由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 真诚求教外加吐槽,老板思路有问题,自己不想浪费时间,怎么办
相关主题
一公nature r-scretase 结构施的工作可能贡献两个诺奖
施一公还有什么颜某某的结构生物学的意义: 就像奥运会里的举重冠军,中国包揽,但是没人关注试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的问个蛋白结晶的问题~~
转:清华大学颜宁教授Nature新年寄语另一个旧样品的传说。
转行做cryo-EM/ET怎么样?结构生物学的一个优点是它是可靠的
看看eLife的新paper.MacKinnon 也开始用冰冻电镜了
有做电镜的吗?真没想着这么快就nature了。。。
绝对的大器晚成啊呼唤生物版的干货
相关话题的讨论汇总
话题: 老板话题: 电镜话题: nature话题: paper话题: 东西
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
b******e
发帖数: 88
1
phd三年级,结构方向,老板是物理出身,专长电镜,好人,有技术,可是实在没有什
么生物方向的insight。我从一年级开始就找了隔壁另外一个晶体大牛挂靠,现在已经
解了一个结构,老板一直对我用结晶做他的project非常支持。
之前还好,老板虽然没什么专业上的帮助,不过也不添乱,我在隔壁大牛指导下做的很
顺。现在文章送了出去,明显老板对于后续计划有了一些想法,不过这些想法实在是让
我哭笑不得。
本来那个晶体结构一出来,我就觉得其中一个功能域还有东西可挖。我当时的建议是继
续做那个功能域和另外一个分子的共结晶。这本来是一个热点,近几年cns上相关的文
章不少,结果老板第一反应是觉得风险太大,不想花太多时间和精力又要冒被人scoop
的风险,他说基本上一两个月之内就要把文章送出去。当时我用了两个星期已经纯化出
了complex,不过要我在两个月之内搞出晶体再解了结构那是不可能的,而且觉得他小
心谨慎也是对的,于是就说好,我马上写吧。
结果初稿交给他后,他老人家磨磨蹭蹭用了半年才定稿把文章送出去。这半年里面,按
照他本来的说法,是要找我们的合作者做bio的部分。但是不知道怎么搞的,过了一个
月也没动静,他解释说决定写完稿以后再通知合作者(我当时就吐血,那还要人合作者
干毛啊,总不能定稿了再补实验吧)。然后他老人家安排我做了一个同源蛋白的电镜结
构,说要一起放在paper里。先不说难度(100kD大小的分子做电镜),我完全不能理解
他的目的。好歹我也搞了一点东西出来,然后他就很高兴,说我们的data比之前别人做
的好多了。我承认是比别人做的好,可是你拿了这一团泥一样的东西,是想说明什么呢
?就这样,我宝贵的几个月扔在了水里。我真心觉得,如果我用这些时间去做我之前想
做的共结晶,说不定都能有晶体了,而不是像现在一样,一篇文章的内容零零散散没有
bio方面的内容,忐忑不安等着被据。
话说有了这些成功(?),他觉得我构建的表达系统真好用,又让我把其他的subunits
照样都来一遍。他老人家的口头禅是这样的:你去试试看啊,也许我们能发现一些有趣
的东西。到这个时候我已经严重怀疑他的指挥能力了。
几个星期前,我老板突然想起了我之前说的那个功能域,他翻了翻nature,发现过去几
年有好几篇文章说的是这个。然后就突然感兴趣了,跟我说,恩你的想法太好了,我们
马上就做,也发个nature(原话!)不过呢(重点来了),我觉得结晶还是风险太大了
,我觉得你同时也要做电镜的工作(!!!)。
我当时就傻了,我说这个功能域,再加上一个binding partner,100多kd,电镜看不清
楚吧。
他说没问题的,10几个kd的都能看(能看和看清楚是两码事你不会不知道吧),我们又
有好的reference(指我的晶体结构)。当然我知道不会有太好的分辨率,大概20A吧,
不过既然别人研究这个能发nature,说明这个很重要,我们要是搞出点data来说不定也
能发现一些有趣的东西呢(我就靠,又是这句话)。
我已经彻底不行了,简直不能相信这样水平的人能是我的老板。人家能发nature,那是
人家的data回答了很多问题。你一团20A的泥巴,能搞清调控机制么,能看清side
chain么。。。
我说:好吧,不过这个东西去年年底已经有人用nmr研究过了,提了个model出来,虽然
我不认为那个model是对的,但是似乎你老20A的电镜图既不能证明人家是对的也不能说
明人家是错的吧。。。。
然后他说:I didn't really read that paper, find that paper for me.
我还能说什么呢?我只能岔开话题,提出另外一个他可能感兴趣的东西,告诉他我们还
有很多其他东西可以试试。果然,就像小孩一样,他的注意力被吸引了。不过悲催的是
,小孩子会忘记但是他不会,他最后说,我们过两个星期好好再谈谈,这几样东西希望
我都去试试。。。。
我必须说,我们俩的谈话始终是亲切友好的,老板是好人,他没有任何恼怒或者觉得权
威受到挑战,他只是有了一些想法想让我去试试而已,同时稍稍有些不负责任罢了。
可是我得为我自己的前途考虑啊,我做的东西就希望能有产出,能发paper。我现在又
不是没有活干,共结晶的那个可以做,手上还有另外一个隔壁大牛老板的project也势
头不错。你让我花时间去陪你搞一坨泥巴出来玩玩看看,以为我脑残啊。。。再说,做
电镜搞泥巴当然也是有前途的,今年现成的就有几篇nature paper是电镜的,那个思路
明明白白放在那里了,你老又不是不知道,还让我去搞那些不着调的东西,搞毛啊。。。
我经验尚浅,吐槽一通,希望大家能给我点建议怎么样聪明的避开老板的不着调想法。
。。
H****N
发帖数: 997
2
Somrtimes you just need to do it without telling your boss. Once you get
good results, he will be happy. That is how I used to deal with my previous
boss. Three of my papers I published with him started without his knowledge.
Of course this only works with some bosses.
L*****t
发帖数: 56
3
偶然搜到这个帖子下了一跳,还以为是我两年前最困难的时候发的。那个时候情况差不
多,自己心里有一个大致思路,老板听不进去还瞎指挥,结果一点进展都没有,现有的
Data连续被Scoop两次。
后来心里明白这样不行就干脆阳奉阴违,自己感觉正确就继续往下做,有进展就第一时
间报告顺便夸老板领导有方,大家各取所需,工作效率也提高了。
l**********1
发帖数: 5204
4
上策让你老板看下这个
HHMI Nikolaus Grigorieff Brandeis University
High-resolution electron cryo-microscopy of macromolecular complexes
The Paper Rejection Repository
Nobody likes to receive a letter from the editor of your favorite journal
letting you know that your paper was rejected. Some journals have begun
including reviewers’ comments with accepted papers to make the views of
experts available to the reader. However, often the paper has been submitted
to several journals and rejected before it is finally accepted. The
rejection letters and comments are equally useful in helping to judge what
kind of papers might be acceptable to a journal, and what kind of comments
lead to rejections.
http://www.hhmi.org/research/investigators/grigorieff.html
http://www.bio.brandeis.edu/faculty/grigorieff.html
http://emlab.rose2.brandeis.edu/rejections
然后楼主和老板一起学习cryo-EM tips, then fix project/s.
中策
让你老板联系以下的任何一位搞合作攻关 for fixing project/s.
Thomas Walz, Ph.D.
Harvard Medical School
http://www.hhmi.org/news/walz_bio.html
or David J. DeRosier
Brandeis University
or
Nikolaus Grigorieff
Brandeis University
or
Stephen C. Harrison
Harvard Medical School
http://walz.med.harvard.edu/EM/
下策
让你老板推荐你去这里做剥尸猴
一切听她/他的指挥, 你就是其的第三和第四只手
http://emlab.rose2.brandeis.edu/positions
下下策 Move On 尽快换学校或换老板或bio jail break to CS
Aquaporin-0 membrane 1.8埃喽 Nature 2004 就做到了
>The 3D structure of a protein complex forming a water pore in the >cell
membrane has been determined
>at a near-atomic resolution of 1.8 Å by electron crystallography
cited from
University of Heidelberg, Germany 2008 one PhD Dissertation
web link:
http double dot
//archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/8514/1/2Doktorarbeit_Bastian_
Barton.pdf
and
Gonen T, Sliz P, Kistler J, Cheng Y, Walz T.
Aquaporin-0 membrane junctions reveal the structure of a closed water pore.
(2004).
Nature. 429: 193-7.
PubMed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15141214
t*d
发帖数: 1290
5
老板脾气这么好,试试直接点。就说你不想这么做,然后说清楚你的思路。也许他就同
意了,告诉他你愿意冒点风险。再说,就浪费几个月的时间而已,多点风险啊。

scoop

【在 b******e 的大作中提到】
: phd三年级,结构方向,老板是物理出身,专长电镜,好人,有技术,可是实在没有什
: 么生物方向的insight。我从一年级开始就找了隔壁另外一个晶体大牛挂靠,现在已经
: 解了一个结构,老板一直对我用结晶做他的project非常支持。
: 之前还好,老板虽然没什么专业上的帮助,不过也不添乱,我在隔壁大牛指导下做的很
: 顺。现在文章送了出去,明显老板对于后续计划有了一些想法,不过这些想法实在是让
: 我哭笑不得。
: 本来那个晶体结构一出来,我就觉得其中一个功能域还有东西可挖。我当时的建议是继
: 续做那个功能域和另外一个分子的共结晶。这本来是一个热点,近几年cns上相关的文
: 章不少,结果老板第一反应是觉得风险太大,不想花太多时间和精力又要冒被人scoop
: 的风险,他说基本上一两个月之内就要把文章送出去。当时我用了两个星期已经纯化出

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
呼唤生物版的干货转行做cryo-EM/ET怎么样?
假如施一公是真的理想主义者看看eLife的新paper.
SBIG: Aquaporin, the water channel - 1有做电镜的吗?
SBIG: Aquaporin, the water channel - 2绝对的大器晚成啊
一公nature r-scretase 结构施的工作可能贡献两个诺奖
施一公还有什么颜某某的结构生物学的意义: 就像奥运会里的举重冠军,中国包揽,但是没人关注试验了很多条件,还是拿不到结晶怎么办?
腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的问个蛋白结晶的问题~~
转:清华大学颜宁教授Nature新年寄语另一个旧样品的传说。
相关话题的讨论汇总
话题: 老板话题: 电镜话题: nature话题: paper话题: 东西