U******u
发帖数: 5829 | 1 给爱抱怨哭诉的生物WSNV们--一个非法移民老墨的故事
我时不时来生物版看看，因为我来北美也做了10年的科研，我自己觉得我有兴趣但
没有大的出路，也不是我和我的家庭的晚年的理想归途。于是，我40岁开始做跳槽
努力，虽然勉强过了USMLE，混进了住院，但我尽了最大努力做好，近50岁时从新开
始当医生。至少，我和我家人不再为养老发愁了，这里就不说那些悬壶济世治病救
人的高尚话语了。
我就不明白，要是真对科学感兴趣，愿意献身，老哭诉什么？如果不甘心，不请愿，
那这个自由世界有得是机会，你自己去努力总有可能改变自己不满意的现状的。即
使最差，你总是去努力过了。
人家老墨干餐馆、加油站，清洁工，也嗨皮得很，更有俺翻译的这个故事的精英。
而在这个各个牛B哄哄的大陆精英版里，看到的就是鬼哭狼嚎抱怨不休。俺来几次贴
点鼓励和建议的帖，总有那几个牛B到连俺的帖子的目的都看不懂，愣要说俺来显摆
暴发户的。
靠，就尔 等这水平，估计也就配在LAB里哭鼻子牢骚养耗子跑PCR了。
俺从来都是真人上网，当个普普通通的病理医生很满足，但我深知作为出来的学医
人在LAB是被严重剥削和压迫的，是与其身份不相符的，是有最... 阅读全帖 |
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U******u
发帖数: 5829 | 2 Terra Firma — A Journey from Migrant Farm Labor
to Neurosurgery
Alfredo Quiñones-Hinojosa, M.D.
http://content.nejm.org/cgi/reprint/357/6/529.pdf
“You will spend the rest of
your life working in the
fields,” my cousin told me when
I arrived in the United States in
the mid-1980s. This fate indeed
appeared likely: a 19-
year-old illegal migrant
farm worker, I
had no English language
skills and no
dependable means of
support. I had grown
up in a small Mexican
farming community,
where I began... 阅读全帖 |
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n*********e
发帖数: 135 | 3 NIBR做Neuroscience的很少，但是postdoc也许可以做。NIBR的研究以Pathway为主，
DMP
（Development and Molecular Pathway)有最多的postdoc. 强调的是集中研究一个
pathway，最后发现和啥疾病相关，再转到相关的DA （disease area）。Function
Group给所
有的DA提供技术帮助，有很多的合作。
我现在就在 NIBR cambridge 做博后，觉得还不错，有事可以给我发站内信，我尽量回
答。 |
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n*********m
发帖数: 38 | 4 Look his publication
Conversion of D-ribulose 5-phosphate to D-xylulose 5-phosphate: new insights
from structural and biochemical studies on human RPE.
Liang W, Ouyang S, Shaw N, Joachimiak A, Zhang R, Liu ZJ.
FASEB J. 2011 Feb;25(2):497-504. Epub 2010 Oct 5.
PMID:
20923965
[PubMed - indexed for MEDLINE]
Related citations
2.
Structural basis for the inhibition of human 5,10-methenyltetrahydrofolate
synthetase by N10-substituted folate analogues.
Wu D, Li Y, Song G, Cheng C, Zhang R, Joac... 阅读全帖 |
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A****A
发帖数: 16 | 5 目前的观点是，HR和NHEJ是在DNA双链断裂修复中互相竞争的pathways。如果能够有效
的抑制NHEJ,HR的频率有可能会有大幅度的提升。目前，一些labs主要通过knock out或
者knock down NHEJ中几个关键player， 比如，Ku70， Ku80 以及Ligase4，来进行验
证。比较convincing的data有Dana Carroll在果蝇的研究，以及Eric Hendrickson在
mammalian cell line中的研究。Paper 如下:
Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Jun 24;105(25):8703-8. Epub 2008 Jun 18.
Ku70, an essential gene, modulates the frequency of rAAV-mediated gene
targeting in human somatic cells.
Fattah FJ, Lichter NF, Fattah KR, Oh S, Hendrickson EA.
Genetics. 2009 Jul;1... 阅读全帖 |
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B*D
发帖数: 5016 | 6 对于一个复杂系统，微观层面的因果联系是没有意义的（或者不说这么绝对
，是不能用来推导宏观行为的）
比如说pathway network的研究，我们就假设今天的技术牛逼了，可以把
所有基因的表达通路完全搞清楚，且假设我们能制造任意药物分子注入到
人体的任何部位。请问你，我们能制造出药到病除的药物吗？
请看如下一个例子
我们知道电阻R和电压电流的关系，V=IR。现在给你一个一百亿各种阻值的
电阻复杂互联的网络，网络图给你，并允许你用任意手段添加或者删除电阻
请问，我指定两个端点输入一个特定的V值，希望在另外两个指定的端点之
间得到一个特定的I值，你能帮我做到吗？ :)
请问，假如你知道了全部的pathway network，再给你一个药物分
子，
你能得知这个分子对人体宏观的作用吗？肯定得不到“全部”作用。运气好
能得到一些具备我们所希望的效果的分子。然后依赖临床n期反馈，对
吧。:)
可惜啊，绝大部分分子一临床，就什么都没了，99%连老鼠身上都出不来效
果，对吧。即使弄出来的，临床过了，应用几年，实验基数大了之后也发现有巨大副作
用。这使得生物医学研究烧钱烧到吐血，但是效率很低。于是我们... 阅读全帖 |
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B*D
发帖数: 5016 | 7 对于一个复杂系统，微观层面的因果联系是没有意义的（或者不说这么绝对
，是不能用来推导宏观行为的）
比如说pathway network的研究，我们就假设今天的技术牛逼了，可以把
所有基因的表达通路完全搞清楚，且假设我们能制造任意药物分子注入到
人体的任何部位。请问你，我们能制造出药到病除的药物吗？
请看如下一个例子
我们知道电阻R和电压电流的关系，V=IR。现在给你一个一百亿各种阻值的
电阻复杂互联的网络，网络图给你，并允许你用任意手段添加或者删除电阻
请问，我指定两个端点输入一个特定的V值，希望在另外两个指定的端点之
间得到一个特定的I值，你能帮我做到吗？ :)
请问，假如你知道了全部的pathway network，再给你一个药物分
子，
你能得知这个分子对人体宏观的作用吗？肯定得不到“全部”作用。运气好
能得到一些具备我们所希望的效果的分子。然后依赖临床n期反馈，对
吧。:)
可惜啊，绝大部分分子一临床，就什么都没了，99%连老鼠身上都出不来效
果，对吧。即使弄出来的，临床过了，应用几年，实验基数大了之后也发现有巨大副作
用。这使得生物医学研究烧钱烧到吐血，但是效率很低。于是我们... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 8 谢谢建议啊，但是我们不想强调这个双向开关。因为我们的文章里其实没有特别详细的
排除该蛋白对pathway A有没有影响。要证明一个东西没有影响要比证明一个东西有影
响难度高很多。因为有影响的话，看到了就是看到了。但是要证明没有影响的话是非常
困难的。
我们文章的新意在于那个蛋白大家以前都不知道它对pathway B竟然是有作用的。
所以我们想要强调这一点，而把pathway A 扔下不管，只在supplemental data 里面说我们“没有看见”它，但是绝口不说一定没有它。
路。 |
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D*a
发帖数: 6830 | 9 额。。。你那个标题也没有反应出功能测试阿。
pathway B
这样呢。
一个问题，那个zzz formation跟 pathway A有关么，如果没关系的话，我觉得对一个
general的journal，zzz formation比 pathway B更大众化些。不过这个也许是因为我
不懂细胞领域的缘故。 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 10 这个reproduction和aging的casual relationship 现在也只在线虫里仔细做过吧。
我的一个想法是，aging到底是适应性的（从而在生物学上有专门的pathway控制）还是
非适应性的（就是一堆random的gene会导致aging，当然这个不是说没有pathway可以用
来延缓／加速衰老）。如果是前者那么我们可以指望最终搞出一个framework解释aging
是怎么回事，如果是后者的话我们也就能指望找到些pathway改变aging性状，但是却不
能解释aging本身（因为每个个体aging的原因都有可能是不一样的）
aging people似乎一般都倾向前者，不过我不知道有什么很有说服力的argument。好像
某天看到cynthia kenyon说，看，这么多物种，有的能活几天，有的能活几十年上百年
，哪怕他们生活环境啊体型啊差不多，这说明aging一定是由精确的genetic
regulation的，我觉得这个站不住脚。
reproduction |
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s*******s
发帖数: 623 | 11 谁叫人家是名人呢～
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22123987
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Nov 28. [Epub ahead of print]
Synthesis of three advanced biofuels from ionic liquid-pretreated
switchgrass using engineered Escherichia coli.
Bokinsky G, Peralta-Yahya PP, George A, Holmes BM, Steen EJ, Dietrich J,
Soon Lee T, Tullman-Ercek D, Voigt CA, Simmons BA, Keasling JD.
Source
Joint BioEnergy Institute, 5885 Hollis Avenue, Emeryville, CA 94608.
Abstract
One approach to reducing the costs of advanced bio... 阅读全帖 |
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r*****t
发帖数: 4793 | 12 and this one
Wiley Interdiscip Rev RNA. 2011 Nov 15. doi: 10.1002/wrna.113. [Epub ahead
of print]
Diversity of animal small RNA pathways and their biological utility.
Okamura K.
Source
Department of Developmental Biology, Sloan-Kettering Institute, New York, NY
, USA. o******[email protected].
Abstract
Higher eukaryotes employ extensive post-transcriptional gene regulation to
accomplish fine control of gene expression. The microRNA (miRNA) family
plays important roles in the post-transcriptional gene ... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 13 sure
搞GWAS SNP RNA-seq 必看的 references:
@ARTICLE{Holmans09,
AUTHOR = {P. Holmans and E. K. Green and J. S. Pahwa and M. A.
Ferreira and S. M. Purcell and P. Sklar and {the Wellcome Trust Case-
Control Consortium} and M. J. Owen and M. C. {O'Donovan} and N. Craddock},
TITLE = {Gene Ontology Analysis of GWA Study Data Sets
Provides Insights into the Biology of Bipolar Disorder},
JOURNAL = {The American Journal of Human Genetics},
YEAR = ... 阅读全帖 |
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g*********3
发帖数: 177 | 14 我本人并不是说NGS对cancer研究没用，只是说不会产生革命性的突破~
1）NGS穷举出mutation不会很难，这也是NGS牛逼的地方，但是真正找到driver很难
2）在function研究方面，无论是RNA-Seq还是ChIP-Seq说的都是一个故事：
transcription，一些初步的数据已经证实protein level翻译水平的贡献率大概是2/3,
另外我觉得NGS的定量分析和microarray一样很丑陋
3）我比较赞同进化的观点，因为cancer不能完全归功于mutation~ LS有两位在讨论
reprogrammed signal pathway~ 这个当然有mutation的例子，但是和mutation无关的
例子简直是太多了~ e.g.a lot of weird metabolism pathways will totally rewire
the epigenetic profiling. Some abnormal metabolites can change the pathway.
.....the interaction between dif... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 15 If Human
try Netpath
//www.netpath.org/
if mouse or rat
try David
//idconverter.bioinfo.cnio.es/
Protein Level
SwissProt
Taken from Ensembl Embl
Taken from Ensembl PDB id
Taken from Ensembl IPI
Taken from Ensembl
OMIM*
Taken from Ensembl
GO
Taken from Ensembl KEGG Pathways
Taken from KEGG Reactome Pathway
Taken from Reactome Reactome Reaction
Taken from Reactome
PubMed id
Taken from NCBI
or
//david.abcc.ncifcrf.gov/conversion.jsp
if crop ... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 16 Please refer
Swedish Umeå Universitet. [2007] one PhD Dissertation
title:
Studies of phosphatidylinositol 3 kinase (PI3K) signaling pathway in
mammalian ovarian follicle activation and development
University dissertation from Umeå : Medicinsk kemi och biofysik
AUTHOR: Singareddy Rajareddy
KEYWORDS: oocyte; follicular development; P13K pathway; Medical Biochemistry
; medicinsk biokemi;
ABSTRACT: ignored and (iii) the overactivated follicles in p27-/- ovaries
are depleted in early adul... 阅读全帖 |
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o**d
发帖数: 3080 | 17 The paper claimed NTCP was functional receptor for HBV, but they did not
claim it would be the only one. I believe there will be more proteins or
molecules involved in HBV infection which are liver specific. Lots of papers
in CNS reported that molecles in TLR7/8/9 pathway, RIG pathway and MAVs
pathway etc are essential for virus infection, would you say all of those
papers are not really solid or convincing?
You can not solve all puzzles in one paper.
papers |
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o**d
发帖数: 3080 | 18 The paper claimed NTCP was functional receptor for HBV, but they did not
claim it would be the only one. I believe there will be more proteins or
molecules involved in HBV infection which are liver specific. Lots of papers
in CNS reported that molecles in TLR7/8/9 pathway, RIG pathway and MAVs
pathway etc are essential for virus infection, would you say all of those
papers are not really solid or convincing?
You can not solve all puzzles in one paper.
papers |
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i*********0
发帖数: 915 | 19 我们在做一个general pathway上的一个gene，到目前业界还没有这个pathway的生物学
意义的报道（主要是因为这个pathway上的gene ko都是胚胎致死）。小鼠，in vitro
和in vivo的loss of function和rescue的实验我一个人做了。idea全新，但是无法找
到一个下游的特定target 去调控KO的生物学表型。
这样的data能投啥杂志比较好。
虽然本人也看到elife，communication啥的，不过老板基本上不会同意。 |
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b*******n
发帖数: 38 | 20 不是做signaling pathway出身的，想求教做这两个pathway的高人问问：针对这两个
pathways有什么比较常用，特异性强的inhibitors吗？一般从哪家买质量比较稳定？多
谢多谢！ |
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l********n
发帖数: 260 | 22 揭露臧敬五在新闻媒体上的谎言——兼评其JCI论文
作者：胆大妄为
方舟子先生，
你好！本人注意到臧敬五在很多新闻媒体上对其作为通讯作者发表在JCI上
的论文加以宣传后，翻阅了这篇论文（1），发现臧敬五胆大妄为，编造谎言，
欺骗中国新闻媒体，应予以揭露。
先看二篇臧敬五在媒体上的宣传：
“骨桥蛋白”是引发类风湿性关节炎的顽凶
新华网上海３月２日电（胡德荣、仇逸）严重影响人类健康和生活质量的类
风湿性关节炎（注：rheumatoid arthritis，RA）研究获得重大突破性进展。我
国科研人员在国际上第一次阐明了骨桥蛋白（注：osteopontin ，OPN）在类风
湿性关节炎发病中的作用，发现“骨桥蛋白”是引发类风湿性关节炎的顽凶，为
治疗类风湿性关节炎找到了临床手段和药物靶点。……
http://www.stcsm.gov.cn/news/detail.asp?pid=64857
我专家突破类风湿关节炎治疗世界难题
上海分院
日前，中国科学院上海生命科学研究院健康科学中心主任臧敬五教授，带领
科研人员完成了“骨桥蛋白在类风湿性关节炎中的病理机制”研究，其论文已刊
登在3月2日出版的... 阅读全帖 |
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n***3
发帖数: 663 | 23 套路性很强啊。先发现个新的innate immune sensor, 然后用纯biochemical method研
究pathway, 只要是complete story, 发CNS没问题。紧接着，用各种pathogen做个
disease model, 然后把这个pathway再做一遍，结论是这个pathway对这种pathogen的
免疫识别很重要，然后这个文章发个Nat Immunol.
这种套路又很多人在用，但是James Chen把它用的炉火纯青，把这个类型的story拆成3
个paper, 而且还都是CNS. 当然了，估计也就是Science能给发，Nature 应该不会。 |
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l******u
发帖数: 936 | 24 It is totally different things. The future direction could be systematically
combining CRISPR/Cas, Cre-lox, and tet-on/off technique to temporally and
spatially switch on and off different genes in specific pathway or study the
crosstalk between pathways using the methods, the candidate genes/pathways
should be from the data mining using the public human omics data base, for
example TCGA, ICGC ...... |
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s******a
发帖数: 252 | 25 I have written reviews on pathway analysis. Pathway, GO and gene sets
analyses are
just bunch of statistical methods. Like any statistical method, it depends
on how you use it and interpret it. Scientific publications often demand
evidence beyond a single statistical method.
One should consider both the quality of gene sets and the underlying
statistical method. GO is often less specific than pathway analysis. MsigDB
(database behind GSEA) is getting too big - one should be careful too. The
type... 阅读全帖 |
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F*Q
发帖数: 3259 | 26 我的理解任何生物过程都可以算作程序化的，也就是有序地遵循某些特定的pathways，
那些pathways不是无序或随机完成的。程序化似乎还有一层意思，就是只要pathway中
某一步（通常是第一步）开启，后面的步骤就不可仪避免而且通常是不可逆转。不知道
我的理解对不对。 |
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g*********3
发帖数: 177 | 27 Just my opinion/impression:
1) How to define "TCA is inhibited":
Sometimes it is not totally inhibited in that whole TCA Cycle. It has
another name: Truncated TCA cycle.
2) as xhzhou said: the intermediate products in glycolysis can enter into
other pathways---"whatever pathways"---synthesized into "macromolecules".
The "whatever pathways" & "macromolecules" are hot filed, which is more
complex than the textbook. Many of them are not discovered yet and may be
tumor-specific SUCH as the oncometab... 阅读全帖 |
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z*t
发帖数: 863 | 28 whatever pathways很可能是正常细胞或者组织也利用的pathway（也就是说是tumor
metabolism的副产物），只能说依赖程度会有不同，针对这些whatever pathway做
target最大的问题就是毒性的问题，毕竟cancer还没有牛逼到自己生生造出来几个
functional gene的水平，想想第一代化疗药不都是抗代谢物嘛，比如氨甲喋呤，5-FU
之类的。当然idh1/2这种neomorphic mutation就另外算了
does |
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w********u
发帖数: 20 | 29 说的挺好的～ 我非常喜欢precision medicine~ YY一下～
precision medicine （PM） 主要的aim就是通过genomic/genetic analysis来 帮助
临床诊断， 临床治疗指南，推动 靶向治疗药物的研发。 PM有希望 完全改变临床 癌
症诊断 和 治疗的指南。
接下来的20年，NIH NCI 会往PM里面扔很多钱，估计PI们来申请 PM相关的科研，主要
的目的可能会有几个方向：
1. 哪些突变 容易引起某系癌症？ （如同bmwcar说的）但是，这个领域，已经基本上
被挖光了。。。 类似BCL-ABL 的 determinant gene 导致 的 癌症，估计已经发现的
差不多了 （BRCA，VHL，BCL-ABL, NF1, NF2,........ 一大堆）。
2. 哪些 突变/genetic background 让病人 的肿瘤 对 某些化疗药 更sensitive？ 那
些让病人的肿瘤 对 化疗药物 resistant? （目前 相同 肿瘤病人 几乎接受的是一样
的standard的化疗...）
3. 哪些 突变/genetic ... 阅读全帖 |
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r******g
发帖数: 600 | 30 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 ext... 阅读全帖 |
|
b****r
发帖数: 17995 | 31
懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
--你不能把眼球停留在眼前，应该放眼10年以后，你职业生涯的成熟期。100，000人一
例患者，全世界有多少患者？数十万！测序技术的普及以及互联网，在几年后就会把这
几十万人基本... 阅读全帖 |
|
w********u
发帖数: 20 | 32 说的挺好的～ 我非常喜欢precision medicine~ YY一下～
precision medicine （PM） 主要的aim就是通过genomic/genetic analysis来 帮助
临床诊断， 临床治疗指南，推动 靶向治疗药物的研发。 PM有希望 完全改变临床 癌
症诊断 和 治疗的指南。
接下来的20年，NIH NCI 会往PM里面扔很多钱，估计PI们来申请 PM相关的科研，主要
的目的可能会有几个方向：
1. 哪些突变 容易引起某系癌症？ （如同bmwcar说的）但是，这个领域，已经基本上
被挖光了。。。 类似BCL-ABL 的 determinant gene 导致 的 癌症，估计已经发现的
差不多了 （BRCA，VHL，BCL-ABL, NF1, NF2,........ 一大堆）。
2. 哪些 突变/genetic background 让病人 的肿瘤 对 某些化疗药 更sensitive？ 那
些让病人的肿瘤 对 化疗药物 resistant? （目前 相同 肿瘤病人 几乎接受的是一样
的standard的化疗...）
3. 哪些 突变/genetic ... 阅读全帖 |
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r******g
发帖数: 600 | 33 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 ext... 阅读全帖 |
|
b****r
发帖数: 17995 | 34
懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
--你不能把眼球停留在眼前，应该放眼10年以后，你职业生涯的成熟期。100，000人一
例患者，全世界有多少患者？数十万！测序技术的普及以及互联网，在几年后就会把这
几十万人基本... 阅读全帖 |
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l********n
发帖数: 260 | 35 1. Zhang P, Wei Y, Wang L, Debeb BG, Yuan Y, Zhang J, Yuan J, Wang M,
Chen D, Sun Y, Woodward W, Liu Y, Dean DC, Liang H, Hu Y, Ang KK, Hung MC,
Chen J, Ma L. ATM-mediated stabilization of ZEB1 promotes DNA damage
response and radioresistance through CHK1. Nat Cell Biol. In Press.
2. Chen D, Sun Y, Yuan Y, Han Z, Zhang P, Zhang J, You MJ, Teruya-
Feldstein J, Wang M, Gupta S, Hung MC, Liang H, Ma L. miR-100 induces
epithelial-mesenchymal transition but suppresses tumorigenesis, migration
a... 阅读全帖 |
|
n*********n
发帖数: 1534 | 36 我和你讨论过组学的问题吧？记得吗？
当然你后来没有继续那个话题
现在回到那个话题好了
你既然知道这么多生物学科的专业名词，说明素质教育普及的不错
生物学科领域内，每年发表的那么多论文，真正的好论文，找到比较确实的东西
的论文，1%~5%，你承认么？其他的基本都是垃圾，这不是我说的，这个是发现
DNA双螺旋的人说的，你应该认识吧？！
重复劳动也好，胡言乱语也好，胡乱解释数据也好
但是不管是胡诌还是真材实料的结果，基本都是基于一个网络的某个点
于是科学家发现，点不行，要到面，于是有了pathway的研究
面还不够，要到网络甚至是全局，于是有了omics的出现
omics现在发展到什么份上了呢？
就是拿omics的数据找你关心的pathway和点，解决网络，解决调控，解决应激
或者做engineering，都解决了吗？far away from the final purpose
举个简单的例子，你知道一棵植物是怎么从小到大长大的吗？哪些因素能影响
它，为什么影响它，怎么影响它？不知道，没人知道，我们可以说一个点，我们
可以说一个化合物，我们可以说一条pathway，但是我们不知道怎么把这些 |
|
t****o
发帖数: 342 | 37 # Antidromic CMTs are wide and potentially faster because of the relatively
short refractory period of most accessory pathways. They are termed
antidromic because anterograde transmission occurs down the accessory
pathway, creating preexcitation of the ventricle adjacent to it. These
dysrhythmias are regular due to the nature of the circus movement.
# The accessory pathways in antidromic CMTs conduct anterograde from the
atria to the ventricles and are likely to have the classic delta wave
appea |
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k********d
发帖数: 78 | 38 在美国，Radiology应该算是个挺热门的专业吧，life style好，pay的高。虽然近年来
受经济的影响，job market有下降的趋势，但如果不挑地方，还是不太难找的——认识
一个土耳其医生，考过board之后，在Ohio找到一份工作，年薪37.5万，没有call，每
年一个月的假期。Private practice和Interventional radiologist还会高些......
这些优点，也导致了大量优秀AMG涌入这个专业，使得IMG很难申请Radiology的住院医
位置。曾经看到过一所大学医院的ranking list，很多AMG candidate是名校毕业、
double 99，有research experience，有paper，整个package很强。
与此同时，还有另外一个有趣的现象：做这个专业的印度人、土耳其人从来就没少过，
住院医、fellow，总能看到他们。如果他们可以，CMG当然也可以。
因为对Radiology专业有点点肤浅的了解，趁现在还有时间，跟大家分享一下这些年来
我的观察和体会——这个圈子说小不小，说大可也不大，如果有感兴趣的同... 阅读全帖 |
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k********d
发帖数: 78 | 39 在美国，Radiology应该算是个挺热门的专业吧，life style好，pay的高。虽然近年来
受经济的影响，job market有下降的趋势，但如果不挑地方，还是不太难找的——认识
一个土耳其医生，考过board之后，在Ohio找到一份工作，年薪37.5万，没有call，每
年一个月的假期。Private practice和Interventional radiologist还会高些......
这些优点，也导致了大量优秀AMG涌入这个专业，使得IMG很难申请Radiology的住院医
位置。曾经看到过一所大学医院的ranking list，很多AMG candidate是名校毕业、
double 99，有research experience，有paper，整个package很强。
与此同时，还有另外一个有趣的现象：做这个专业的印度人、土耳其人从来就没少过，
住院医、fellow，总能看到他们。如果他们可以，CMG当然也可以。
因为对Radiology专业有点点肤浅的了解，趁现在还有时间，跟大家分享一下这些年来
我的观察和体会——这个圈子说小不小，说大可也不大，如果有感兴趣的同... 阅读全帖 |
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J*********4
发帖数: 1274 | 40 考完Step1没有马上写考经, 怕我的非典型准备经历误导别人.
今天拿到成绩了. 回想一年的准备, 从麦地得到太多的帮助. 如果没有这块宝地, 困难
会大很多, 后果会很严重……真心感谢历任班务帮助我们耕耘这块宝地. 也把我几方面
的一些感受(教训+体会)汇报给大家, 希望有所启发(谈不上帮助), 作为对新班务的支
持.
1.如何搞定病理
2.关于题库 (try to master the principle)
3.考试的一些考点和经历
4.记忆和口诀(esp. for old CMG like me)
5.others
我的第一点教训: 一定要全部仔细阅读精华区和前辈的考经!!!
我开始时读了一些, 但没有全部读. 一定要常翻看前辈的经验----在准备的不同阶段,
都有不同新的体会. 远的如Emma, hmis, ….近的如 DaobanID, Jeff…… (恕不一一列
举, 在此多谢你们的宝贵经验!). 一定要多读啊!
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YOG-18年, 国内硕士, USA PHD, full-time postdoc (bas... 阅读全帖 |
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t******a
发帖数: 408 | 41 应版主的吩咐，把考经的第一部分又重贴一次。
祝还在备考的同学都能取得好成绩！
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发信人: JennyGao424 (Jenny), 信区: MedicalCareer
标 题: 代tangpusa发考经：step1/252, 回报麦地考经, 1. 如何搞定病理
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 4 09:07:50 2013, 美东)
考完Step1没有马上写考经, 怕我的非典型准备经历误导别人.
今天拿到成绩了. 回想一年的准备, 从麦地得到太多的帮助. 如果没有这块宝地, 困难
会大很多, 后果会很严重……真心感谢历任班务帮助我们耕耘这块宝地. 也把我几方面
的一些感受(教训+体会)汇报给大家, 希望有所启发(谈不上帮助), 作为对新班务的支
持.
1.如何搞定病理
http://www.mitbbs.com/article_t/MedicalCareer/31531335.html
2.关于题库 (try to master the principle)
3.考试的一些考点和经历
http... 阅读全帖 |
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f******s
发帖数: 288 | 42 不能说是变长了吧，原本生物药是没有保护期的，但是对生物仿制药来说，在美国，也
没有相应的pathway批准，所以，应该说“保护期”是无限的，美国到现在为止也没有
正式意义的生物仿制药。
其他很多国家，比如欧洲，就有相应的pathway，所以就有不少生物仿制药在市场上。
这样，fda面对的压力就一直比较大，所以横竖都要出个办法来。以前还可以拖着，现
在这个bill 被加到医疗改革里了，fda 就必须要想办法了。不过说道这个保护期的问
题，因为generic 行业都希望保护期短些，比如和化学药一样，也是5年。然后biotech
不干，说15年。obama 说7年吧。后来根医改扯到一起去了，house 和senate 通过的
amendment都说 12年。这就是现在最后通过的保护期，12年。不过，现在市面上很多生
物药早过了12年了。
fda会做什么，是马上出新的regulation么，什么时候能开始执行，现在说太早了。这
个就根80年代的hatchman－wax 法案让fda出台了相应的化学仿制药的pathway类似，法
规给了一个方向，具体执行是一个慢慢调整的过程。
所以近几年这个生物 |
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m****s
发帖数: 18160 | 43 ☆─────────────────────────────────────☆
walkingtall (步步高) 于 (Wed May 25 17:33:31 2011, 美东) 提到:
[英文版名]：medical device
[中文版名]：医疗器械
[所属讨论区]：学术学科
[申请理由]：医疗器械(Medical device)是一个涵盖工程和自然科学的交叉学科, 比如
生物医学, 生物工程, 化学, 药剂药学, 高分子 材料, 微电子, 精密仪器等等. 除
了基础研究, regulatory pathway 和传统制药和生物制药也不尽相同. 大部分理工科
专业都可以在此领域找到合适的发展方向. 今建议建立medical device版, 一起交流,
共享信息, 帮助职业发展.
[治版纲领]：share, discuss and learn
[是否申请版主]：是
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kaylaxu (人生如戏) 于 (Wed May 25 17:33:55 2011, 美东) 提到:
sp... 阅读全帖 |
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h********0
发帖数: 944 | 44 Following the reform of the drug and device approval system by China’s
State Council in August,1 the China Food and Drug Administration (“CFDA”)
has finally unveiled its implementation policies regarding improvements to
the drug approval system, with the November 11, 2015 release of the Circular
Concerning Several Policies on Drug Registration Review and Approval (CFDA
Circular [2015] No. 230, the “No. 230 Circular”) and several draft
implementation measures. These documents set the stage for th... 阅读全帖 |
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h********0
发帖数: 944 | 45 Following the reform of the drug and device approval system by China’s
State Council in August,1 the China Food and Drug Administration (“CFDA”)
has finally unveiled its implementation policies regarding improvements to
the drug approval system, with the November 11, 2015 release of the Circular
Concerning Several Policies on Drug Registration Review and Approval (CFDA
Circular [2015] No. 230, the “No. 230 Circular”) and several draft
implementation measures. These documents set the stage for th... 阅读全帖 |
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y*****l
发帖数: 5997 | 46 1月有个会议，这个最近有什么炒点吗？
Exelixis reports encouraging data from Phase II MBC trial
4 days 2 hours 36 minutes ago - Datamonitor via Comtex
Exelixis, Inc., a biotechnology company, has reported positive preliminary
data from a cohort of 45 patients with metastatic breast cancer, or MBC,
participating in the ongoing cabozantinib Phase II randomized
discontinuation trial, or RDT.
As of the October 15, 2011 data cut-off, 45 patients with previously treated
estrogen receptor-positive, triple negative, or in... 阅读全帖 |
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b***1
发帖数: 668 | 47 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bixu1 (2-39), 信区: Military
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:20:09 2011, 美东)
◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者：知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene，为了取得投资，他通过北大女教师魏丽萍，找
到她老公、巨有钱的张帆（红杉资本中国基金创始人）。
王晓东做所长的研究所是国家研究所（National Institute），王晓东聘魏
丽萍担任北京生命科学研究所资深研究员，给予高薪和上千万研究经费。
王晓东没有经过北京生命科学研究所公开演讲和选拔的正常途径，私自聘请
魏丽萍。
魏丽萍根本达不到北京生命科学研究员的资格，更不要说资深研究员。研究
员要通过两次国际评审，经过高级研究员、资深研究员。
北京生命科学研究所... 阅读全帖 |
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s******n
发帖数: 518 | 48 https://www.nytimes.com/2015/10/25/opinion/sunday/with-gmo-policies-europe-
turns-against-science.html
With G.M.O. Policies, Europe Turns Against Science
By MARK LYNASOCT. 24, 2015
A cornfield near Roquettes, France, after hundreds of activists uprooted
genetically modified plants to replace them with organic ones in May 2014.
Credit Pascal Pavani/Agence France-Presse — Getty Images
CALL it the “Coalition of the Ignorant.” By the first week of October, 17
European countries — including Austria, ... 阅读全帖 |
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g***j
发帖数: 40861 | 49 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: gshjj (各输己键), 信区: Biology
标 题: Tough Lessons From Golden Rice 不错的转基因故事
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Mar 2 22:51:41 2011, 美东)
Tough Lessons From Golden Rice
Martin Enserink
It was supposed to prevent blindness and death from vitamin A deficiency
in millions of children. But almost a decade after its invention, golden
rice is still stuck in the lab
It's easy to recognize Ingo Potrykus at the train station in Basel,
Switzerland. Quietly waiting while hurried travelers zip ... 阅读全帖 |
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b***1
发帖数: 668 | 50 ◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者：知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene，为了取得投资，他通过北大女教师魏丽萍，找
到她老公、巨有钱的张帆（红杉资本中国基金创始人）。
王晓东做所长的研究所是国家研究所（National Institute），王晓东聘魏
丽萍担任北京生命科学研究所资深研究员，给予高薪和上千万研究经费。
王晓东没有经过北京生命科学研究所公开演讲和选拔的正常途径，私自聘请
魏丽萍。
魏丽萍根本达不到北京生命科学研究员的资格，更不要说资深研究员。研究
员要通过两次国际评审，经过高级研究员、资深研究员。
北京生命科学研究所高级研究员都有Cell Nature Science论文，魏丽萍一
篇都没有，却高出这些人一级，没有经过国际评审，当了资深研究员。魏丽萍
2004年才有自己的课题组，年资不高，而且成绩平平，之所以能在北京生命科学
研究所当上高级研究员，是因为王晓... 阅读全帖 |
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