求教：RNA-seq，小鼠，mixed genetic background的问题 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 求教：RNA-seq，小鼠，mixed genetic background的问题

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d***s 发帖数: 1062	1 小鼠的genetic background不纯，B6和129s mixed。会造成很大的vitiation吗？做alignment的时候拿什么做reference？先谢谢了。
K**R 发帖数: 193	2 可能不会吧，老鼠都是MM9现在？
d***s 发帖数: 1062	3 谢谢。这就是我的问题，MM9是B6 background。我的小鼠是B6 X 129s。我只看transcriptome。【在 K**R 的大作中提到】 : 可能不会吧，老鼠都是MM9现在？
d***s 发帖数: 1062	4 此外，之前看到有人在板上说自己的data有3’bias。怎么样才能降低3‘bias呢？有没有比较详细的guild line或者protocol啊？

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