问一个引物设计问题 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 问一个引物设计问题

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n****0 发帖数: 696	1 有些manual上建议3‘端用G or C,可是用软件设计的引物末端经常是AT，稍微改一下 rating就会变得很低，因为hairpin，dimer之类的，这种情况我是应该完全相信软件，还是确保末端是GC更重要啊？
Z******5 发帖数: 435	2 不放心的话就在后面再加一个碱基。
n****0 发帖数: 696	3 可是加了的话，就会出现一些二级结构，软件的rating就会变低，不知道是哪个更重要些【在 Z******5 的大作中提到】 : 不放心的话就在后面再加一个碱基。
j****x 发帖数: 1704	4 mannual的建议自然是优先考虑的，软件评分本身就是个参考，一般而言二级结构对引物效率的影响有限除非是极为稳定的结构，更何况只是多一个C/G的差异。实在不放心就设计两对同时试，浪费不了多少时间/成本要些【在 n****0 的大作中提到】 : 可是加了的话，就会出现一些二级结构，软件的rating就会变低，不知道是哪个更重要些

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