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Biology版 - 求助,批量引物设计:如何指定产物的GC content?
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Re: 紧急求助PCR空白对照有扩增,并且熔解曲线是单峰说明什么?
求助high GC content的real-time PCR奇怪的RT-PCR问题,只能扩增出短片段
谁来答疑一下?请教关于超量表达的克隆
如何检测PCR正反向引物之间能不能形成dimer?ChIP很难做吗?
[合集] 可以将长PCR产物送出去直接测序吗?求助土壤古细菌16S鉴定
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话题: gc话题: content话题: 引物话题: 产物话题: primer3
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j****x
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1
需要设计50对基因组扩增引物,要求是PCR产物片段大小在2Kb左右,amplicon的GC
Content需要设定在48%上下浮动5%。自用的网上的引物设计工具都没有找到针对产物GC
Content的参数设定,哪位能给指点一下?
谢谢!
w*e
发帖数: 740
2
APE 软件就有这个功能选项,免费的直接下载
j****x
发帖数: 1704
3
哥们,你说的APE是“A plasmid Editor”这个软件吧。我知道几乎左右的MB软件都能
计算GC content,用MS WORD也很方便,但是我急需的其实是引物设计工具中的一个输
出filter功能,而无需后续一个个手工选取/验证。
还是谢谢你!

【在 w*e 的大作中提到】
: APE 软件就有这个功能选项,免费的直接下载
s******e
发帖数: 163
4
用命令行的 primer3
Primer3 picks primers for PCR reactions, considering as criteria:
o oligonucleotide melting temperature, size, GC content, and primer-dimer
possibilities,
p****p
发帖数: 3360
5
Online version has GC content setting too:
http://frodo.wi.mit.edu/

【在 s******e 的大作中提到】
: 用命令行的 primer3
: Primer3 picks primers for PCR reactions, considering as criteria:
: o oligonucleotide melting temperature, size, GC content, and primer-dimer
: possibilities,

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