求分析deep sequence的免费软件 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 求分析deep sequence的免费软件

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m********2 发帖数: 317	1 用lenti viral vector做了个shRNA screen，测序已经做完了，现在需要个软件分析，其实应该很简单，就是看每个shRNA的读数。老板联系了一个生物信息组，他们说至少需要６个月，请问大家有没有什么免费的软件能够分析deep sequence结果万分感激
m********2 发帖数: 317	2 dingding
m********2 发帖数: 317	3 自己顶顶
k****z 发帖数: 1863	4 you have bam files ? then use IGV
d*******e 发帖数: 1649	5 随便找个mapping的软件，只算数量的话几分钟就出来了。不过做实验前就应该联系好人，那个要半年的估计自己也没做过这类分析把。

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