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Biology版 - 怪异的大质粒
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b****r
发帖数: 17995
1
构建了个CONSTRUCT,从基因组扩了16KB,插入表达载体,总长大概是22KB,但是做转染
没结果,想不明白。这个也就算了。测序都测不出来,作为困难模板,BAC测都不行。
而我从这个CONSTRCUT里面扩增小片段测序可以的,真遇到鬼了。是不是测序公司太烂
了,还是怎么回事?
M*****n
发帖数: 16729
2
容易弄的小片断都被人研究过了。
这剩下这种怪异的大片段了。
惨啊。
Ecoli都很惨,本来天生的质粒没这么大的,现在非得吃进去这么大一块DNA.

【在 b****r 的大作中提到】
: 构建了个CONSTRUCT,从基因组扩了16KB,插入表达载体,总长大概是22KB,但是做转染
: 没结果,想不明白。这个也就算了。测序都测不出来,作为困难模板,BAC测都不行。
: 而我从这个CONSTRCUT里面扩增小片段测序可以的,真遇到鬼了。是不是测序公司太烂
: 了,还是怎么回事?

C*******e
发帖数: 4348
3
不能回答lz的疑问,我是来求教的
“测序都测不出来,作为困难模板,BAC测都不行”
——请问什么意思?BAC测是针对困难模板么?
我手上有个模板也是测不出来
从两端外侧往里测可以,从里面继续测下去就不行

【在 b****r 的大作中提到】
: 构建了个CONSTRUCT,从基因组扩了16KB,插入表达载体,总长大概是22KB,但是做转染
: 没结果,想不明白。这个也就算了。测序都测不出来,作为困难模板,BAC测都不行。
: 而我从这个CONSTRCUT里面扩增小片段测序可以的,真遇到鬼了。是不是测序公司太烂
: 了,还是怎么回事?

b****r
发帖数: 17995
4
我想BAC因为很大,有自己独特的测序protocol
我在想是不是这些大玩意有二级结构了,但是Hidi应该可以把这些结构拉直把……

【在 C*******e 的大作中提到】
: 不能回答lz的疑问,我是来求教的
: “测序都测不出来,作为困难模板,BAC测都不行”
: ——请问什么意思?BAC测是针对困难模板么?
: 我手上有个模板也是测不出来
: 从两端外侧往里测可以,从里面继续测下去就不行

C*******e
发帖数: 4348
5
我那个倒不是大质粒
就3.7kb的片段
但是很难P,也难测序

【在 b****r 的大作中提到】
: 我想BAC因为很大,有自己独特的测序protocol
: 我在想是不是这些大玩意有二级结构了,但是Hidi应该可以把这些结构拉直把……

j****x
发帖数: 1704
6
High GC content?
换酶换buffer

【在 C*******e 的大作中提到】
: 我那个倒不是大质粒
: 就3.7kb的片段
: 但是很难P,也难测序

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