g*********5
发帖数: 2533 | 1 最近想做一个实验，control and model mouse, 提取组织，标记红色，绿色，然后run
2D gel，（DIGE）， 质谱。后来一个哥们告诉我可以直接把样品质谱定量分析，这样
更容易找到差异表达的蛋白了。有人做过吗？这个用在ip筛选作用蛋白就不用割胶，更
容易了
谢谢。 |
s******s
发帖数: 13035 | 2 用同位素标记，这个用细胞做，换culture做容易。你用老鼠，
估计没法做
run
【在 g*********5 的大作中提到】
: 最近想做一个实验，control and model mouse, 提取组织，标记红色，绿色，然后run
: 2D gel，（DIGE）， 质谱。后来一个哥们告诉我可以直接把样品质谱定量分析，这样
: 更容易找到差异表达的蛋白了。有人做过吗？这个用在ip筛选作用蛋白就不用割胶，更
: 容易了
: 谢谢。
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g*********5
发帖数: 2533 | 3 细胞也做不了，我们实验室没有license，老板也不想用。 |
s******y
发帖数: 28562 | 4 SILAC 啊。
用的是稳定同位素。
run
【在 g*********5 的大作中提到】
: 最近想做一个实验，control and model mouse, 提取组织，标记红色，绿色，然后run
: 2D gel，（DIGE）， 质谱。后来一个哥们告诉我可以直接把样品质谱定量分析，这样
: 更容易找到差异表达的蛋白了。有人做过吗？这个用在ip筛选作用蛋白就不用割胶，更
: 容易了
: 谢谢。
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b*******g
发帖数: 1309 | 5 ask for iTRAQ technique
run
【在 g*********5 的大作中提到】
: 最近想做一个实验，control and model mouse, 提取组织，标记红色，绿色，然后run
: 2D gel，（DIGE）， 质谱。后来一个哥们告诉我可以直接把样品质谱定量分析，这样
: 更容易找到差异表达的蛋白了。有人做过吗？这个用在ip筛选作用蛋白就不用割胶，更
: 容易了
: 谢谢。
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k******0
发帖数: 1073 | 6 Silac做组织的好像还不行。可以用楼下建议的i-TRAq。
【在 s******y 的大作中提到】
: SILAC 啊。
: 用的是稳定同位素。
:
: run
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C********4
发帖数: 308 | 7 请问iTAQ和SILAC，一个是处理后的蛋白质样品用同位素标记；一种是先标记细胞再做
我比较一个细胞系加药和control的差异，两种办法都可以咯，但是灵敏度和定量效果
上哪个好？
【在 b*******g 的大作中提到】
: ask for iTRAQ technique
:
: run
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l**********1
发帖数: 5204 | 8 SILAC 的定量效果较好
【在 C********4 的大作中提到】
: 请问iTAQ和SILAC，一个是处理后的蛋白质样品用同位素标记；一种是先标记细胞再做
: 我比较一个细胞系加药和control的差异，两种办法都可以咯，但是灵敏度和定量效果
: 上哪个好？
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b*******g
发帖数: 1309 | 9 ITRAQ方便，protein digestion 之后开始标记，也相对便宜
SILAC 从cell culture开始加isotope labeled AA
这个方法对in vivo的实验没办法
ionization efficiency for some iTRAQ labeled peptides might be enhanced,
this would boost the sensitivity.
linear range for quantitation, SILAC might be better.
【在 C********4 的大作中提到】
: 请问iTAQ和SILAC，一个是处理后的蛋白质样品用同位素标记；一种是先标记细胞再做
: 我比较一个细胞系加药和control的差异，两种办法都可以咯，但是灵敏度和定量效果
: 上哪个好？
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