由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 简单的方法做Volcano Plot?
相关主题
RNA seq 数据统计分析问题请教How to analyze the interaction between two RNA molecules?
RNA-seq 表达量问题请教:如何灵敏检测 40-50 nt viral RNA
请问R大牛或者懂RNA-SEQ分析的牛人,DESeq里面怎么对partially replicates的sample进行分析啊?谢!miRNA作为突触信号分子
truth about RNAseq vs Microarray大家怎么评价这个工作
Can I put single and pair-ended RNAseq data together in DESeq analysis土问:怎样提高two Oligo ligation的效率?
才发现deseq除了2,好太多请问QIAGEN的miRNeasy Mini Kit能否用于提去植物的microRNA啊
Re: about RNARACE求助!!
Re: 请问用什么方法证明蛋白与蛋白的直接作用?(ZT) 2008中国百篇最具影响国际论文(生物类)
相关话题的讨论汇总
话题: plot话题: volcano话题: 方法话题: 简单话题: seq
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
p*****c
发帖数: 116
1
请问有没有什么简单的方法做Volcano Plot? 是RNA-Seq Data.
x*****d
发帖数: 704
2
DESeq,CummeRund这几个package都能生成
k***a
发帖数: 636
3
http://www.r-bloggers.com/using-volcano-plots-in-r-to-visualize

【在 p*****c 的大作中提到】
: 请问有没有什么简单的方法做Volcano Plot? 是RNA-Seq Data.
p*****c
发帖数: 116
4
谢谢各位,那个link已经不work了。我学习一下DESeq
g********6
发帖数: 86
5
有log2 fold change和p value用R plot function就可以,如果想做的好看一些就用
ggplot2

【在 p*****c 的大作中提到】
: 请问有没有什么简单的方法做Volcano Plot? 是RNA-Seq Data.
G******n
发帖数: 289
6
直接plot就可以了……
w***g
发帖数: 5958
7
给你回邮件了。我们专门给不会写程序画图的同学提供收费的RNA-Seq数据分析服务。

【在 p*****c 的大作中提到】
: 请问有没有什么简单的方法做Volcano Plot? 是RNA-Seq Data.
p*****c
发帖数: 116
8
非常感谢诸位的帮助!
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
(ZT) 2008中国百篇最具影响国际论文(生物类)Can I put single and pair-ended RNAseq data together in DESeq analysis
miRNA id和miRNA family id才发现deseq除了2,好太多
Faculty Positions RNA Research University AlbanyRe: about RNA
paper help again!Re: 请问用什么方法证明蛋白与蛋白的直接作用?
RNA seq 数据统计分析问题请教How to analyze the interaction between two RNA molecules?
RNA-seq 表达量问题请教:如何灵敏检测 40-50 nt viral RNA
请问R大牛或者懂RNA-SEQ分析的牛人,DESeq里面怎么对partially replicates的sample进行分析啊?谢!miRNA作为突触信号分子
truth about RNAseq vs Microarray大家怎么评价这个工作
相关话题的讨论汇总
话题: plot话题: volcano话题: 方法话题: 简单话题: seq