b****r
发帖数: 17995 | 1 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
NIH 2015年budget正好30B）。
http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
recommends $10 billion in extra funding for NIH over 5 years. |
o**4
发帖数: 35028 | |
r******g
发帖数: 600 | 3 support for “young emerging scientists,” precision medicine, and a third
category still to be determined.
充分看好 precision medicine 未来10年的发展 |
l********8
发帖数: 197 | 4 好事，也说明美国经济在复苏，不然哪里可以这么烧钱。前一阵子回国了那么多人，现
在留在美国的人机会更多了。 |
F*Q
发帖数: 3259 | 5 经费增加当然是好事，只是增加幅度太小，这里受益的人恐怕不会有几个。
[在 bmwcar (decent) 的大作中提到：]
：总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
：NIH 2015年budget正好30B）。
：........... |
b****r
发帖数: 17995 | 6 怎么会，貌似已经5年没涨过了
这种钱，每年涨百分之几大家感觉都会很明显
10b（
【在 F*Q 的大作中提到】
: 经费增加当然是好事，只是增加幅度太小，这里受益的人恐怕不会有几个。
: [在 bmwcar (decent) 的大作中提到：]
: ：总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: ：NIH 2015年budget正好30B）。
: ：...........
|
w*********o
发帖数: 3030 | 7 What's the difference between precision medicine and personal medicine?
Better sounding word? |
T****i
发帖数: 15191 | 8 靠，可惜对我来说晚点，我已经不能算Young scientist了。我看好Dua美眉和下弦月美
眉。
previous
【在 b****r 的大作中提到】
: 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: NIH 2015年budget正好30B）。
: http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
: A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
: biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
: National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
: FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
: Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
: around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
: version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
|
r*****t
发帖数: 4793 | |
x********a
发帖数: 230 | 10 千老生性乐观哪。长一点就拍手叫好, 以前的血泪史都忘了。nih钱再跌下来,就有一群
四五十岁千老托家带口找不到工作。 真是千老命。 |
|
|
T****i
发帖数: 15191 | 11 是的，现有制度不改革，就是一个新的循环。没有科学家工会，国会就不把科学家当人
啊。
【在 x********a 的大作中提到】
: 千老生性乐观哪。长一点就拍手叫好, 以前的血泪史都忘了。nih钱再跌下来,就有一群
: 四五十岁千老托家带口找不到工作。 真是千老命。
|
v*******e
发帖数: 11604 | 12 别的好说，就是这个“young scientist”不靠谱。应该支持老scientist，而不是支持
young的。说不好听的，这就是故意增大总生物人口，为将来生物更加苦逼添砖加瓦的
。等到young的变成中年了，support也没了，转行也来不及了。 |
b****r
发帖数: 17995 | 13 这样的前提是生物继续当一个只能插管吸血的行业，不能自我造血
在这种行业的人，惨也不能怪社会。什么比较文学，天体物理，都不比生物好，说不定
更差，不要自怨自艾，觉得自己是全世界最惨淡
personalized medicine目前看起来就是生物成为自我造血行业的出路。希望这10B 鸡
血能让生物杀出一条血路，成为IT那样自我繁荣发展的路。NIH已经常年作为基础行业
吸纳税人血最多的行业了，在某些方向上取得一些有重大社会意义的突破也是应该的了
【在 T****i 的大作中提到】
: 是的，现有制度不改革，就是一个新的循环。没有科学家工会，国会就不把科学家当人
: 啊。
|
b****r
发帖数: 17995 | 14 我自认为一直在这个领域里，干了十多年了。我觉得两者只有字面上的区别
【在 w*********o 的大作中提到】
: What's the difference between precision medicine and personal medicine?
: Better sounding word?
|
T****i
发帖数: 15191 | 15 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
限。
【在 b****r 的大作中提到】
: 这样的前提是生物继续当一个只能插管吸血的行业，不能自我造血
: 在这种行业的人，惨也不能怪社会。什么比较文学，天体物理，都不比生物好，说不定
: 更差，不要自怨自艾，觉得自己是全世界最惨淡
: personalized medicine目前看起来就是生物成为自我造血行业的出路。希望这10B 鸡
: 血能让生物杀出一条血路，成为IT那样自我繁荣发展的路。NIH已经常年作为基础行业
: 吸纳税人血最多的行业了，在某些方向上取得一些有重大社会意义的突破也是应该的了
|
s******y
发帖数: 17729 | 16 然并卵
不管咋治疗，效果如何，这些和千老有半毛钱关系？
过去几年国内的房子卖的火吧，房子盖的漂亮吧，各种楼盘抢手吧
国家城镇化支持力度大吧，中央左一个文件，又一个指示的维护房价
然而这些东西，和工地上的农民工有半毛钱关系？撑死也就是遇上好的包工头，不拖欠
工资，盒饭里多几块肉。这些政策对于不管是搬砖的，扛麻袋的小工，还是砍专的的大
工。有多大影响？
生物悲哀在于，读了一辈子书，连农民工的觉悟都不如。农民工尚且知道，城市豪华，
楼房漂亮，和自己半毛钱关系没有。从没见过几个农民工以某栋摩天大楼沾沾自喜过。
千老总是把那些和自己没关系的东西往自己身上扯。
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
|
X**********g
发帖数: 13 | 17 Not really good for cancer research.
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
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b****r
发帖数: 17995 | 18 你这么想当然也可以
只能干这个工作的话，盒饭里多几块肉，工资都能到手，怎么叫做没半毛钱关系
我看到的叫兽或者出去创业的CEO都是搬砖的千老干出来的，我虽然混得不怎么样，也
是千老干出来的
现在又没有档案调令卡着人不能改行，不能出国或者回国。觉得这行没出路，赶紧换。
觉得自己有可能干点东西出来，就继续干。别搞得行业变景气了，结果还是在这里自怨
自艾，这个就不太合理了
【在 s******y 的大作中提到】
: 然并卵
: 不管咋治疗，效果如何，这些和千老有半毛钱关系？
: 过去几年国内的房子卖的火吧，房子盖的漂亮吧，各种楼盘抢手吧
: 国家城镇化支持力度大吧，中央左一个文件，又一个指示的维护房价
: 然而这些东西，和工地上的农民工有半毛钱关系？撑死也就是遇上好的包工头，不拖欠
: 工资，盒饭里多几块肉。这些政策对于不管是搬砖的，扛麻袋的小工，还是砍专的的大
: 工。有多大影响？
: 生物悲哀在于，读了一辈子书，连农民工的觉悟都不如。农民工尚且知道，城市豪华，
: 楼房漂亮，和自己半毛钱关系没有。从没见过几个农民工以某栋摩天大楼沾沾自喜过。
: 千老总是把那些和自己没关系的东西往自己身上扯。
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s******y
发帖数: 17729 | 19 说的搬砖民工人人都能干成包工头一样，啧啧，继续yy。
啥时候千老不拿着制药或者医疗的革新来自我麻醉了，这个行业就有救了。
从来没人质疑千老的辛苦付出会带来医药或者医疗的突飞猛进，就像没人质疑民工搬砖
会为城市摩天大楼的贡献一样。然并卵
现在看看那些睡在工棚的民工，有拿着城市的高楼来吹牛逼炫耀的吗？
【在 b****r 的大作中提到】
: 你这么想当然也可以
: 只能干这个工作的话，盒饭里多几块肉，工资都能到手，怎么叫做没半毛钱关系
: 我看到的叫兽或者出去创业的CEO都是搬砖的千老干出来的，我虽然混得不怎么样，也
: 是千老干出来的
: 现在又没有档案调令卡着人不能改行，不能出国或者回国。觉得这行没出路，赶紧换。
: 觉得自己有可能干点东西出来，就继续干。别搞得行业变景气了，结果还是在这里自怨
: 自艾，这个就不太合理了
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b****r
发帖数: 17995 | 20 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
现有这种突变DNA，那么就可以预警此人很可能已经有恶性肿瘤。大家应该都知道，早
期和晚期的恶性肿瘤可以说预后有天壤之别。我想在不远的将来，也许就是几年之后，
这样的检查手段就会极度的普及开来，每个人在45或50岁后每年都可以进行几次这样的
检测，会有很多的人本来可能活不到55岁，但是现在在一个几千人刀的CT检测+手术后
，能健康工作到60多岁退休，然后继续享受天伦之乐
其他的类似临床应用还有很多很多，无论什么疾病，归根结底大部分都是人或者微生物
的DNA/RNA的变化造成的，而DNA/RNA的检测可以说必然会继续以超过默尔定理的速度发
展若干年，因为实质上DNA/RNA的检测已经变成了标准的半导体技术。不是说每个生物
领域的人都能从这个技术获益，但是我相信有很多相关领域的同行都有机会搭上这趟快
车。我对此很乐观，也希望更多的人投身进来，推动整个行业的发展。我甚至觉得现在
的DNA/RNA分析相关领域将会类似于2000年左右的互联网领域，会在10年后改变整个社
会的面貌。实际上国内这一两年这个领域的风投和startup的热度，在我看来并不亚于
2000年的互联网。大家可以随便用中文搜索基因检测，看看有多少新成立的公司。
我们可以拭目以待。
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
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b****r
发帖数: 17995 | 21 我想板上的人有很多也记得我几年前还在千老的时候的帖子，而且还有一些人用这个信
息成功拿到了教职或者不错的公司职位，或者即将走上这样的岗位。我当然不是说每个
人都能更进一步，不过我相信接下来会有很多这样的机会，当然这样的机会只是给那些
积极向上的人，不会给那些自怨自艾还一堆负能量的人
【在 s******y 的大作中提到】
: 说的搬砖民工人人都能干成包工头一样，啧啧，继续yy。
: 啥时候千老不拿着制药或者医疗的革新来自我麻醉了，这个行业就有救了。
: 从来没人质疑千老的辛苦付出会带来医药或者医疗的突飞猛进，就像没人质疑民工搬砖
: 会为城市摩天大楼的贡献一样。然并卵
: 现在看看那些睡在工棚的民工，有拿着城市的高楼来吹牛逼炫耀的吗？
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w*********o
发帖数: 3030 | 22 Don't get too excited. I predict that using omics for cancer treatment is
the next biggest bust after the amyloid-beta :)
【在 b****r 的大作中提到】
: 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
: 白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
: 是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
: 突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
: 行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
: 遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
: 另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
: 什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
: 部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
: 人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
|
D*a
发帖数: 6830 | 23 你有病啊，我招你惹你了
【在 T****i 的大作中提到】
: 靠，可惜对我来说晚点，我已经不能算Young scientist了。我看好Dua美眉和下弦月美
: 眉。
:
: previous
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s******y
发帖数: 17729 | 24 这回我没说你吧，以后我也不说你了，也不说下弦月了
【在 D*a 的大作中提到】
: 你有病啊，我招你惹你了
|
b****r
发帖数: 17995 | 25 amyloid-beta 有什么bust吗，没有感觉到过，不就是发现了一种常见病的机理，没觉
得有多少后续投资进去，跟omics是没法比的
【在 w*********o 的大作中提到】
: Don't get too excited. I predict that using omics for cancer treatment is
: the next biggest bust after the amyloid-beta :)
|
w*********o
发帖数: 3030 | 26 "后续投资"
it pretty much killed the neuroscience drug discovery in industry. For now,
I don't think pharma is even touching the Omics in their pipe lines other
than lip services :)
【在 b****r 的大作中提到】
: amyloid-beta 有什么bust吗，没有感觉到过，不就是发现了一种常见病的机理，没觉
: 得有多少后续投资进去，跟omics是没法比的
|
w********u
发帖数: 20 | 27 说的挺好的～ 我非常喜欢precision medicine~ YY一下～
precision medicine （PM） 主要的aim就是通过genomic/genetic analysis来 帮助
临床诊断， 临床治疗指南，推动 靶向治疗药物的研发。 PM有希望 完全改变临床 癌
症诊断 和 治疗的指南。
接下来的20年，NIH NCI 会往PM里面扔很多钱，估计PI们来申请 PM相关的科研，主要
的目的可能会有几个方向：
1. 哪些突变 容易引起某系癌症？ （如同bmwcar说的）但是，这个领域，已经基本上
被挖光了。。。 类似BCL-ABL 的 determinant gene 导致 的 癌症，估计已经发现的
差不多了 （BRCA，VHL，BCL-ABL, NF1, NF2,........ 一大堆）。
2. 哪些 突变/genetic background 让病人 的肿瘤 对 某些化疗药 更sensitive？ 那
些让病人的肿瘤 对 化疗药物 resistant? （目前 相同 肿瘤病人 几乎接受的是一样
的standard的化疗...）
3. 哪些 突变/genetic background 让病人 更容易复发？(比较典型的例子，是前不久
国内发的那篇B-ALL的复发的Nat Med paper: Nature Medicine 21, 563–571 (2015)
doi:10.1038/nm.3840)
4. 如何 通过genomics技术 帮助 早期癌症的 诊断？
等等等
意淫 20年后，如果PM成功，每一种肿瘤 都有 一个“相关肿瘤预后的gene array”。
一个女病人去医院，乳腺肿块。活检乳腺癌 “乳腺癌”。根据 20年的PM，一共有160
个genes跟 乳腺癌的治疗 和 预后 相关。然后，把病人的肿瘤组织 直接进行160 gene
的chip（standard kit）。chip完成以后，比如 病人一共有30个gene 突变，主要集中
于 位于 2条pathways （比如purine synthesis 和 multi-drug resistant pathway）
。这样，病人的 病理诊断 是 乳腺癌105型 （根据 病理 ，临床 和 genetics结果，
比如一共有 1-200个亚型，每一个亚型都有一个不同的化疗方案）。那么 这个 病人，
由于 有purine sythesis 的突变，化疗方案里面 则会增加有 一个 靶向target
purine synthesis pathway的药物, 以及 增加一个 靶向 target MDR的化疗药。
这个工程 会 有大量的新药物研发，大量的startup，大量的genetic study！ 目前已
经有很多小公司开发 gene array来进行 早期肿瘤诊断了 （目前问题是 保险公司的
reimbursement 太低了）
以后oncologists 还需要有 genomics/genetics background，或者 以后的 clinical
geneticist 会更多～ 感觉如果PM 成功，以后临床治疗指南 将会 完全改变。
可能有人会讨论 肿瘤heterogeneity的问题... 至于 这个问题，目前可以说 是
scientists的speculation。真理都是试出来的，等几年 看看PM 能不能成功～
保险公司的 reimbursement 可能 是大问题？？？.......
YY结束！
【在 b****r 的大作中提到】
: 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
: 白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
: 是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
: 突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
: 行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
: 遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
: 另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
: 什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
: 部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
: 人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
|
b****r
发帖数: 17995 | 28 没错，到底效果如何，都是试出来的，现在都是预测而已。
也许有很多新的driver mutation被挖出来也不一定。虽然说单个就能致病的driver
mutation可能如你所说挖得差不多了，但也许对于任何一"种"肿瘤，实际上其实是很多
种完全不同的肿瘤，癌种是由两个或者多个driver突变的 组合 来定义，治疗方案（不
一定要Imatinib 或者全反式维甲酸这样直接针对突变本身，可以是几种已有的化疗方
案中的一种）才是最优的。这个在血液系肿瘤的临床应用中已经很普遍了，实体瘤则还
有很多工作要做。这个你刚才也基本提到了。
这个中间有很多重要的工作需要完成，一方面是对肿瘤的进一步测序分析（临床学家，
遗传学家和生物信息学家来做这个），一方面是研究这些突变的组合，哪些才是最具有
生物学意义的（其他那些只是passenger mutation），这个是做信号通路的人的拿手好
戏。然后就可以针对这样的组合来进行药物筛选，高通量lab，动物中心和药厂来做这
个工作
【在 w********u 的大作中提到】
: 说的挺好的～ 我非常喜欢precision medicine~ YY一下～
: precision medicine （PM） 主要的aim就是通过genomic/genetic analysis来 帮助
: 临床诊断， 临床治疗指南，推动 靶向治疗药物的研发。 PM有希望 完全改变临床 癌
: 症诊断 和 治疗的指南。
: 接下来的20年，NIH NCI 会往PM里面扔很多钱，估计PI们来申请 PM相关的科研，主要
: 的目的可能会有几个方向：
: 1. 哪些突变 容易引起某系癌症？ （如同bmwcar说的）但是，这个领域，已经基本上
: 被挖光了。。。 类似BCL-ABL 的 determinant gene 导致 的 癌症，估计已经发现的
: 差不多了 （BRCA，VHL，BCL-ABL, NF1, NF2,........ 一大堆）。
: 2. 哪些 突变/genetic background 让病人 的肿瘤 对 某些化疗药 更sensitive？ 那
|
b****r
发帖数: 17995 | 29 I C
不过这个应该在整个生物界甚至社会上算不得什么影响吧
和现在每个人都打鸡血一样说的 精准医疗 还是差得很远的
不过如果你说的omics是想通过一种由几千几万甚至更多的数据点的pattern来描述定义
一种疾病，那我完全同意那是个bust。放在学校里那就是system biology，我觉得也是
吹牛占90%
我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
变 来定义一种疾病
,
【在 w*********o 的大作中提到】
: "后续投资"
: it pretty much killed the neuroscience drug discovery in industry. For now,
: I don't think pharma is even touching the Omics in their pipe lines other
: than lip services :)
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w*********o
发帖数: 3030 | 30 The money NIH spent on bio R&D is really small comparing to pharma/biotech
and much less effective. The data from industry is much more trustworthy and
not from slave labor, if they were published.
我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
变 来定义一种疾病
--- the diseases that can be defined in such a simple way are already
defined, and are usually Orphan disease :)
【在 b****r 的大作中提到】
: I C
: 不过这个应该在整个生物界甚至社会上算不得什么影响吧
: 和现在每个人都打鸡血一样说的 精准医疗 还是差得很远的
: 不过如果你说的omics是想通过一种由几千几万甚至更多的数据点的pattern来描述定义
: 一种疾病，那我完全同意那是个bust。放在学校里那就是system biology，我觉得也是
: 吹牛占90%
: 我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
: 变 来定义一种疾病
:
: ,
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b****r
发帖数: 17995 | 31 你觉得工业界的R&D效率就一定更高，对于有些方向也许是，肯定有我不了解的东西。
不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳
。但是每个基因的发现，直接使所有该遗传病患者和其家庭获益。这是一个小例子。前
面我举的几个个体化医疗的target mutation，也不是什么工业界做出来的。
关于你说的第二点，你可以去看看现在的nature genetics， A J Human Genetics，每
一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆，这个能叫做already defined？而且现在主
要还只能做这些high penetrance的单基因，low penetrance的难度更大，还有很多空
白点，这个工作还根本没有做完。人20000多基因，不说所有基因都和单基因有关，就
算1/3和单基因有关（这也是学界公认的比例），7000左右，现在还只有4000多被“
define”了，留给遗传学家的东西还不少。
而如果是bi allelic 致病，理论上你需要的sample size是做单基因疾病的平方。你想
想现在还差多远吧。 我们现在看到貌似常见的肿瘤（前面的帖子我已经提到了），或
者冠心病，糖尿病，先心病，大家都称他们为都是“多因素病”，其实现在人类的技术
还根本没有搞清楚是不是真是如此，在这之前，只好糊涂一把，统一叫做“多因素病”
。大量的GWAS，数学模型都是建立在单个位点的计算上，而根本没有足够的power计算
locus*locus interaction这样的可能性，原因就是我说的，现在人类能做到的power根
本不够，多一个locus参与interaction，sample size就要多一次方。
当然，我不是说这些常见病就一定是biallelic，双位点致病，但是绝对不是你说的那
样”defined“。这个问题人类还根本没有能力回答。不过随着测序技术的摩尔式发展
，我想不需要等很久。摩尔式发展的威力，可以参考那个象棋格子里放1，2，4.。粒麦
子的故事。
and
【在 w*********o 的大作中提到】
: The money NIH spent on bio R&D is really small comparing to pharma/biotech
: and much less effective. The data from industry is much more trustworthy and
: not from slave labor, if they were published.
: 我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
: 变 来定义一种疾病
: --- the diseases that can be defined in such a simple way are already
: defined, and are usually Orphan disease :)
|
w*********o
发帖数: 3030 | 32 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
--- Because there is no market for it.
每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
, the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
lot of projects never even get off ground because the published findings are
not repeatable.
不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
--- The individual situation is much more complex than the sequence of human
genome, which is stable and largely a technical issue. Most people can
afford have their genome sequenced, but I don't expect that the genomic
sequence, free from the tampering of environment and aging process, can be
used for disease treatment in my life time.
大家都称他们为都是“多因素病”，
--- I am more inclined to believe most disease, including cancer, are “多因
素病”. That's not to say personalized medicine is not the direction. It is
just a long, long, ... long term goal.
【在 b****r 的大作中提到】
: 你觉得工业界的R&D效率就一定更高，对于有些方向也许是，肯定有我不了解的东西。
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳
: 。但是每个基因的发现，直接使所有该遗传病患者和其家庭获益。这是一个小例子。前
: 面我举的几个个体化医疗的target mutation，也不是什么工业界做出来的。
: 关于你说的第二点，你可以去看看现在的nature genetics， A J Human Genetics，每
: 一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆，这个能叫做already defined？而且现在主
: 要还只能做这些high penetrance的单基因，low penetrance的难度更大，还有很多空
: 白点，这个工作还根本没有做完。人20000多基因，不说所有基因都和单基因有关，就
: 算1/3和单基因有关（这也是学界公认的比例），7000左右，现在还只有4000多被“
: define”了，留给遗传学家的东西还不少。
|
T****i
发帖数: 15191 | 33 你们年轻，又热爱生物，这不是机会来了吗？我真心的。我认为其他在Career早期，读
博和刚做博后的，这也许是个好时机，只不过我只记得你们两个的ID。
【在 D*a 的大作中提到】
: 你有病啊，我招你惹你了
|
r******g
发帖数: 600 | 34 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 extreme phenotype来 研究 non-extreme common
disease 才是 这个圈子的真正目的。 而这样的科研，是纯机制的科研，当然 只有学
术圈来做了
我给你举个经典例子吧：80-90年代，RP lifton等人的组，发现全世界 2个地方 的人
，有不少人 患有非常严重的 hypertension （extreme cases)。 于是，他们通过
linkage study，发现了很多病人有 angiotensinogen 这个gene的mutation。 其实 你
仔细想想，大多数 高血压都是 原发的，与mutation无关。 但是，RP lifton的这个科
研，立刻让biochemists发现了 angiotensin pathways。接下来，大家发现 大多数
hypertension都跟 angiotensin pathway被激活有关（但是并非mutation）。 然后，
大家发现了 angiotensin pathway的抑制剂。 接下来，最常用的 治疗高血压药物 “
ARB，ATI” 就发明出来了。 这是一个 经典的例子，通过rare disease 来研究
common disease。
事实上，大多数 疾病都不仅仅是由mutation导致的。那些rare disease的科研，只能
用于 研究 机制，然后运用于common disease。 企图 通过研究monogenic disease来
治疗 orphan disease是 木有意义的。
所以，你的理解 可能有偏差。
最后，precision medicine 跟 RP lifton他们做的 这些 mendelian traits的
diseases 是完全不同的两个领域。当然，RP lifton由于 江湖地位很高， 在
precision medicine中，身兼要职。precision medicine的 最终 目的，应该集中在
肿瘤领域。通过不同的genetic pattern，来帮助 诊断，治疗，化疗方案，癌症预后预
测。
【在 b****r 的大作中提到】
: 你觉得工业界的R&D效率就一定更高，对于有些方向也许是，肯定有我不了解的东西。
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳
: 。但是每个基因的发现，直接使所有该遗传病患者和其家庭获益。这是一个小例子。前
: 面我举的几个个体化医疗的target mutation，也不是什么工业界做出来的。
: 关于你说的第二点，你可以去看看现在的nature genetics， A J Human Genetics，每
: 一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆，这个能叫做already defined？而且现在主
: 要还只能做这些high penetrance的单基因，low penetrance的难度更大，还有很多空
: 白点，这个工作还根本没有做完。人20000多基因，不说所有基因都和单基因有关，就
: 算1/3和单基因有关（这也是学界公认的比例），7000左右，现在还只有4000多被“
: define”了，留给遗传学家的东西还不少。
|
r******g
发帖数: 600 | 35 你 第一 第二点 理解的很对
但是，请看我 上一条回复 里面那个例子！ 希望，能解释一些问题。 这些monogenic
diseases的科研，不只有novelties！ 其实是大有文章，只是biochemists不follow而已
至于你的第三点，我发现27楼写的很好，感觉 能给你 partial answer！
劳。
"
verifications
decided
are
human
【在 w*********o 的大作中提到】
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
: --- Because there is no market for it.
: 每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
: are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
: , the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
: to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
: lot of projects never even get off ground because the published findings are
: not repeatable.
: 不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
: --- The individual situation is much more complex than the sequence of human
|
c********e
发帖数: 598 | 36
If you pay attention to the changes of industry, you will find
1) Some rare disease has good market outlook.
2) Today our concept of whether particular gene can be drugable is quite
different now.
3)Even if many diseases are caused by multiple factors, the trick is not to
solve
the factor but to stop the progression or induce remission (not limited to
oncology)
【在 w*********o 的大作中提到】
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
: --- Because there is no market for it.
: 每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
: are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
: , the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
: to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
: lot of projects never even get off ground because the published findings are
: not repeatable.
: 不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
: --- The individual situation is much more complex than the sequence of human
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c********e
发帖数: 598 | 37
I think your perspective is limited to genetic diseases. The system biology
will have a jump start.
【在 b****r 的大作中提到】
: I C
: 不过这个应该在整个生物界甚至社会上算不得什么影响吧
: 和现在每个人都打鸡血一样说的 精准医疗 还是差得很远的
: 不过如果你说的omics是想通过一种由几千几万甚至更多的数据点的pattern来描述定义
: 一种疾病，那我完全同意那是个bust。放在学校里那就是system biology，我觉得也是
: 吹牛占90%
: 我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
: 变 来定义一种疾病
:
: ,
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s******y
发帖数: 28562 | 38 说得非常好。很多时候研究罕见疾病其实是为了找机理，而不是为了特地的去研究那个
罕见疾病。不过这个道理不要说普通博士后或者学生了，连一些PI都不一定知道。
另外，我最近偶然知道了国内某大牛（饶毅）对疾病研究的态度，让我大吃一惊，
他似乎觉得只有纯基础研究是值得做的，凡是做疾病的都是歪门邪道。我不知道说这个
事情的人有没有冤枉他，但是如果那些身居高位的生物研究者都是这样的话，国内的生
物研究的高投入估计持续了不多久就要崩溃了。
【在 r******g 的大作中提到】
: 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
: 其实你们两个人 说的是对的
: 你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
: 目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
: 全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
: 来寻找 human knockout的phenotype。
: 通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
: 临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
: mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
: 自然也不会对这个领域感兴趣...
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r******g
发帖数: 600 | 39 居然得到 胖头鱼 老师的表扬！ 谢谢
最近 悟出来的～ 最近读paper悟出来不少道理！
【在 s******y 的大作中提到】
: 说得非常好。很多时候研究罕见疾病其实是为了找机理，而不是为了特地的去研究那个
: 罕见疾病。不过这个道理不要说普通博士后或者学生了，连一些PI都不一定知道。
: 另外，我最近偶然知道了国内某大牛（饶毅）对疾病研究的态度，让我大吃一惊，
: 他似乎觉得只有纯基础研究是值得做的，凡是做疾病的都是歪门邪道。我不知道说这个
: 事情的人有没有冤枉他，但是如果那些身居高位的生物研究者都是这样的话，国内的生
: 物研究的高投入估计持续了不多久就要崩溃了。
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s******y
发帖数: 28562 | 40 这个关于为什么要研究罕见疾病的问题是发考题面试的时候的经典问题之一。
所以说你是个好学生啊。要是我的学生们有你一半的程度就好了，我经常在上课的时候
被他们气个半死。
【在 r******g 的大作中提到】
: 居然得到 胖头鱼 老师的表扬！ 谢谢
: 最近 悟出来的～ 最近读paper悟出来不少道理！
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r******g
发帖数: 600 | 41 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
【在 s******y 的大作中提到】
: 这个关于为什么要研究罕见疾病的问题是发考题面试的时候的经典问题之一。
: 所以说你是个好学生啊。要是我的学生们有你一半的程度就好了，我经常在上课的时候
: 被他们气个半死。
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c********e
发帖数: 598 | 42
You should go precise medicine directly.
【在 r******g 的大作中提到】
: 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
: 向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
|
c********e
发帖数: 598 | 43
Ultra-Rare Diseases
Alexion is focused on providing life-transforming treatments to patients
with severe and life-threatening rare diseases for which there are few, if
any, effective treatment options.
The impact of these diseases on patients, their families, and society is
profound as many are severe, chronic and progressive, with high mortality
rates. Ultra-rare diseases often present unique public health challenges.
Typically, few researchers or companies explore such diseases. It is also
highly likely that very few physicians are familiar with diagnosing and
treating these conditions, leading to missed, delayed or inaccurate
diagnosis and thereby delaying treatment, even when an approved, effective
therapy is available.
When developing treatments for patients with rare and ultra-rare diseases,
often there are no pre-existing regulatory pathways or prior controlled
studies. Alexion is one of the few companies in this field with a proven
track record in drug discovery, regulatory affairs, clinical trial design
and recruitment, and manufacturing.
Our approach to serving patients is driven by education and a passion for
understanding and meeting the unique needs of patients and families
suffering from rare and ultra-rare diseases.
【在 s******y 的大作中提到】
: 这个关于为什么要研究罕见疾病的问题是发考题面试的时候的经典问题之一。
: 所以说你是个好学生啊。要是我的学生们有你一半的程度就好了，我经常在上课的时候
: 被他们气个半死。
|
b****r
发帖数: 17995 | 44 也许，我并不排斥这种可能性，所以我只说90%是吹。大家边走边瞧吧
我对genetic disease的定义很广泛，包括肿瘤，各种有家族倾向的常见慢性病，也包
括病原微生物，因为它们的生命过程以及与宿主的互作也几乎完全是由它们的DNA/RNA
决定的。将来也许这个定义会更广泛，当然也可能我估计过高，呵呵
biology
【在 c********e 的大作中提到】
:
: Ultra-Rare Diseases
: Alexion is focused on providing life-transforming treatments to patients
: with severe and life-threatening rare diseases for which there are few, if
: any, effective treatment options.
: The impact of these diseases on patients, their families, and society is
: profound as many are severe, chronic and progressive, with high mortality
: rates. Ultra-rare diseases often present unique public health challenges.
: Typically, few researchers or companies explore such diseases. It is also
: highly likely that very few physicians are familiar with diagnosing and
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b****r
发帖数: 17995 | 45
的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
--- Because there is no market for it.
again，临床上光是产前诊断一项就是一个巨大的市场，而且是一个在以指数级递增的
大市场。当然，相信你不是临床出身，这方面不一定有关注
每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
, the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
lot of projects never even get off ground because the published findings are
not repeatable.
同样的，你对基因疾病的认识还停留在是否drugable这样一个简单的认识层面。前面提
到了血液病的例子，大量的血液肿瘤相关突变并不drugable，甚至功能不明，但是这不
妨碍以此对疾病进行个体化细分，因为这些突变很可能决定了肿瘤的生物行为，比如是
否对DNA损伤敏感，是不是基因组不稳定，甚至一些我们还根本不懂的原因。只要我们
能正确的细分肿瘤类别，就可以针对性进行临床试验总结出哪一种药物对什么样的化疗
药物最敏感。这实际上已经是血液科大部分肿瘤的指南内容。
对于普通遗传病，同样的，知道什么基因致病就可以帮助这些家庭进行产前诊断。就算
一个最罕见的遗传病，全世界只有几十个家庭有，但是你一篇文章可以改变这几十个家
庭的命运，这个难道不是可以让人感到很光荣的成就吗。经济角度其实更是如此。一个
患儿的出身，接下来可能就是父母以及双方家庭几十年的磨难与无穷无尽的经济投入，
以及社会福利的支出
不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
--- The individual situation is much more complex than the sequence of human
genome, which is stable and largely a technical issue. Most people can
afford have their genome sequenced, but I don't expect that the genomic
sequence, free from the tampering of environment and aging process, can be
used for disease treatment in my life time.
这个我们可以拭目以待。again，不要小看莫尔定理的威力。
大家都称他们为都是“多因素病”，
--- I am more inclined to believe most disease, including cancer, are “多因
素病”. That's not to say personalized medicine is not the direction. It is
just a long, long, ... long term goal.
同上
【在 w*********o 的大作中提到】
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
: --- Because there is no market for it.
: 每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
: are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
: , the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
: to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
: lot of projects never even get off ground because the published findings are
: not repeatable.
: 不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
: --- The individual situation is much more complex than the sequence of human
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b****r
发帖数: 17995 | 46
懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
--你不能把眼球停留在眼前，应该放眼10年以后，你职业生涯的成熟期。100，000人一
例患者，全世界有多少患者？数十万！测序技术的普及以及互联网，在几年后就会把这
几十万人基本连成一个整体。而且，这些患者的致病原因都是非常均一的（特别是和现
在的多因素疾病相比），对药物的反应也很可能均一得多。而且突变基因的功能可能是
非常清楚的，靶向药物的设计完全可以进行educated guess，不需要shoot in the
dark，这都是颠覆现有概念的新事物。此外，你如果读完我那篇链接的全文，我记得提
到了FDA对这种罕见病药物的最短通过时间是4天。对，你没看错，4天。 这是一个
巨大的市场。
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 extreme phenotype来 研究 non-extreme common
disease 才是 这个圈子的真正目的。 而这样的科研，是纯机制的科研，当然 只有学
术圈来做了
我给你举个经典例子吧：80-90年代，RP lifton等人的组，发现全世界 2个地方 的人
，有不少人 患有非常严重的 hypertension （extreme cases)。 于是，他们通过
linkage study，发现了很多病人有 angiotensinogen 这个gene的mutation。 其实 你
仔细想想，大多数 高血压都是 原发的，与mutation无关。 但是，RP lifton的这个科
研，立刻让biochemists发现了 angiotensin pathways。接下来，大家发现 大多数
hypertension都跟 angiotensin pathway被激活有关（但是并非mutation）。 然后，
大家发现了 angiotensin pathway的抑制剂。 接下来，最常用的 治疗高血压药物 “
ARB，ATI” 就发明出来了。 这是一个 经典的例子，通过rare disease 来研究
common disease。
事实上，大多数 疾病都不仅仅是由mutation导致的。那些rare disease的科研，只能
用于 研究 机制，然后运用于common disease。 企图 通过研究monogenic disease来
治疗 orphan disease是 木有意义的。
所以，你的理解 可能有偏差。
--这方面我倒并不是特别给予厚望。我始终认为人和动物的区别并不是那么大。而且动
物模型，humanized animal也是一个发展很快的领域。在这之后，必须以人作为疾病模
型才能研究清楚的东西，也许只有10%（我瞎猜一个数字，但我觉得肯定是一小部分）
。如果想做机制，高等动物模型的优势还是多太多了，可控实验条件，均一遗传背景，
快速繁殖传代。
最后，precision medicine 跟 RP lifton他们做的 这些 mendelian traits的
diseases 是完全不同的两个领域。当然，RP lifton由于 江湖地位很高， 在
precision medicine中，身兼要职。precision medicine的 最终 目的，应该集中在
肿瘤领域。通过不同的genetic pattern，来帮助 诊断，治疗，化疗方案，癌症预后预
测。
--我个人做了十多年的mendelian traits，最近才比较多接触precision medicine，不
过我个人会把单基因遗传病放到precision medicine中来作为其中一部分。因为无论实
验方法，实验对象，基础知识等等，两者的重合度都是极高的。毕竟归根结底，两者都
是基因病，一个是germline mutation，一个是somatic mutation
【在 r******g 的大作中提到】
: 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
: 向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
|
r******g
发帖数: 600 | 47 嗯，开发药物那个，说的还是有道理的！ 没想到 FDA可以approve的这么快～
rare disease 里面，biallelic loss-of-function的 很多都是无法治疗的，根本无法
开发药物 （除了一些 已知的代谢疾病，可以进行 supplement治疗）。绝大多数
biallelic的 已知的rare disease 致病基因都是 细胞内的 蛋白问题，几乎无法开发
药物target。
Autosomal dominant的 rare disease 还是比较适合 开发target therapy的.
【在 b****r 的大作中提到】
:
: 懂得不多，只是提提个人观点
: 其实你们两个人 说的是对的
: 你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
: 目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
: 全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
: 来寻找 human knockout的phenotype。
: 通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
: 临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
: mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
|
f**********e
发帖数: 185 | 48 great!
previous
【在 b****r 的大作中提到】
: 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: NIH 2015年budget正好30B）。
: http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
: A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
: biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
: National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
: FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
: Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
: around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
: version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
|
b****r
发帖数: 17995 | 49 代谢疾病 正是遗传病里最常见已知的类别啊。不光是酶替代疗法（可以看看Genezyme
的信息）和昂贵的特殊饮食，还有现在最热的干细胞，CRISPR knockin，转基因，都被
你无视了啊。
结构蛋白也有办法，比如cystic fibrosis （美国最常见的隐性遗传病，白人中携带率
1/25）G551D这种突变，最近开发出一种药物针对这种点突变的异常蛋白有非常好的疗
效。当然钱也是滚滚而来
In the first 9 months of its second year on the market (2014), ivacaftor
sales were $339M
https://en.wikipedia.org/wiki/Ivacaftor
【在 r******g 的大作中提到】
: 嗯，开发药物那个，说的还是有道理的！ 没想到 FDA可以approve的这么快～
: rare disease 里面，biallelic loss-of-function的 很多都是无法治疗的，根本无法
: 开发药物 （除了一些 已知的代谢疾病，可以进行 supplement治疗）。绝大多数
: biallelic的 已知的rare disease 致病基因都是 细胞内的 蛋白问题，几乎无法开发
: 药物target。
: Autosomal dominant的 rare disease 还是比较适合 开发target therapy的.
|
d***s
发帖数: 1062 | 50
我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
【在 r******g 的大作中提到】
: 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
: 向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
|
|
|
r******g
发帖数: 600 | 51 :D
私信
【在 d***s 的大作中提到】
:
: 我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
: 会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
|
v**********m
发帖数: 5516 | 52 不改变现有的职业发展制度，钱越多，祸害的人越多。
基础科研领域的包工头最招人恨的一点是他们需要大量的廉价劳动力来维持自己作坊的
低水平重复生产，他们不遗余力的鼓吹新人入行。
具体的手段是用PhD的头衔来吸引新的廉价劳力，把他们当易耗品(施在美国做PI时的原
话)，基本上用十年就扔 掉，换新的一批。
生产模式基本是血汗工厂，玩命的加班，低薪，多雇人，以量取胜，员工没有向上发展
的空间。
这些行业的现状就像烂泥地玩高密度的摔跤拍板砖。令狐冲也会死在闷砖之下，没机会
做五岳盟主。
这种模式下，已经没有天才的培养土壤，甚至没有高智商PhD成长的土壤，看清现实，
有能力转行的都走了。看看北清的本科毕业生，没多少留了下来继续做学术。痴迷基础
研究的人最后也被学术圈赶走，比如那个克隆gfp的司机。因为学术圈需要小鲜肉的体
力来支撑血汗工厂。
一堆中年主动或被迫转行的故事和新人入行受骗的故事同时在发生。故事非常荒诞但正
在真实的发生。
previous
【在 b****r 的大作中提到】
: 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: NIH 2015年budget正好30B）。
: http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
: A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
: biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
: National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
: FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
: Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
: around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
: version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
|
T****i
发帖数: 15191 | 53 我前老板也是这种思路。她做的也蛮好的。可惜，跟我们领域的主要疾病差别太大。所
以对主要的那几个病没什么参考价值。她生存没问题，而我再想走同样的路，别人就不
太买账了。
【在 b****r 的大作中提到】
: 代谢疾病 正是遗传病里最常见已知的类别啊。不光是酶替代疗法（可以看看Genezyme
: 的信息）和昂贵的特殊饮食，还有现在最热的干细胞，CRISPR knockin，转基因，都被
: 你无视了啊。
: 结构蛋白也有办法，比如cystic fibrosis （美国最常见的隐性遗传病，白人中携带率
: 1/25）G551D这种突变，最近开发出一种药物针对这种点突变的异常蛋白有非常好的疗
: 效。当然钱也是滚滚而来
: In the first 9 months of its second year on the market (2014), ivacaftor
: sales were $339M
: https://en.wikipedia.org/wiki/Ivacaftor
|
s******a
发帖数: 252 | 54 It may not be a good idea - genomics is just as a crowded field.
On the other hand, human immunology is on a rapid rise, thanks to all the
big data.
【在 d***s 的大作中提到】
:
: 我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
: 会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
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n******7
发帖数: 12463 | 55 要居安思危
暂时稳定下来了就要赶快考虑下一步路
不要等到下一轮危机了才醒悟
【在 x********a 的大作中提到】
: 千老生性乐观哪。长一点就拍手叫好, 以前的血泪史都忘了。nih钱再跌下来,就有一群
: 四五十岁千老托家带口找不到工作。 真是千老命。
|
b****r
发帖数: 17995 | 56 我完全同意即使加大投入，大部分生物基础行业的人日子仍然会十分艰辛。我觉得你可
能没太明白我这篇文章的重点：生物领域有一块，也就是和precision medicine相关的
领域有机会从基础研究脱胎出去，成为和IT ，互联网一样可以自我造血，不再仰人鼻
息的热门专业。实际上我自己可以说就跨进了这个门，虽然还是留在高校当AP，但是我
没有funding的压力，外面也多的是公司机会，经常收到猎头的信
可以看看我3年前的相关帖子
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31476677.html
当然，我不是什么牛人也谈不上什么收入好，但是我坚信这个领域会继续蓬勃的发展，
会造就一批和IT界一样的富翁，而生物口的人如果基础好，很多人是完全有可能跨入这
个领域的
【在 v**********m 的大作中提到】
: 不改变现有的职业发展制度，钱越多，祸害的人越多。
: 基础科研领域的包工头最招人恨的一点是他们需要大量的廉价劳动力来维持自己作坊的
: 低水平重复生产，他们不遗余力的鼓吹新人入行。
: 具体的手段是用PhD的头衔来吸引新的廉价劳力，把他们当易耗品(施在美国做PI时的原
: 话)，基本上用十年就扔 掉，换新的一批。
: 生产模式基本是血汗工厂，玩命的加班，低薪，多雇人，以量取胜，员工没有向上发展
: 的空间。
: 这些行业的现状就像烂泥地玩高密度的摔跤拍板砖。令狐冲也会死在闷砖之下，没机会
: 做五岳盟主。
: 这种模式下，已经没有天才的培养土壤，甚至没有高智商PhD成长的土壤，看清现实，
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v**********m
发帖数: 5516 | 57 谢有心人，先读读你的帖子。
【在 b****r 的大作中提到】
: 我完全同意即使加大投入，大部分生物基础行业的人日子仍然会十分艰辛。我觉得你可
: 能没太明白我这篇文章的重点：生物领域有一块，也就是和precision medicine相关的
: 领域有机会从基础研究脱胎出去，成为和IT ，互联网一样可以自我造血，不再仰人鼻
: 息的热门专业。实际上我自己可以说就跨进了这个门，虽然还是留在高校当AP，但是我
: 没有funding的压力，外面也多的是公司机会，经常收到猎头的信
: 可以看看我3年前的相关帖子
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31476677.html
: 当然，我不是什么牛人也谈不上什么收入好，但是我坚信这个领域会继续蓬勃的发展，
: 会造就一批和IT界一样的富翁，而生物口的人如果基础好，很多人是完全有可能跨入这
: 个领域的
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b****r
发帖数: 17995 | 58 有人问我pharmacogenomics/pharmacogenetics吗，尤其是在precision medicine方面
的前景，我对药理其实了解比较局限，尽力说说我的看法吧
我觉得药物的发展显然是滞后于相关的靶向的发现的。这不完全是由于药物的研发过程
漫长（这个基本是个硬杠杠，能改变的很有限），更多的时候其实是发现靶向（基因相
关领域）和药物研发领域互相之间的交集很少，做药的很多时候不知道有些什么靶向。
而我们基因相关领域的，对药物的研发过程相对也很陌生。比如我们的遗传系我也待了
好些年了，全美数一数二的大系，但是只有很少的几个老板做药物相关，而且一般也是
药厂主动找上门，或者用的是非常经典的思路，比如酶基因突变就补充那个酶。这样的
做法显然没有跟上时代的潮流，更别说成为时代弄潮儿。
我想几年后，市场会是这样一个方向，制药公司更多的雇佣遗传相关人士，或者聘请这
些人做consultant，与他们brain storm，共同提出领域里最新出现的一些有潜力的突
变，然后采用现代药物研发的方法，比如各种小分子筛选，抗体筛选，甚至CART 细胞
治疗来做药物。总之交叉型人才会越来吃香，对机制理解得越深刻，就越有机会提出最
好的靶向，而只会做比较简单经典的东西的人则会面临越来越多的就业压力，一方面来
自公司流水线，一方面来自第三世界的廉价劳动力 |
b****r
发帖数: 17995 | 59 我很久以前（大于7年）就觉得免疫和遗传是将来生物领域最有前景的两个方向。现在
看起来，我还是挺佩服我自己的眼光，生物口创业并成功的，今天看起来大多就是这
两个领域
免疫方面最近两年的突破我想你肯定比我更加关注。而这两者说老实话交集并不太大，
要成功的跳过来并且又不浪费你的免疫背景，我觉得需要很仔细的考虑，耐心的寻找机会
【在 d***s 的大作中提到】
:
: 我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
: 会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
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n******7
发帖数: 12463 | 60 哈哈
几个月前我说起cfDNA的应用，你还不屑一顾
现在变得挺快嘛
【在 b****r 的大作中提到】
: 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
: 白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
: 是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
: 突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
: 行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
: 遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
: 另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
: 什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
: 部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
: 人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
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b****r
发帖数: 17995 | 61 那个帖子我记得。我可没有不屑一顾。你说的是已经在临床上用得很多了，这个就是瞎
扯了。科研和临床是两码事，这个我觉得你还是得搞清楚
【在 n******7 的大作中提到】
: 哈哈
: 几个月前我说起cfDNA的应用，你还不屑一顾
: 现在变得挺快嘛
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r******g
发帖数: 600 | 62 cfDNA 有挺多小公司的
前几天 刚停过一个加州的公司的讲座～ 做的cancer diagnositic的 panel， 100多个
gene呢
【在 b****r 的大作中提到】
: 那个帖子我记得。我可没有不屑一顾。你说的是已经在临床上用得很多了，这个就是瞎
: 扯了。科研和临床是两码事，这个我觉得你还是得搞清楚
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b****r
发帖数: 17995 | 63 能发个链接吗？
这玩意一个月一个月不一样。我们也在做这个，希望能尽快也投到临床上去
【在 r******g 的大作中提到】
: cfDNA 有挺多小公司的
: 前几天 刚停过一个加州的公司的讲座～ 做的cancer diagnositic的 panel， 100多个
: gene呢
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w*********o
发帖数: 3030 | 64 This was posted one week ago,
64 replies
21 unique IDs
12503 hits |
r******g
发帖数: 600 | 65 https://www.genoptix.com/
【在 b****r 的大作中提到】
: 能发个链接吗？
: 这玩意一个月一个月不一样。我们也在做这个，希望能尽快也投到临床上去
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n******7
发帖数: 12463 | 66 那请你说说NIPS临床用得多不多
【在 b****r 的大作中提到】
: 那个帖子我记得。我可没有不屑一顾。你说的是已经在临床上用得很多了，这个就是瞎
: 扯了。科研和临床是两码事，这个我觉得你还是得搞清楚
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b****r
发帖数: 17995 | 67 我不想跟你吵。这个帖子我贴出来了，如果你说的cfDNA指的是NIPT，我同意，这玩意
在国内2011年年左右还是在我的导师那里做的，其中来龙去脉我想我比板上任何一个人
可能都清楚
你要说的是除NIPT之外其他的cfDNA，也就是那个帖子讨论的诊断各种疾病，我不敢苟
同。当然，这个领域发展非常快，也许明年就铺开了，这也是我现在这个帖子的核心
http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31945373_0_5.html
【在 n******7 的大作中提到】
: 那请你说说NIPS临床用得多不多
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b****r
发帖数: 17995 | 68 我看了这个网站，对于病人的对外服务项目在这里
https://www.genoptix.com/patients/test-options#test-types
我只看到三项，骨髓，外周血细胞和组织活检，没看到liquid biopsy之类
我自己现在就在亲手做liquid biopsy的CLIA test development，我已经采用的是最廉
价也应该非常敏感的手段，就做单位点仍然难度不小。以我的了解，做几十上百个位点
也许技术上没问题，但是目前患者和医保的支付能力是远远达不到覆盖成本的，这个东
西目前的瓶颈主要在于测序价格还是太高太高。我很难想象商业公司能够规模性的提供
这种临检项目。我在猜想是不是你听到的只是他们的一种营销策略，显示他们的技术实
力，并不是想靠这个赚钱？
【在 r******g 的大作中提到】
: https://www.genoptix.com/
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n******7
发帖数: 12463 | 69 cfDNA当然是包含NIPT
用在其他疾病上，严格的说，诊断不是很多，主要是监测和指导target therapy
【在 b****r 的大作中提到】
: 我不想跟你吵。这个帖子我贴出来了，如果你说的cfDNA指的是NIPT，我同意，这玩意
: 在国内2011年年左右还是在我的导师那里做的，其中来龙去脉我想我比板上任何一个人
: 可能都清楚
: 你要说的是除NIPT之外其他的cfDNA，也就是那个帖子讨论的诊断各种疾病，我不敢苟
: 同。当然，这个领域发展非常快，也许明年就铺开了，这也是我现在这个帖子的核心
: http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31945373_0_5.html
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n******7
发帖数: 12463 | 70 版上在招人的accuragen就是做cfDNA的
【在 b****r 的大作中提到】
: 我看了这个网站，对于病人的对外服务项目在这里
: https://www.genoptix.com/patients/test-options#test-types
: 我只看到三项，骨髓，外周血细胞和组织活检，没看到liquid biopsy之类
: 我自己现在就在亲手做liquid biopsy的CLIA test development，我已经采用的是最廉
: 价也应该非常敏感的手段，就做单位点仍然难度不小。以我的了解，做几十上百个位点
: 也许技术上没问题，但是目前患者和医保的支付能力是远远达不到覆盖成本的，这个东
: 西目前的瓶颈主要在于测序价格还是太高太高。我很难想象商业公司能够规模性的提供
: 这种临检项目。我在猜想是不是你听到的只是他们的一种营销策略，显示他们的技术实
: 力，并不是想靠这个赚钱？
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r******g
发帖数: 600 | 71 他们挣不到钱
如果他们有 足够充足的病人量，每个chip能够run maximal sample size，to
minimize per patient cost, 每个病人的成本好像是 250USD, 但是insurance目前的
reimbursement少于100USD
所以，你说的对，他们应该挣不到钱～
目前主要的服务对象应该是 out of pockets 的人的钱
再者，
这种，小型技术公司，光挣病人的钱，也挣不了多少
拿足够的专利，做足够的宣传，然后 去 融资 找赞助，把公司做大，应该才是他们的
目的
能挣多少钱，以后再说呗
现在的小型技术公司，大多不都是这个套路？ 把公司融资扩大，然后转手卖给大公司
。大
公司的资源雄厚，有强大的advocacy团队，有希望能够 把90的reimbursement变成300
hopefully?
【在 b****r 的大作中提到】
: 我看了这个网站，对于病人的对外服务项目在这里
: https://www.genoptix.com/patients/test-options#test-types
: 我只看到三项，骨髓，外周血细胞和组织活检，没看到liquid biopsy之类
: 我自己现在就在亲手做liquid biopsy的CLIA test development，我已经采用的是最廉
: 价也应该非常敏感的手段，就做单位点仍然难度不小。以我的了解，做几十上百个位点
: 也许技术上没问题，但是目前患者和医保的支付能力是远远达不到覆盖成本的，这个东
: 西目前的瓶颈主要在于测序价格还是太高太高。我很难想象商业公司能够规模性的提供
: 这种临检项目。我在猜想是不是你听到的只是他们的一种营销策略，显示他们的技术实
: 力，并不是想靠这个赚钱？
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b****r
发帖数: 17995 | 72 你说的这个panel能给个他们网站内部的连接吗？我想借鉴一下但是没找到
【在 r******g 的大作中提到】
: 他们挣不到钱
: 如果他们有 足够充足的病人量，每个chip能够run maximal sample size，to
: minimize per patient cost, 每个病人的成本好像是 250USD, 但是insurance目前的
: reimbursement少于100USD
: 所以，你说的对，他们应该挣不到钱～
: 目前主要的服务对象应该是 out of pockets 的人的钱
: 再者，
: 这种，小型技术公司，光挣病人的钱，也挣不了多少
: 拿足够的专利，做足够的宣传，然后 去 融资 找赞助，把公司做大，应该才是他们的
: 目的
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h****n
发帖数: 333 | 73 你确定那个公司的cancer diagnostic panel是用的cfDNA吗？
如果是抽血的，会不会是一般的germline的cancer predisposition genes？
或者一般的用tumer tissue的？
【在 r******g 的大作中提到】
: cfDNA 有挺多小公司的
: 前几天 刚停过一个加州的公司的讲座～ 做的cancer diagnositic的 panel， 100多个
: gene呢
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r******g
发帖数: 600 | 74 http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
another perfect example how studying rare diseases may help common disease |
V******t
发帖数: 444 | 75 这篇文章牛啊
【在 r******g 的大作中提到】
: http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
: another perfect example how studying rare diseases may help common disease
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r******g
发帖数: 600 | 76 看临床效果了
能治愈白内障，这几个哥们人可以冲 大奖了
【在 V******t 的大作中提到】
: 这篇文章牛啊
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b****r
发帖数: 17995 | 77 白内障本来就是个小手术就能搞定的
【在 r******g 的大作中提到】
: 看临床效果了
: 能治愈白内障，这几个哥们人可以冲 大奖了
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b****r
发帖数: 17995 | 78 白内障本来就是个小手术就能搞定的
【在 r******g 的大作中提到】
: 看临床效果了
: 能治愈白内障，这几个哥们人可以冲 大奖了
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b****r
发帖数: 17995 | 79 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
NIH 2015年budget正好30B）。
http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
recommends $10 billion in extra funding for NIH over 5 years. |
o**4
发帖数: 35028 | |
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r******g
发帖数: 600 | 81 support for “young emerging scientists,” precision medicine, and a third
category still to be determined.
充分看好 precision medicine 未来10年的发展 |
l********8
发帖数: 197 | 82 好事，也说明美国经济在复苏，不然哪里可以这么烧钱。前一阵子回国了那么多人，现
在留在美国的人机会更多了。 |
F*Q
发帖数: 3259 | 83 经费增加当然是好事，只是增加幅度太小，这里受益的人恐怕不会有几个。
[在 bmwcar (decent) 的大作中提到：]
：总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
：NIH 2015年budget正好30B）。
：........... |
b****r
发帖数: 17995 | 84 怎么会，貌似已经5年没涨过了
这种钱，每年涨百分之几大家感觉都会很明显
10b（
【在 F*Q 的大作中提到】
: 经费增加当然是好事，只是增加幅度太小，这里受益的人恐怕不会有几个。
: [在 bmwcar (decent) 的大作中提到：]
: ：总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: ：NIH 2015年budget正好30B）。
: ：...........
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w*********o
发帖数: 3030 | 85 What's the difference between precision medicine and personal medicine?
Better sounding word? |
T****i
发帖数: 15191 | 86 靠，可惜对我来说晚点，我已经不能算Young scientist了。我看好Dua美眉和下弦月美
眉。
previous
【在 b****r 的大作中提到】
: 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: NIH 2015年budget正好30B）。
: http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
: A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
: biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
: National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
: FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
: Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
: around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
: version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
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r*****t
发帖数: 4793 | |
x********a
发帖数: 230 | 88 千老生性乐观哪。长一点就拍手叫好, 以前的血泪史都忘了。nih钱再跌下来,就有一群
四五十岁千老托家带口找不到工作。 真是千老命。 |
T****i
发帖数: 15191 | 89 是的，现有制度不改革，就是一个新的循环。没有科学家工会，国会就不把科学家当人
啊。
【在 x********a 的大作中提到】
: 千老生性乐观哪。长一点就拍手叫好, 以前的血泪史都忘了。nih钱再跌下来,就有一群
: 四五十岁千老托家带口找不到工作。 真是千老命。
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v*******e
发帖数: 11604 | 90 别的好说，就是这个“young scientist”不靠谱。应该支持老scientist，而不是支持
young的。说不好听的，这就是故意增大总生物人口，为将来生物更加苦逼添砖加瓦的
。等到young的变成中年了，support也没了，转行也来不及了。 |
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b****r
发帖数: 17995 | 91 这样的前提是生物继续当一个只能插管吸血的行业，不能自我造血
在这种行业的人，惨也不能怪社会。什么比较文学，天体物理，都不比生物好，说不定
更差，不要自怨自艾，觉得自己是全世界最惨淡
personalized medicine目前看起来就是生物成为自我造血行业的出路。希望这10B 鸡
血能让生物杀出一条血路，成为IT那样自我繁荣发展的路。NIH已经常年作为基础行业
吸纳税人血最多的行业了，在某些方向上取得一些有重大社会意义的突破也是应该的了
【在 T****i 的大作中提到】
: 是的，现有制度不改革，就是一个新的循环。没有科学家工会，国会就不把科学家当人
: 啊。
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b****r
发帖数: 17995 | 92 我自认为一直在这个领域里，干了十多年了。我觉得两者只有字面上的区别
【在 w*********o 的大作中提到】
: What's the difference between precision medicine and personal medicine?
: Better sounding word?
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T****i
发帖数: 15191 | 93 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
限。
【在 b****r 的大作中提到】
: 这样的前提是生物继续当一个只能插管吸血的行业，不能自我造血
: 在这种行业的人，惨也不能怪社会。什么比较文学，天体物理，都不比生物好，说不定
: 更差，不要自怨自艾，觉得自己是全世界最惨淡
: personalized medicine目前看起来就是生物成为自我造血行业的出路。希望这10B 鸡
: 血能让生物杀出一条血路，成为IT那样自我繁荣发展的路。NIH已经常年作为基础行业
: 吸纳税人血最多的行业了，在某些方向上取得一些有重大社会意义的突破也是应该的了
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s******y
发帖数: 17729 | 94 然并卵
不管咋治疗，效果如何，这些和千老有半毛钱关系？
过去几年国内的房子卖的火吧，房子盖的漂亮吧，各种楼盘抢手吧
国家城镇化支持力度大吧，中央左一个文件，又一个指示的维护房价
然而这些东西，和工地上的农民工有半毛钱关系？撑死也就是遇上好的包工头，不拖欠
工资，盒饭里多几块肉。这些政策对于不管是搬砖的，扛麻袋的小工，还是砍专的的大
工。有多大影响？
生物悲哀在于，读了一辈子书，连农民工的觉悟都不如。农民工尚且知道，城市豪华，
楼房漂亮，和自己半毛钱关系没有。从没见过几个农民工以某栋摩天大楼沾沾自喜过。
千老总是把那些和自己没关系的东西往自己身上扯。
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
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X**********g
发帖数: 13 | 95 Not really good for cancer research.
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
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b****r
发帖数: 17995 | 96 你这么想当然也可以
只能干这个工作的话，盒饭里多几块肉，工资都能到手，怎么叫做没半毛钱关系
我看到的叫兽或者出去创业的CEO都是搬砖的千老干出来的，我虽然混得不怎么样，也
是千老干出来的
现在又没有档案调令卡着人不能改行，不能出国或者回国。觉得这行没出路，赶紧换。
觉得自己有可能干点东西出来，就继续干。别搞得行业变景气了，结果还是在这里自怨
自艾，这个就不太合理了
【在 s******y 的大作中提到】
: 然并卵
: 不管咋治疗，效果如何，这些和千老有半毛钱关系？
: 过去几年国内的房子卖的火吧，房子盖的漂亮吧，各种楼盘抢手吧
: 国家城镇化支持力度大吧，中央左一个文件，又一个指示的维护房价
: 然而这些东西，和工地上的农民工有半毛钱关系？撑死也就是遇上好的包工头，不拖欠
: 工资，盒饭里多几块肉。这些政策对于不管是搬砖的，扛麻袋的小工，还是砍专的的大
: 工。有多大影响？
: 生物悲哀在于，读了一辈子书，连农民工的觉悟都不如。农民工尚且知道，城市豪华，
: 楼房漂亮，和自己半毛钱关系没有。从没见过几个农民工以某栋摩天大楼沾沾自喜过。
: 千老总是把那些和自己没关系的东西往自己身上扯。
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s******y
发帖数: 17729 | 97 说的搬砖民工人人都能干成包工头一样，啧啧，继续yy。
啥时候千老不拿着制药或者医疗的革新来自我麻醉了，这个行业就有救了。
从来没人质疑千老的辛苦付出会带来医药或者医疗的突飞猛进，就像没人质疑民工搬砖
会为城市摩天大楼的贡献一样。然并卵
现在看看那些睡在工棚的民工，有拿着城市的高楼来吹牛逼炫耀的吗？
【在 b****r 的大作中提到】
: 你这么想当然也可以
: 只能干这个工作的话，盒饭里多几块肉，工资都能到手，怎么叫做没半毛钱关系
: 我看到的叫兽或者出去创业的CEO都是搬砖的千老干出来的，我虽然混得不怎么样，也
: 是千老干出来的
: 现在又没有档案调令卡着人不能改行，不能出国或者回国。觉得这行没出路，赶紧换。
: 觉得自己有可能干点东西出来，就继续干。别搞得行业变景气了，结果还是在这里自怨
: 自艾，这个就不太合理了
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b****r
发帖数: 17995 | 98 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
现有这种突变DNA，那么就可以预警此人很可能已经有恶性肿瘤。大家应该都知道，早
期和晚期的恶性肿瘤可以说预后有天壤之别。我想在不远的将来，也许就是几年之后，
这样的检查手段就会极度的普及开来，每个人在45或50岁后每年都可以进行几次这样的
检测，会有很多的人本来可能活不到55岁，但是现在在一个几千人刀的CT检测+手术后
，能健康工作到60多岁退休，然后继续享受天伦之乐
其他的类似临床应用还有很多很多，无论什么疾病，归根结底大部分都是人或者微生物
的DNA/RNA的变化造成的，而DNA/RNA的检测可以说必然会继续以超过默尔定理的速度发
展若干年，因为实质上DNA/RNA的检测已经变成了标准的半导体技术。不是说每个生物
领域的人都能从这个技术获益，但是我相信有很多相关领域的同行都有机会搭上这趟快
车。我对此很乐观，也希望更多的人投身进来，推动整个行业的发展。我甚至觉得现在
的DNA/RNA分析相关领域将会类似于2000年左右的互联网领域，会在10年后改变整个社
会的面貌。实际上国内这一两年这个领域的风投和startup的热度，在我看来并不亚于
2000年的互联网。大家可以随便用中文搜索基因检测，看看有多少新成立的公司。
我们可以拭目以待。
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
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b****r
发帖数: 17995 | 99 我想板上的人有很多也记得我几年前还在千老的时候的帖子，而且还有一些人用这个信
息成功拿到了教职或者不错的公司职位，或者即将走上这样的岗位。我当然不是说每个
人都能更进一步，不过我相信接下来会有很多这样的机会，当然这样的机会只是给那些
积极向上的人，不会给那些自怨自艾还一堆负能量的人
【在 s******y 的大作中提到】
: 说的搬砖民工人人都能干成包工头一样，啧啧，继续yy。
: 啥时候千老不拿着制药或者医疗的革新来自我麻醉了，这个行业就有救了。
: 从来没人质疑千老的辛苦付出会带来医药或者医疗的突飞猛进，就像没人质疑民工搬砖
: 会为城市摩天大楼的贡献一样。然并卵
: 现在看看那些睡在工棚的民工，有拿着城市的高楼来吹牛逼炫耀的吗？
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w*********o
发帖数: 3030 | 100 Don't get too excited. I predict that using omics for cancer treatment is
the next biggest bust after the amyloid-beta :)
【在 b****r 的大作中提到】
: 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
: 白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
: 是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
: 突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
: 行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
: 遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
: 另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
: 什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
: 部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
: 人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
|
|
|
D*a
发帖数: 6830 | 101 你有病啊，我招你惹你了
【在 T****i 的大作中提到】
: 靠，可惜对我来说晚点，我已经不能算Young scientist了。我看好Dua美眉和下弦月美
: 眉。
:
: previous
|
s******y
发帖数: 17729 | 102 这回我没说你吧，以后我也不说你了，也不说下弦月了
【在 D*a 的大作中提到】
: 你有病啊，我招你惹你了
|
b****r
发帖数: 17995 | 103 amyloid-beta 有什么bust吗，没有感觉到过，不就是发现了一种常见病的机理，没觉
得有多少后续投资进去，跟omics是没法比的
【在 w*********o 的大作中提到】
: Don't get too excited. I predict that using omics for cancer treatment is
: the next biggest bust after the amyloid-beta :)
|
w*********o
发帖数: 3030 | 104 "后续投资"
it pretty much killed the neuroscience drug discovery in industry. For now,
I don't think pharma is even touching the Omics in their pipe lines other
than lip services :)
【在 b****r 的大作中提到】
: amyloid-beta 有什么bust吗，没有感觉到过，不就是发现了一种常见病的机理，没觉
: 得有多少后续投资进去，跟omics是没法比的
|
w********u
发帖数: 20 | 105 说的挺好的～ 我非常喜欢precision medicine~ YY一下～
precision medicine （PM） 主要的aim就是通过genomic/genetic analysis来 帮助
临床诊断， 临床治疗指南，推动 靶向治疗药物的研发。 PM有希望 完全改变临床 癌
症诊断 和 治疗的指南。
接下来的20年，NIH NCI 会往PM里面扔很多钱，估计PI们来申请 PM相关的科研，主要
的目的可能会有几个方向：
1. 哪些突变 容易引起某系癌症？ （如同bmwcar说的）但是，这个领域，已经基本上
被挖光了。。。 类似BCL-ABL 的 determinant gene 导致 的 癌症，估计已经发现的
差不多了 （BRCA，VHL，BCL-ABL, NF1, NF2,........ 一大堆）。
2. 哪些 突变/genetic background 让病人 的肿瘤 对 某些化疗药 更sensitive？ 那
些让病人的肿瘤 对 化疗药物 resistant? （目前 相同 肿瘤病人 几乎接受的是一样
的standard的化疗...）
3. 哪些 突变/genetic background 让病人 更容易复发？(比较典型的例子，是前不久
国内发的那篇B-ALL的复发的Nat Med paper: Nature Medicine 21, 563–571 (2015)
doi:10.1038/nm.3840)
4. 如何 通过genomics技术 帮助 早期癌症的 诊断？
等等等
意淫 20年后，如果PM成功，每一种肿瘤 都有 一个“相关肿瘤预后的gene array”。
一个女病人去医院，乳腺肿块。活检乳腺癌 “乳腺癌”。根据 20年的PM，一共有160
个genes跟 乳腺癌的治疗 和 预后 相关。然后，把病人的肿瘤组织 直接进行160 gene
的chip（standard kit）。chip完成以后，比如 病人一共有30个gene 突变，主要集中
于 位于 2条pathways （比如purine synthesis 和 multi-drug resistant pathway）
。这样，病人的 病理诊断 是 乳腺癌105型 （根据 病理 ，临床 和 genetics结果，
比如一共有 1-200个亚型，每一个亚型都有一个不同的化疗方案）。那么 这个 病人，
由于 有purine sythesis 的突变，化疗方案里面 则会增加有 一个 靶向target
purine synthesis pathway的药物, 以及 增加一个 靶向 target MDR的化疗药。
这个工程 会 有大量的新药物研发，大量的startup，大量的genetic study！ 目前已
经有很多小公司开发 gene array来进行 早期肿瘤诊断了 （目前问题是 保险公司的
reimbursement 太低了）
以后oncologists 还需要有 genomics/genetics background，或者 以后的 clinical
geneticist 会更多～ 感觉如果PM 成功，以后临床治疗指南 将会 完全改变。
可能有人会讨论 肿瘤heterogeneity的问题... 至于 这个问题，目前可以说 是
scientists的speculation。真理都是试出来的，等几年 看看PM 能不能成功～
保险公司的 reimbursement 可能 是大问题？？？.......
YY结束！
【在 b****r 的大作中提到】
: 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
: 白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
: 是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
: 突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
: 行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
: 遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
: 另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
: 什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
: 部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
: 人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
|
b****r
发帖数: 17995 | 106 没错，到底效果如何，都是试出来的，现在都是预测而已。
也许有很多新的driver mutation被挖出来也不一定。虽然说单个就能致病的driver
mutation可能如你所说挖得差不多了，但也许对于任何一"种"肿瘤，实际上其实是很多
种完全不同的肿瘤，癌种是由两个或者多个driver突变的 组合 来定义，治疗方案（不
一定要Imatinib 或者全反式维甲酸这样直接针对突变本身，可以是几种已有的化疗方
案中的一种）才是最优的。这个在血液系肿瘤的临床应用中已经很普遍了，实体瘤则还
有很多工作要做。这个你刚才也基本提到了。
这个中间有很多重要的工作需要完成，一方面是对肿瘤的进一步测序分析（临床学家，
遗传学家和生物信息学家来做这个），一方面是研究这些突变的组合，哪些才是最具有
生物学意义的（其他那些只是passenger mutation），这个是做信号通路的人的拿手好
戏。然后就可以针对这样的组合来进行药物筛选，高通量lab，动物中心和药厂来做这
个工作
【在 w********u 的大作中提到】
: 说的挺好的～ 我非常喜欢precision medicine~ YY一下～
: precision medicine （PM） 主要的aim就是通过genomic/genetic analysis来 帮助
: 临床诊断， 临床治疗指南，推动 靶向治疗药物的研发。 PM有希望 完全改变临床 癌
: 症诊断 和 治疗的指南。
: 接下来的20年，NIH NCI 会往PM里面扔很多钱，估计PI们来申请 PM相关的科研，主要
: 的目的可能会有几个方向：
: 1. 哪些突变 容易引起某系癌症？ （如同bmwcar说的）但是，这个领域，已经基本上
: 被挖光了。。。 类似BCL-ABL 的 determinant gene 导致 的 癌症，估计已经发现的
: 差不多了 （BRCA，VHL，BCL-ABL, NF1, NF2,........ 一大堆）。
: 2. 哪些 突变/genetic background 让病人 的肿瘤 对 某些化疗药 更sensitive？ 那
|
b****r
发帖数: 17995 | 107 I C
不过这个应该在整个生物界甚至社会上算不得什么影响吧
和现在每个人都打鸡血一样说的 精准医疗 还是差得很远的
不过如果你说的omics是想通过一种由几千几万甚至更多的数据点的pattern来描述定义
一种疾病，那我完全同意那是个bust。放在学校里那就是system biology，我觉得也是
吹牛占90%
我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
变 来定义一种疾病
,
【在 w*********o 的大作中提到】
: "后续投资"
: it pretty much killed the neuroscience drug discovery in industry. For now,
: I don't think pharma is even touching the Omics in their pipe lines other
: than lip services :)
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w*********o
发帖数: 3030 | 108 The money NIH spent on bio R&D is really small comparing to pharma/biotech
and much less effective. The data from industry is much more trustworthy and
not from slave labor, if they were published.
我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
变 来定义一种疾病
--- the diseases that can be defined in such a simple way are already
defined, and are usually Orphan disease :)
【在 b****r 的大作中提到】
: I C
: 不过这个应该在整个生物界甚至社会上算不得什么影响吧
: 和现在每个人都打鸡血一样说的 精准医疗 还是差得很远的
: 不过如果你说的omics是想通过一种由几千几万甚至更多的数据点的pattern来描述定义
: 一种疾病，那我完全同意那是个bust。放在学校里那就是system biology，我觉得也是
: 吹牛占90%
: 我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
: 变 来定义一种疾病
:
: ,
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b****r
发帖数: 17995 | 109 你觉得工业界的R&D效率就一定更高，对于有些方向也许是，肯定有我不了解的东西。
不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳
。但是每个基因的发现，直接使所有该遗传病患者和其家庭获益。这是一个小例子。前
面我举的几个个体化医疗的target mutation，也不是什么工业界做出来的。
关于你说的第二点，你可以去看看现在的nature genetics， A J Human Genetics，每
一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆，这个能叫做already defined？而且现在主
要还只能做这些high penetrance的单基因，low penetrance的难度更大，还有很多空
白点，这个工作还根本没有做完。人20000多基因，不说所有基因都和单基因有关，就
算1/3和单基因有关（这也是学界公认的比例），7000左右，现在还只有4000多被“
define”了，留给遗传学家的东西还不少。
而如果是bi allelic 致病，理论上你需要的sample size是做单基因疾病的平方。你想
想现在还差多远吧。 我们现在看到貌似常见的肿瘤（前面的帖子我已经提到了），或
者冠心病，糖尿病，先心病，大家都称他们为都是“多因素病”，其实现在人类的技术
还根本没有搞清楚是不是真是如此，在这之前，只好糊涂一把，统一叫做“多因素病”
。大量的GWAS，数学模型都是建立在单个位点的计算上，而根本没有足够的power计算
locus*locus interaction这样的可能性，原因就是我说的，现在人类能做到的power根
本不够，多一个locus参与interaction，sample size就要多一次方。
当然，我不是说这些常见病就一定是di-genic，双位点致病，但是绝对不是你说的那
样”defined“。这个问题人类还根本没有能力回答。不过随着测序技术的摩尔式发展
，我想不需要等很久。摩尔式发展的威力，可以参考那个象棋格子里放1，2，4.。粒麦
子的故事。
and
【在 w*********o 的大作中提到】
: The money NIH spent on bio R&D is really small comparing to pharma/biotech
: and much less effective. The data from industry is much more trustworthy and
: not from slave labor, if they were published.
: 我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
: 变 来定义一种疾病
: --- the diseases that can be defined in such a simple way are already
: defined, and are usually Orphan disease :)
|
w*********o
发帖数: 3030 | 110 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
--- Because there is no market for it.
每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
, the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
lot of projects never even get off ground because the published findings are
not repeatable.
不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
--- The individual situation is much more complex than the sequence of human
genome, which is stable and largely a technical issue. Most people can
afford have their genome sequenced, but I don't expect that the genomic
sequence, free from the tampering of environment and aging process, can be
used for disease treatment in my life time.
大家都称他们为都是“多因素病”，
--- I am more inclined to believe most disease, including cancer, are “多因
素病”. That's not to say personalized medicine is not the direction. It is
just a long, long, ... long term goal.
【在 b****r 的大作中提到】
: 你觉得工业界的R&D效率就一定更高，对于有些方向也许是，肯定有我不了解的东西。
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳
: 。但是每个基因的发现，直接使所有该遗传病患者和其家庭获益。这是一个小例子。前
: 面我举的几个个体化医疗的target mutation，也不是什么工业界做出来的。
: 关于你说的第二点，你可以去看看现在的nature genetics， A J Human Genetics，每
: 一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆，这个能叫做already defined？而且现在主
: 要还只能做这些high penetrance的单基因，low penetrance的难度更大，还有很多空
: 白点，这个工作还根本没有做完。人20000多基因，不说所有基因都和单基因有关，就
: 算1/3和单基因有关（这也是学界公认的比例），7000左右，现在还只有4000多被“
: define”了，留给遗传学家的东西还不少。
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T****i
发帖数: 15191 | 111 你们年轻，又热爱生物，这不是机会来了吗？我真心的。我认为其他在Career早期，读
博和刚做博后的，这也许是个好时机，只不过我只记得你们两个的ID。
【在 D*a 的大作中提到】
: 你有病啊，我招你惹你了
|
r******g
发帖数: 600 | 112 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 extreme phenotype来 研究 non-extreme common
disease 才是 这个圈子的真正目的。 而这样的科研，是纯机制的科研，当然 只有学
术圈来做了
我给你举个经典例子吧：80-90年代，RP lifton等人的组，发现全世界 2个地方 的人
，有不少人 患有非常严重的 hypertension （extreme cases)。 于是，他们通过
linkage study，发现了很多病人有 angiotensinogen 这个gene的mutation。 其实 你
仔细想想，大多数 高血压都是 原发的，与mutation无关。 但是，RP lifton的这个科
研，立刻让biochemists发现了 angiotensin pathways。接下来，大家发现 大多数
hypertension都跟 angiotensin pathway被激活有关（但是并非mutation）。 然后，
大家发现了 angiotensin pathway的抑制剂。 接下来，最常用的 治疗高血压药物 “
ARB，ATI” 就发明出来了。 这是一个 经典的例子，通过rare disease 来研究
common disease。
事实上，大多数 疾病都不仅仅是由mutation导致的。那些rare disease的科研，只能
用于 研究 机制，然后运用于common disease。 企图 通过研究monogenic disease来
治疗 orphan disease是 木有意义的。
所以，你的理解 可能有偏差。
最后，precision medicine 跟 RP lifton他们做的 这些 mendelian traits的
diseases 是完全不同的两个领域。当然，RP lifton由于 江湖地位很高， 在
precision medicine中，身兼要职。precision medicine的 最终 目的，应该集中在
肿瘤领域。通过不同的genetic pattern，来帮助 诊断，治疗，化疗方案，癌症预后预
测。
【在 b****r 的大作中提到】
: 你觉得工业界的R&D效率就一定更高，对于有些方向也许是，肯定有我不了解的东西。
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳
: 。但是每个基因的发现，直接使所有该遗传病患者和其家庭获益。这是一个小例子。前
: 面我举的几个个体化医疗的target mutation，也不是什么工业界做出来的。
: 关于你说的第二点，你可以去看看现在的nature genetics， A J Human Genetics，每
: 一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆，这个能叫做already defined？而且现在主
: 要还只能做这些high penetrance的单基因，low penetrance的难度更大，还有很多空
: 白点，这个工作还根本没有做完。人20000多基因，不说所有基因都和单基因有关，就
: 算1/3和单基因有关（这也是学界公认的比例），7000左右，现在还只有4000多被“
: define”了，留给遗传学家的东西还不少。
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r******g
发帖数: 600 | 113 你 第一 第二点 理解的很对
但是，请看我 上一条回复 里面那个例子！ 希望，能解释一些问题。 这些monogenic
diseases的科研，不只有novelties！ 其实是大有文章，只是biochemists不follow而已
至于你的第三点，我发现27楼写的很好，感觉 能给你 partial answer！
劳。
"
verifications
decided
are
human
【在 w*********o 的大作中提到】
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
: --- Because there is no market for it.
: 每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
: are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
: , the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
: to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
: lot of projects never even get off ground because the published findings are
: not repeatable.
: 不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
: --- The individual situation is much more complex than the sequence of human
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c********e
发帖数: 598 | 114
If you pay attention to the changes of industry, you will find
1) Some rare disease has good market outlook.
2) Today our concept of whether particular gene can be drugable is quite
different now.
3)Even if many diseases are caused by multiple factors, the trick is not to
solve
the factor but to stop the progression or induce remission (not limited to
oncology)
【在 w*********o 的大作中提到】
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
: --- Because there is no market for it.
: 每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
: are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
: , the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
: to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
: lot of projects never even get off ground because the published findings are
: not repeatable.
: 不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
: --- The individual situation is much more complex than the sequence of human
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c********e
发帖数: 598 | 115
I think your perspective is limited to genetic diseases. The system biology
will have a jump start.
【在 b****r 的大作中提到】
: I C
: 不过这个应该在整个生物界甚至社会上算不得什么影响吧
: 和现在每个人都打鸡血一样说的 精准医疗 还是差得很远的
: 不过如果你说的omics是想通过一种由几千几万甚至更多的数据点的pattern来描述定义
: 一种疾病，那我完全同意那是个bust。放在学校里那就是system biology，我觉得也是
: 吹牛占90%
: 我喜欢的是一个一个的数据点/突变，在可以展望的将来，最多是两个两个的数据点/突
: 变 来定义一种疾病
:
: ,
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s******y
发帖数: 28562 | 116 说得非常好。很多时候研究罕见疾病其实是为了找机理，而不是为了特地的去研究那个
罕见疾病。不过这个道理不要说普通博士后或者学生了，连一些PI都不一定知道。
另外，我最近偶然知道了国内某大牛（饶毅）对疾病研究的态度，让我大吃一惊，
他似乎觉得只有纯基础研究是值得做的，凡是做疾病的都是歪门邪道。我不知道说这个
事情的人有没有冤枉他，但是如果那些身居高位的生物研究者都是这样的话，国内的生
物研究的高投入估计持续了不多久就要崩溃了。
【在 r******g 的大作中提到】
: 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
: 其实你们两个人 说的是对的
: 你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
: 目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
: 全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
: 来寻找 human knockout的phenotype。
: 通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
: 临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
: mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
: 自然也不会对这个领域感兴趣...
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r******g
发帖数: 600 | 117 居然得到 胖头鱼 老师的表扬！ 谢谢
最近 悟出来的～ 最近读paper悟出来不少道理！
【在 s******y 的大作中提到】
: 说得非常好。很多时候研究罕见疾病其实是为了找机理，而不是为了特地的去研究那个
: 罕见疾病。不过这个道理不要说普通博士后或者学生了，连一些PI都不一定知道。
: 另外，我最近偶然知道了国内某大牛（饶毅）对疾病研究的态度，让我大吃一惊，
: 他似乎觉得只有纯基础研究是值得做的，凡是做疾病的都是歪门邪道。我不知道说这个
: 事情的人有没有冤枉他，但是如果那些身居高位的生物研究者都是这样的话，国内的生
: 物研究的高投入估计持续了不多久就要崩溃了。
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s******y
发帖数: 28562 | 118 这个关于为什么要研究罕见疾病的问题是发考题面试的时候的经典问题之一。
所以说你是个好学生啊。要是我的学生们有你一半的程度就好了，我经常在上课的时候
被他们气个半死。
【在 r******g 的大作中提到】
: 居然得到 胖头鱼 老师的表扬！ 谢谢
: 最近 悟出来的～ 最近读paper悟出来不少道理！
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r******g
发帖数: 600 | 119 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
【在 s******y 的大作中提到】
: 这个关于为什么要研究罕见疾病的问题是发考题面试的时候的经典问题之一。
: 所以说你是个好学生啊。要是我的学生们有你一半的程度就好了，我经常在上课的时候
: 被他们气个半死。
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c********e
发帖数: 598 | 120
You should go precise medicine directly.
【在 r******g 的大作中提到】
: 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
: 向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
|
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c********e
发帖数: 598 | 121
Ultra-Rare Diseases
Alexion is focused on providing life-transforming treatments to patients
with severe and life-threatening rare diseases for which there are few, if
any, effective treatment options.
The impact of these diseases on patients, their families, and society is
profound as many are severe, chronic and progressive, with high mortality
rates. Ultra-rare diseases often present unique public health challenges.
Typically, few researchers or companies explore such diseases. It is also
highly likely that very few physicians are familiar with diagnosing and
treating these conditions, leading to missed, delayed or inaccurate
diagnosis and thereby delaying treatment, even when an approved, effective
therapy is available.
When developing treatments for patients with rare and ultra-rare diseases,
often there are no pre-existing regulatory pathways or prior controlled
studies. Alexion is one of the few companies in this field with a proven
track record in drug discovery, regulatory affairs, clinical trial design
and recruitment, and manufacturing.
Our approach to serving patients is driven by education and a passion for
understanding and meeting the unique needs of patients and families
suffering from rare and ultra-rare diseases.
【在 s******y 的大作中提到】
: 这个关于为什么要研究罕见疾病的问题是发考题面试的时候的经典问题之一。
: 所以说你是个好学生啊。要是我的学生们有你一半的程度就好了，我经常在上课的时候
: 被他们气个半死。
|
b****r
发帖数: 17995 | 122 也许，我并不排斥这种可能性，所以我只说90%是吹。大家边走边瞧吧
我对genetic disease的定义很广泛，包括肿瘤，各种有家族倾向的常见慢性病，也包
括病原微生物，因为它们的生命过程以及与宿主的互作也几乎完全是由它们的DNA/RNA
决定的。将来也许这个定义会更广泛，当然也可能我估计过高，呵呵
biology
【在 c********e 的大作中提到】
:
: Ultra-Rare Diseases
: Alexion is focused on providing life-transforming treatments to patients
: with severe and life-threatening rare diseases for which there are few, if
: any, effective treatment options.
: The impact of these diseases on patients, their families, and society is
: profound as many are severe, chronic and progressive, with high mortality
: rates. Ultra-rare diseases often present unique public health challenges.
: Typically, few researchers or companies explore such diseases. It is also
: highly likely that very few physicians are familiar with diagnosing and
|
b****r
发帖数: 17995 | 123
的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
--- Because there is no market for it.
again，临床上光是产前诊断一项就是一个巨大的市场，而且是一个在以指数级递增的
大市场。当然，相信你不是临床出身，这方面不一定有关注
每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
, the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
lot of projects never even get off ground because the published findings are
not repeatable.
同样的，你对基因疾病的认识还停留在是否drugable这样一个简单的认识层面。前面提
到了血液病的例子，大量的血液肿瘤相关突变并不drugable，甚至功能不明，但是这不
妨碍以此对疾病进行个体化细分，因为这些突变很可能决定了肿瘤的生物行为，比如是
否对DNA损伤敏感，是不是基因组不稳定，甚至一些我们还根本不懂的原因。只要我们
能正确的细分肿瘤类别，就可以针对性进行临床试验总结出哪一种药物对什么样的化疗
药物最敏感。这实际上已经是血液科大部分肿瘤的指南内容。
对于普通遗传病，同样的，知道什么基因致病就可以帮助这些家庭进行产前诊断。就算
一个最罕见的遗传病，全世界只有几十个家庭有，但是你一篇文章可以改变这几十个家
庭的命运，这个难道不是可以让人感到很光荣的成就吗。经济角度其实更是如此。一个
患儿的出身，接下来可能就是父母以及双方家庭几十年的磨难与无穷无尽的经济投入，
以及社会福利的支出
不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
--- The individual situation is much more complex than the sequence of human
genome, which is stable and largely a technical issue. Most people can
afford have their genome sequenced, but I don't expect that the genomic
sequence, free from the tampering of environment and aging process, can be
used for disease treatment in my life time.
这个我们可以拭目以待。again，不要小看莫尔定理的威力。
大家都称他们为都是“多因素病”，
--- I am more inclined to believe most disease, including cancer, are “多因
素病”. That's not to say personalized medicine is not the direction. It is
just a long, long, ... long term goal.
同上
【在 w*********o 的大作中提到】
: 不过打比方对于罕见遗传病基因的寻找，工业界几乎没有贡献，基本都是学术界的功劳。
: --- Because there is no market for it.
: 每一期都还有n个新的单基因疾病基因被克隆 --- what percentage of of those "n"
: are real and drug-able? I think generally, without independent verifications
: , the papers can only be treated as novelties. Usually, if a company decided
: to take on a target, the key data will have to be repeated in house and a
: lot of projects never even get off ground because the published findings are
: not repeatable.
: 不过随着测序技术的摩尔式发展，我想不需要等很久。
: --- The individual situation is much more complex than the sequence of human
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b****r
发帖数: 17995 | 124
懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
--你不能把眼球停留在眼前，应该放眼10年以后，你职业生涯的成熟期。100，000人一
例患者，全世界有多少患者？数十万！测序技术的普及以及互联网，在几年后就会把这
几十万人基本连成一个整体。而且，这些患者的致病原因都是非常均一的（特别是和现
在的多因素疾病相比），对药物的反应也很可能均一得多。而且突变基因的功能可能是
非常清楚的，靶向药物的设计完全可以进行educated guess，不需要shoot in the
dark，这都是颠覆现有概念的新事物。此外，你如果读完我那篇链接的全文，我记得提
到了FDA对这种罕见病药物的最短通过时间是4天。对，你没看错，4天。 这是一个
巨大的市场。
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 extreme phenotype来 研究 non-extreme common
disease 才是 这个圈子的真正目的。 而这样的科研，是纯机制的科研，当然 只有学
术圈来做了
我给你举个经典例子吧：80-90年代，RP lifton等人的组，发现全世界 2个地方 的人
，有不少人 患有非常严重的 hypertension （extreme cases)。 于是，他们通过
linkage study，发现了很多病人有 angiotensinogen 这个gene的mutation。 其实 你
仔细想想，大多数 高血压都是 原发的，与mutation无关。 但是，RP lifton的这个科
研，立刻让biochemists发现了 angiotensin pathways。接下来，大家发现 大多数
hypertension都跟 angiotensin pathway被激活有关（但是并非mutation）。 然后，
大家发现了 angiotensin pathway的抑制剂。 接下来，最常用的 治疗高血压药物 “
ARB，ATI” 就发明出来了。 这是一个 经典的例子，通过rare disease 来研究
common disease。
事实上，大多数 疾病都不仅仅是由mutation导致的。那些rare disease的科研，只能
用于 研究 机制，然后运用于common disease。 企图 通过研究monogenic disease来
治疗 orphan disease是 木有意义的。
所以，你的理解 可能有偏差。
--这方面我倒并不是特别给予厚望。我始终认为人和动物的区别并不是那么大。而且动
物模型，humanized animal也是一个发展很快的领域。在这之后，必须以人作为疾病模
型才能研究清楚的东西，也许只有10%（我瞎猜一个数字，但我觉得肯定是一小部分）
。如果想做机制，高等动物模型的优势还是多太多了，可控实验条件，均一遗传背景，
快速繁殖传代。
最后，precision medicine 跟 RP lifton他们做的 这些 mendelian traits的
diseases 是完全不同的两个领域。当然，RP lifton由于 江湖地位很高， 在
precision medicine中，身兼要职。precision medicine的 最终 目的，应该集中在
肿瘤领域。通过不同的genetic pattern，来帮助 诊断，治疗，化疗方案，癌症预后预
测。
--我个人做了十多年的mendelian traits，最近才比较多接触precision medicine，不
过我个人会把单基因遗传病放到precision medicine中来作为其中一部分。因为无论实
验方法，实验对象，基础知识等等，两者的重合度都是极高的。毕竟归根结底，两者都
是基因病，一个是germline mutation，一个是somatic mutation
【在 r******g 的大作中提到】
: 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
: 向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
|
r******g
发帖数: 600 | 125 嗯，开发药物那个，说的还是有道理的！ 没想到 FDA可以approve的这么快～
rare disease 里面，biallelic loss-of-function的 很多都是无法治疗的，根本无法
开发药物 （除了一些 已知的代谢疾病，可以进行 supplement治疗）。绝大多数
biallelic的 已知的rare disease 致病基因都是 细胞内的 蛋白问题，几乎无法开发
药物target。
Autosomal dominant的 rare disease 还是比较适合 开发target therapy的.
【在 b****r 的大作中提到】
:
: 懂得不多，只是提提个人观点
: 其实你们两个人 说的是对的
: 你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
: 目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
: 全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
: 来寻找 human knockout的phenotype。
: 通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
: 临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
: mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
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f**********e
发帖数: 185 | 126 great!
previous
【在 b****r 的大作中提到】
: 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: NIH 2015年budget正好30B）。
: http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
: A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
: biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
: National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
: FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
: Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
: around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
: version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
|
b****r
发帖数: 17995 | 127 代谢疾病 正是遗传病里最常见已知的类别啊。不光是酶替代疗法（可以看看Genezyme
的信息）和昂贵的特殊饮食，还有现在最热的干细胞，CRISPR knockin，转基因，都被
你无视了啊。
结构蛋白也有办法，比如cystic fibrosis （美国最常见的隐性遗传病，白人中携带率
1/25）G551D这种突变，最近开发出一种药物针对这种点突变的异常蛋白有非常好的疗
效。当然钱也是滚滚而来
In the first 9 months of its second year on the market (2014), ivacaftor
sales were $339M
https://en.wikipedia.org/wiki/Ivacaftor
【在 r******g 的大作中提到】
: 嗯，开发药物那个，说的还是有道理的！ 没想到 FDA可以approve的这么快～
: rare disease 里面，biallelic loss-of-function的 很多都是无法治疗的，根本无法
: 开发药物 （除了一些 已知的代谢疾病，可以进行 supplement治疗）。绝大多数
: biallelic的 已知的rare disease 致病基因都是 细胞内的 蛋白问题，几乎无法开发
: 药物target。
: Autosomal dominant的 rare disease 还是比较适合 开发target therapy的.
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d***s
发帖数: 1062 | 128
我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
【在 r******g 的大作中提到】
: 目前马上 薄厚 考虑 换 方向，从 老鼠免疫（基础免疫） 换入 genomics/genetics方
: 向～ 胖头鱼老师，怎么看 未来的前景？
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r******g
发帖数: 600 | 129 :D
私信
【在 d***s 的大作中提到】
:
: 我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
: 会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
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v**********m
发帖数: 5516 | 130 不改变现有的职业发展制度，钱越多，祸害的人越多。
基础科研领域的包工头最招人恨的一点是他们需要大量的廉价劳动力来维持自己作坊的
低水平重复生产，他们不遗余力的鼓吹新人入行。
具体的手段是用PhD的头衔来吸引新的廉价劳力，把他们当易耗品(施在美国做PI时的原
话)，基本上用十年就扔 掉，换新的一批。
生产模式基本是血汗工厂，玩命的加班，低薪，多雇人，以量取胜，员工没有向上发展
的空间。
这些行业的现状就像烂泥地玩高密度的摔跤拍板砖。令狐冲也会死在闷砖之下，没机会
做五岳盟主。
这种模式下，已经没有天才的培养土壤，甚至没有高智商PhD成长的土壤，看清现实，
有能力转行的都走了。看看北清的本科毕业生，没多少留了下来继续做学术。痴迷基础
研究的人最后也被学术圈赶走，比如那个克隆gfp的司机。因为学术圈需要小鲜肉的体
力来支撑血汗工厂。
一堆中年主动或被迫转行的故事和新人入行受骗的故事同时在发生。故事非常荒诞但正
在真实的发生。
previous
【在 b****r 的大作中提到】
: 总结：21st Century Cures Act 刚在国会获得通过，今后5年NIH budget将增加10b（
: NIH 2015年budget正好30B）。
: http://news.sciencemag.org/funding/2015/04/wake-new-cures-bill-
: A day after the much-heralded rollout of a new draft bill to accelerate
: biomedical innovation, lawmakers got some feedback from officials at the
: National Institutes of Health (NIH) and the Food and Drug Administration (
: FDA). In a hearing held by the Health Subcommittee of the U.S. House of
: Representatives’ Energy and Commerce Committee, much of the buzz centered
: around a proposal to bump up NIH funding—a dramatic change from a previous
: version of the bill, known as the 21st Century Cures Act. The new draft
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T****i
发帖数: 15191 | 131 我前老板也是这种思路。她做的也蛮好的。可惜，跟我们领域的主要疾病差别太大。所
以对主要的那几个病没什么参考价值。她生存没问题，而我再想走同样的路，别人就不
太买账了。
【在 b****r 的大作中提到】
: 代谢疾病 正是遗传病里最常见已知的类别啊。不光是酶替代疗法（可以看看Genezyme
: 的信息）和昂贵的特殊饮食，还有现在最热的干细胞，CRISPR knockin，转基因，都被
: 你无视了啊。
: 结构蛋白也有办法，比如cystic fibrosis （美国最常见的隐性遗传病，白人中携带率
: 1/25）G551D这种突变，最近开发出一种药物针对这种点突变的异常蛋白有非常好的疗
: 效。当然钱也是滚滚而来
: In the first 9 months of its second year on the market (2014), ivacaftor
: sales were $339M
: https://en.wikipedia.org/wiki/Ivacaftor
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s******a
发帖数: 252 | 132 It may not be a good idea - genomics is just as a crowded field.
On the other hand, human immunology is on a rapid rise, thanks to all the
big data.
【在 d***s 的大作中提到】
:
: 我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
: 会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
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n******7
发帖数: 12463 | 133 要居安思危
暂时稳定下来了就要赶快考虑下一步路
不要等到下一轮危机了才醒悟
【在 x********a 的大作中提到】
: 千老生性乐观哪。长一点就拍手叫好, 以前的血泪史都忘了。nih钱再跌下来,就有一群
: 四五十岁千老托家带口找不到工作。 真是千老命。
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b****r
发帖数: 17995 | 134 我完全同意即使加大投入，大部分生物基础行业的人日子仍然会十分艰辛。我觉得你可
能没太明白我这篇文章的重点：生物领域有一块，也就是和precision medicine相关的
领域有机会从基础研究脱胎出去，成为和IT ，互联网一样可以自我造血，不再仰人鼻
息的热门专业。实际上我自己可以说就跨进了这个门，虽然还是留在高校当AP，但是我
没有funding的压力，外面也多的是公司机会，经常收到猎头的信
可以看看我3年前的相关帖子
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31476677.html
当然，我不是什么牛人也谈不上什么收入好，但是我坚信这个领域会继续蓬勃的发展，
会造就一批和IT界一样的富翁，而生物口的人如果基础好，很多人是完全有可能跨入这
个领域的
【在 v**********m 的大作中提到】
: 不改变现有的职业发展制度，钱越多，祸害的人越多。
: 基础科研领域的包工头最招人恨的一点是他们需要大量的廉价劳动力来维持自己作坊的
: 低水平重复生产，他们不遗余力的鼓吹新人入行。
: 具体的手段是用PhD的头衔来吸引新的廉价劳力，把他们当易耗品(施在美国做PI时的原
: 话)，基本上用十年就扔 掉，换新的一批。
: 生产模式基本是血汗工厂，玩命的加班，低薪，多雇人，以量取胜，员工没有向上发展
: 的空间。
: 这些行业的现状就像烂泥地玩高密度的摔跤拍板砖。令狐冲也会死在闷砖之下，没机会
: 做五岳盟主。
: 这种模式下，已经没有天才的培养土壤，甚至没有高智商PhD成长的土壤，看清现实，
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v**********m
发帖数: 5516 | 135 谢有心人，先读读你的帖子。
【在 b****r 的大作中提到】
: 我完全同意即使加大投入，大部分生物基础行业的人日子仍然会十分艰辛。我觉得你可
: 能没太明白我这篇文章的重点：生物领域有一块，也就是和precision medicine相关的
: 领域有机会从基础研究脱胎出去，成为和IT ，互联网一样可以自我造血，不再仰人鼻
: 息的热门专业。实际上我自己可以说就跨进了这个门，虽然还是留在高校当AP，但是我
: 没有funding的压力，外面也多的是公司机会，经常收到猎头的信
: 可以看看我3年前的相关帖子
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31476677.html
: 当然，我不是什么牛人也谈不上什么收入好，但是我坚信这个领域会继续蓬勃的发展，
: 会造就一批和IT界一样的富翁，而生物口的人如果基础好，很多人是完全有可能跨入这
: 个领域的
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b****r
发帖数: 17995 | 136 有人问我pharmacogenomics/pharmacogenetics吗，尤其是在precision medicine方面
的前景，我对药理其实了解比较局限，尽力说说我的看法吧
我觉得药物的发展显然是滞后于相关的靶向的发现的。这不完全是由于药物的研发过程
漫长（这个基本是个硬杠杠，能改变的很有限），更多的时候其实是发现靶向（基因相
关领域）和药物研发领域互相之间的交集很少，做药的很多时候不知道有些什么靶向。
而我们基因相关领域的，对药物的研发过程相对也很陌生。比如我们的遗传系我也待了
好些年了，全美数一数二的大系，但是只有很少的几个老板做药物相关，而且一般也是
药厂主动找上门，或者用的是非常经典的思路，比如酶基因突变就补充那个酶。这样的
做法显然没有跟上时代的潮流，更别说成为时代弄潮儿。
我想几年后，市场会是这样一个方向，制药公司更多的雇佣遗传相关人士，或者聘请这
些人做consultant，与他们brain storm，共同提出领域里最新出现的一些有潜力的突
变，然后采用现代药物研发的方法，比如各种小分子筛选，抗体筛选，甚至CART 细胞
治疗来做药物。总之交叉型人才会越来吃香，对机制理解得越深刻，就越有机会提出最
好的靶向，而只会做比较简单经典的东西的人则会面临越来越多的就业压力，一方面来
自公司流水线，一方面来自第三世界的廉价劳动力 |
b****r
发帖数: 17995 | 137 我很久以前（大于7年）就觉得免疫和遗传是将来生物领域最有前景的两个方向。现在
看起来，我还是挺佩服我自己的眼光，生物口创业并成功的，今天看起来大多就是这
两个领域
免疫方面最近两年的突破我想你肯定比我更加关注。而这两者说老实话交集并不太大，
要成功的跳过来并且又不浪费你的免疫背景，我觉得需要很仔细的考虑，耐心的寻找机会
【在 d***s 的大作中提到】
:
: 我也是基础免疫要找genomics genetics方向。找了有一段时间了，感觉有很多博后机
: 会，但是都需要computational biology，bioinformatics 或者statistics的背景。
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n******7
发帖数: 12463 | 138 哈哈
几个月前我说起cfDNA的应用，你还不屑一顾
现在变得挺快嘛
【在 b****r 的大作中提到】
: 有些种类的肿瘤，大部分就是由一个driver mutation引起的，好的例子有慢性粒细胞
: 白血病的 BCR—ABL 融合基因，有急性早幼粒白血病的PML-RARA 。这两种白血病都不
: 是罕见病，而在这两种突变被发现后，对应的靶向抑制药物随后被研发出来，有这两种
: 突变的患者从之前的绝大部分5年内死亡变成了绝大部分能被治愈，这就是靶向药物进
: 行个体化治疗的威力。现在的一个主流工作就是寻找更多这样的突变，这个工作可以从
: 遗传技术入手，也可以从蛋白的功能，机制入手，也可以从突变的抑制方法入手。
: 另一个个体化医疗的临床应用是疾病的早期诊断。打个比方，有一些肿瘤突变虽然没有
: 什么好的药物，但是在正常细胞里不会出现，是很好的肿瘤marker。而肿瘤细胞总有一
: 部分会死亡，DNA会被释放到血液中，那么这个时候，比如说拿这个表现还完全正常的
: 人的血液，甚至唾液（唾液中相当一部分成分直接来自血液），抽取DNA进行测序，发
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b****r
发帖数: 17995 | 139 那个帖子我记得。我可没有不屑一顾。你说的是已经在临床上用得很多了，这个就是瞎
扯了。科研和临床是两码事，这个我觉得你还是得搞清楚
【在 n******7 的大作中提到】
: 哈哈
: 几个月前我说起cfDNA的应用，你还不屑一顾
: 现在变得挺快嘛
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b****r
发帖数: 17995 | 140 能发个链接吗？
这玩意一个月一个月不一样。我们也在做这个，希望能尽快也投到临床上去
【在 r******g 的大作中提到】
: cfDNA 有挺多小公司的
: 前几天 刚停过一个加州的公司的讲座～ 做的cancer diagnositic的 panel， 100多个
: gene呢
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w*********o
发帖数: 3030 | 141 This was posted one week ago,
64 replies
21 unique IDs
12503 hits |
r******g
发帖数: 600 | 142 https://www.genoptix.com/
【在 b****r 的大作中提到】
: 能发个链接吗？
: 这玩意一个月一个月不一样。我们也在做这个，希望能尽快也投到临床上去
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n******7
发帖数: 12463 | 143 那请你说说NIPS临床用得多不多
【在 b****r 的大作中提到】
: 那个帖子我记得。我可没有不屑一顾。你说的是已经在临床上用得很多了，这个就是瞎
: 扯了。科研和临床是两码事，这个我觉得你还是得搞清楚
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b****r
发帖数: 17995 | 144 我不想跟你吵。这个帖子我贴出来了，如果你说的cfDNA指的是NIPT，我同意，这玩意
在国内2011年年左右还是在我的导师那里做的，其中来龙去脉我想我比板上任何一个人
可能都清楚
你要说的是除NIPT之外其他的cfDNA，也就是那个帖子讨论的诊断各种疾病，我不敢苟
同。当然，这个领域发展非常快，也许明年就铺开了，这也是我现在这个帖子的核心
http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31945373_0_5.html
【在 n******7 的大作中提到】
: 那请你说说NIPS临床用得多不多
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b****r
发帖数: 17995 | 145 我看了这个网站，对于病人的对外服务项目在这里
https://www.genoptix.com/patients/test-options#test-types
我只看到三项，骨髓，外周血细胞和组织活检，没看到liquid biopsy之类
我自己现在就在亲手做liquid biopsy的CLIA test development，我已经采用的是最廉
价也应该非常敏感的手段，就做单位点仍然难度不小。以我的了解，做几十上百个位点
也许技术上没问题，但是目前患者和医保的支付能力是远远达不到覆盖成本的，这个东
西目前的瓶颈主要在于测序价格还是太高太高。我很难想象商业公司能够规模性的提供
这种临检项目。我在猜想是不是你听到的只是他们的一种营销策略，显示他们的技术实
力，并不是想靠这个赚钱？
【在 r******g 的大作中提到】
: https://www.genoptix.com/
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n******7
发帖数: 12463 | 146 cfDNA当然是包含NIPT
用在其他疾病上，严格的说，诊断不是很多，主要是监测和指导target therapy
【在 b****r 的大作中提到】
: 我不想跟你吵。这个帖子我贴出来了，如果你说的cfDNA指的是NIPT，我同意，这玩意
: 在国内2011年年左右还是在我的导师那里做的，其中来龙去脉我想我比板上任何一个人
: 可能都清楚
: 你要说的是除NIPT之外其他的cfDNA，也就是那个帖子讨论的诊断各种疾病，我不敢苟
: 同。当然，这个领域发展非常快，也许明年就铺开了，这也是我现在这个帖子的核心
: http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31945373_0_5.html
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n******7
发帖数: 12463 | 147 版上在招人的accuragen就是做cfDNA的
【在 b****r 的大作中提到】
: 我看了这个网站，对于病人的对外服务项目在这里
: https://www.genoptix.com/patients/test-options#test-types
: 我只看到三项，骨髓，外周血细胞和组织活检，没看到liquid biopsy之类
: 我自己现在就在亲手做liquid biopsy的CLIA test development，我已经采用的是最廉
: 价也应该非常敏感的手段，就做单位点仍然难度不小。以我的了解，做几十上百个位点
: 也许技术上没问题，但是目前患者和医保的支付能力是远远达不到覆盖成本的，这个东
: 西目前的瓶颈主要在于测序价格还是太高太高。我很难想象商业公司能够规模性的提供
: 这种临检项目。我在猜想是不是你听到的只是他们的一种营销策略，显示他们的技术实
: 力，并不是想靠这个赚钱？
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r******g
发帖数: 600 | 148 他们挣不到钱
如果他们有 足够充足的病人量，每个chip能够run maximal sample size，to
minimize per patient cost, 每个病人的成本好像是 250USD, 但是insurance目前的
reimbursement少于100USD
所以，你说的对，他们应该挣不到钱～
目前主要的服务对象应该是 out of pockets 的人的钱
再者，
这种，小型技术公司，光挣病人的钱，也挣不了多少
拿足够的专利，做足够的宣传，然后 去 融资 找赞助，把公司做大，应该才是他们的
目的
能挣多少钱，以后再说呗
现在的小型技术公司，大多不都是这个套路？ 把公司融资扩大，然后转手卖给大公司
。大
公司的资源雄厚，有强大的advocacy团队，有希望能够 把90的reimbursement变成300
hopefully?
【在 b****r 的大作中提到】
: 我看了这个网站，对于病人的对外服务项目在这里
: https://www.genoptix.com/patients/test-options#test-types
: 我只看到三项，骨髓，外周血细胞和组织活检，没看到liquid biopsy之类
: 我自己现在就在亲手做liquid biopsy的CLIA test development，我已经采用的是最廉
: 价也应该非常敏感的手段，就做单位点仍然难度不小。以我的了解，做几十上百个位点
: 也许技术上没问题，但是目前患者和医保的支付能力是远远达不到覆盖成本的，这个东
: 西目前的瓶颈主要在于测序价格还是太高太高。我很难想象商业公司能够规模性的提供
: 这种临检项目。我在猜想是不是你听到的只是他们的一种营销策略，显示他们的技术实
: 力，并不是想靠这个赚钱？
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b****r
发帖数: 17995 | 149 你说的这个panel能给个他们网站内部的连接吗？我想借鉴一下但是没找到
【在 r******g 的大作中提到】
: 他们挣不到钱
: 如果他们有 足够充足的病人量，每个chip能够run maximal sample size，to
: minimize per patient cost, 每个病人的成本好像是 250USD, 但是insurance目前的
: reimbursement少于100USD
: 所以，你说的对，他们应该挣不到钱～
: 目前主要的服务对象应该是 out of pockets 的人的钱
: 再者，
: 这种，小型技术公司，光挣病人的钱，也挣不了多少
: 拿足够的专利，做足够的宣传，然后 去 融资 找赞助，把公司做大，应该才是他们的
: 目的
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h****n
发帖数: 333 | 150 你确定那个公司的cancer diagnostic panel是用的cfDNA吗？
如果是抽血的，会不会是一般的germline的cancer predisposition genes？
或者一般的用tumer tissue的？
【在 r******g 的大作中提到】
: cfDNA 有挺多小公司的
: 前几天 刚停过一个加州的公司的讲座～ 做的cancer diagnositic的 panel， 100多个
: gene呢
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r******g
发帖数: 600 | 151 http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
another perfect example how studying rare diseases may help common disease |
V******t
发帖数: 444 | 152 这篇文章牛啊
【在 r******g 的大作中提到】
: http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
: another perfect example how studying rare diseases may help common disease
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r******g
发帖数: 600 | 153 看临床效果了
能治愈白内障，这几个哥们人可以冲 大奖了
【在 V******t 的大作中提到】
: 这篇文章牛啊
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b****r
发帖数: 17995 | 154 白内障本来就是个小手术就能搞定的
【在 r******g 的大作中提到】
: 看临床效果了
: 能治愈白内障，这几个哥们人可以冲 大奖了
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b****r
发帖数: 17995 | 155 白内障本来就是个小手术就能搞定的
【在 r******g 的大作中提到】
: 看临床效果了
: 能治愈白内障，这几个哥们人可以冲 大奖了
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o**4
发帖数: 35028 | 156 能科普下怎么做产前诊断吗？具体步骤咋做的呢？不可能测这个基因组序列吧？
另外，personal medicine将来是不是都需要测基因组序列？还是只弄个芯片就可以了？
谢谢。
【在 b****r 的大作中提到】
: 白内障本来就是个小手术就能搞定的
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k*****r
发帖数: 21039 | 157 精辟。
反正有一堆数据可以左右倒腾，发些似是而非的Paper，大家都可以交差而已。
【在 T****i 的大作中提到】
: 我抛砖引玉一个。我觉得因为肿瘤突变太多，个人化医疗的表述不精确。我理解，个人
: 化医疗是根据每个病人的突变来治疗，精确化医疗是根据每个病人的每个肿瘤细胞的每
: 个突变来治疗。不过我认为这是无法达成的目标，因为决定几百个突变里面那个突变是
: 关键的很难。当然作为大忽悠，做癌症的尤其生物信息的有福了，对其他领域的好处有
: 限。
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