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Biology版 - 真正药物的革命,全是北欧和瑞士领导的
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落后就要挨打,没钱就要被嘲笑。今天听SYG讲座的最大感受
蛋白晶体结构分析该发在哪个杂志上?施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果
结构生物学的一个优点是它是可靠的求推荐计算晶体结构rmsd的软件
外行问个关于测蛋白晶体结构的问题感觉做结构好像实用性不强
一公nature r-scretase 结构请教做晶体结构的前辈
呼唤生物版的干货试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
相关话题的讨论汇总
话题: 结构话题: 基因组话题: 神经话题: 8232话题: 实验室
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1 (共1页)
T*********8
发帖数: 1221
1
美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千

老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重

复恶霸的概念。


比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要

跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。
a*******e
发帖数: 245
2
其实你说的这个,对做结构的实验室反而是好处
结构基因组的拿了好多钱,没作出什么像样的东西,砍掉了对做结构的实验室是利好

【在 T*********8 的大作中提到】
: 美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
: ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千
: 
老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
: 中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重
: 
复恶霸的概念。


: 比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
: 老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要
: 
跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
: 是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。

M*******T
发帖数: 66
3
挺有意思的话题,估计能上10大!

【在 T*********8 的大作中提到】
: 美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
: ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千
: 
老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
: 中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重
: 
复恶霸的概念。


: 比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
: 老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要
: 
跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
: 是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。

S***J
发帖数: 1210
4
你估计没有看NIH关于为什么关闭‘大结构’计划,对于‘结构生物学实验室’与‘结
构基因组学实验室’的本质区别也没有什么了解。NIH把结构基因组的钱拿掉,我作为
结构生物学实验室的一员,不仅仅是跑十几圈那么爽,我为此整整一个月都处于贫农翻
身把歌唱的状态。
砍掉的结构基因组的钱,大部分仍会资助小的结构生物学实验室,对其他领域没什么好
处,也没什么坏处。
至于晶体结构技术的发展,你说的大方向倒是不错,只不过衰落没有那么快。而且结构
生物学的人转其他纯生物的领域,要门槛低得多。lz就不要替别人担心了,止增笑耳。

【在 T*********8 的大作中提到】
: 美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
: ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千
: 
老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
: 中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重
: 
复恶霸的概念。


: 比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
: 老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要
: 
跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
: 是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。

T*********8
发帖数: 1221
5
晶体结构的CRO,比美国化学会的CRO还容易,拿个Cn3D 一看,就知道你的质量。
你看,他死到临头还在嘴硬,嘿嘿!你这样的,跑到新泽西这里求职的,至少看过百把
个了。
医学院毕业的,转行还可以,喜欢和人打交道的可以学习一个护工,不喜欢和人打交道
的可以学习一个电工。学晶体这一行的,很难转。

【在 S***J 的大作中提到】
: 你估计没有看NIH关于为什么关闭‘大结构’计划,对于‘结构生物学实验室’与‘结
: 构基因组学实验室’的本质区别也没有什么了解。NIH把结构基因组的钱拿掉,我作为
: 结构生物学实验室的一员,不仅仅是跑十几圈那么爽,我为此整整一个月都处于贫农翻
: 身把歌唱的状态。
: 砍掉的结构基因组的钱,大部分仍会资助小的结构生物学实验室,对其他领域没什么好
: 处,也没什么坏处。
: 至于晶体结构技术的发展,你说的大方向倒是不错,只不过衰落没有那么快。而且结构
: 生物学的人转其他纯生物的领域,要门槛低得多。lz就不要替别人担心了,止增笑耳。

d******1
发帖数: 709
6
真不知道你是真的不懂,还是假装不懂。
学晶体的,算是学生物这行中,最偏数理, 最好转行,最好找工作。只要不挑不减,6
万到8万的工作随便拿。没绿卡的就另说了。

【在 T*********8 的大作中提到】
: 晶体结构的CRO,比美国化学会的CRO还容易,拿个Cn3D 一看,就知道你的质量。
: 你看,他死到临头还在嘴硬,嘿嘿!你这样的,跑到新泽西这里求职的,至少看过百把
: 个了。
: 医学院毕业的,转行还可以,喜欢和人打交道的可以学习一个护工,不喜欢和人打交道
: 的可以学习一个电工。学晶体这一行的,很难转。

m*b
发帖数: 1421
7
结构基因组的东西早该毙掉了
做结构的人都是恨得牙痒痒
几个大佬想用这个噱头搞点大钱而已
都是吃断子绝孙饭的
自己一时拿大钱爽了
手下徒子徒孙的饭碗都给搞没了

【在 T*********8 的大作中提到】
: 美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
: ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千
: 
老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
: 中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重
: 
复恶霸的概念。


: 比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
: 老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要
: 
跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
: 是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。

S***J
发帖数: 1210
8
呵呵,不是嘴硬啊,你说说生物哪个小领域进公司容易?细胞?生化?老鼠?质谱?
都是难兄难弟,就别tm装逼了,大家应该多体谅。
晶体这块的,实在没招了就转码农吧,反正都有编程基础。

【在 T*********8 的大作中提到】
: 晶体结构的CRO,比美国化学会的CRO还容易,拿个Cn3D 一看,就知道你的质量。
: 你看,他死到临头还在嘴硬,嘿嘿!你这样的,跑到新泽西这里求职的,至少看过百把
: 个了。
: 医学院毕业的,转行还可以,喜欢和人打交道的可以学习一个护工,不喜欢和人打交道
: 的可以学习一个电工。学晶体这一行的,很难转。

m*b
发帖数: 1421
9
据说最近神经比较容易进公司
几个大公司都新开了神经方面的研发

【在 S***J 的大作中提到】
: 呵呵,不是嘴硬啊,你说说生物哪个小领域进公司容易?细胞?生化?老鼠?质谱?
: 都是难兄难弟,就别tm装逼了,大家应该多体谅。
: 晶体这块的,实在没招了就转码农吧,反正都有编程基础。

S***J
发帖数: 1210
10
正好漏了神经,哈哈,谢谢提醒。
最近NIH搞得脑认知方向很火,公司也不少跟进,觉得神经生物学到了突破瓶颈的阶段
了。殊不知其他领域早就有过多次“突破瓶颈”的时刻,最好都证明不是那么乐观。
不过神经方向好找工作,为同行高兴!

【在 m*b 的大作中提到】
: 据说最近神经比较容易进公司
: 几个大公司都新开了神经方面的研发

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外行问个关于测蛋白晶体结构的问题施一公还有什么颜某某的结构生物学的意义: 就像奥运会里的举重冠军,中国包揽,但是没人关注
一公nature r-scretase 结构11G应该赶紧搞MagR的蛋白结构
呼唤生物版的干货今天听SYG讲座的最大感受
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s******c
发帖数: 331
11
赞,同样做为做结构的,觉得结构基因组就是joke,基本上没有什么方法学的重大突破
,也没有generate很多有用的结构,不过过去几年暴增的很多GPCR的结构,倒是大部分
是结构基因组资助的,这个还是很少见的,membrane protein一般来说结构基因组成功
率极低,但是偏偏最重要的药靶GPCR可以用固定的方法high throughput去做结构,这
个在工业界还是很受认可很实用的事情。
结构基因组的砍掉绝对对于做结构的单个实验室是好事,而且结构生物学paper的引用
跟做结构的没关系,没几个结构的文章会引用跟自己结构无关的其它蛋白结构,如果你
做的蛋白够重要,结构够原创,那些做相关biochemistry的,做pharmacology的,甚至
做animal的都一定会引用。
另外一方面,现在越来越少纯粹做结构生物学的实验室了,首先重要东西的结构解析
greatly depends on biochemistry,很多时候重要的结构是一些做biochemistry做的
很好的实验室的水到渠成的事情,很多传统做结构的实验室也开始发展相关的
biochemistry和cell biology的研究去推进结构的解析,另外很多时候结构只是一个开
始,大家越来越意识到based on structure可以做很多事情,以前都是某个实验室把结
构发了,其它实验室去做下游的事情,现在大家觉得为什么自己不去做下游的事情,
either recruit 有经验的postdoc去做,or collaborate with other groups,都要做
的大,做的全面,当然一部分是funding难申需要大的project的缘故,总体来说我觉得
是好事。

【在 S***J 的大作中提到】
: 你估计没有看NIH关于为什么关闭‘大结构’计划,对于‘结构生物学实验室’与‘结
: 构基因组学实验室’的本质区别也没有什么了解。NIH把结构基因组的钱拿掉,我作为
: 结构生物学实验室的一员,不仅仅是跑十几圈那么爽,我为此整整一个月都处于贫农翻
: 身把歌唱的状态。
: 砍掉的结构基因组的钱,大部分仍会资助小的结构生物学实验室,对其他领域没什么好
: 处,也没什么坏处。
: 至于晶体结构技术的发展,你说的大方向倒是不错,只不过衰落没有那么快。而且结构
: 生物学的人转其他纯生物的领域,要门槛低得多。lz就不要替别人担心了,止增笑耳。

c*********r
发帖数: 1312
12
歪楼帮做神经的LD问一下,都有哪些公司新开了关于神经方面的研发?有哪些方面的信
息?谢谢!

【在 m*b 的大作中提到】
: 据说最近神经比较容易进公司
: 几个大公司都新开了神经方面的研发

c*********r
发帖数: 1312
13
请问一下现在有哪些神经方面的工作比较好找啊?能给个方向吗?谢谢!

【在 S***J 的大作中提到】
: 正好漏了神经,哈哈,谢谢提醒。
: 最近NIH搞得脑认知方向很火,公司也不少跟进,觉得神经生物学到了突破瓶颈的阶段
: 了。殊不知其他领域早就有过多次“突破瓶颈”的时刻,最好都证明不是那么乐观。
: 不过神经方向好找工作,为同行高兴!

h********n
发帖数: 4079
14
有没有链接贴一下, 我想看看怎么回事
谢谢.
g*****1
发帖数: 666
15
正好相反,现在多数大公司都把神经,代谢和CV方向彻底砍掉了,要么现有的成功率太
低了,如神经,代谢,要么现有的药物很难再提高,如CV方向。Oncology和Immunology
现在是主流。Virology除在HIV,HCV和HBV,其它也不会有大的起色。
现在big pharma大方向就是砍人,砍项目。估计二十年内神经没戏。
big pharma的晶体学组现在处在既不会有大的发展,也不会缩小或outsourcing。测序
会outsourcing,结构不会。结构有太多的sensible information,公司决对不希望,
不trust任何 third party。

【在 c*********r 的大作中提到】
: 歪楼帮做神经的LD问一下,都有哪些公司新开了关于神经方面的研发?有哪些方面的信
: 息?谢谢!

s******c
发帖数: 331
16
这个同意,不过big pharma现在很多在扩张或成立membrane protein crystal的东西,
比如很多重要靶点的ion channels,receptors等等。

Immunology

【在 g*****1 的大作中提到】
: 正好相反,现在多数大公司都把神经,代谢和CV方向彻底砍掉了,要么现有的成功率太
: 低了,如神经,代谢,要么现有的药物很难再提高,如CV方向。Oncology和Immunology
: 现在是主流。Virology除在HIV,HCV和HBV,其它也不会有大的起色。
: 现在big pharma大方向就是砍人,砍项目。估计二十年内神经没戏。
: big pharma的晶体学组现在处在既不会有大的发展,也不会缩小或outsourcing。测序
: 会outsourcing,结构不会。结构有太多的sensible information,公司决对不希望,
: 不trust任何 third party。

c*********r
发帖数: 1312
17
哦,这样啊。看来学神经的还是待在学术界吧。

Immunology

【在 g*****1 的大作中提到】
: 正好相反,现在多数大公司都把神经,代谢和CV方向彻底砍掉了,要么现有的成功率太
: 低了,如神经,代谢,要么现有的药物很难再提高,如CV方向。Oncology和Immunology
: 现在是主流。Virology除在HIV,HCV和HBV,其它也不会有大的起色。
: 现在big pharma大方向就是砍人,砍项目。估计二十年内神经没戏。
: big pharma的晶体学组现在处在既不会有大的发展,也不会缩小或outsourcing。测序
: 会outsourcing,结构不会。结构有太多的sensible information,公司决对不希望,
: 不trust任何 third party。

g*****1
发帖数: 666
18
membrane protein crystal最近在academia的确有不小突破,不过我觉得big pharma现
在还仅仅是试探性的,谈不上扩张。多数工作是给些钱给startup或academia做,有些
interesting的结果就继续投些。重视基础研究的公司如Novartis, Gene可能自己养1-
2人也做些试探性的工作。没听说有什么真正意义的突破,各家招人的速度也不快,显
得并不积极。

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个同意,不过big pharma现在很多在扩张或成立membrane protein crystal的东西,
: 比如很多重要靶点的ion channels,receptors等等。
:
: Immunology

p****s
发帖数: 3153
19
re这个,现在搞AD的公司都死得很惨,比如礼来之类。Abeta机制好像已经证明死路了。

Immunology

【在 g*****1 的大作中提到】
: 正好相反,现在多数大公司都把神经,代谢和CV方向彻底砍掉了,要么现有的成功率太
: 低了,如神经,代谢,要么现有的药物很难再提高,如CV方向。Oncology和Immunology
: 现在是主流。Virology除在HIV,HCV和HBV,其它也不会有大的起色。
: 现在big pharma大方向就是砍人,砍项目。估计二十年内神经没戏。
: big pharma的晶体学组现在处在既不会有大的发展,也不会缩小或outsourcing。测序
: 会outsourcing,结构不会。结构有太多的sensible information,公司决对不希望,
: 不trust任何 third party。

h****9
发帖数: 36
20
GPCR结构也没有暴增吧,现在一共只有不到20个结构,平均每年2-3个。

【在 s******c 的大作中提到】
: 赞,同样做为做结构的,觉得结构基因组就是joke,基本上没有什么方法学的重大突破
: ,也没有generate很多有用的结构,不过过去几年暴增的很多GPCR的结构,倒是大部分
: 是结构基因组资助的,这个还是很少见的,membrane protein一般来说结构基因组成功
: 率极低,但是偏偏最重要的药靶GPCR可以用固定的方法high throughput去做结构,这
: 个在工业界还是很受认可很实用的事情。
: 结构基因组的砍掉绝对对于做结构的单个实验室是好事,而且结构生物学paper的引用
: 跟做结构的没关系,没几个结构的文章会引用跟自己结构无关的其它蛋白结构,如果你
: 做的蛋白够重要,结构够原创,那些做相关biochemistry的,做pharmacology的,甚至
: 做animal的都一定会引用。
: 另外一方面,现在越来越少纯粹做结构生物学的实验室了,首先重要东西的结构解析

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施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果请教做晶体结构的前辈
求推荐计算晶体结构rmsd的软件试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
感觉做结构好像实用性不强结构生物学的意义?
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d***s
发帖数: 1062
21
lz这坑挖的好!得到不少有用的信息
s****9
发帖数: 932
22
大部分的大药厂的大研发中心都在美国。
美国的NIH hypothesis driven的发grant方式确实很糟糕,真正的science需要的是
creativity,不是hypothesis。
但是不可否认的,美国的biology仍然领先全球,最优秀的人才仍然在美国。San
Francisco和Boston仍然是最clustered的biotech R&D的研发地。

【在 T*********8 的大作中提到】
: 美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
: ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千
: 
老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
: 中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重
: 
复恶霸的概念。


: 比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
: 老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要
: 
跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
: 是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。

M*******T
发帖数: 66
23
怎么做到creativity driven?

【在 s****9 的大作中提到】
: 大部分的大药厂的大研发中心都在美国。
: 美国的NIH hypothesis driven的发grant方式确实很糟糕,真正的science需要的是
: creativity,不是hypothesis。
: 但是不可否认的,美国的biology仍然领先全球,最优秀的人才仍然在美国。San
: Francisco和Boston仍然是最clustered的biotech R&D的研发地。

s****9
发帖数: 932
24
很简单,fund scientist,not proposal。可以像HHMI一样,grant一旦通过了就给20
年。

【在 M*******T 的大作中提到】
: 怎么做到creativity driven?
w******l
发帖数: 67
25
原来事情如此简单噢。

20

【在 s****9 的大作中提到】
: 很简单,fund scientist,not proposal。可以像HHMI一样,grant一旦通过了就给20
: 年。

t*****a
发帖数: 5180
26
yee-kung shit,是不是就做这个的蜜柚跟屁?

【在 T*********8 的大作中提到】
: 美国的模式是,几个恶霸把几个概念炒起来,比如晶体结构指导药物设计,NF-kB,
: ubiquitin 是药物靶点, EMT 是发病机制, 下面有几千个中国工程师来做,几十万个千
: 
老去送死,影响因子就这样上去了,和药物的革命没有任何关系。
: 中国工程师和千老的生存,取决于恶霸的兴衰。所谓千人计划,就是一些中国工程师重
: 
复恶霸的概念。


: 比如美国NIH 一直想枪毙掉晶体结构每年10亿美金的budget,上个月终于枪毙掉了,
: 老子听到后高兴的在办公室里小跑了十几圈。那晶体结构这个领域,肯定是影响因子要
: 
跌掉10倍,比研究雾霾还要低。影响因子是做的人数决定的,100亿美金砍掉,
: 是行业
性的倒毙。以后做晶体的,比测序的还惨。测序的还有市场。

l******a
发帖数: 3339
27
基本靠谱,其实就是那么几大疾病类型,手都能数出来,癌症,传染病,心脏病,免疫
类疾病,糖尿病等等

Immunology

【在 g*****1 的大作中提到】
: 正好相反,现在多数大公司都把神经,代谢和CV方向彻底砍掉了,要么现有的成功率太
: 低了,如神经,代谢,要么现有的药物很难再提高,如CV方向。Oncology和Immunology
: 现在是主流。Virology除在HIV,HCV和HBV,其它也不会有大的起色。
: 现在big pharma大方向就是砍人,砍项目。估计二十年内神经没戏。
: big pharma的晶体学组现在处在既不会有大的发展,也不会缩小或outsourcing。测序
: 会outsourcing,结构不会。结构有太多的sensible information,公司决对不希望,
: 不trust任何 third party。

L**S
发帖数: 7833
28
做结构的,呵呵

【在 S***J 的大作中提到】
: 你估计没有看NIH关于为什么关闭‘大结构’计划,对于‘结构生物学实验室’与‘结
: 构基因组学实验室’的本质区别也没有什么了解。NIH把结构基因组的钱拿掉,我作为
: 结构生物学实验室的一员,不仅仅是跑十几圈那么爽,我为此整整一个月都处于贫农翻
: 身把歌唱的状态。
: 砍掉的结构基因组的钱,大部分仍会资助小的结构生物学实验室,对其他领域没什么好
: 处,也没什么坏处。
: 至于晶体结构技术的发展,你说的大方向倒是不错,只不过衰落没有那么快。而且结构
: 生物学的人转其他纯生物的领域,要门槛低得多。lz就不要替别人担心了,止增笑耳。

n******7
发帖数: 12463
29
你们说的结构基因组是啥啊?
3D genome?
1 (共1页)
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试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?结构生物学的一个优点是它是可靠的
结构生物学的意义?外行问个关于测蛋白晶体结构的问题
上海药物所一人在nature同期发两篇文章一公nature r-scretase 结构
一个做药物的crystallographer,告诉你不必夸大结构的作用呼唤生物版的干货
老施对中国科研的误导算是没人能比了吧?施一公还有什么颜某某的结构生物学的意义: 就像奥运会里的举重冠军,中国包揽,但是没人关注
颜宁会因为Glut1结构获诺贝尔奖?11G应该赶紧搞MagR的蛋白结构
落后就要挨打,没钱就要被嘲笑。今天听SYG讲座的最大感受
蛋白晶体结构分析该发在哪个杂志上?施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果
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