e**r
发帖数: 1144 | 1 用Bio-rad mini PROTEAN那么大的胶，跑50bp左右的片段，能分辨1-2bp的差异么？
能的话要用多大浓度的胶？ |
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A**l
发帖数: 225 | 2 【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: ManOf35 (对酒当歌,人生几何), 信区: Stock
标 题: 当前的局势和我们的对策
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Sep 20 23:02:53 2007)
邓小平同志教导我们,冷静观察,稳住阵脚,沉着应付,韬光养晦,有所作为.
FED星期二降息50BPS是一个极其聪明的选择,一是这个次级房贷到底会恶化成啥样,谁心
里都没底,反应过度总比不反应强.二是降25BPS,会给人续列降息的错觉,毕竟从通货膨
胀的角度来看,没必要降息.在市场普遍期待和政府介入的情况下,FED已是骑虎难下,即
使饮鸩止渴,也乐得送个顺水人情.所以一次性降50BPS,既是对不可预测的次级房贷开了
一个药方,不孚众望,也是毫不含糊的告诉市场,下不为例.
降息是个双韧剑.所有的ASSET TYPE都对50BPS释放了"积极"的响应.这应当是在FED的预
料之中.美元,黄金,原油,股票,我不给大家RECOUP了.美元作为结算货币,这个地位不可
挑战,不容挑战,是美国政府的既定国策.美国对IRAQ开打的一个背后因素,就是IRAQ境内
原油交易该用 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 3 Genomic strand:
5'----nnnn-----mmmm--- intron5--50bp----exon6-----nnnn----mmmm--Stop codon--
-UTR------3'
设计two 引物从 upstream of --intron5--50bp- at least not over lap over 6
nt base
from that 5'-end of intron5--50bp--
然后对于cDNA=(设计了primer针对intron5
semi-nested PCR 30 cycle, if no band that is alternative splicing form
if still had band and size is same to last (发现用这个primer直接从genomic里
也可以得到PCR片断) that is pseudogene.
exon6
intron5 |
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y**e
发帖数: 2729 | 4 这句话对大部分产品不准确,traditional Life 勉强可以套用这个定义
其他的UL, VUL, EIA, VA, SPIA,FA等等都不合适
特别是对投资型的年金产品
投资在股票市场的钱就是客户的钱,=准备金(不是公司的东西)
公司的revenue只是管理这部分钱的费用,比如50bps
50bps 比10% 小了不知道多少
准备金误差是指你的模型和它实际上报的数目的差别,来自模型不准确
1B/50B=2%的误差, 4M/50B可以忽略
模型的不准确来自太多的客户,一般都百万以上,如果程序运行每个客户,估计一周都没
结果
所以必须压缩,简化你的模型.即便这样简化之后,如果是stochastic model,1000个
scenario
扔到100台机子运行,也得6小时. 所以误差是难免的. |
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T********l
发帖数: 1670 | 5 这个很受启发，当初我老就用stochastic 概念去描述一个物理现象从而建立数学模型
，最后得到一个漂亮而简单的分析解，就像牛顿定律一样很准确。感觉金融领域，都是
数学牛人，喜欢自己编程，在server 上run 程序。如果run 1000个scenario，怎么去
定义prediction 的uncertainty。这个可能对你的assumption很有关系？？？是不是这
样？讨论讨论。
这句话对大部分产品不准确,traditional Life 勉强可以套用这个定义
其他的UL, VUL, EIA, VA, SPIA,FA等等都不合适
特别是对投资型的年金产品
投资在股票市场的钱就是客户的钱,=准备金(不是公司的东西)
公司的revenue只是管理这部分钱的费用,比如50bps
50bps 比10% 小了不知道多少
准备金误差是指你的模型和它实际上报的数目的差别,来自模型不准确
1B/50B=2%的误差, 4M/50B可以忽略
模型的不准确来自太多的客户,一般都百万以上,如果程序运行每个客户,估计一周都没
结果
所以必须压缩,简化你的模型.即便这样简化之后,如果是stochast... 阅读全帖 |
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m**z
发帖数: 787 | 6 弄成2段是什么意思，一分为二？100bp+100bp,然后50bp+50bp? 这样的话你可能把
binding site拆成2段了，当然不会bind |
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Z******5
发帖数: 435 | 7 一般测序貌似前50bp信号都不好。你一共200bp，有1/4测不好。当然也要考虑一下前面
50bp是否是你的关键序列。 双向测序倒是可以解决。 |
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z*m
发帖数: 3227 | 8 本版五毛或自甘五请务必钻研业务，和国常会保持一致，不要做出挖天朝墙角的错误行
径！
=====================
降准降息真要来了！国常会重磅定调，外部环境更趋复杂严峻，要增强紧迫感，专项债
四大新部署成最大关注点
随着下半年经济下行压力加大，逆周期调节政策要重新加码提前应对，全面降准或将很
快在本月落地。
据中国政府网消息，国务院总理李克强9月4日主持召开国务院常务会议，部署精准施策
加大力度做好“六稳”工作；确定加快地方政府专项债券发行使用的措施，带动有效投
资支持补短板扩内需。
外部环境严峻 国常会重磅定调！降准降息真要来了
本次会议的重中之重，在于从两大方面着手部署下一步稳增长举措：
一是把做好“六稳”工作放在更加突出位置，梳理强化逆周期调节的六大重点领域关键
问题精准施策，具体包括稳就业、稳物价、落实减税降费举措、货币政策适时预调微调
等。
二是为稳基建投资，部署四大新举措加快发行使用地方政府专项债券，具体涵盖提前下
达明年专项债部分新增额度、扩大专项债使用范围、专项债额度向部分地区倾斜、明确
专项债作为项目资本金的使用占比上限等。
“六稳”表述升级，圈定六大逆... 阅读全帖 |
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s*******r
发帖数: 21 | 9 实在是穿聚聚太蠢了。一紧张就喊建墙，要么印钱。50bps降息瞬间就被市场吃了连渣
都不剩。就这么三板斧，连对付病毒都只会撒钱。真是蠢到无以复加。 |
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z***t
发帖数: 10817 | 10 【 以下文字转载自 USANews 讨论区 】
发信人: zlltt (中文语言坏境蠢坏横行礼崩乐坏), 信区: USANews
标 题: trump大考：biden领先，疫情暴涨，股市暴跌，
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Mar 11 18:31:22 2020, 美东)
武汉肺炎pandemic梦魇成真席卷全球 美国要迎来爆发；
股市从correction跌入bear market形成金融危机 即将蔓延形成经济危机
fed利率大降50bps 18日fomc会议还可能有动作稳定金融市场
大选年比较激进的sanders落后偏中间的biden， who is a 相对难度高的对手
3.11晚9pm 白宫全国讲话
他出台的政策的控制住疫情 且稳定住经济 那11月连任当之无愧
否则就将和sleepy joe进入泥沼肉搏战 |
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t*******s
发帖数: 492 | 11 I support trump and I support minimal wage as well. Under the current
economic situation, the country needs a bit higher inflation (preferably
driven by labor cost increase, not momentary base expansion) for many
reasons. Higher minimal wage is a perfect candidate for this.
Also, trump's infrastructure plan sparked higher inflation expectation, with
10yr tsy sold off 50bps post-election, that's also a good thing in many
ways. |
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h*****d
发帖数: 210 | 12 EMSA 新手，希望能碰到生物学的老师帮我看看。
我从种子提nuclear extract, 想做EMSA, 用的是DIG-Gel shift kit. 开啥有了
TATABOX （5 repeats) 25bp in length, 试试看蛋白是不是有功能的，结果没加蛋白
的free probe也有带，所以认为我那加了蛋白后产生的带不是真的binding，因为2 带
的位置是一样的。但是有些情况用其他大一点的探针，50bp, 会得到smear. 还有我跑
电泳的胶很小，8x8cm（bio-rad)， 5% native gel. 0.25x TBE buffer, 4C, 80V.
问题：
1）怎么能证明蛋白是用功能的？现在没有binding， 不知是不是蛋白的原因，SDS-
PAGE 检测蛋白还行。抽的几次都是结果差不多，尽管有些带很强且集中在2个区段，但
总体来讲，蛋白的分布大小都有。
2)能不能找个其他probe 做postitive control。 有人可以推见一下啥探针？
3）我是用的nuclear extract, 探针可不可以用200bp 长的。
4)调整些啥才能有好 |
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l******7
发帖数: 4449 | 13 好吧，生活就是折腾……
我只有50BP 其它是shell，想换你１００safeway,你要觉得合适又不嫌麻烦，咱们就换
吧 |
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A**********i
发帖数: 780 | 14 可惜不在加州，不过问一下，50bp值得refi吗？ 是不是要再付appraisal, title
search, title insurance什么的就不值了？ |
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b*d
发帖数: 9308 | 15 对，50bps就值得做了，尤其你的是Jumbo，加州应该可以做到No Closing Cost,或者很
少的Closing Cost,你可以问一问当地的Agent，如果自己付的话，可能就不太值了。 |
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c********e
发帖数: 383 | 16 自己去银行问，我说得你也拿不到啊。
注意只能5万每年每人。基本是中间价+50bps.要不就得找地下钱庄了。 |
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m********0
发帖数: 2717 | 17 这个叫time decay不合适吧。
你举那个例子不过是因为
（1+x)*(1-x)<1
但是
(1+x)*(1+x)>1+2x
横盘 + high volatility对ETF很不利。而且都有50bp 以上的手续费。
同意NX ETF不适合长期持有，除非你有非常强烈的单边市场的远景。
跌 MATCH 它追踪的 INDEX。 我们来看一个很简单的例子。假设 DAY 1 DOW 收盘时 是
10000, 而你在收盘时买了10000元的DOUBLE DOW。DAY 2 DOW 涨到 11000， 10% 的
GAIN。 那么 你买的DOUBLE DOW 涨到 10000*(1+2*1/10)=12000。假设DAY 3 DOW 跌到
10000，一个 大概 0。091 的LOSS。 这样 你买的 DOUBLE DOW DAY 3 的 VALUE 是
12000( 1-2/11)=9818。12。 这样 DOW 是 FLAT 的， 但是 DOUBLE DOW 已经让你亏损
192元。
LEVERAGE 用的越多， 时间越久，TIME DECAY 越厉害。 最后举一个实际的例子。2009
年... 阅读全帖 |
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h******o
发帖数: 6113 | 18 我赞同你的观点今年黄金要到1500美元，不过我觉得是，今年的平均价格可达1500。扣
除中东动荡避险投资需求以外，最关键原因是宽松的货币政策，而实施宽松货币政策的
目的是为了刺激经济。 当然回调还是有可能的，因为，从中线上，如果QE一直继续，
推高inflation,超过央行的容忍范围，开始紧缩货币，只有紧缩到一定程度，金价才可
回调，当仅仅是回调，趋势不变。 考虑加息，每次加个25BP，联邦基金利率要一直加
到50BP才可能会回调，这期间时候很蛮长的，目前米国产能利用率不高，失业率还是高
，在这种情况下，QE政策不会立即推高通胀。一种可能的情况是，QE只会产生泡沫，不
会推高CPI, 而 央行的政策是盯着CPI的， 现在CPI不高，央行是不会急于紧缩。所以
，我认为中线上看，金价上涨还会持续。但是我有一点担心的是，由于2季度又会炒作
一波债务危机，（因为2季度PIGS的P,S，债务快到期了）美元升值的话，金价回调（留
意这段时间09/12-10/2），随后欧洲又来个量化宽松，金价和美金又来同涨。不知历史
不会来个重演。
从以上野鸡分析，我觉得金价是涨到2季度初，然后回调一阵子，再继续... 阅读全帖 |
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Y******u
发帖数: 1090 | 19 Some analysis on Business insider
http://www.businessinsider.com/europe-is-dying-and-the-worlds-c
Note that it is now cheaper for foreign banks to borrow dollars from
their local banks than it is for US banks to borrow dollars from the Fed, so
we could see a 25bp cut in the discount window in the coming days to level
the playing field.
Again, we look at this facility as eliminating the liquidity element of
LIBOR (banks don't need to be as afraid of lending term because they know
they hav... 阅读全帖 |
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c*****r
发帖数: 8227 | 20 1. Housing activity has picked up considerably. The housing sector is an
important “leading sector” with a profound impact on the overall economy,
as the financial crisis made plain. Housing starts are up nearly 25% year-
over-year; in summer 2011 they were still in the doldrums and some
forecasters worried about a major “double-dip” in housing prices.
2. Oil prices look less threatening. Although oil prices have gyrated
considerably this year, on net the price of Brent crude is little c... 阅读全帖 |
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h********o
发帖数: 3320 | 22 不一定就跌多少，最后还会涨回去。早就该加息了。 |
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E***r
发帖数: 1037 | 23 主要是treasury yield要突破三十几年的下降通道了，倒不是绝对数值（当然整数点触
发机器卖盘是可能的）。现在像是几十年债市熊市的开始。
升息一定会造成yield curve flattening甚至倒挂，但从历史上看，从yield curve倒
挂到股市到顶往往还有相当长的时间。更何况现在2-year 10-year spread只是刚刚走
进50bps，离倒挂还有一段距离。 |
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g*********9
发帖数: 1285 | 24 问个问题，每次衰退前都有倒挂?
: 主要是treasury yield要突破三十几年的下降通道了，倒不是绝对数值（当然整
数点触
: 发机器卖盘是可能的）。现在像是几十年债市熊市的开始。
: 升息一定会造成yield curve flattening甚至倒挂，但从历史上看，从yield
curve倒
: 挂到股市到顶往往还有相当长的时间。更何况现在2-year 10-year spread只是
刚刚走
: 进50bps，离倒挂还有一段距离。
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g*******s
发帖数: 2828 | 25 this is a private bank catering to high net worth clients, although i think
most Chinese couples would qualify.
their mortgage is not no cost like the ones you typically get from Chinese m
brokers, but it is still a decent deal. and you will even get additional 5-
10bps off depending on how much cash balance you keep with them. when i was
shopping, the lowest rate i got was 35bps lower on a 30 yr mortgage than
from the Chinese brokers, and 50bps if i kept a $150k cash balance (i think
it was 5bp... 阅读全帖 |
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b*****y
发帖数: 350 | 26 您说的那第一点... 贷款金额和利率高低，基本是两头高中间低的 U-shape. 首先如果
金额超过conforming loan limit (德州是$417K), 利率大概要高50bps左右. 即便金额
在$417K以下，少数银行的定价模型会考虑贷款金额对信用风险的影响，但大多数考虑
的没这马细。最低贷款额一般在$50-$75K, 银行出于固定成本的考虑，利率会相应提高。
15年和30年贷款的利差，同5年和10年国债收益率利差紧密相关，看看过去的yield
curve, 就知道为神马有段时间15年贷款的利率超低，而现在15年和30年都涨起来了。
长远来看, 目前的低利率政策无法维持，涨息+通胀都是早晚的事。从投资的角度考虑
，明智的做法是猛贷款住大房子，能搞多大搞多大。
事。 |
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y**e
发帖数: 2729 | 27 1.招行报告显示中国27%亿万富翁已完成投资移民
昨天，招商银行发布《2011中国私人财富报告》显示，中国有50万人投资资产超过千万
。千万富翁投资
国内房地产的热情下降，投资移民意愿强烈，该报告受访者的亿万富翁中，约27%已经
完成了投资移民。
2.7大城市高压测试
中国房地产指数研究院数据显示，2010年7月，上海、深圳、广州、重庆、杭州、南京
的商品住房成交
均价分别为23883元/平、23465元/平、13926元/平、6325元/平、19950元/平、11892元
/平，及
至今年3月，这6大城市商品住房成交价分别为13806元/平、19424元/平、11287元/平、
6933元/
平、18352元/平、13069元/平，多数城市房价下降（北京数据缺失）。 怀疑上海的降
幅？？？
3.高压测试WORST SCENARIO 是108BPS，现在是50BPS，还有2次好调 |
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c*******n
发帖数: 27 | 28 IMHP, for overlapping PCR, 10bp overlop is too short. Previous I tried
around 30bp overlap, it's ok, but sometimes takes a while. Then I always use
~50bp overlap, it always works with one or two tries. If your PCR not
working very good, try gradient PCR to find the best conditions.
You also can do it another way. After PCR, first try TA cloning, after
sequencing, cut it out and clone into your destiny plasmid. It always works
for me if having trouble cloning it directly into the destiny plasmid. |
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x**2
发帖数: 255 | 29 最近一个克隆做的很郁闷，还望各位高手相助~
谢谢！
由于实验需要，要把两个DNA片断插入到昆虫细胞表达载体(pFastbac)的同一个多克隆
位点中，该表达载体内的多克隆位点有BssHII，EcoR1, Xba1和HindIII。
我要插入的片段是：
EcoR1-片段1-Nhe1（Xba1的同尾酶），和Xba1-片段2-HindIII，
我尝试过三个片段一起连接(three way ligation)，板子上长的两个点都不对（平行做
的BssHII-片段4-Nhe1，Xba1-片段2-HindIII成功得到正确质粒）。
我后来先把片段2插入到载体中，得到质粒：载体-EcoR1-Xba1-片段2-HindIII-载体。
然后再尝试把EcoR1-片段1-Nhe1插入，板子上长的两个点还是都不对，得到的质粒用双
酶切鉴定好像是自连质粒（虽然我双酶切的载体-EcoR1-Xba1-片段2-HindIII-载体）。
个人认为不是双酶切载体的问题，因为：1，EcoR1, Xba1两个酶切位点相隔50bp；如果只
有一个酶切动了质粒那么应该会有很多自连载体，而我的板子上只得到两个点。
我测序鉴定过载体 |
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c*********r
发帖数: 1046 | 30 两端加上酶切位点,最多长20bp, PCR 产物在50bp左右,这么小的片段好连接吗?
还有其他方法吗? 谢谢! |
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b******k
发帖数: 1874 | 31 so, if i am going to ligate two tandem short fragments (say, 50bp each):
synthesize 50nt oligo of Sense and antisense (with 5' phosphate group modifi
cation),
anneal them by boiling and cooling naturally,
then ligate the annealed fragments (ideally, with synthesizd 3' overhang fro
m first one, and 5' overhang from 2nd)by conventional T4 ligase system?
thanks. |
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h*****d
发帖数: 210 | 32 EMSA 新手，求教高手以下问题。
我从种子提nuclear extract, 想做EMSA, 用的是DIG-Gel shift kit. 开啥有了
TATABOX （5 repeats) 25bp in length, 试试看蛋白是不是有功能的，结果没加蛋白
的free probe也有带，所以认为我那加了蛋白后产生的带不是真的binding，因为2 带
的位置是一样的。但是有些情况用其他大一点的探针，50bp, 会得到smear. 还有我跑
电泳的胶很小，8x8cm（bio-rad)， 5% native gel. 0.25x TBE buffer, 4C, 80V.
问题：
1）怎么能证明蛋白是用功能的？现在没有binding， 不知是不是蛋白的原因，SDS-
PAGE 检测蛋白还行。抽的几次都是结果差不多，尽管有些带很强且集中在2个区段，但
总体来讲，蛋白的分布大小都有。
2)能不能找个其他probe 做postitive control。 有人可以推见一下啥探针？
3）我是用的nuclear extract, 探针可不可以用200bp 长的。
4)调整些啥才能有好的bindin |
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T**********t
发帖数: 1604 | 33 传统sequencing好像都是这样，primer后面的20bp甚至我见过到50bp左右的噪音都很大
，读不出准确的序列来，我觉得跟测序胶的制备质量有关系。但是开始15到20个bp读不
出来是很正常的。解决方法很容易，在insert两端再往外20个bp左右设计一个新的测序
引物就好了。
第二个问题，如果你几次测序结果都肯定了那个是突变而不是误测的话，那应该就是突
变了。。。用site-directed mutagenesis把它变回来就好了。 |
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T**********t
发帖数: 1604 | 34 只能答一下第二个问题：
sanger测序用的引物是质粒测序的标准引物还是自己设计的？你说的往后隔了好远是多
远？Sanger测序的前30-50个base基本都是乱的，没有太大参考意义。所以一般设计测
序引物都会在插入位点的前后至少隔开50bp以上的距离，否则你就要损失一段序列读不
出来了。 |
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o********r
发帖数: 775 | 35 十年前测序都可以读到800bp，不至于省这50bp吧 |
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y******y
发帖数: 107 | 36 一个plasmid (A) 里面混有gapped plasmid (B)，A和B的序列完全一样，A 和 B的唯一
不同是B一条链上有一个 50bp的gap，A和B都是100 ng左右，希望比较干净的除去B （
只要切断单链区域就行了），然后做PCR扩增A （扩增区域含有B的gapped
region）。目的是希望PCR模板是从A来的，而不是B来的，谢谢。
酶切可以吗？什么酶可以专一切断gapped plasmid中的单链区域？ |
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s******s
发帖数: 13035 | 38 never done mapping myself, but FYI
1. histone marker和TF的Chip-seq protocol应该非常不一样，不知道你是不是用的一
个protocol
2. hiseq现在一条lane大概200m reads, 50bp的话，略微不到40G的data.
70
,
with
binding |
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m******5
发帖数: 1383 | 39 很多paper的说法是第二个core sequence以及下游50bp序列就sufficient，我也不知道
第一个core sequence以及长长的上游是干什么吃的
顶上去同求教 |
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h***e
发帖数: 146 | 40 先用recombineering引入一个counter selection marker, 然后用合成的ssDNA每端大
约50bp的同源臂，再次recombineering消去反向选择的marker，也不用盲晒，酶切鉴定
然后测序。我现在就在做点突变用这个方法，大约20kb，效率在10-20%左右 |
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g***y
发帖数: 201 | 41 40-50bp homologous region is enough for recombineering.
Next time, you can order 20bp primers first and do a test run, if it is very
robust and specific, then you can order 70bp primers which contains extra
recombination region. |
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c**y
发帖数: 127 | 42 No simple answer to Seq V array. It depends on many factors including your
biological questions, your budget and your experimental design for seq/array
etc.. The community awaits a systematic evaluation of cost-benefit trade-
off between seq and array platform for differential gene expression analysis
. Ideally, such evaluation would include an ultra-deep-sequenced RNA-seq
dataset(way deeper than the currently adopted depth) and microarray dataset
on the same set of biological replicates and a g... 阅读全帖 |
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c*****g
发帖数: 66 | 43 "Back to your RNA-seq data, if you only want to identify
differentially-expressed genes tha t are well-annotated. you would rather
put money on doing single-end sequencing (~50bp) to as deep as your budget
allows. "
这不是真的。。。
2 x single-end sequencing 比 1 x paired-end sequencing 在同样的throughput下
贵不少。所以在他的预算允许的情况下，应该做paired-end，甚至应该做multiplex来
消除lane effect etc.
真要做well-annotated genes，还搞啥sequencing，直接就array算了，不知道省多少
事。
array
analysis
dataset
identify |
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u*********1
发帖数: 2518 | 45 正在制作用于whole-genome sequencing的human genome library。做完ligation跑胶
看到smear，然后切下比如450-500bp的区间做PCR。但可能是50bp的interval太小或者
自己技术不好，所以最后PCR出来的亮度比较低。（当然也不排除ligation efficiency
不好）
PCR的结果如图。
还没拿去测浓度。只想问问有经验的前辈这样的情况能拿去测30 coverage的WGS吗？
另外还有一个问题，就是，我们切胶的smear每一个区间（300-400，400-500，500-600
）这些区间里都一定cover了genome的每一个部分吗？我总担心genome的有的部分没有
被涵盖到，那岂不是就人为引入了很多bias？
thx |
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r*m
发帖数: 16380 | 46 这是为什么呢？
QPCR用两个primers， 各20-25bp，nanoString也是两个probe， 各50bp，而且没有
amplification，至少从表面上看不出来QPCR更准确啊。
more |
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m***o
发帖数: 272 | 47 做RACE，找到一个alternativesplicing form. 比如从intron5 转录了50bp接着exon6
直到stop codon。这个intron5也有splicing的标识。然后就设计了primer针对intron5
转录的这段做RTpcr，得到很亮的条带。偶尔发现用这个primer直接从genomic里也可以
得到PCR片断。怀疑假gene。但是我现在怎么能知道这个mRNA是splicing form呢，还是
直接从pseudogene转录的呢？ |
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K**R
发帖数: 193 | 48 想请教，northernblotting 探针一般设计多长呢？ 有地说50bp 有的说1KB。。。 |
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n****3
发帖数: 543 | 49 用常规40－50bp左右的引物彼此重叠20bp去pcr,很容易得到你的产物，很少有突变的，
挑2－3个送去测序，一定有你要的正确克隆。hplc纯化的引物也不是100%没有突变的，
而且超贵 |
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i*********0
发帖数: 915 | 50 intron几十个碱基，可能少了一点，我一般都是至少在exon留下50bps的距离，再插入
loxp位点。 |
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