l**********k
发帖数: 189 | 1 由于一直以来没有表达Cre的工具大鼠，所以可能会影响到cKO大鼠的应用，进而影响到
大鼠做为模式动物在医学研究中的应用。我们这几个月想先做一二十种Cre Knockin大
鼠。然而，虽然大鼠在神经生物学和心血管疾病方面比小鼠有优势（所以用途更广），
但我对这两个领域不是很了解。我知道这里卧虎藏龙，麻烦这些领域的朋友给提一些建
议，以便我们可以有些目标，并对要做的Cre大鼠排一个优先顺序。如果您的建议被采
纳，一旦你用得到，我们会优先免费提供，或是提供给你指定的在国内的科研朋友。感
谢大家的帮忙。 | D*a
发帖数: 6830 | | r*****i
发帖数: 117 | 3 有点跑题啊
我明年回国，需要Mx cre小鼠(血液细胞特异表达的)，
请问你们有吗 | V******t
发帖数: 444 | 4 Rosa26;CreERT2?
【在 l**********k 的大作中提到】
: 由于一直以来没有表达Cre的工具大鼠，所以可能会影响到cKO大鼠的应用，进而影响到
: 大鼠做为模式动物在医学研究中的应用。我们这几个月想先做一二十种Cre Knockin大
: 鼠。然而，虽然大鼠在神经生物学和心血管疾病方面比小鼠有优势（所以用途更广），
: 但我对这两个领域不是很了解。我知道这里卧虎藏龙，麻烦这些领域的朋友给提一些建
: 议，以便我们可以有些目标，并对要做的Cre大鼠排一个优先顺序。如果您的建议被采
: 纳，一旦你用得到，我们会优先免费提供，或是提供给你指定的在国内的科研朋友。感
: 谢大家的帮忙。
| l**********k
发帖数: 189 | 5 这个可以查一下南京大学模式动物研究所。他们那里应该有的。
【在 r*****i 的大作中提到】
: 有点跑题啊
: 我明年回国，需要Mx cre小鼠(血液细胞特异表达的)，
: 请问你们有吗
| l**********k
发帖数: 189 | 6 这是一个非常急需的大鼠。我们已经开始在大鼠上做rosa-loxP-STOP-loxP-XFP, 目的
是为了检测cre expression 特异性的。
不知道在小鼠研究中，神经和心血管领域哪种cre鼠最常用，这样我们在做cre大鼠的时
候，也有一个参考。因为想先做客户范围比较广，在科研领域最常用的，就象免疫研究
里的CD4-Cre, CD19-Cre, FoxP3-Cre, CD11c-Cre等。
谢谢。
【在 D*a 的大作中提到】
: rosa-XFP?
| l**********k
发帖数: 189 | 7 您是说在Rosa26位置上放CreERT2? 如果是这样的话，虽然可以做Tamoxifen induced
cKO，但就没有tissue specificity了。而且，在有些tissue里可能效率不会很高。
【在 V******t 的大作中提到】
: Rosa26;CreERT2?
| z****u
发帖数: 1007 | 8 Mx1-Cre 不够特异。在很多内皮以及osteogenic stem cell也有表达。
【在 r*****i 的大作中提到】
: 有点跑题啊
: 我明年回国，需要Mx cre小鼠(血液细胞特异表达的)，
: 请问你们有吗
| z****u
发帖数: 1007 | 9 我希望能有Wnt1-cre 这是做颅颌面,neural crest cell的必备line. | d****h
发帖数: 46 | 10 For rat neuron
GABRA1: (Neuron. 1989 Dec;3(6):745-53.A novel alpha subunit in rat brain
GABAA receptors.Khrestchatisky M, MacLennan AJ, Chiang MY, Xu WT, Jackson MB
, Brecha N, Sternini C, Olsen RW, Tobin AJ.)
GABBR2:similar to GABRA1, highly neuron-specific
MAP2:(A Harada, J Teng, Y Takei, K Oguchi, N Hirokawa
MAP2 is required for dendrite elongation, PKA anchoring in dendrites, and
proper PKA signal transduction J Cell Biol, 158 (2002), pp. 541–549)
Tuj1: (J Neurobiol. 1995 May;27(1):26-43.Dividing neuron precursors express
neuron-specific tubulin.Memberg SP, Hall AK.)
NeuN/Fox3: (J Histochem Cytochem. 1996 Oct;44(10):1167-71.NeuN: a useful
neuronal marker for diagnostic histopathology.Wolf HK, Buslei R, Schmidt-
Kastner R, Schmidt-Kastner PK, Pietsch T, Wiestler OD, Blümcke I.)
Neuritin:(Neuritin- a gene induced by neural activity and neurotrophins that
promotes neuritogenesis.- Naeve G.S., Ramakrishnan M., Kramer R., Hevroni D
., Citri Y., Theill L.E.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94-2648-2653(1997))
astrocyte-glial
GFAP (Tissue-specific DNA methylation patterns of the rat glial fibrillary
acidic protein gene." Condorelli D.F., Nicoletti V.G., Barresi V., Caruso A.
, Conticello S., de Vellis J., Giuffrida-Stella A.J. Neurosci. Res. 39:694-
707(1994)
Oligodendrocyte
MBP ("Characterization of cloned cDNA representing rat myelin basic protein:
absence of expression in brain of shiverer mutant mice."
Roach A., Boylan K.B., Horvath S., Prusiner S.B., Hood L.E.
Cell 34:799-806(1983))
Olig1/Olig2 (Igor Jakovcevski and Nada Zecevic. Olig Transcription Factors
Are Expressed in Oligodendrocyte and Neuronal Cells in Human Fetal CNS. The
Journal of Neuroscience, November 2, 2005 25(44):10064 –10073.)
MAG/Siglec 4a (J Cell Biol. 1990 Dec;111(6 Pt 1):2651-61.The myelin-
associated glycoproteins: membrane disposition, evidence of a novel
disulfide linkage between immunoglobulin-like domains, and posttranslational
palmitylation.Pedraza L, Owens GC, Green LA, Salzer JL.
Hope this helps | | | l**********k
发帖数: 189 | 11 太感谢了。
因为我对神经领域实在是一点知识都没有，不知能否麻烦您列出一些目前最常用的Cre
小鼠，这样我做Cre大鼠的时候可以有个参考。其实做10－20个cre 基因敲进大鼠不难
，难在我们自己这方面的人才很缺，所以自己没有能力做分析。所以做出来之后，还要
找科研机构的朋友合作来做，要做的事情还是蛮多的，所以我想最好先确定一个先后顺
序，先紧着常用的做。
看得出来您在神经领域的知识非常丰富，非常希望您给出更具体的建议。多谢多谢。
2653(
express
【在 d****h 的大作中提到】
: For rat neuron
: GABRA1: (Neuron. 1989 Dec;3(6):745-53.A novel alpha subunit in rat brain
: GABAA receptors.Khrestchatisky M, MacLennan AJ, Chiang MY, Xu WT, Jackson MB
: , Brecha N, Sternini C, Olsen RW, Tobin AJ.)
: GABBR2:similar to GABRA1, highly neuron-specific
: MAP2:(A Harada, J Teng, Y Takei, K Oguchi, N Hirokawa
: MAP2 is required for dendrite elongation, PKA anchoring in dendrites, and
: proper PKA signal transduction J Cell Biol, 158 (2002), pp. 541–549)
: Tuj1: (J Neurobiol. 1995 May;27(1):26-43.Dividing neuron precursors express
: neuron-specific tubulin.Memberg SP, Hall AK.)
| d****h
发帖数: 46 | 12 I might find some for you on Monday.
You may want to prioritize on modeling:
Addiction
Parkinson disease
Alzheimer's disease
Amytrophic Lateral Sclerosis
and developing tools for Optogenteics
Cre
【在 l**********k 的大作中提到】
: 太感谢了。
: 因为我对神经领域实在是一点知识都没有，不知能否麻烦您列出一些目前最常用的Cre
: 小鼠，这样我做Cre大鼠的时候可以有个参考。其实做10－20个cre 基因敲进大鼠不难
: ，难在我们自己这方面的人才很缺，所以自己没有能力做分析。所以做出来之后，还要
: 找科研机构的朋友合作来做，要做的事情还是蛮多的，所以我想最好先确定一个先后顺
: 序，先紧着常用的做。
: 看得出来您在神经领域的知识非常丰富，非常希望您给出更具体的建议。多谢多谢。
:
: 2653(
: express
| m******5
发帖数: 1383 | 13 做 Endothelial Cell 的 Tie2-Cre
做心脏的cTnT-Cre 和Nkx2.5-Cre等等
不过没见做这些的用rat…… | s******y
发帖数: 28562 | 14 对于脑神经，我推荐用 CAMK II (Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase II)-
Cre。 而且因为启动得比较晚，对发育影响比较小。可以在研究行为以及老年病的时
候都可以用。
对于心脏，比较常用的就是 a-MHC (Myosin heavy chain alpha)-cre，标记心肌细胞
。
对于血管，比较常见的是VE-cadherin-cre (endothelial cell marker)
这三个基因都是进化上高度保守的，在小鼠和大鼠里应该都能用。
可惜我在短期内大概是用不上rat的。
【在 l**********k 的大作中提到】
: 由于一直以来没有表达Cre的工具大鼠，所以可能会影响到cKO大鼠的应用，进而影响到
: 大鼠做为模式动物在医学研究中的应用。我们这几个月想先做一二十种Cre Knockin大
: 鼠。然而，虽然大鼠在神经生物学和心血管疾病方面比小鼠有优势（所以用途更广），
: 但我对这两个领域不是很了解。我知道这里卧虎藏龙，麻烦这些领域的朋友给提一些建
: 议，以便我们可以有些目标，并对要做的Cre大鼠排一个优先顺序。如果您的建议被采
: 纳，一旦你用得到，我们会优先免费提供，或是提供给你指定的在国内的科研朋友。感
: 谢大家的帮忙。
| r*****i
发帖数: 117 | 15 造血系统特异表达的cre是什么比较好呢？
HSC-SCL-Cre-ER(T)?
我问过几个人，他们说目前还是Mx1cre比较好。
题外话，这两天刚刚有一篇文章出来，好像也是造血相关的，不错的杂志，第一作者就
是zhaohu，不会是你吧
【在 z****u 的大作中提到】
: Mx1-Cre 不够特异。在很多内皮以及osteogenic stem cell也有表达。
| r*****i
发帖数: 117 | 16 thank you
【在 l**********k 的大作中提到】
: 这个可以查一下南京大学模式动物研究所。他们那里应该有的。
| S******9
发帖数: 2837 | 17 血管内皮肯定用VE-cadherin-cre
心脏心肌细胞用a-MHC-cre | a*****i
发帖数: 679 | 18 说说心血管领域内常用的Cre小鼠：
Cardiac progenitor cells: Nkx2.5-Cre, Gata4-Cre
First heart field： Tbx5-Cre
Second heart filed: Isl1-Cre，Mef2c-Cre
心肌细胞（myocardium）：cTNT-Cre（胚胎发育早期即表达），alpha-MHC和Beta-MHC
（在成年小鼠中采用inducible诱导表达的比较多），Mlc2v（心室特异性），Mlc2a（
心房特异性），Tbx2-Cre（non-chamber myocardium，仅限于胚胎发育早期），SM22-
Cre或者smMHC-Cre（平滑肌特异性，但是经常有leaky到心肌细胞）。
心脏内膜（endocardium): Tie2-Cre(除了endocardium之外，在vascular endothelial
cell也有表达），Nfatc1-Cre（endocardium specific，参见2012年cell一篇文章）。
心脏外膜（epicardium）：Wt1-Cre，Tbx18-Cre
心脏传导系统（cardiac conduction system）：Tbx3-Cre，HCN4-Cre
Cardiac neural crest cell：Wnt1-Cre
【在 l**********k 的大作中提到】
: 这是一个非常急需的大鼠。我们已经开始在大鼠上做rosa-loxP-STOP-loxP-XFP, 目的
: 是为了检测cre expression 特异性的。
: 不知道在小鼠研究中，神经和心血管领域哪种cre鼠最常用，这样我们在做cre大鼠的时
: 候，也有一个参考。因为想先做客户范围比较广，在科研领域最常用的，就象免疫研究
: 里的CD4-Cre, CD19-Cre, FoxP3-Cre, CD11c-Cre等。
: 谢谢。
| l**********1
发帖数: 5204 | 19 补充两个gene targets
high-mobility-group-protein B1 (HMGB1), and
carbonic anhydrase II in rat glaucoma model
Referenece:
PMID 22792152
PLoS One. (2012). 7: e33593.
Regulation of retinal proteome by topical antiglaucomatous eye drops in an
inherited glaucoma rat model.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22792152
ps: 楼主 今后如果做出 tissue conditional KO Rat 麻烦给nerverthink one pair
哈
)-
【在 s******y 的大作中提到】
: 对于脑神经，我推荐用 CAMK II (Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase II)-
: Cre。 而且因为启动得比较晚，对发育影响比较小。可以在研究行为以及老年病的时
: 候都可以用。
: 对于心脏，比较常用的就是 a-MHC (Myosin heavy chain alpha)-cre，标记心肌细胞
: 。
: 对于血管，比较常见的是VE-cadherin-cre (endothelial cell marker)
: 这三个基因都是进化上高度保守的，在小鼠和大鼠里应该都能用。
: 可惜我在短期内大概是用不上rat的。
| D*a
发帖数: 6830 | 20 我觉得是不是先考虑什么实验是必须用大鼠的吧？心脏神经这些东西大家都在小鼠里面
做的好好的，换成大鼠如果还是用同样的gene再重复一遍也没啥意思啊。有些器官体积
在小鼠里受限制不便于手术，或者什么基因特异性的，比如社交啊什么的（瞎说的），
可能需求量会更大一些？ | | | a*****i
发帖数: 679 | 21 同意。
在心血管发育领域，已经有许多成熟可用的Cre和loxP小鼠。特别是做胚胎早期发育阶
段，小鼠个体小，繁殖快，每胎个体多的优势就体现出来了（很多情况下mutant
genotype的胚胎只占25%）。周围用大鼠做心血管方面研究的主要是做心脏电生理，或
者成年大鼠的心脏病治疗方法（结构缺陷或者心肌疾病），而且用的大多是野生型大鼠
，这种情况下不会需要大量的genetic modified大鼠，也不存在大量的cross breeding
要做。
【在 D*a 的大作中提到】
: 我觉得是不是先考虑什么实验是必须用大鼠的吧？心脏神经这些东西大家都在小鼠里面
: 做的好好的，换成大鼠如果还是用同样的gene再重复一遍也没啥意思啊。有些器官体积
: 在小鼠里受限制不便于手术，或者什么基因特异性的，比如社交啊什么的（瞎说的），
: 可能需求量会更大一些？
| l**********1
发帖数: 5204 | 22 sure 楼主 还是 做Cre rabbit 吧
一直最后做到Cre Monkey or even Ape ? 超过Bill Gates 哈
just check one table,
cited from
PMID 22665989
J Biomed Biotechnol. (2012). 2012: 692609.
Animal models of glaucoma.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22665989
breeding
【在 a*****i 的大作中提到】
: 同意。
: 在心血管发育领域，已经有许多成熟可用的Cre和loxP小鼠。特别是做胚胎早期发育阶
: 段，小鼠个体小，繁殖快，每胎个体多的优势就体现出来了（很多情况下mutant
: genotype的胚胎只占25%）。周围用大鼠做心血管方面研究的主要是做心脏电生理，或
: 者成年大鼠的心脏病治疗方法（结构缺陷或者心肌疾病），而且用的大多是野生型大鼠
: ，这种情况下不会需要大量的genetic modified大鼠，也不存在大量的cross breeding
: 要做。
| l**********k
发帖数: 189 | 23 感谢zhaohu, daihsh, muhe1985, sunnyday, rayxixi, sumo2009, andycai,
lotkaeuler11, dua，以及Neverthink和直接写email或私信给我的朋友们的建议。我已
经把各位的建议拷贝下来，这周会把这批cre大鼠定下来然后尽快开始。
大鼠虽然不象小鼠目前用得这么广泛，但在神经疾病和心血管疾病方面的用途还是很大
的。而且目前能做大鼠基因敲进和cKO的地方很少，我想对我们来讲市场也远远超过我
们的产能了。之所以选择从cre大鼠开始做起，主要原因是如果有人想做cKO大鼠，一定
会需要cre大鼠。如果只是为单个客户做cre大鼠的定制化服务，其他客户要想用同样的
cre大鼠，我们就没有办法提供了。所以干脆先做一批常用cre大鼠。因为还没有见到任
何通过Knockin方法得到cre大鼠的报道，所以我想如果我们先做出一批来，说不定会把
模式大鼠的应用带起来。
神经方面有朋友给列出了10多个非常有用的cre大鼠，应该可以马上开始了。心血管方
面我们在综合一下各位的建议，希望也做一些。
lotkaeuler11 提到兔子和猴子，实际上也是我一直想参与的。猴子已经在跟朋友商量
怎么开始。关于兔子，我们对该用哪种品系，它们的产卵情况，受精卵移植，胚胎发育
等方面，可以说是一窍不通。如果各位懂或认识这方面的人才，非常欢迎跟我联系合作
。哪怕不做cre，只做一些一般的荧光蛋白基因敲进，应该也是一个比较有意思的工作。
非常感谢各位贡献自己的知识和智慧来帮我思考。 | l**********1
发帖数: 5204 | 24 >关于兔子，我们对该用哪种品系，它们的产卵情况，受精卵移植，胚胎发育
等方面，可以说是一窍不通。如果各位懂或认识这方面的人才，非常欢迎跟我联系合作
。哪怕不做cre，只做一些一般的荧光蛋白基因敲进，应该也是一个比较有意思的工作。
pls check,
>Adult albino rabbits (2.5– 4.5 kg; age, 2 –6 months) were obtained
from Myrtle’s Rabbitry (Thompson Station, TN).
cited from
PMID 16565394
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16565394
full text link:
//www.iovs.org/content/47/4/1571.full.pdf
also first author contacts detail pls check your gmail post,
just sent to you longwoodwalk (长木行走) by BCC...
【在 l**********k 的大作中提到】
: 感谢zhaohu, daihsh, muhe1985, sunnyday, rayxixi, sumo2009, andycai,
: lotkaeuler11, dua，以及Neverthink和直接写email或私信给我的朋友们的建议。我已
: 经把各位的建议拷贝下来，这周会把这批cre大鼠定下来然后尽快开始。
: 大鼠虽然不象小鼠目前用得这么广泛，但在神经疾病和心血管疾病方面的用途还是很大
: 的。而且目前能做大鼠基因敲进和cKO的地方很少，我想对我们来讲市场也远远超过我
: 们的产能了。之所以选择从cre大鼠开始做起，主要原因是如果有人想做cKO大鼠，一定
: 会需要cre大鼠。如果只是为单个客户做cre大鼠的定制化服务，其他客户要想用同样的
: cre大鼠，我们就没有办法提供了。所以干脆先做一批常用cre大鼠。因为还没有见到任
: 何通过Knockin方法得到cre大鼠的报道，所以我想如果我们先做出一批来，说不定会把
: 模式大鼠的应用带起来。
| l**********1
发帖数: 5204 | 25 if by TALENs, ZFNs and >CRISPR/Cas
pls check below database at least three month one time:
>EENs (Engineered EndoNucleases) are artificial endonucleases designed to
target special DNA sequences. TALENs, ZFNs and >CRISPR/Cas systems are the
most frequently used EENs.
http://eendb.zfgenetics.org/index.php
EENdb is a database collecting reported TALENs, ZFNs and CRISPR/Cas systems
targeting organism. EENdb also provides a knowledge base of EEN engineering
and other utilities of EENs.
rabbit:
http://eendb.zfgenetics.org/een.php?species=Oryctolagus+cunicul
rat:
http://eendb.zfgenetics.org/een.php?species=Rattus+norvegicus
monkey:
http://eendb.zfgenetics.org/een.php?species=Cercopithecus+aethi
【在 l**********k 的大作中提到】
: 由于一直以来没有表达Cre的工具大鼠，所以可能会影响到cKO大鼠的应用，进而影响到
: 大鼠做为模式动物在医学研究中的应用。我们这几个月想先做一二十种Cre Knockin大
: 鼠。然而，虽然大鼠在神经生物学和心血管疾病方面比小鼠有优势（所以用途更广），
: 但我对这两个领域不是很了解。我知道这里卧虎藏龙，麻烦这些领域的朋友给提一些建
: 议，以便我们可以有些目标，并对要做的Cre大鼠排一个优先顺序。如果您的建议被采
: 纳，一旦你用得到，我们会优先免费提供，或是提供给你指定的在国内的科研朋友。感
: 谢大家的帮忙。
| l**********1
发帖数: 5204 | 26 if Cre rabbit
two EU dot com are doing it now:
a dot com
PolyGene dot CH
has a fully functional production site for the establishment of transgenic
and knockout / knockin animals, such as mice, rats or rabbits. Those animal
models (of human diseases) are suitable for all kind of research areas, such
as cardiology, oncology, obesity, immunology, neurology, physiology, ageing
, etc.
generation of constitutive or conditional, inducible knock-out animals (
mouse and rabbit) applying Cre/lox technology or Zinc-finger nuclease (ZFN)
technology
http://www.b2match.eu/fp7health2011/participants/158
or
http://www.polygene.ch
b dot com in France:
RABBITS AS MODELS FOR THE STUDY OF HUMAN DISEASES
Rabbit has demonstrated interest in the study of several human diseases or
research areas:
- Atherosclerosis
- Ophtalmology
- Hypertrophic myopathies
- Diabetes - Obesity
- Hemostasis
- Respiratory diseases
- AIDS
- Cancer
- Spongiform encephalopathies
http://www.transgenic-rabbit-models.com/Rabbits_as_Models.html |
|
