,人不是也照样做。
assignment就是说那上面的每个峰分别代表蛋白序列中的哪个氨基酸,知道了它们代表
什么才能做下面的工作,这一般来说都是第一步的工作。二级结构可以通过secondary
chemical shifts知道。如果想了解这个可以去看ad bax 1991年的工作。
s******y
发帖数: 28562
23
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
NMR不管蛋白在什么状态下都能做,而且还能做动态图谱,理论上来说更
接近于蛋白在溶液里的自然状态。但是NMR的结构能力取决于仪器,
因为磁场的大小决定了磁量子的差分度, 也就是分辨率.
但是目前的仪器的限制,决定了NMR没有办法做大的蛋白。
而x-ray crystalgraphy 的分辨率主要由结晶的质量决定。
p****s
发帖数: 3153
24
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
我觉得原则上是可能的,用selective labeling,蛋白不同的部分relaxation不同,有
的特别灵活就可以用NMR做。我没太
关注过这方面的东西,不过我是觉得NMR的重点不在这里,有很多Xray根本没法做的东
西(RNA, dynamics,RNA-
protein interaction),这些问题做为NMR研究来说应该是比单纯的静态结构有意思多
了。
C*********m
发帖数: 213
25
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途

NMR计算结构的时候,所有的约束条件作模拟退火的时候都是假定真空状态。Hydration
不是不可以做,但是5年前肯定是不能直接用在结构计算中的。
错了,你肯定没有学过晶体学。
什么叫间接的看?晶体看到的也是间接的看,看到的电子云密度不过是用Fourier
Transformation算出来的。
NMR直接定出
Segmental labeling NMR,看你多大的蛋白。
C*********m
发帖数: 213
26
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
峰宽是用Hz量的,峰间距是用ppm量的,这是高场好处之一。
高场的第二好处是trosy效应,当然不是所有的核都越高越好,15N到1T就到顶了,13C
好像是在600M附近.s/n当然也是一个因素。另外有些RDC也是用Hz量的,所以场越高越
好。
不过Solution NMR解结构基本上走到头了,剩下的改进多数是奇技淫巧。固体NMR和MRI
是前途。话说回来,任何一门学科发展到工程化,学科本身就沦落为一种工具。结构生
物学发展到structural proteomics阶段之后,结构生物学本身就沦落成一门工具。结
构生物学的黄金时期早已过去,新兴的是各种 -omics技术,或者就回到生物学问题本
身。做生物研究,体系比方法更重要。楼主问NMR能找啥工作,还不如问问自己做的是
什么生物问题。
g*****n
发帖数: 36
27
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
做结构NMR肯定不如Crystal,CNS文章没几篇是NMR做出来了,相反Crystal的文章,几
乎每期都有。
这里有一个有意思的关于NMR专业毕业出路讨论。
http://www.chinanmr.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=5594
D******9
发帖数: 2665
28
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
认识三个人做NMR,都是美国名校实验室PHD, PHD都发了10片以上的文章, 没有CNS,
都是JBC,JMB一类的文章。 一个回了中国, 现在已经不做NMR 了, 另一个博士毕业直
接去了一个制药公司, 当了个NMR manager, 其实就是替大家RUN一下样品,都只要是
一维的, 实在太简单了。 最后一个换了方向, 该做晶体, 做了两轮薄厚, 找了一
个AP.
P***e
发帖数: 804
29
来自主题: Chemistry版 - 有做single molecular NMR的同学吗
不是什么好做的项目。
学NMR的时候,就说 NMR is not a sensitive analytical technique..
of course you can claim it has evolved ....
Single molecular NMR sounds too academic for now.
r******0
发帖数: 2753
30
来自主题: Chemistry版 - 问个高分子NMR的问题。
原来学过的,可惜过了这么多年没碰,都还给老师了。因为高分子的relaxation time的缘故,T1是该增加还是减小来着?我记得是增加,隐隐约约记得我用过10s。可有人跟我说是减小,我就糊涂了。哪位给我个正确答案。
另外,除了改T1外,做高分子的NMR相对于小分子的NMR还要改点什么设置,改sequence之类的高难度的就不用讲了,俺只要点basic的东西。谢谢。
BTW, it is for solution NMR not solid.
y***l
发帖数: 1095
31
来自主题: Chemistry版 - 准备怀孕的女生能做NMR实验吗?
你这说的也太危言耸听了吧。。。我PHD期间全部是做NMR的,还在FACILITY工作,超近
距离接触NMR仪器的每天,整个孕期一直工作到最后一天都还常需要在NMR仪器下活动的
,孩子挺好的。
y***l
发帖数: 1095
32
来自主题: Chemistry版 - 准备怀孕的女生能做NMR实验吗?
你这说的也太危言耸听了吧。。。我PHD期间全部是做NMR的,还在FACILITY工作,超近
距离接触NMR仪器的每天,整个孕期一直工作到最后一天都还常需要在NMR仪器下活动的
,孩子挺好的。
z**********m
发帖数: 17
33
来自主题: Chemistry版 - 准备怀孕的女生能做NMR实验吗?
就仪器本身而言,根本没有毒,仅仅是微弱的磁场,而且是屏蔽的好的基本上手机都不
用拿出口袋;
以前有个NMR的女老师,上课时候,电脑桌面就是她活泼可爱的女儿。他特地说她怀孕
时候做NMR,她女儿很健康,NMR没有事!
N*****r
发帖数: 2108
34
来自主题: Chemistry版 - 准备怀孕的女生能做NMR实验吗?
目前的看法是,没有数据显示NMR对健康或者是怀孕有影响。
lz老板说要做NMR,看来不是专门做NMR的,很可能是有机什么的,有机试剂什么的几乎
是可以肯定有影响的。
h********g
发帖数: 143
35
各位大牛,
小弟又来求助了。
我最近做了C-NMR的时候,出现了很奇怪的Doublet。而product的H-NMR和MS都是纯的。
这个doublet是怎么回事呢?会是C-N coupling么?
这两个分子式2,5-dibromoterephthalonitrile和2-amino-4-bromobenzonitrile,结构
式见下图。
C-NMR见下图。两个doublet分别在138 ppm和118 ppm的地方。
谢谢各位大牛咯~
g*****n
发帖数: 36
36
小分子NMR比蛋白NMR要好找工作。
这里都是NMR的工作信息。
http://www.chinanmr.cn/forum.php?mod=forumdisplay&fid=37
r******0
发帖数: 2753
37
来自主题: Macromolecules版 - question about 1H NMR spectrum

The difference between alchol and ester is much larger than alchol and ether.
~~~~
C-NMR may be more sensitive on this case.
I do hope you are right. Low MW polymer and very good NMR might tell the
difference. What I did is give you other possibilities that you may need
consider. Another suggestion is to order some very low MW poly(ethylene
glycol) and see if you NMR can see the chain end. If yes, you are right; if
not, :(
overlap.
ends
good
D********g
发帖数: 533
38
来自主题: Macromolecules版 - Faculty Position in NMR Spectroscopy
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: quasi (燕双飞), 信区: Chemistry
标 题: Faculty Position in NMR Spectroscopy
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jul 19 23:01:08 2007), 转信
The DEPARTMENT OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOPHYSICS at Washington Unive
rsity School of Medicine is looking for outstanding junior or senior faculty
who use NMR spectroscopy as their primary tool for studying functional dyna
mics of biological macromolecules. NMR studies would be augmented with bioch
emical and biophysical investigations. Areas o
r******0
发帖数: 2753
39
来自主题: Macromolecules版 - 问个高分子NMR的问题。 (转载)
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: ross2000 (无所事事,啥也不想干), 信区: Chemistry
标 题: 问个高分子NMR的问题。
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Oct 15 09:48:06 2010, 美东)
原来学过的,可惜过了这么多年没碰,都还给老师了。因为高分子的relaxation time
的缘故,T1是该增加还是减小来着?我记得是增加,隐隐约约记得我用过10s。可有人
跟我说是减小,我就糊涂了。哪位给我个正确答案。
另外,除了改T1外,做高分子的NMR相对于小分子的NMR还要改点什么设置,改
sequence之类的高难度的就不用讲了,俺只要点basic的东西。谢谢。
s*****n
发帖数: 1279
40
来自主题: Physics版 - 问一个NMR的问题
我不是搞NMR的,不过最近在看一篇文章(也不是NMR方面的),不过其中有一句话介绍
NMR:
Nuclear magnetic resonance analysis techniques are based on the principle
that all isotopes with an odd-
numbered atomic number (Z) have an intrinsic spin when subjected to a
magnetic field and therefore align
themselves along the magnetic field lines.
这句话有没有毛病?为什么要odd number proton?odd number neutron 不行吗?
d****z
发帖数: 9503
41
来自主题: Science版 - 问个关于NMR的问题
I worked on NMR in physics, not in medicine.
Firstly, the NMR signal itself from water only last less than 1ms even in
quite good magnetic field with quite pure water.
Secondly, one H2O molecule is the same as the other. As long as the density of
H2O doesn't change, you don't care about the flow of water.
The NMR signal in ice should be better than that in water because there are
less collision and therefore longer relaxation time. Just my guess. However,
you have to recalibrate your MRI.



i*********s
发帖数: 159
42
来自主题: NextGeneration版 - 准备怀孕的女生能做NMR实验吗? (转载)
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: insighteyes (insighteyes), 信区: Chemistry
标 题: 准备怀孕的女生能做NMR实验吗?
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 27 20:02:06 2011, 美东)
我是女生,想在读博期间生孩子,正在犹豫要不要选某个导师,她很明确地说我进去以
后要用NMR做实验
不知道这是不是本版常见问题,只是想问一下有经验的前辈……如果要防护,该怎么防
护呢?
n*****6
发帖数: 47
43
来自主题: Immigration版 - 求审稿 (protein NMR 方向)
急需审稿,溶液核磁共振方向, 从天然小分子, 到多肽,蛋白质, 以及复合物的NMR
研究都可以。 蛋白质结构及其复合物的NMR研究最合适。
非常感谢您的帮助!
p****s
发帖数: 3153
44
真想懂NMR的话找本书看看,这个还是需要书的...不是一下就能懂。
我老板都说"it is not easy",要知道他是多么聪明的人。我记得有个教授把他的手稿
放到网上,似乎叫understanding nmr spectroscopy,有空可以找找看看。
如果只是想稍微了解的话知道它能干嘛就行了,如果以后不用的话可能花那么多功夫也
没必要哈哈。
C*********m
发帖数: 213
45
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途

这个其实是有争议的,NMR计算结构的时候一般不考虑水,解出来的结构看不到水分子
,相反,晶体结构中通常能观察到水分子
NMR不是不能做大蛋白,而是不能直接定大蛋白的结构,如果研究功能,上百KDa的蛋白
也是可以的
s******y
发帖数: 28562
46
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途

这个不是我的意思。
NMR解出来的结构,应该是该蛋白在水作为溶剂中最真实的结构。
你说的那个晶体中解出的作为heterogenity 存在的水分子,其实是共结晶的水,
一般是蛋白里面的盐桥之间的水分子,和作为溶剂的水不是一回事。
研究大蛋白功能的时候,只能看局部一小个区域,而且只能通过一些同位素标记
法间接的看。不但要直接定出一个大蛋白的结构目前不可能,要用NMR直接定出
一个大蛋白的局部区域的具体结构貌似也是不可以的,就是只有间接信息,没有直接信
息。
p****s
发帖数: 3153
47
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
这个您说错了,主要不是仪器的限制,仪器可以提高信噪比,所以磁场越高越好,现在
应该有950M-1G的吧
但是对于大蛋白来说,限制NMR的主要是transverse relaxation,蛋白越大转得越慢,
灵敏度sensitivity就越低了。这个
大概不是提高磁场就能很好解决的,我想对于一个50 kDa的蛋白来说600 M和800 M没啥
大区别。现在常用的方法就是避
免relaxation造成的低灵敏度,方法有TROSY和methyl labeling,还有在高温下做(
thermophilic system)。蛋白大的另
一个问题是残基太多,峰的位置重复,但是这个可以用高维NMR解决,现在不是都有7维
了么。
C*********m
发帖数: 213
48
来自主题: Biology版 - nmr 做蛋白结构的前途
7D NMR也就是做做小蛋白的,脉冲程序那么长,信号基本上衰减完了. Reduced
dimensional NMR 还好一点,数据处理比较麻烦。
m********r
发帖数: 124
49
那你觉得我这种xray跟NMR结合的咋样?说实话,还是觉得X-ray靠谱点,当然我还不会
NMR解结构

.
g*****n
发帖数: 36
50
来自主题: Chemistry版 - 有做single molecular NMR的同学吗
不太清楚你的问题,NMR可以给出原子水平信息。
这里有一个NMR 中文wiki
http://www.nmrwiki.cn
再不行,这里还有一个专业的论坛
http://www.chinanmr.cn/forum.php
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