d****i
发帖数: 2346 | 1 刚开始做启动子甲基化。
像这个图中的1、3、6行是不是可以看作是明显的没有convert的？这样我在计算甲基化
比例的时候应该把几个序列exclude掉？ |
c*********t
发帖数: 340 | 2 it is quite normal to have consecutive CpGs all methylated... |
b****r
发帖数: 17995 | 3 同时做全部都没有被甲基化的control，比如pcr product，如果都converted那就说明
问题了 |
c*********t
发帖数: 340 | 4 话说，虽然pcr-product是很常用的neg control，但是个人觉得它CONVERT不能保证你
看的那个MOLECULE也CONVERT了
看序列中的其它C都CONVERT了，我觉得这里应该是METHYLATION PROTECTION吧
话说其它C都CONVERT，偏偏CpG context的没有，这个概率很小的 |
d****i
发帖数: 2346 | 5 谢谢各位！
我是发现那几行每个CG位点有没有变，因此有疑问。 |
