a***y
发帖数: 19743 | 1 比如改进酶效率
研究蛋白结构进化法则
为蛋白药物设计做研究 |
w*******2
发帖数: 2199 | 2 a dead field
【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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a***y
发帖数: 19743 | 3 why is it dead?
【在 w*******2 的大作中提到】
: a dead field
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s***m
发帖数: 6197 | 4 前一阵该领域里一些重要paper retracted
【在 a***y 的大作中提到】
: why is it dead?
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a***y
发帖数: 19743 | 5 Where can I find out what happened?
我事实上是在考虑对这方面的可行性的基础性＋实用性研究的课题。
【在 s***m 的大作中提到】
: 前一阵该领域里一些重要paper retracted
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k********u
发帖数: 2209 | 6 看你打算跟谁做了。还是自己起家？
【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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a***y
发帖数: 19743 | 7 跟什么样的人做好？
不是自己起家。。
【在 k********u 的大作中提到】
: 看你打算跟谁做了。还是自己起家？
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S**I
发帖数: 15689 | 8 google Hellinga；这方面研究的实用性目前基本上都还停留在纸面上。
【在 a***y 的大作中提到】
: Where can I find out what happened?
: 我事实上是在考虑对这方面的可行性的基础性＋实用性研究的课题。
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d********e
发帖数: 321 | 9 自己设计蛋白简直就是扯淡，现在预测 secondary structure还不怎么样呢
【在 S**I 的大作中提到】
: google Hellinga；这方面研究的实用性目前基本上都还停留在纸面上。
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a***y
发帖数: 19743 | 10 我觉得现在的研究潜能主要是在改进已有蛋白功能上
首先理解蛋白质功能变化于结构的更本质关系，这个可以在修改的过程中研究出来
成果可以指导如何修改蛋白，用什么方法高效筛选等
从头设计的话，是还很遥远。
【在 S**I 的大作中提到】
: google Hellinga；这方面研究的实用性目前基本上都还停留在纸面上。
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k********u
发帖数: 2209 | 11 A pubmed search would answer most of your questions.=)
I know a guy from UPenn, HHMI investigator, used to be working
in related field. I don't know whether or not he is focusing on that now.
I am not in this field, don't follow it.
Generally speaking, you want to find a Big Cow, has tons of extra money
to burn, probably from a structure lab, and is nice if you are lucky...
【在 a***y 的大作中提到】
: 跟什么样的人做好？
: 不是自己起家。。
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k********u
发帖数: 2209 | 12 Easy to say than to do...
You can try.
【在 a***y 的大作中提到】
: 我觉得现在的研究潜能主要是在改进已有蛋白功能上
: 首先理解蛋白质功能变化于结构的更本质关系，这个可以在修改的过程中研究出来
: 成果可以指导如何修改蛋白，用什么方法高效筛选等
: 从头设计的话，是还很遥远。
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s********n
发帖数: 2939 | 13 Rational design成功率很低，directed evolution如果有好的筛选系统的话成功率会
高一些。 |
p*******r
发帖数: 4048 | 14 you can try to go to janelia farm and work for looren looger.
They have money to burn. :)
【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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a***y
发帖数: 19743 | 15 directed evolution你觉得这个方向如何?
我感觉directed evolution做得多了，rational design才更有rationale可以依据吧？
【在 s********n 的大作中提到】
: Rational design成功率很低，directed evolution如果有好的筛选系统的话成功率会
: 高一些。
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s********n
发帖数: 2939 | 16 rational design比较炫，directed evolution比较实用。 |
s***m
发帖数: 6197 | 17 看看david baker的实验室
他rp比较好
【在 a***y 的大作中提到】
: Where can I find out what happened?
: 我事实上是在考虑对这方面的可行性的基础性＋实用性研究的课题。
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s***m
发帖数: 6197 | 18 去年有两片文章分别发在nature和science
david baker实验室的
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怎么不怎样呢？
【在 d********e 的大作中提到】
: 自己设计蛋白简直就是扯淡，现在预测 secondary structure还不怎么样呢
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l*********1
发帖数: 351 | 19 对酶工程来说没啥好的hts技术嘛。
display ×
荧光 ×
抗生素 ×
设计高质量的library才是王道
【在 s********n 的大作中提到】
: Rational design成功率很低，directed evolution如果有好的筛选系统的话成功率会
: 高一些。
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l*********1
发帖数: 351 | 20 这年头，觉着之友david baker算是这行的大牛。Baker+Tawfik才是未来的方向。
早两年stephen mayo搞计算还是很nb的，这两年不知道为什么没啥动静了。
顺便求内幕。
【在 a***y 的大作中提到】
: 比如改进酶效率
: 研究蛋白结构进化法则
: 为蛋白药物设计做研究
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s********n
发帖数: 2939 | 21 不能一概而论吧，很多工业用的酶都没有很好的筛选系统。当然高质量的library是前
提，但还是要有高通量甚至超高通量的筛选。
【在 l*********1 的大作中提到】
: 对酶工程来说没啥好的hts技术嘛。
: display ×
: 荧光 ×
: 抗生素 ×
: 设计高质量的library才是王道
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a**y
发帖数: 464 | 22 I know him well. But to be honest, his science is far from good.
【在 p*******r 的大作中提到】
: you can try to go to janelia farm and work for looren looger.
: They have money to burn. :)
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v**********m
发帖数: 5516 | 23 利用各种表达库来筛结合伴侣比设计快得多。
看看单抗筛选，能得到结合常数在pmol级别的单抗。
【在 a***y 的大作中提到】
: 我觉得现在的研究潜能主要是在改进已有蛋白功能上
: 首先理解蛋白质功能变化于结构的更本质关系，这个可以在修改的过程中研究出来
: 成果可以指导如何修改蛋白，用什么方法高效筛选等
: 从头设计的话，是还很遥远。
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b***d
发帖数: 102 | 24 在rational degign方面很多研究将实验和计算结合起来，是一个不错的探索。
david Baker组里利用Rosetta等软件设计、改造酶，再通过实验验证，在sicence
nature发表了重要研究成果。 但这方面非常烧钱啊，问题在于成功率。 |
