由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 谁做TUNNEL assay有经验?帮我看看吧
相关主题
为什么在IB中能看到变化而PCR中却不能呢?请教DNase
[合集] 大家谈谈ageing吧:)NGS/Array Job opportunity -Illumina
[合集] 王小东won Richard Lounsbery Award (national academy)找人一起办个杂志
【求助】新手问apoptosis assay难怪NIH得cut funding
邓宏魁新的chemical induced iPSC 文章Temp position:RA in Genentech (转载)
请教protein assay如何reproduce和量化?JBC文章还好使不?
流式分选有多敏感eLife将检验50篇高引用率文章
关于小分子和蛋白结合的SPR数据Cancer reproducibility project
相关话题的讨论汇总
话题: tunnel话题: control话题: positive话题: assay话题: cells
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
b***e
发帖数: 125
1
我们在小鼠里敲除一个基因后,做TUNNEL assay,发现retina的inner nuclear layer呈
阳性(上图箭头处),而control则是阴性(下图箭头处)。 但有个同事说是假阳性,
因为真正的阳性细胞应该看上去偏小,呈小点状,而且组织结构应该会mess up,但我这
个retina,看这结构还很完整,不像apoptosis.大家说呢?谢谢。
s****9
发帖数: 932
2
What is your control, Wild type mice control or no antibody control?
It does not looks positive from my view. It is unlikely that all of these
cells in this layer are uniformly positive. In addition, the cell size of
positive cells in your picture look pretty round and uniform, while the size
of true positive apoptotic cells are quite heterogeneous and look different
from healthy cells.

【在 b***e 的大作中提到】
: 我们在小鼠里敲除一个基因后,做TUNNEL assay,发现retina的inner nuclear layer呈
: 阳性(上图箭头处),而control则是阴性(下图箭头处)。 但有个同事说是假阳性,
: 因为真正的阳性细胞应该看上去偏小,呈小点状,而且组织结构应该会mess up,但我这
: 个retina,看这结构还很完整,不像apoptosis.大家说呢?谢谢。

b***e
发帖数: 125
3
谢谢!是wild type mice control.你说的和我同事说的很接近。但是我搞不懂,为什
么control这么干净。我两个是平行做的。

size
different

【在 s****9 的大作中提到】
: What is your control, Wild type mice control or no antibody control?
: It does not looks positive from my view. It is unlikely that all of these
: cells in this layer are uniformly positive. In addition, the cell size of
: positive cells in your picture look pretty round and uniform, while the size
: of true positive apoptotic cells are quite heterogeneous and look different
: from healthy cells.

n***w
发帖数: 2405
4
Where is your positive control?
b***e
发帖数: 125
5
这个到是没做,需要一个inner nuclear layer undergoing apoptosis的control...
不过我在网上找到这个(见贴图),确实如spt009说的,和我的有些不一样。
TUNNEL是用来stain DNA nick,也许在我的sample里,可能不是apoptosis,但确实DNA
fragmentation增多了。

【在 n***w 的大作中提到】
: Where is your positive control?
s****9
发帖数: 932
6
If it is wild type littermate control, it is worthy to repeat more mice to
see whether the staining is reproducible. If yes, maybe there is something
going on.

【在 b***e 的大作中提到】
: 谢谢!是wild type mice control.你说的和我同事说的很接近。但是我搞不懂,为什
: 么control这么干净。我两个是平行做的。
:
: size
: different

n***w
发帖数: 2405
7
直接用DNase做positive control.
这样可以告诉你至少两个信息。
1 你的TUNNEL工作了没?
2 阳性对照下的morphology。
上面说的对,你需要多重复重复。
不过在有tunnel信号的时候,组织不一定会mess up.

【在 b***e 的大作中提到】
: 这个到是没做,需要一个inner nuclear layer undergoing apoptosis的control...
: 不过我在网上找到这个(见贴图),确实如spt009说的,和我的有些不一样。
: TUNNEL是用来stain DNA nick,也许在我的sample里,可能不是apoptosis,但确实DNA
: fragmentation增多了。

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
Cancer reproducibility project邓宏魁新的chemical induced iPSC 文章
求推荐:96 well plate 哪家公司的比较好?请教protein assay如何reproduce和量化?
完全是外行,不过从韩各种表现看,肯定是作假了。流式分选有多敏感
Position Available: Associate Scientist, High Throughput Screening/Assay Development关于小分子和蛋白结合的SPR数据
为什么在IB中能看到变化而PCR中却不能呢?请教DNase
[合集] 大家谈谈ageing吧:)NGS/Array Job opportunity -Illumina
[合集] 王小东won Richard Lounsbery Award (national academy)找人一起办个杂志
【求助】新手问apoptosis assay难怪NIH得cut funding
相关话题的讨论汇总
话题: tunnel话题: control话题: positive话题: assay话题: cells