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v*******y
发帖数: 5530 | 2 我们专业来说OSU>MSU>UCSC
年轻轻地去UCSC干嘛？养老？ |
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g******6
发帖数: 942 | 3 Depends on major. If EECS, OSU is much better than UCSC. BTW, OSU has
pension as well. The pay at UCSC is very low and you cannot afford a house
even after working for many years.
Univ |
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p*******g
发帖数: 809 | 4 正解
楼主别听上面一群人jjww，那些人中很多都不是faculty。你自己好好想想，OSU的名气
比UCSC强多了。国内学生老师没有不知道OSU的，但估计知道UCSC的人很少。既然是走
faculty的路，学校名气和学生质量是首先考虑的因素。天气？你当是你去加州度假的
啊？ |
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e******e
发帖数: 59 | 6 If you have to make a decision between UCSC and a middle west university (
ranked at 30~40, for example) such as Ohio State Univ or Michigan State Univ
. Which one you would like to choose? |
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b********d
发帖数: 5 | 10 选UCSC
地点好 （天气，风景，离硅谷近）
福利很好 （有pension）
压力不大（tenure很少被拒）
缺点：工资一般，房价较贵
Univ |
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m****o
发帖数: 12 | 12 很难想象上面的回答来自faculty. 难道不是 big10 的学校有 better reputation,
resource, better students, and better student placement??
我不知道 UCSC 如何。-- 孤陋寡闻了，以前没听说过这个建于1965的UC学校。 |
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a*****k
发帖数: 974 | 15 曾经在硅谷生活很多年，现在在mid-west。
无论从事业发展还是生活质量，绝对选OSU。
UCSC属于加州垫底的学校。基本上很难拿到资源。硅谷的资源是很多，但基本上被
stanford和berkeley垄断了。
生活上，加州除了天气，实在再没有什么好的地方。房价巨贵，生活成本巨高。除非加
州的工资能多一倍，否则根本不用考虑。 |
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h**a
发帖数: 163 | 16 not really... ucsc 的很多方向在全美都是topnotch，
比如超强的天文，生物的某些方向（比如 genomics）。
整体发展很快。具体还是要看专业方向。 |
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b*********o
发帖数: 1045 | 17 if it is my field, UCSC might be a bit better than OSU. MSU is out of the
question. |
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i*****t
发帖数: 24265 | 18 请教ucsc薄厚3万多够活么？如果有1个baby和1个家属的话？是否属于e-verify可以opt
延期呢？
谢谢！ |
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发帖数: 1 | 19 /美国UCSC毕业证书,Q微信193998606/加州大学圣克鲁兹分校毕业证成绩单,文凭,学历
认证,使馆认证,教育部认证/University of California Santa Cruz
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内各类基金等必备的材料。留学人员持有此证明还可以享受购买国产汽车免税等多项优
惠政策。
㈡：教育部认证的用途：
如果您计划在国内发展，那么办理国内教育部认证是必不可少的。事业性用人单位如银
行，国企，公务员 ，在您应聘时 都会需要您提供这个认证。其他私营、外企企业... 阅读全帖 |
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g***t
发帖数: 2278 | 20 去了好多次Berkeley了，
感觉Berkeley校园的内部本身没有特色，仿佛就是美国普通的乡镇。
倒是校园靠外的几条路风格迥异于湾区的其他大学的校园。
这种布局正好跟Stanford相反，SU是校园的外围没有什么特色，就是普通的美国乡镇的
样子，
但是SU校园内部却很漂亮。
UC Santa Cruz也去了几次，则算是内外都有特色，内部如丛林般，倒有些热带的味道
，外部有大农场。
UCSC在校园内就可以看到海边，Berkeley和SU在校园的靠外围的地方也可以看到海（湾
）。关于海景这一点，我不能肯定我各个校园去过的地方足够多，也许有的校内能看到
海。
就总体感觉来说，SU给人的感觉比较舒服、漂亮。 |
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i******n
发帖数: 201 | 21 ucsc 的校园实在是太漂亮了
海边的一个山头，以前是加州的自然保护区
足球场上下边就是海
学校builidng坐落在森林深处
路上经常会看见很多鹿穿过。
推荐一下 |
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p****l
发帖数: 1098 | 22 怪不得我看到介绍说UCSC和UCSB是加州大学里最漂亮的两个校区
如果ucsb有个山头就好了，也太热点了。 |
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p****l
发帖数: 1098 | 23 我怎么感觉你是在说ucsc，现在我家南面的卧室早上晚上都是摄氏18度左右。 |
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x*********9
发帖数: 19 | 25 没去过UCSB和UCSC， 不过UC Merced比berkeley好多了。 |
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l**********3
发帖数: 5 | 26 UCSC计算机的Prof Arnav Jhala水平如何? 容易相处吗？他是搞图像的assistant prof.
thanks. |
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l**********3
发帖数: 5 | 27 UCSC计算机的Prof Arnav Jhala水平如何? 容易相处吗？他是搞图像的assistant prof.
thanks. |
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G***G
发帖数: 16778 | 28 + strand in ucsc genome database stands for
1) DNA antisense strand
or 2) DNA sense strand? |
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j*p
发帖数: 411 | 29 括号中是同一个基因的不同isoform的ucsc id，另外，后面不都已经有基因在染色体上
的位点了嘛，长度不是很简单嘛！问题够弱的，都不好意思回答。 |
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n******2
发帖数: 971 | 30 为啥对同一个gene variant会有不同的ucsc id?这些id后面的基因位置都不一样。哪一
个才是正确的？ |
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e*********6
发帖数: 3453 | 31 又卡又慢，难以忍受啊。仅仅是个一维的数据，还没发用鼠标滚轮缩放，感觉比类似于
google map差了好几代的产品。当然这不能怪UCSC，毕竟他们是义务劳动，又不收钱。
NIH那么有钱，应该招标重新做个类似东西，板上有影响力的大佬赶紧提NIH提提意见吧
，就参考google earth和google map的标准做一个吧。 |
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e*********6
发帖数: 3453 | 32 这个流畅多了，不过很多都要自己手动输入了。
BTW，有没有办法吧UCSC brower上的track下载下来啊 |
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b****r
发帖数: 17995 | 33 试了一下，貌似很快，不过实在没啥数据啊，飞快也没用。load 几个track后是啥速度
要打个大疑问号，现在数据量和UCSC完全不是一个数量级，不说明问题 |
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Z******5
发帖数: 435 | 34 想从UCSC genome browser上弄一些ChIP-seq的图片下来，但是view image的分辨率好
低，请问有啥好方法能弄高分辨率的图片下来？最好是矢量图~~~~ |
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Z******5
发帖数: 435 | 35 最近在做一个转录因子，发现UCSC上有ChIP-seq的数据，想弄下来做个全面分析。
现在能做到的是：从ftp上下载bigWig数据，然后用bwtool过滤，然后转成Wig格式，然
后再转成Bed格式，然互再提交到GREAT做分析。
问题是：过滤后的数据转为Bed有 300M 左右，但是GREAT只能提交50M且不超过50000个
element，这样上传的文件基本只有5M左右，或者更低。
请问有啥好办法能够一次性注释300M或者更大的Bed文件呀？ |
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Z******5
发帖数: 435 | 36 Yes, I was misdirected from the start.
I have finished it by using the narrowPeak file downloading from the UCSC
web site.
Now I'm learning MACS2, it's a very usefull tool. Thanks for your suggestion.
actually
file |
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j***x
发帖数: 1469 | 37 大家好，我要在文章的supplementary material里加一个转录因子的ChIP-seq的截图，
ChIP-seq数据来自genome.ucsc.edu.请问大家有没有范文提供一下？ 具体怎么引用和
表述。谢谢！
最好是PNAS格式的，genome research的也行。 |
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f********8
发帖数: 5601 | 38 UCSC is closer to Bay. Maybe it's easier to get internship. Either MA or MS,
you are not going to learn much useful for the industry. |
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s*****6
发帖数: 254 | 39 In my opinion, GaTech and UCSB are comparable. UCSC is not at the same
level with the other two schools.
If you are thinking moving to the Bay area after graduation, UCSB might have
a slight edge over GaTech though. However, taking all factors (program
costs, cost of living, etc.) into account, I suggest selecting GaTech.
szu2006 |
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R***s
发帖数: 302 | 40 UCSC is very close to Silicon Valley. It will be much easier to find
internship there. That's a big plus. I haven't heard "Worcester". So can't
even comment. |
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l****c
发帖数: 838 | 41 Worcester is in central Mass., about one hour (40miles) from Boston.
Of course, it is not so good as UCSC. |
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d****i
发帖数: 4809 | 42 No brainer, UCSC for sure. It is so close to the center of the heart of the
Valley. |
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a***n
发帖数: 74 | 43 October 8, 1999
Contact: Tim Stephens/Jim Burns, 831/459-2495
Eminent UCSC computer scientist David Huffman dies at age 74
'Huffman Codes' used in fax machines, modems, other applications involving the
compression of data
FOR IMMEDIATE RELEASE
SANTA CRUZ, CA--David A. Huffman, the founding faculty member of the Computer
Science Department at the University of California, Santa Cruz, and a pioneer in the field,
died at a local hospital on Thursday, October 7, after a 10-month battle with cancer. |
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j*p
发帖数: 411 | 44 本人在wet lab里面做纯数据分析，for NGS data analysis, 简单介绍一些自己接触过
，并且觉得挺有用的工具，说的有点杂，权作抛砖引玉，还请不吝赐教。
Next-Gen sequencing(NGS)和现在正在发展的3rd-gen sequencing将会在生物学研究中
被越来越广泛应用。不管你信不信，反正我信了。一是基于实验成本的降低（$1k
whole-genome sequencing is coming），越来越多的实验室可以操作；二是可以提供
相对low throughput experiment多的多的数据和信息，可以看到很多从前看不到的东
西；三是sequencer本身对测序的准确性正在逐渐提高，所以实验固有错误率降低；四
是各种算法的成熟应用，这使得很多由于实验产生的误差在出数据后通过对数据的分析
得以过滤。按照library preparation来分，NGS主要有DNA-seq和RNA-seq
DNA-seq is usually used as ChIP-seq to study transcription factor(TF)-DNA
bi... 阅读全帖 |
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j*p
发帖数: 411 | 45 本人在wet lab里面做纯数据分析，for NGS data analysis, 简单介绍一些自己接触过
，并且觉得挺有用的工具，说的有点杂，权作抛砖引玉，还请不吝赐教。
Next-Gen sequencing(NGS)和现在正在发展的3rd-gen sequencing将会在生物学研究中
被越来越广泛应用。不管你信不信，反正我信了。一是基于实验成本的降低（$1k
whole-genome sequencing is coming），越来越多的实验室可以操作；二是可以提供
相对low throughput experiment多的多的数据和信息，可以看到很多从前看不到的东
西；三是sequencer本身对测序的准确性正在逐渐提高，所以实验固有错误率降低；四
是各种算法的成熟应用，这使得很多由于实验产生的误差在出数据后通过对数据的分析
得以过滤。按照library preparation来分，NGS主要有DNA-seq和RNA-seq
DNA-seq is usually used as ChIP-seq to study transcription factor(TF)-DNA
bi... 阅读全帖 |
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f**o
发帖数: 12685 | 46 新浪科技 探索
中国天文界公开争论:“世界最大”光学望远镜该咋建
2017.08.06 19:02:34综合
来源：知识分子公众号
资料图：中国科学院国家天文台郭守敬望远镜（LAMOST）。 新华社记者 殷刚 摄
资料图：中国科学院国家天文台郭守敬望远镜（LAMOST）。 新华社记者 殷刚 摄
编者按：
公共事件无私议。然而，中国科学界公共议事空间发展并不充分。表现在一些信息、甚
至是争议，局限在一个很小的圈子里流传，直至最终决策出来了，很多科学的同行可能
才从小道消息，或者窃窃私语中了解一鳞半爪。而公众，更加不知道决策的过程，自然
也无从谈起对科学的支持，对科学家的支持。这是需要改进的中国科学文化的一部分。
有希望获得国家财政支持的12米光学望远镜究竟应该怎么建，天文学界有两种不同的技
术方案，而且在内部持续争论有日，直到上周五，一封信件在天文学界的微信群里传开
，将这一内部争论大白于天下。
《知识分子》尽可能地联系争议的双方，希望如实报道这一影响中国天文学界未来数十
年研究的科学决策，以及其中的种种曲折，是非自当公论。我们将不偏不倚，刊登来自
两个方面的不同意见。来稿请联系[em... 阅读全帖 |
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L***s
发帖数: 9258 | 47 发信人: Mang (忙 盲 茫), 信区: TsinghuaCent
标 题: 任教于美国一流大学的部分清华学子
发信站: 水木社区 (Tue Sep 10 11:30:55 2013), 站内
【致谢】感谢参与编写和提供信息的以下校友：
IhateBS strong
根据美国US News 2013年美国大学排名前100的顺序统计，缺漏错误之处难免，请大家
补充
分为Full Professor（正教授）、Associate Professor（副教授）和Assistant
Professor三类，
其中前两类一般具有终身教职，不含解放前的清华学子，也含有极少数非tenure track
教职
人员,和已离职的人员，只列出，不计入统计总数。
共有在职Tenure track系列教职的共492 人，其中90名正教授。副教授186人
另有部分著名实验室全职研究人员22人
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1,哈佛大学 6
林希虹
Professor, 生物统计系... 阅读全帖 |
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j***h
发帖数: 3205 | 48 美國加州大學聖克魯茲分校（UC Santa Cruz，UCSC）心理學暨生物心理學系知名教授
布里吉曼（Bruce Bridgeman），本月稍早赴台灣演說時，在台北遭巴士撞擊身亡，享
壽71歲。UCSC於25日發布聲明指出，布里吉曼在神經科學、空間定向等領域享有國際性
聲望，他與妻子黛安（Diane Bridgeman）本月稍早在亞洲進行巡迴演說，原定10日於
台北醫學大學發表演說，但當天他在台北過十字路口時不幸遭巴士撞死。布里吉曼擁有
史丹福大學博士學位， 1973年就進入UCSC任教，「極為睿智、幽默，富有探求智識的
好奇心、教學認真、待人溫和有禮」。他身後留有妻子、兩個女兒及外孫子女。UCSC將
於10月舉行紀念布里吉曼的儀式。 （國際中心／綜合外電報導）
布里吉曼小檔案
◎生卒：1944/09/17~2016/07/10，享壽71歲
◎家鄉：加州聖克魯茲
◎職業：美國加州大學聖克魯茲分校心理學暨生物心理學系教授
◎專長：神經科學、空間定向
◎學歷：康乃爾大學心理學學士（1967）、史丹福大學博士（1971）
◎家庭：已婚，與妻子黛安育有兩個女兒，已當外公
資料來源：《聖克魯茲... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 49 29岁大陆硕士求建议：
现状：由于家庭经济一般，2016fall只申请了美国的PHD，但出国的目的是肉身翻墙，
工作和学术都可以。
已有的offer：
1. UCSC CE phd，导师是副教授，方向是控制，属于无面试的offer，老师也没有积极
联系我，只是最近催着做决定。 个人感觉去了UCSC，应该就是尽量往CS靠然后找工作
，即时找到工作就quit了。
2. VT ECE phd，导师是刚毕业的AP，paper很厉害，名校毕业，方向是机器人，跟着这
个老师对学术还是有期待的，不过自身条件一般，毕业后找教职困难，可能就postdoc
赞paper拿卡吧。
3. GWU ME phd，导师也是年轻的AP，比VT的老师略差，自我感觉去GWU之后去企业不如
UCSC的地理位置好，专业也没有CE好；之后postdoc赞paper没有VT有把握。
我现在纠结的是：
如果去UCSC尽快就业的话，担心H1B抽签问题，怕分分钟被赶回来了；
如果去VT的话，感觉phd之后postdoc不需要太担心身份问题，但好像工资不高，加上自
己经济条件也一般，估计近十年生活质量会一直不好。
一开始申请没有抬头看... 阅读全帖 |
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