d**e 发帖数: 5 | 1 请教有关SPR的数据解释问题: 我们用SPR测试了一个小分子和靶点的结合,用一个阳
性化合物做对照 ,虽然两者曲线看起来都像结合的样子,但是KD 大概是80-100uM,而
实际的阳性化合物用别的assay测试是ki=12nM,我的问题是我可以说这个化合物与阳性
化合物活性相当吗? 多谢指点! |
c**********n 发帖数: 177 | 2 不能,因为结合位点可能完全不同啊。为啥不直接用你们的小分子去做assay拿这个小
分子的Ki? |
d**e 发帖数: 5 | 3 谢谢你的解答,但是我的理解是小分子跟蛋白的结合可能也就是在相同口袋里。 现阶
段没有合适的assay去做,所以想用 SPR测试一下。 |
c**********n 发帖数: 177 | 4 SPR做小分子蛋白结合不是特别的reliable,我猜你应该是immobolize蛋白然后flow小
分子吧。推荐用等热滴定去做蛋白小分子结合。
【在 d**e 的大作中提到】 : 谢谢你的解答,但是我的理解是小分子跟蛋白的结合可能也就是在相同口袋里。 现阶 : 段没有合适的assay去做,所以想用 SPR测试一下。
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d**e 发帖数: 5 | |