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Biology版 - 细胞到底怎么死的
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请教 如何诱导细胞 necrosis问个学术问题,有什么peptide在ER里聚集会导致apoptosis
请问Harvard的Yuan Junying是不是好老板?请教做apoptosis的大牛
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话题: 细胞话题: caspase话题: death话题: cell话题: autophagy
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l******n
发帖数: 298
1
caspase就是乱砍一气细胞就自己死了?激活caspase 3怎么细胞就死了,是慢慢死的还
是折磨死的还是怎么死的
有没有王晓东的学生什么的给好好解释一下。或者哪个大侠具体给科普一下
K**4
发帖数: 1015
2
呵呵,刨根揭底 和生物武器机制差不多

【在 l******n 的大作中提到】
: caspase就是乱砍一气细胞就自己死了?激活caspase 3怎么细胞就死了,是慢慢死的还
: 是折磨死的还是怎么死的
: 有没有王晓东的学生什么的给好好解释一下。或者哪个大侠具体给科普一下

v*******e
发帖数: 11604
3
apoptosis和线粒体关系很大。
C*********h
发帖数: 83
4
这是cell death领域一个重要的问题,就是cell death是如何execute的。
不论哪种cell death, 最后大家都希望找到一个enzyme,来充当这个executioner。
1)以楼主问的apoptosis为例,最简单的回答的,就是Caspase切割了重要的细胞蛋白,
导致细胞的remodeling和loss of function.
Xiaodong Wang解决的核心pathway就是Apaf1/Cytc/Caspase9/dATP->Caspase3/7->cut.
另外细胞凋亡中,一个重要的现象就是DNA fragmentation, 以此为assay, Wang纯化了
DFF45 and DFF40,这其实是个nuclease complex,负责把DNA切割成核小体大小,形成
常见的DNA ladder。
Caspase作为一个蛋白酶,也不是乱切的,切割位点也有些pattern. 有不少人研究,但
意义多大,很难说。到了Caspase activation,已经是point of no return。
参考以下文献:
Cell Death Differ. 2003 Jan;10(1):76-100.
Many cuts to ruin: a comprehensive update of caspase substrates.
Caspase Substrates and Cellular Remodeling
Annual Review of Biochemistry
Vol. 80: 1055-1087 (Volume publication date July 2011)
专门有个数据库
The CASBAH database http://www.casbah.ie/
2)另外一些death,如necrosis, necroptosis, autophagic cell death中也有
executioner的问题。有些还不甚明了。改日有机会再聊。

【在 l******n 的大作中提到】
: caspase就是乱砍一气细胞就自己死了?激活caspase 3怎么细胞就死了,是慢慢死的还
: 是折磨死的还是怎么死的
: 有没有王晓东的学生什么的给好好解释一下。或者哪个大侠具体给科普一下

j******1
发帖数: 1315
5
学习了不少,您对autophagic cell death 有什么文献推荐吗?我在实验中检测到不少
药物引起autophagy都是似乎和cell death无关。对这个很敢兴趣,但是实验室基本没
有这种基础。

cut.

【在 C*********h 的大作中提到】
: 这是cell death领域一个重要的问题,就是cell death是如何execute的。
: 不论哪种cell death, 最后大家都希望找到一个enzyme,来充当这个executioner。
: 1)以楼主问的apoptosis为例,最简单的回答的,就是Caspase切割了重要的细胞蛋白,
: 导致细胞的remodeling和loss of function.
: Xiaodong Wang解决的核心pathway就是Apaf1/Cytc/Caspase9/dATP->Caspase3/7->cut.
: 另外细胞凋亡中,一个重要的现象就是DNA fragmentation, 以此为assay, Wang纯化了
: DFF45 and DFF40,这其实是个nuclease complex,负责把DNA切割成核小体大小,形成
: 常见的DNA ladder。
: Caspase作为一个蛋白酶,也不是乱切的,切割位点也有些pattern. 有不少人研究,但
: 意义多大,很难说。到了Caspase activation,已经是point of no return。

C*********h
发帖数: 83
6
autophagy实际是个很promiscuous的phenotype
很多药物都会引起autophagy(细胞状态不好、DNA damage, mitochondria stress, ER
stress)等等。
如果不是特别重要的化合物,不建议follow.
如果某个特别的基因KO or express引起autophagy还值得一做。
另外autophagy和autophagic cell death也需要区别对待。
很多autophagy并不会引起death.

【在 j******1 的大作中提到】
: 学习了不少,您对autophagic cell death 有什么文献推荐吗?我在实验中检测到不少
: 药物引起autophagy都是似乎和cell death无关。对这个很敢兴趣,但是实验室基本没
: 有这种基础。
:
: cut.

l******n
发帖数: 298
7
谢谢楼上的。很多时候细胞死亡都是瞬时的,很快的。我们目前监测的apoptosis都是
静态的,在某一个时间点。但是细胞培养的时候是动态的,一些细胞彻底necrosis,一
些细胞aoptosiss,怎么有效的来表达呢?
还有能否给一些建议关于细胞细胞间的骨架连接和mmp 。一般细胞死亡细胞都要脱离相
互间的连接。什么细胞骨架蛋白起作用呢?
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