X******n
发帖数: 914 | 1 想换个系统做做，大家觉得zebrafish找个系统怎么样？比如说和线虫，酵母比较，有
什么优缺点？ |
l******n
发帖数: 105 | 2 跟线虫、果蝇、酵母相比，有一根脊椎，所有跟医学研究更直接相关。
跟小鼠相比，胚胎发育在体外，而且胚胎是透明的，可以直接观察胚胎发育的全过程。
缺点是世代周期太长（3个月？），跟小鼠几乎一样。
也没有定位基因敲除的常规方法（随机点突变或者插入突变方法是有的）。最近发现的
锌指核酸酶定位基因敲除的方法还没有普及，成功率也可能很低（不是每个基因都可以
用这种方法高效敲除）。
再有就是连基因组草图还没有完成。领域比较小，用这一模式生物的实验室也不多。
【在 X******n 的大作中提到】
: 想换个系统做做，大家觉得zebrafish找个系统怎么样？比如说和线虫，酵母比较，有
: 什么优缺点？
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x**w
发帖数: 112 | 3 全球5000个lab你觉得还不够多？
【在 l******n 的大作中提到】
: 跟线虫、果蝇、酵母相比，有一根脊椎，所有跟医学研究更直接相关。
: 跟小鼠相比，胚胎发育在体外，而且胚胎是透明的，可以直接观察胚胎发育的全过程。
: 缺点是世代周期太长（3个月？），跟小鼠几乎一样。
: 也没有定位基因敲除的常规方法（随机点突变或者插入突变方法是有的）。最近发现的
: 锌指核酸酶定位基因敲除的方法还没有普及，成功率也可能很低（不是每个基因都可以
: 用这种方法高效敲除）。
: 再有就是连基因组草图还没有完成。领域比较小，用这一模式生物的实验室也不多。
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l******n
发帖数: 105 | 4 我还真不知道有这么多实验室。这个数据是来自？
【在 x**w 的大作中提到】
: 全球5000个lab你觉得还不够多？
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a********k
发帖数: 2273 | 5 不可能有这么多。
【在 x**w 的大作中提到】
: 全球5000个lab你觉得还不够多？
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x**w
发帖数: 112 | 6 sorry,
5000 researchers, 450 lab @ 2008
now should be over 500 labs
http://www.dailyemerald.com/2.2358/big-fish-on-campus-1.195895 |
p*****m
发帖数: 7030 | 7 我刚知道中国有42个lab作fish community不小了
【在 x**w 的大作中提到】
: sorry,
: 5000 researchers, 450 lab @ 2008
: now should be over 500 labs
: http://www.dailyemerald.com/2.2358/big-fish-on-campus-1.195895
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x**w
发帖数: 112 | 8 感觉中国的fish lab好像有一半多是做ecology和环境毒理， 前几天的fish meeting中
国只有貌似3，4个实验室有人来 |
p*****m
发帖数: 7030 | 9 你也去了?不知道遇到你没有
【在 x**w 的大作中提到】
: 感觉中国的fish lab好像有一半多是做ecology和环境毒理， 前几天的fish meeting中
: 国只有貌似3，4个实验室有人来
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l******n
发帖数: 105 | 10 500个实验室也不少了。
【在 x**w 的大作中提到】
: sorry,
: 5000 researchers, 450 lab @ 2008
: now should be over 500 labs
: http://www.dailyemerald.com/2.2358/big-fish-on-campus-1.195895
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n***g
发帖数: 5027 | 11 这还不少啊？还有比这更少的么？
【在 l******n 的大作中提到】
: 500个实验室也不少了。
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p*****m
发帖数: 7030 | 12 不如交流一下吧 你为啥要转fish呢？你觉得fish比起其它的系统有什么好处，就你
要研究的问题而言？我要fly to fish，这次去开会也认识了几个fly to fish的人
【在 X******n 的大作中提到】
: 想换个系统做做，大家觉得zebrafish找个系统怎么样？比如说和线虫，酵母比较，有
: 什么优缺点？
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p*******r
发帖数: 4048 | 13 why not srart with you?
I am interested in fish too.
Mainly because ease of imaging.
【在 p*****m 的大作中提到】
: 不如交流一下吧 你为啥要转fish呢？你觉得fish比起其它的系统有什么好处，就你
: 要研究的问题而言？我要fly to fish，这次去开会也认识了几个fly to fish的人
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p*****m
发帖数: 7030 | 14 1是透明，这个还不光是拍个confocal或者做个ca imaging方便，而且用形态变化作
assay很容易；还有就是chemical screen方便。我主要是这俩原因。当然了 也有个
考虑是总体比较不拥挤
【在 p*******r 的大作中提到】
: why not srart with you?
: I am interested in fish too.
: Mainly because ease of imaging.
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X******n
发帖数: 914 | 15 我自己感兴趣的东西是chemical genomics，但是感觉到如果没有一个mutant library
的话，很难做得非常深入，也很难找到target。我确实看到有几篇很好的用它做筛选模
型的文章，比如Peterson lab的东东。 大家估计什么时候可以有一个象酵母一样有个
突变库呢？ |
p*****m
发帖数: 7030 | 16 Good to know (cannot type in Chinese now). I am very interested in Randy
Peterson:) The chemical screen can be very powerful in fish if combined
with measures that can be scaled up and automated.
library
【在 X******n 的大作中提到】
: 我自己感兴趣的东西是chemical genomics，但是感觉到如果没有一个mutant library
: 的话，很难做得非常深入，也很难找到target。我确实看到有几篇很好的用它做筛选模
: 型的文章，比如Peterson lab的东东。 大家估计什么时候可以有一个象酵母一样有个
: 突变库呢？
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X******n
发帖数: 914 | 17 去看了一下Peterson的背景，原来是shreiber的门下，将他的chemical genomics用到
了fish上。 |
p*****m
发帖数: 7030 | 18 He is a student of Shreiber, and postdoc of Mark Fishman. SO it is not
surprising he combined chemical screen with zebrafish:) |
X******n
发帖数: 914 | 19 我觉得Chemical proteomics也是找target一个比较有前景的方法，不知道现在SILAC或
者label free quantitative proteomics在fish里面发展的怎么样？ |
y***i
发帖数: 11639 | 20 No genome mutant library (like for yeast) exists for ANY multicellular
species.
library
【在 X******n 的大作中提到】
: 我自己感兴趣的东西是chemical genomics，但是感觉到如果没有一个mutant library
: 的话，很难做得非常深入，也很难找到target。我确实看到有几篇很好的用它做筛选模
: 型的文章，比如Peterson lab的东东。 大家估计什么时候可以有一个象酵母一样有个
: 突变库呢？
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X******n
发帖数: 914 | 21 我到是听说有几个fish的lab在做突变库。
不是说老鼠都快完成了吗。 |
y***i
发帖数: 11639 | 22 突变库很多，象yeast那样每个gene ko的没有。I think to establish such a
library is impossible for mice in near future.
【在 X******n 的大作中提到】
: 我到是听说有几个fish的lab在做突变库。
: 不是说老鼠都快完成了吗。
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p*****m
发帖数: 7030 | 23 鱼里面 别说突变体库 90年代那几个大screen出来的mutant现在没有map出来的也多
的是 这个不是问题 问题是没有很好的reverse genetics
【在 X******n 的大作中提到】
: 我到是听说有几个fish的lab在做突变库。
: 不是说老鼠都快完成了吗。
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X******n
发帖数: 914 | 24 我说的library就是一个个基因的knockout Array，听说已经开始了。 |
p*****m
发帖数: 7030 | 25 用ZFN搞得吧 不过好像是说也就cover一千来个gene
【在 X******n 的大作中提到】
: 我说的library就是一个个基因的knockout Array，听说已经开始了。
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X******n
发帖数: 914 | 26 这个就不清楚了。
大家觉得chemical genomics的模式选择什么比较好：fish， 线虫，酵母，细菌，细胞？
当然根据不同的研究问题，每个可能都有自己的优缺点。比如说研究Autophagy，Aging
，Dibetes...大家会怎么选择呢？ |
x**w
发帖数: 112 | 27 nih新的fsih facility的capacity 是25，000tanks， 据Weistien lab的人说他们
genome wided的mutagenesis已经开始了，每次上4000tank
以可以接受的效率和较低的cost在鱼里面target gene的技术估计2，3年应该可以成熟了 |
x**w
发帖数: 112 | 28 恩那
不过我们是小虾米，可能我知道你你不知道我。。呵呵。。
你现在在国内做鱼？要不站内短信交流一下。。呵呵。。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 你也去了?不知道遇到你没有
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