l*******k 发帖数: 361 | 1 其他方向,还是需要很多专业背景,以及相应的逻辑推理的,不是高中生能做的来得 |
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t***o 发帖数: 24 | 3 只有庸才才争论技术手段的高低。
你要有本事解决一个问题就算是靠数棍棍我也服。
使剑不比使刀更跩。能砍人不被砍才是牛人。 |
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h*******n 发帖数: 2052 | 4 Cai is one of his first two postdocs. |
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S**I 发帖数: 15689 | 5 我以前上过一门晶体结构解析的课,一学期下来感觉还是云山雾罩,啥也不懂,这个对
数学和计算机的要求确实挺高的。 |
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a****o 发帖数: 1786 | 6 这正说明了要大力发展结构生物学,因为现在还落后于传统或高通量筛选 |
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w******y 发帖数: 8040 | 9 此言差矣
现在基于结构的药物筛选, 真正的瓶颈在于ccomputational chemistry
docking/ virtual screening都不灵,
你有再多精细的结构有头用?
这才是落后于筛选的原因 |
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w******y 发帖数: 8040 | 10 又出来混淆视听了
有了lead, 根据结构或者根本没有结构根据经验, 来更改修饰集团,
所谓的QSAR。
你需要的是举出denovo基于结构发现药物的例子, 而且是多个例子才有说服力 |
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t***o 发帖数: 24 | 11 GPCR结构出来有几个做GPCR的人不看的。当然你要说那几个结构也没有出新药所以没用
也可以。
个人觉得,判断一项工作不是看发什么杂志或什么高深的方法。找一片写的好的REVIEW
, 什么是对这个community有价值
的就很清楚了。 |
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S******G 发帖数: 965 | 12 Computational chemistry, at least at this point, is nothing more than an "
after-the-fact" decoration.
Fancy docking models is nice for the eyes when publishing a paper. But it
does not help much in the lead discovery/optimization stage. In real life,
no medicinal chemist will make decision about which compounds to make on
docking result.
Sturctural biology is more than computational chemistry and it has played
important role in drug discovery. For instance, if we know target A shares
similar bi |
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a********k 发帖数: 2273 | 13 大牛们全挂了。你看那个CNS灌水的大牛出过药?这么大个人了还争吵做basic science
要出药呢。 |
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b****n 发帖数: 311 | 15 你就别混淆视听了。人家要的是根据结构发现药物的例子,不是只根据结构发现药物的
例子。我找的例子有什么错?HIV的例子是公认的structure based drug design,谁也
没说structure based drug design就要排除其他一切方法。感情你们在BBS上一吧啦,
啥标准都得听你们的。 |
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w******y 发帖数: 8040 | 16 我就不明白了
这生物领域咋就这么多毫无逻辑的PI?
我指出小老虎他爸说基于结构的药物设计被screening beat的真正原因
是computational chemistry没跟上
有精细的结构也没法对接出药物
我只字没提结构生物学本身有没有用, 是现在有用还是将来有用
你裹脚布敲了一通, 除了证实我的观点, 同时自己设了个靶子
自己打得欢, 还剩下什么?
生物PI基本上是PI里逻辑能力最差的一个群体了
lol
having
not |
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S******G 发帖数: 965 | 18 I was confirming your point, as you pointed out.
it is just impossible to reply to all the bashing thread. Sorry if quoting
your post caused any confustion. |
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v**********m 发帖数: 5516 | 19 我觉得结构还是比较犀利的,但远远不够,其他的生化和细胞知识也非常重要。
劝退 |
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v**********m 发帖数: 5516 | 20 我觉的会解析结构需要知道所有相位解析的技术,其实也不难,有点数理基础都可以,
只是现在学生物的都被简单的细胞,动物生物实验搞坏了逻辑思维能力。 |
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v**********m 发帖数: 5516 | 21 别这么说,结构还是有用的,至少在筛选药物先导物时做到定向。 |
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v**********m 发帖数: 5516 | 22 现在有非常多的公司在设计小分子制药,结构是他们的一个研究部门。不过结构技术再
过十年就该是现在的DNA测序技术一样简单和普遍了,很多只会结构的人就喝西北风去
了。
藏] |
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v**********m 发帖数: 5516 | 23 他的目标是杨焕明,哈哈,给国外生物制药公司做外包的结构解析服务。 |
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v**********m 发帖数: 5516 | 24 同意。
virtual screening你我都翘翘了也等不到那一天,设计的上千上万原子的相互作用,
而且还是动态的三维,还得考虑和溶剂分子相互作用,wokao,人类真的是GOD了。
结构结果指导一下先导物的优化途径还可能。 |
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S******G 发帖数: 965 | 25 无论什么单一的知识拿来制药都是不会成功的,结构生物学也不例外。
结构生物学的研究结果对于药物研发的一些环节是有作用的。但是目前来看,它起的作
用没有达到大家的期望值。一个很大的原因是因为1。结构生物学提供的知识还不够好
(x单晶结构给出的只是蛋白质的静态结构。动态呢?)2。现在的计算手段还不能预
期如何才能有效利用这些结构知识。
其实,目前的药物研究还处于撞大运的阶段 (如果你不同意的话,请解释一下)。单
独把结构生物学拿出来批评,有失公平。
藏] |
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S******G 发帖数: 965 | 27 也许永远也没有那一天。
一个静电作用就可以让一个化合物增加10倍活性,一个氢键作用可以影响上千倍。在
一个有几千上万个原子的体系里面做计算,本身的取近似误差就比这个大。
还有另外一个贴子里面提到的,还要考虑到大分子(蛋白质)本身的折叠和相对移动,
溶剂,其他的竞争小分子(比如atp)。 |
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S******G 发帖数: 965 | 29 这个我不清楚。目前公司的做法是获取多个单晶结构,然后评估到底蛋白质有多大的
flexibility。
就拿酶来说,一般来说基本的hinge结构比较固定,但是其他residue比较flexible (
比如说activation loop)。也许结构生物学不能告诉我们如何才能抓住这些residue(
一般来说这个是最重要的问题。由于同一个family绝大多数的酶hinge部分比较相似,
所以只有抓住这些较为特异的residue才能改善活性和选择性),但是的确能指导大概
什么样的presentation of functionality可以有起码的ligand-target作用。从这个
意义上来说,有时侯知道靶向的结构是至关重要的。而不是象某些同学说的那样一无是
处。 |
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x*****g 发帖数: 42 | 30 嗯,有道理,一次和工业界一个家伙聊过,说很多药厂现在都
把做结构的部门外包了,光搞结构生物学在药厂很难找到位置。
而且光搞结构生物学现在也不好发文章,在学术界也不好找位置,所以该转行的还是赶
紧转行吧,不然就去学点细胞生物学做结构和功能关系。 |
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a********k 发帖数: 2273 | 31 呵呵,还没有听说过哪个纯生物专业好找工作的。现在热门的system biology,
chemical biology估计过几年也就那样了。 |
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h*******n 发帖数: 2052 | 33 Haha, we should have gone out and had a cup of coffee after that seminar. |
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v**********m 发帖数: 5516 | 36 那个更是joke. 一堆的constraint加已有的化学键知识,得到的结构解析度和可信度都
成问题。 |
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p**i 发帖数: 3525 | 37 nod, tell me your contact? |
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a***a 发帖数: 40617 | 44 他lab出来的postdoc目前美国找到教职的有几个?1个?tamu的?还有吗 |
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a***a 发帖数: 40617 | 45 就一条
你给解释一下那些4,5个并列一作的文章的必要性吧 |
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a***a 发帖数: 40617 | 46 说白了就是看谁拿到更好的算docking的软件
一个license 几万一年
有哪个结构生物学家自己在开发这个算法?关结构生物学家鸟事
真可笑
我同意你说的wsbioguy |
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a***a 发帖数: 40617 | 47 你确定你知道现在公司里结构方面招人的情况?别信口开河了 |
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a***a 发帖数: 40617 | 48 我觉得你们谈这么宏观上层的东西没意义
具体说应该谈现在为啥做结构的学生、postdoc最后都沦为蛋白民工,最后没几个能走
全套流程这个问题 |
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a***a 发帖数: 40617 | 49 en,所以现在都搞complex的crystal,cocrystal
然后把学生、postdoc7,8年的生命糟蹋掉 |
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p*****m 发帖数: 7030 | 50 能不能是给学生福利 本来是2作3作业能混个co-1st写在cv上好看?我不知道这个能说
明啥
就一条
你给解释一下那些4,5个并列一作的文章的必要性吧 |
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