s******s
发帖数: 13035 | 1 搞笑吧。我原来实验室隔壁就新来一养鱼的，和养老鼠
的笼子一样，一大堆塑料鱼缸都是模块化的，就比笼子大
一点。基本上一个office大小就能养一百来缸，不是大实
验室差不多就够了，而且不像老鼠那么脏。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 2 养果蝇要有一个18C的房间，专门放stock；两个双开门
大incubator, 一个18C，一个25C；一个不做果蝇完全分离
的地方，隔离可能有mites污染的。 |
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g*********d
发帖数: 233 | 4 科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因
2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》（PLoS ONE）期刊上的一份研究报告称康涅
狄格大学的遗
传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库
中的大约
1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因组数据受到了人类DNA的污染，样品处理有可能是
导致DNA数据
库广泛污染的最主要原因。这一研究报告引起了生物研究人员及各大权威媒体的高度关
注，《科学
家》（The Scientist）杂志以及《自然》（Nature）杂志均在其官方网络上第一时间
对这一事件
进行了报道。
Mark Longo等在报告中呼吁科学家们需更加努力以确保测序获得的基因组不受到污染，
并应对来自
公共基因组数据库的基因组进行潜在污染检测。
“基因组污染是一个大问题，但却不是一个新问题，”加州大学进化生物学家、美国能
源部联合基因组
研究所系统发育基因组学计划负责人Jonathan Eisen说：“这篇论文或可帮助提醒人们
注意这一问
题。”
污染有可能在测序的任何一个阶段导入到基因组序列中... 阅读全帖 |
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S*********e
发帖数: 127 | 7 Methods Mol Biol. 2011;686:371-8.
Zebrafish model of the blood-brain barrier: morphological and permeability
studies.
Eliceiri BP, Gonzalez AM, Baird A. |
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M*****n
发帖数: 16729 | 8 有个朋友今天来找俺，说是要研究ULK1 in zebrafish.
看来是很hot呢。 |
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c*********r
发帖数: 1312 | 9 pat, pat~
我LP申请Physiology summer course也被拒了。。。听说Physiology的课程很好就是竞
争太激烈。老板不出名的话很难申请到，所以悲剧了。。。她其实也是做neuroscience
的，以后也许申请一下neuroscience方面的summer course或者Zebrafish的specific
topic。^_^ |
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m*p
发帖数: 226 | 10 They said they only remove cardiomyocytes, which means blood vessels (
endothelial cells and smooth muscle cells), valve (endothelial cells) and
structure (fibroblast) of the heart are fine. But I did not hear the talk
and not sure how they did it.
In Zebrafish, scientist use a genetic tool to kill 90% of the cardiomyocytes
, and the heart still can regenerate. |
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m*p
发帖数: 226 | 11 I read a little background, yes, they kill every cells in the heart, leaving ECM behind. They argue ECM in the
heart and artificial pressure mimicking the blood flow can drive the stem cell to differentiate to endothelial cell
and smooth muscle cells, but I did not read the paper and did not know how they demonstrate the "heart"
has all the cells. By the way, the heart has an artificial PACE MAKER to initiate the heart beating.
In the zebrafish, they use a cardiomyocyte specific promoter to driv... 阅读全帖 |
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g****e
发帖数: 137 | 12 he is a superbig bull in stem cell, you have to use zebrafish as a model
though |
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a****d
发帖数: 1919 | 13 He is super nice, and his lab is one of the best in HSC field, probably the
best zebrafish lab if you want to study stem cells. |
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w***y
发帖数: 493 | 14 基因大概有2.6KB, PCR克隆后链接到质粒里然后转到E.coli里面扩增，做小抽然后把质
粒送去测序发现基因的两端都连进去了但是中间部分丢失。测序过几次丢失的部分好像
没什么规律，有时2kb,有时800bp。 PCR的产物还没有测序，因为看size是正确的。请
问这种情况是怎么回事？是不是菌种的问题呢？这个基因是zebrafish的基因。谢谢 |
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a********k
发帖数: 2273 | 15 鸡胚啊，绝好的发育model之一了
神经管单侧电转，另外一侧天然control
Xenopus和zebrafish里面也有人做，当然老鼠里面也有人做，不过前两个胚胎太小，后
面一个取胚胎太难，根本不可能做筛选。鸡胚一天弄个几十上百电转都行，后面几个就
很麻烦了，不光要手巧还要运气好。
当然纯做鸡胚我还是觉得死路一条，一般老鼠实验室用来做前期筛选，生化实验室用来
做后期in vivo是再好不过了。仅仅知道神经发育这么干非常方便，不了解其他tissue
的。 |
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s********8
发帖数: 619 | 16 大家fix embryo的时候都fix 多久啊,protocol上说是4C O/N.但是我们实验室的人告诉
我说可以leave in fix over the weekend.大家都是怎么做的?我是用来做 insitu的,
不知道时间太长了会不会overfix啊?
bow了先~~ |
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a********k
发帖数: 2273 | 17 请教一下Chien, Ekker, Kawakami, Hopkins比Tool明显高一个档次的贡献。
Hopkins也算是纯做zebrafish唯一的院士了吧，其实整个领域就没作出啥东西。。。 |
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s*********y
发帖数: 1189 | 18 请问你试过的两种Ab 都具体是什么公司的，Cat# 是什么？我个人觉得单克隆的可能会
好一点。 |
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n***w
发帖数: 2405 | 19 你的目的条带应该是多少？
你试过anti-你的target protein吗？
HA的话，我用过millipore的，背景挺多的。。。。我觉得抗体可能会bind到一些非特
异性的major bands。。。 |
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x**w
发帖数: 112 | 21 实验室有人在用p2A
我老板说p2A比t2A稍好 但似乎都不怎么好
你是要做tracer还是别的 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 22 居然没有看到你的会贴。。不好意思哈 多谢信息 我现在再试p2A了。看起来应该是最
好的。我就是做transgene挂个tag而已 |
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e**e
发帖数: 614 | 24 这个东西效率到底有多高，问个几个做这个的实验室都是一脸苦相 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 25 看了。。
话说这本来是我做fish想要试的第一个project 还没开始试就听说有文章nature
biotech接收了 当时还想是不是那帮做fish ZFN的人干的 没想到看了文章 居然是我同
学。。。这世界真奇妙。。。 |
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c********r
发帖数: 189 | 26 至少应该比zinc finger nuclease要好吧 |
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M*****n
发帖数: 16729 | 27 你不是做behabvior的吗？
这么hot的东西不做了？
你那个zebrafish 也是做behavior/sleep的。
怎么做metabolism了？ |
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M*****n
发帖数: 16729 | 28 俺在zebrafish上面试了LPS，只有局部反应。
不知道鱼的TLR4是不是比较特别。
有没有大仙给科普一下TLR4,LPS.
谢谢
还有有什么药可以activate TLR4 pathway? |
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m*********r
发帖数: 136 | 29 Hi,there,
can anybody get access to this article
"Transposon-mediated BAC transgenesis in zebrafish"
Thanks. |
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a******p
发帖数: 414 | 30 没有邮箱，怎么给你？
"Transposon-mediated BAC transgenesis in zebrafish and mouse????" |
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A****9
发帖数: 262 | 33 How's 2A？ thank you so much! |
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A****9
发帖数: 262 | 34 还想请教一下，这种影响是对IRES前后两个基因影响相似呢，还是对后面的基因影响更
大呢？前面的基因能够正常表达吗？谢谢！ |
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m******5
发帖数: 1383 | 37 对后面的基因影响大。
IRES在一些 物种，组织或者cell line里recruit 40s的效率很差
具体原因我忘了， 但理论上说对前面的基因应该没有影响 |
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b******s
发帖数: 1089 | 38 接下去该是‘老板的女儿’，‘美人zebrafish’..... |
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c********n
发帖数: 67 | 39 Infectious disease modeling and innate immune function in zebrafish embryos.
PMID: 21951535
c*****[email protected]
Thanks very much for your kindly help! |
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l**********1
发帖数: 5204 | 40 老大或你老板 能开发个Array knock out tool that can parallel 敲除任意N (N>2) N个基因 at E coli
next Yeast, fly, zebrafish, especially on Rat Mice Human at universal biomedical reactions pathway middle
point. then 这里的千老就能成墙街矿工或湾区龟公的生路喽
而你和你老板可以炸药奖或被至少被那个奖提名
of course, might should be done at Biosafety level P4 areas. -- not joke, Sure!
//en.wikipedia.org/wiki/Biosafety_level#Biosafety_level.C2.A04
Cm |
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c********n
发帖数: 67 | 41 Zebrafish as an appealing model for optogenetic studies
Simmich J, Staykov E, Scott E.
Prog Brain Res. 2012;196:145-62.
h***[email protected]
Thanks very much. |
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b****n
发帖数: 110 | 42 Marie Curie POST-DOC fellowship application
University of Barcelona, Department of Genetics
Our new group on the field of Functional Evo-Devo and Genomics on Chordates
is looking for candidates to apply for the forthcoming FP7 POST-DOC
FELLOWSHIP from the Marie Curie program (Opening call March 13)
Candidates have to be enthusiastic, and need to have a competitive CV to
successfully apply for the fellowship. Experience in Molecular Genetics,
Transgenesis and Developmental Biology, and (or) Backg... 阅读全帖 |
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s********8
发帖数: 619 | 43 就是做co表达的那个东东,不知道好不好用?和IRES比怎样呢? |
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s********8
发帖数: 619 | 46 这是为什么?不好意思,从来没做过这个,请大牛指教~~ |
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s********8
发帖数: 619 | 47 谢谢!我好像以前在哪听说过这个也不太好,也许是我记错了.. |
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s********8
发帖数: 619 | 48 谢谢!我好像以前在哪听说过这个也不太好,也许是我记错了.. |
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g*********5
发帖数: 2533 | 49 IRES One mRNA, Two Ribosome entry, sure two seperate protein.
P2A, encode One protein first then self break into two protein. |
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x**2
发帖数: 255 | 50 我是菜鸟，乱说几句
IRES的确不能保证两个蛋白的比例是1:1
但是P2A能么？
每个蛋白折叠了以后降解的速度都会不同
即使P2A翻译出来是1:1
也不能保证在细胞内的浓度也是1:1吧？ |
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