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Biology版 - 问个UCSC Genes 的小白问题
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n******2
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1
各位大牛,我就想知道BRCA2在染色体上的位置。在ENCODE gene browser中输入BRCA2
,结果出来这么一堆信息。对照一下,好像有的是一部分,有的是全长。有没有什么
filter的功能能够自动得到全长的位置而不用自己挨个算?基因名后面括号中的是什么
信息?谢了。
BRCA2 (uc031qkz.1) at chr13:32945093-32953652
BRCA2 (uc031qky.1) at chr13:32928998-32936830
BRCA2 (uc001uub.1) at chr13:32889617-32973809
BRCA2 (uc001uua.1) at chr13:32889617-32907524
j*p
发帖数: 411
2
括号中是同一个基因的不同isoform的ucsc id,另外,后面不都已经有基因在染色体上
的位点了嘛,长度不是很简单嘛!问题够弱的,都不好意思回答。
n******2
发帖数: 971
3
为啥对同一个gene variant会有不同的ucsc id?这些id后面的基因位置都不一样。哪一
个才是正确的?

【在 j*p 的大作中提到】
: 括号中是同一个基因的不同isoform的ucsc id,另外,后面不都已经有基因在染色体上
: 的位点了嘛,长度不是很简单嘛!问题够弱的,都不好意思回答。

n******2
发帖数: 971
4
或者对同一个基因的variant,哪一个位置的信息是最新的数据?

【在 j*p 的大作中提到】
: 括号中是同一个基因的不同isoform的ucsc id,另外,后面不都已经有基因在染色体上
: 的位点了嘛,长度不是很简单嘛!问题够弱的,都不好意思回答。

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