L****T
发帖数: 169 | 1 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
型，真是无语了。 |
m*****u
发帖数: 15526 | 2 你当初发文了么？他们的表型跟你当初看的是一回事么
shRNA
【在 L****T 的大作中提到】
: 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
: ，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
: 型，真是无语了。
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L****T
发帖数: 169 | 3 我当时没有检测到表型就没有发文。他们的表型和我当时的hypothesis是一样，用的
mESC分化protocol也都一样（都是follow一个大牛的方法），我当时除了shRNA kd，还
用了chemical inhibitors，其他几个lab用KO的mESC貌似也没有看到这个表型。
【在 m*****u 的大作中提到】
: 你当初发文了么？他们的表型跟你当初看的是一回事么
:
: shRNA
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l*******i
发帖数: 153 | 4 几个问题：
（1）你用的ESC细胞系与他们的是一样的吗？
（2）培养条件是否一样（serum还是2i/LIF）?
（3）他们是否也用了shRNA，还是KO？
（4）你是否检测了你的shRNA的效率，有时达到80%，表型也不一定能拿到。off-
target看了没？是挑稳定的KD单克隆做的实验，还是pool？
（5）这个基因对self-renewal有没有影响？
（6）对分化的影响，你与他们检测的时间点和指标是否一致？
（7）我查了今年的发表在mol cell上的几篇关于mESC的文章，不确定你指的是哪篇。
能否明示？谢谢！ |
D***a
发帖数: 516 | 5 我感觉随着生物垃圾文章越发越多，最终就是每个基因在每一种疾病里面都起作用。真
假难辨啊。
shRNA
【在 L****T 的大作中提到】
: 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
: ，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
: 型，真是无语了。
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m******5
发帖数: 1383 | 6 楼主说一下是那篇啊？
不过如果发了molecular cell我觉得几乎肯定是ko cell line. shRNA 没用
【在 l*******i 的大作中提到】
: 几个问题：
: （1）你用的ESC细胞系与他们的是一样的吗？
: （2）培养条件是否一样（serum还是2i/LIF）?
: （3）他们是否也用了shRNA，还是KO？
: （4）你是否检测了你的shRNA的效率，有时达到80%，表型也不一定能拿到。off-
: target看了没？是挑稳定的KD单克隆做的实验，还是pool？
: （5）这个基因对self-renewal有没有影响？
: （6）对分化的影响，你与他们检测的时间点和指标是否一致？
: （7）我查了今年的发表在mol cell上的几篇关于mESC的文章，不确定你指的是哪篇。
: 能否明示？谢谢！
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L****T
发帖数: 169 | 7 是啊，如果自己不是恰好也做那个玩意，还真是分不清楚真假。
【在 D***a 的大作中提到】
: 我感觉随着生物垃圾文章越发越多，最终就是每个基因在每一种疾病里面都起作用。真
: 假难辨啊。
:
: shRNA
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x****6
发帖数: 4339 | |
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L****T
发帖数: 169 | 9 多谢分享。我也是碰巧遇到这个事情，就上来吐个槽。
【在 x****6 的大作中提到】
: 在生物领域，只有10——30%的发表实验能被重复，楼主这个问题不是很正常吗？
: http://www.jove.com/blog/2012/05/03/studies-show-only-10-of-pub
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L****T
发帖数: 169 | 10 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
型，真是无语了。 |
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m*****u
发帖数: 15526 | 11 你当初发文了么？他们的表型跟你当初看的是一回事么
shRNA
【在 L****T 的大作中提到】
: 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
: ，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
: 型，真是无语了。
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L****T
发帖数: 169 | 12 我当时没有检测到表型就没有发文。他们的表型和我当时的hypothesis是一样，用的
mESC分化protocol也都一样（都是follow一个大牛的方法），我当时除了shRNA kd，还
用了chemical inhibitors，其他几个lab用KO的mESC貌似也没有看到这个表型。
【在 m*****u 的大作中提到】
: 你当初发文了么？他们的表型跟你当初看的是一回事么
:
: shRNA
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l*******i
发帖数: 153 | 13 几个问题：
（1）你用的ESC细胞系与他们的是一样的吗？
（2）培养条件是否一样（serum还是2i/LIF）?
（3）他们是否也用了shRNA，还是KO？
（4）你是否检测了你的shRNA的效率，有时达到80%，表型也不一定能拿到。off-
target看了没？是挑稳定的KD单克隆做的实验，还是pool？
（5）这个基因对self-renewal有没有影响？
（6）对分化的影响，你与他们检测的时间点和指标是否一致？
（7）我查了今年的发表在mol cell上的几篇关于mESC的文章，不确定你指的是哪篇。
能否明示？谢谢！ |
D***a
发帖数: 516 | 14 我感觉随着生物垃圾文章越发越多，最终就是每个基因在每一种疾病里面都起作用。真
假难辨啊。
shRNA
【在 L****T 的大作中提到】
: 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
: ，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
: 型，真是无语了。
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m******5
发帖数: 1383 | 15 楼主说一下是那篇啊？
不过如果发了molecular cell我觉得几乎肯定是ko cell line. shRNA 没用
【在 l*******i 的大作中提到】
: 几个问题：
: （1）你用的ESC细胞系与他们的是一样的吗？
: （2）培养条件是否一样（serum还是2i/LIF）?
: （3）他们是否也用了shRNA，还是KO？
: （4）你是否检测了你的shRNA的效率，有时达到80%，表型也不一定能拿到。off-
: target看了没？是挑稳定的KD单克隆做的实验，还是pool？
: （5）这个基因对self-renewal有没有影响？
: （6）对分化的影响，你与他们检测的时间点和指标是否一致？
: （7）我查了今年的发表在mol cell上的几篇关于mESC的文章，不确定你指的是哪篇。
: 能否明示？谢谢！
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L****T
发帖数: 169 | 16 是啊，如果自己不是恰好也做那个玩意，还真是分不清楚真假。
【在 D***a 的大作中提到】
: 我感觉随着生物垃圾文章越发越多，最终就是每个基因在每一种疾病里面都起作用。真
: 假难辨啊。
:
: shRNA
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x****6
发帖数: 4339 | |
L****T
发帖数: 169 | 18 多谢分享。我也是碰巧遇到这个事情，就上来吐个槽。
【在 x****6 的大作中提到】
: 在生物领域，只有10——30%的发表实验能被重复，楼主这个问题不是很正常吗？
: http://www.jove.com/blog/2012/05/03/studies-show-only-10-of-pub
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F*Q
发帖数: 3259 | 19 本人N(>5)年前做的被当时的老板压住没发的东西，最近开会看到课题竞争对手的实验
室展示了一个用和我当年同样的技术做的poster，他们展示的东西连结果都称不上呢。
那个实验室的老板曾经在GRC上对我的poster拍照，GRC 过后两年左右他们发了一篇
PNAS，就是把我的结果中的一部分深入做了一下而已。因为他们已经在那个课题上发表
过文章了，所以我没把他们的PNAS文章看作为剽窃。
shRNA
【在 L****T 的大作中提到】
: 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
: ，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
: 型，真是无语了。
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h**********n
发帖数: 506 | 20 楼主，这个消息对你来说应该是太好了，因为你五年前做的阴性结果可以用来发表了，
你可以把这个结果写成文章用来反驳这个人，这样你又多一篇文章，对你来说是好事
shRNA
【在 L****T 的大作中提到】
: 多年前做的一个课题——研究某基因在小鼠ES细胞分化过程中的作用，用了几个shRNA
: ，kd效果都很好，但对分化没有影响，最近居然看到有个lab发了Mol Cell，说是有表
: 型，真是无语了。
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L****T
发帖数: 169 | 21 haojietiedan的想法很好。只是发文章不是自己能完全做主，PI不肯发小paper啊。 |
t****w
发帖数: 130 | 22 所以说纯粹做分子机制的基础研究注定是要消亡的，多搞translational medicine解决
实际问题才是今后的方向
【在 D***a 的大作中提到】
: 我感觉随着生物垃圾文章越发越多，最终就是每个基因在每一种疾病里面都起作用。真
: 假难辨啊。
:
: shRNA
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i*********0
发帖数: 915 | 23 说不定血清不一样，结果都不一样。
一个differentiation的assay不能100%说明结果。要有多个assay，in vitro + in
vivo 才能下结论。要是mol cell的那个文章就是一个assay，就有可能他们select了一
个实验来解释他们的假说。
mESC differentiation 这种实验，和靠P value 吃饭 实验不一样，很多情况结果是
black and white，所以要更多的assay来支持才行。 |
S****2
发帖数: 164 | 24 问题是，又是5年多过去了，你还没有坐上PI没有自主权，除了mitbbs之外还打算有怎
么样的话语权呢
错过了K99的，就move on吧，唉
【在 L****T 的大作中提到】
: haojietiedan的想法很好。只是发文章不是自己能完全做主，PI不肯发小paper啊。
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L****T
发帖数: 169 | 25 早就翻篇了。只是感慨同样是鸡肋，有人便宜卖掉了，有人扔掉了，有人能当鱼翅卖个
好价格。
【在 S****2 的大作中提到】
: 问题是，又是5年多过去了，你还没有坐上PI没有自主权，除了mitbbs之外还打算有怎
: 么样的话语权呢
: 错过了K99的，就move on吧，唉
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h**********n
发帖数: 506 | 26 给你老板说，反正阴性数据也没有用，不如发个文章增加自己的credit
【在 L****T 的大作中提到】
: haojietiedan的想法很好。只是发文章不是自己能完全做主，PI不肯发小paper啊。
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d****i
发帖数: 2346 | 27 我看到有一篇文章，就是反驳另一篇文章的，原因是BSA是不同公司的，做出来结果就
不一样，一个有一个无，就这么简单。 |
h**********n
发帖数: 506 | 28 这个借口有点牵强啊
【在 d****i 的大作中提到】
: 我看到有一篇文章，就是反驳另一篇文章的，原因是BSA是不同公司的，做出来结果就
: 不一样，一个有一个无，就这么简单。
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