s********n
发帖数: 2939 | 1 Talk非常棒，会后大伙排了好长队和他face to face talk，很像追星族。俺也是其中
一员，和他聊了几分钟，邀请他到我们那give a talk，大牛欣然同意，开心了一会，
希望他看在我们头的份上会来呵。 |
I*****y
发帖数: 6402 | 2 这是啥会？
没和David合影吗？呵呵
【在 s********n 的大作中提到】
: Talk非常棒，会后大伙排了好长队和他face to face talk，很像追星族。俺也是其中
: 一员，和他聊了几分钟，邀请他到我们那give a talk，大牛欣然同意，开心了一会，
: 希望他看在我们头的份上会来呵。
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h****u
发帖数: 480 | 3
没有让他在哪签个名？:)
【在 s********n 的大作中提到】
: Talk非常棒，会后大伙排了好长队和他face to face talk，很像追星族。俺也是其中
: 一员，和他聊了几分钟，邀请他到我们那give a talk，大牛欣然同意，开心了一会，
: 希望他看在我们头的份上会来呵。
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s********n
发帖数: 2939 | 4 在Seattle的Symposium of Industrial Microbiology.
没有，当时只是想认识一下而已，下次吧。
【在 I*****y 的大作中提到】
: 这是啥会？
: 没和David合影吗？呵呵
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s********n
发帖数: 2939 | 5 拿他的paper给签名？
【在 h****u 的大作中提到】
:
: 没有让他在哪签个名？:)
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s********n
发帖数: 2939 | 6 之前是久闻其大名，一直以为是个老头，没想到这么年轻，才四十多岁。 |
l*********1
发帖数: 351 | 7 伊是大明星。directed evolution谁都能做，de novo design就他家了。mayo 跟
hellinga都已经成为过去式了。关键是人nice，supportive |
j****x
发帖数: 1704 | |
A******y
发帖数: 2041 | 9 Nicest and smartest person whom I ever met. |
o**4
发帖数: 35028 | 10 做结构的？
是不是比11公还厉害啊？
【在 s********n 的大作中提到】
: Talk非常棒，会后大伙排了好长队和他face to face talk，很像追星族。俺也是其中
: 一员，和他聊了几分钟，邀请他到我们那give a talk，大牛欣然同意，开心了一会，
: 希望他看在我们头的份上会来呵。
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S**********l
发帖数: 3835 | 11 哇。好牛啊。是Baker's yeast的那个Baker么？
【在 s********n 的大作中提到】
: Talk非常棒，会后大伙排了好长队和他face to face talk，很像追星族。俺也是其中
: 一员，和他聊了几分钟，邀请他到我们那give a talk，大牛欣然同意，开心了一会，
: 希望他看在我们头的份上会来呵。
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b****n
发帖数: 311 | 12 我也觉得丫的design功夫很NB！可惜俺是这辈子没本事进这圈子了。 |
o**4
发帖数: 35028 | 13 能大概说说他做的东西么？
【在 b****n 的大作中提到】
: 我也觉得丫的design功夫很NB！可惜俺是这辈子没本事进这圈子了。
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b****n
发帖数: 311 | 14 computational approach, basing on structure and physical/chemical laws, to
modify enzyme function/interaction, or even CREAT new enzyme/interaction.
Nature and/or Science every year. In my view, one of the most creative
scientist, at least one step further than most of us, because he is seriously
creating enzymes,once the job of mother nature.
【在 o**4 的大作中提到】
: 能大概说说他做的东西么？
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o**4
发帖数: 35028 | 15 有什么好的design现在应用的广泛的么？
seriously
【在 b****n 的大作中提到】
: computational approach, basing on structure and physical/chemical laws, to
: modify enzyme function/interaction, or even CREAT new enzyme/interaction.
: Nature and/or Science every year. In my view, one of the most creative
: scientist, at least one step further than most of us, because he is seriously
: creating enzymes,once the job of mother nature.
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b****n
发帖数: 311 | 16 not yet. This is research at very premitive but also exciting stage. Most of his
papers are prove-of-principle studies. The demonstration of the capability to
rationally design enzyme is very NB by itself.
【在 o**4 的大作中提到】
: 有什么好的design现在应用的广泛的么？
:
: seriously
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s******y
发帖数: 28562 | 17 倒。。。原来你还会甲醇：）
【在 S**********l 的大作中提到】
: 哇。好牛啊。是Baker's yeast的那个Baker么？
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o**4
发帖数: 35028 | 18 确实很牛逼了，有点像是把生物推向了IT行业，到时候人人都可以搞设计了，呵呵
of his
to
【在 b****n 的大作中提到】
: not yet. This is research at very premitive but also exciting stage. Most of his
: papers are prove-of-principle studies. The demonstration of the capability to
: rationally design enzyme is very NB by itself.
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c*******k
发帖数: 554 | 19
说的还真对，看看他参与的这篇Nature文章的题目：
Predicting protein structures with a multiplayer online game. Nature. 466,
756-60, (2010).
【在 o**4 的大作中提到】
: 确实很牛逼了，有点像是把生物推向了IT行业，到时候人人都可以搞设计了，呵呵
:
: of his
: to
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h****u
发帖数: 480 | 20
or on your shirt :)
【在 s********n 的大作中提到】
: 拿他的paper给签名？
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h****u
发帖数: 480 | 21
At the end, computer and IT save the day and start the Renaissance? ;)
【在 j****x 的大作中提到】
: 就是server太不给力了。。。
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l*********1
发帖数: 351 | 22 广泛没有，毕竟预测结构，设计全新的酶方法还不是很成熟。不过有应用了，伊的一棒
子徒弟搞了个公司好像跟dupont之类已经开始合作，而且有产品出来了。
www.arzeda.com
【在 o**4 的大作中提到】
: 有什么好的design现在应用的广泛的么？
:
: seriously
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s********n
发帖数: 2939 | 23 Agreed,他的学生和postdoc的出路都很不错。
【在 l*********1 的大作中提到】
: 伊是大明星。directed evolution谁都能做，de novo design就他家了。mayo 跟
: hellinga都已经成为过去式了。关键是人nice，supportive
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s********n
发帖数: 2939 | 24 Protein engineering满大街都在做，大部分都是修修补补，只有几个小组是真正在做
de novo design，他是#1。他的报告让我印象最深的有两点：
1. de novo design - 他有一个protein scafolds的数据库，里面的scafolds都已经通
过实验证明是可以表达，而且与预测结构相符合的。然后分析target reactions的
transition stages，提出可能的catalytic residues和binding residues及其空间分
布，然后就从数据库里调scafolds，找到能够维持催化和底物结合构象的scafolds，一
般有好几十个candidates，然后就是实验验证了（基因合成，蛋白表达和活性测定）。
一般能够得到Kcat/Km=1E4-1E5的artificial catalysts，这就差不多是catalytic
antibodies的水平了，当然离天然酶还挺远（1E8 - 1E12），但可以以此为模板做
directed evolution。感觉其最重要的一点是在于可以设计一些biocatalysts来催化自
然界里没有的反应或者自然界没有相应的酶的反应。
2. Foldit - 一个game，他们用这个game成功的预测结构。具体故事是这样，有个实验
室对一个retrovirus protease做了很久结构，包括X-ray和NMR，数据有了，但就是结
构解析不出来，折腾了好几年（>5），他们找到和David Baker，他就把这个蛋白的原
始数据结构放在Foldit上面，然后就有一些team就开始帮这个结构找最合适的构象，结
构找到了。最有意思的是文章署名的时候，他们本来要把网上那个team列作作者的，但
那个team拒绝了。 |
p****s
发帖数: 3153 | 25 数据都有了结构解不出来是什么原因？
【在 s********n 的大作中提到】
: Protein engineering满大街都在做，大部分都是修修补补，只有几个小组是真正在做
: de novo design，他是#1。他的报告让我印象最深的有两点：
: 1. de novo design - 他有一个protein scafolds的数据库，里面的scafolds都已经通
: 过实验证明是可以表达，而且与预测结构相符合的。然后分析target reactions的
: transition stages，提出可能的catalytic residues和binding residues及其空间分
: 布，然后就从数据库里调scafolds，找到能够维持催化和底物结合构象的scafolds，一
: 般有好几十个candidates，然后就是实验验证了（基因合成，蛋白表达和活性测定）。
: 一般能够得到Kcat/Km=1E4-1E5的artificial catalysts，这就差不多是catalytic
: antibodies的水平了，当然离天然酶还挺远（1E8 - 1E12），但可以以此为模板做
: directed evolution。感觉其最重要的一点是在于可以设计一些biocatalysts来催化自
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f****y
发帖数: 104 | 26 他的认可度要远高于一公。一工做晶体结构，业内牛人很多，这样给人感觉就比较大路
货了，获得认可也难些。
当年一公和本校的Bonnie Bassler一起去参加HHMI评选，Bassler上了而一公却被刷，
一公认为只因为Bassler是个女的。我觉得原因还是做的东西过于大路货有关。
【在 o**4 的大作中提到】
: 做结构的？
: 是不是比11公还厉害啊？
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g****1
发帖数: 261 | 27
Classic!
【在 f****y 的大作中提到】
: 他的认可度要远高于一公。一工做晶体结构，业内牛人很多，这样给人感觉就比较大路
: 货了，获得认可也难些。
: 当年一公和本校的Bonnie Bassler一起去参加HHMI评选，Bassler上了而一公却被刷，
: 一公认为只因为Bassler是个女的。我觉得原因还是做的东西过于大路货有关。
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b****n
发帖数: 311 | 28 Bassler的research很赞啊，要我判，二选一的话我也给Bassler.
【在 f****y 的大作中提到】
: 他的认可度要远高于一公。一工做晶体结构，业内牛人很多，这样给人感觉就比较大路
: 货了，获得认可也难些。
: 当年一公和本校的Bonnie Bassler一起去参加HHMI评选，Bassler上了而一公却被刷，
: 一公认为只因为Bassler是个女的。我觉得原因还是做的东西过于大路货有关。
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f****y
发帖数: 104 | 29 品位不错，赞！ :)
【在 b****n 的大作中提到】
: Bassler的research很赞啊，要我判，二选一的话我也给Bassler.
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s********n
发帖数: 2939 | 30 听报告得到的信息，具体什么原因不知道，会不会是相位的问题，可能得看原文了。
【在 p****s 的大作中提到】
: 数据都有了结构解不出来是什么原因？
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I*****y
发帖数: 6402 | 31 好像还有个Xencor(e)
【在 l*********1 的大作中提到】
: 广泛没有，毕竟预测结构，设计全新的酶方法还不是很成熟。不过有应用了，伊的一棒
: 子徒弟搞了个公司好像跟dupont之类已经开始合作，而且有产品出来了。
: www.arzeda.com
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M*******s
发帖数: 108 | 32 看过他实验室最近两年在nature上的那两篇文章
当时就觉得做的好牛必啊
没想到就是这个人啊。。。
以后看文章真应该多看看 作者的实验室 |
p**5
发帖数: 2544 | 33 1. Baker的确很牛很牛，他自己不做结构，和很多人合作做结构，他主要做方法和计算
，同时让别人“帮着实验他的idea”，很多人都愿意和他合作，发paper多猛啊
2. Bassler是个女的，确实有很大关系。一公早该HHMI的。
【在 f****y 的大作中提到】
: 他的认可度要远高于一公。一工做晶体结构，业内牛人很多，这样给人感觉就比较大路
: 货了，获得认可也难些。
: 当年一公和本校的Bonnie Bassler一起去参加HHMI评选，Bassler上了而一公却被刷，
: 一公认为只因为Bassler是个女的。我觉得原因还是做的东西过于大路货有关。
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p*****m
发帖数: 7030 | 34 bonnie bassler还是挺牛的吧 是不是女的关系不大吧。。
【在 p**5 的大作中提到】
: 1. Baker的确很牛很牛，他自己不做结构，和很多人合作做结构，他主要做方法和计算
: ，同时让别人“帮着实验他的idea”，很多人都愿意和他合作，发paper多猛啊
: 2. Bassler是个女的，确实有很大关系。一公早该HHMI的。
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D******n
发帖数: 2836 | 35 baker的确是这个field里面名字最响亮的。可是这个feild现在很naive。
protein prediction基本很难，de nova就更没戏。baker聪明在，没有死守在这个没有
生气的领域，又义无反顾的投入了protein design。
【在 p**5 的大作中提到】
: 1. Baker的确很牛很牛，他自己不做结构，和很多人合作做结构，他主要做方法和计算
: ，同时让别人“帮着实验他的idea”，很多人都愿意和他合作，发paper多猛啊
: 2. Bassler是个女的，确实有很大关系。一公早该HHMI的。
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p**5
发帖数: 2544 | 36 兄弟你也是从生物转到统计的？
【在 D******n 的大作中提到】
: baker的确是这个field里面名字最响亮的。可是这个feild现在很naive。
: protein prediction基本很难，de nova就更没戏。baker聪明在，没有死守在这个没有
: 生气的领域，又义无反顾的投入了protein design。
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D******n
发帖数: 2836 | 37 是bioinformatics，见笑了。
【在 p**5 的大作中提到】
: 兄弟你也是从生物转到统计的？
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