w*********y
发帖数: 7895 | 1 ☆─────────────────────────────────────☆
bom112233 (知人者智，知己者明) 于 (Wed Aug 6 04:57:18 2008) 提到:
致chinastock网友的一封信
大家好，我是bom，大家对我可能并不陌生，因为最近的股托事件。我，是个眼里不能
揉一点沙子人，也自认是个正直善良的好人，我写这篇东东是想让大家了解我的出发点
，也是替所有善良的人做点事情。
我先简单说说我炒股的历程，我从2000年还在美国读大学的时候就开始炒美股了，那时
买入了ptr和一些naz股票，当然我一进场就赶上了naz泡沫破掉，那时我不会做空也不
懂hedge所以赔了不少，最后除了保留了ptr我曾一度清仓直到2003年。2003年，在我有
了一些积蓄并和家里要了点钱之后又全部放进了russell 2000这类的股票，结果到2004
年已经翻了翻。期间我又加仓了ptr，并在2006年初的时候全线买入了snp，我记得2006
年六七月份的时候，那时我在香港赶上索罗斯做空港股，当时割了一半的snp在46块左
右，我现在一直认 |
|
c***m
发帖数: 2630 | 2 来自主题: ChinaStock版 - 关注中石化 can I buy SNP instead? I don't have china account. Currently I long PGJ
which contains SNP and ptr. |
|
a****g
发帖数: 3027 | 3 这个 non-snps也还可以跳到google?
SNPS 和 google有啥相关性? |
|
M*****8
发帖数: 17722 | 4 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: MB80528 (肥猫(Contrarian)[食MM而肥]), 信区: Military
标 题: Re: 2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jul 9 22:18:23 2013, 美东)
2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
多数到顶。墙街已深入插管，吸血在即。
排列依次为，号码，股票符号，收市价。
#0001, A , 44.6000
#0002, AA , 7.9010
#0003, AAGIY , 17.1600
#0004, AAMRQ , 4.7300
#0005, AAN , 28.9700
#0006, AAON , 24.7400
#0007, AAP , 83.2000
#0008, AAUKY , 9.5300
#0009, ABAX , 50.2800
#0010, AB... 阅读全帖 |
|
n*****o
发帖数: 849 | 5 QCOM的package甚至还不如SNPS（当然，SNPS也可以算作软件公司啦）。QCOM店大欺客
，全加州的offer基本都一样，不太考虑当地的living cost，所以在SD能过得比较舒服
的，在SF就差点了 |
|
|
u****g
发帖数: 171 | 7 帮朋友发的，大家具体看连接，不要给我发站内信哦~我不清楚细节~
中科院北京基因组研究所曾长青课题组主要从事基因组测序、SNP多态性分型和生物信
息学相关研究，现因工作需要拟招聘如下岗位。
一、招聘岗位
（一）助理研究员/副研究员
招聘人数：1名，工作地点：北京
1、任职条件
1）获得生物信息学、群体遗传学、基因组学、计算机科学、遗传学等相关专业博士学
位;
2）精通统计学原理，方法和应用，熟练Matlab，R等相关软件的使用，对基因组测序、
RNA-seq、SNP分型等组学数据具有较好的分析能力。熟悉 UNIX系统,熟练掌握C、Perl
或其它生物信息学分析中常用的编程语言；
3）至少有一篇以上的第一作者SCI文章；
4）有大规模测序数据分析相关科研工作经历者优先；
5）能独立从事科研，并协助制定课题计划及撰写研究论文；
6）具有良好的英语阅读、写作和交流能力；
7）身体健康，工作认真负责，热爱科研, 具有扎实的专业基础、良好的团队精神、较
好的学习能力及沟通能力；
2、岗位职责
1）利用计算生物学方法和知识，对海量测序数据进行深入挖掘。包括全基因组测序、
RNA-seq、ChIP-s... 阅读全帖 |
|
m****s
发帖数: 18160 | 8 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: hujinnan (trymeagain), 信区: Postdoc
标 题: OSU 生物 postdoc 机会
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 29 14:52:52 2013, 美东)
关键词：真菌，全基因组测序比对，SNPs，克隆，实验室管理，4年合约
很好的老板。为了防止垃圾邮件，老板的邮箱没有贴在广告里，感兴趣的申请者去网上
一搜就出来了。
A Post-Doctoral Scientist position is currently available at Dr. Thomas
Mitchell’s lab in the Department of Plant Pathology at The Ohio State
University at Columbus, Ohio. This position is for an international grant
that aims to conduct genome comparison analysis and functional genom... 阅读全帖 |
|
X****i
发帖数: 1877 | 9 【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: XiuShi (致力为花街散财，造福散户), 信区: Stock
标 题: 【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jan 9 19:01:30 2019, 美东)
【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
熊市策略是逢高峰就卖空，谷底补空平仓，如此周而复始。要少做多。
熊市性质是多数日子前盘价位高，后盘价位低，如此制造下跌的趋势。
对比预测，如果股价越极端，散户获暴利的机会和风险其实反而越佳。
花街的捣蛋，挤空或砸价，其实是制造极端价供精明的散户收割暴利。
花街这么做绝非善意，而是要吓唬散户在其人为的极端价割肉出局。
花街有用之不尽的代理基金和资金充炮灰，可以任性的挤高峰砸谷底。
花街有别人的代理钱来任性，用大量炮灰钱可以买出涨价，砸出跌价。
股票最不定因素，就是花街每天对散户的捣蛋，尤其挤高峰和砸谷底。
以下是为蝌蚪们提供的最基本，炒股绝对须要遵守，的注意事项：
1. 预备大量(>=50%)现金，准备用来收割花街人为制造的捣蛋极端价... 阅读全帖 |
|
|
r*m
发帖数: 16380 | 11 真给面子啊，CHL逆势冲50了。
乘着现在蒙对了几把，再给几个pick
1. TLT 90以下是用来diversify，预防大盘暴跌的好选择
2. T/VZ T跌倒25， VZ跌倒30一带，是可以买来捂捂的，正如前几天46的CHL
3. SNP/SHI SNP回调到80以下， SHI到40以下，越便宜越好，买来捂捂，这个赌的是港
股内地股早晚价格要统一，当然他们本身也不错
4. ZNH 被美国飞机震晕了的，可以试试咱自己的嘛，其实更安稳，15以下根据大盘情
况可以考虑进货
注解：本人一向的原则就是捞底不追高，不管什么TA阻力止损，就挑不会破产的公司越
便宜越买，跌了就捂，跌多了再加仓，涨了分批锁利。这个方法的后果之一就是买入往
往在左边，一般买了就被套，要扛一阵子才能回来，没有这个心理准备的千万不要跟啊
！ |
|
l**********n
发帖数: 8443 | 12 caused by inactivation of the INI1 gene (SMARCB1)on chromosome 22q which
functions as a classic tumour suppressor gene.
Inactivation of INI1 can occur via deletion, mutation, or acquired UPD.
Uniparental disomy (UPD) occurs when a person receives two copies of a
chromosome, or part of a chromosome, from one parent and no copies from the
other parent.
In a recent study[4], SNP array karyotyping identified deletions or LOH of
22q in 49/51 rhabdoid tumours. Of these, 14 were copy neutral LOH (or
ac... 阅读全帖 |
|
c***m
发帖数: 2630 | 13 I agree. RE sector is dropping. I sold 82% of TAO last two months. what
about oil in china? Do you watch SNP or ptr? I am holding PGJ whose major
holding is SNP,PTR and BIDU. |
|
c*******9
发帖数: 6411 | 14 also curious about SHI and SNP, SHI is called SINOPEC Shanghai, so is SNP
owned SHI? |
|
M*****8
发帖数: 17722 | 15 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: MB80528 (肥猫(Contrarian)[食MM而肥]), 信区: Military
标 题: Re: 2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jul 9 22:18:23 2013, 美东)
2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
多数到顶。墙街已深入插管，吸血在即。
排列依次为，号码，股票符号，收市价。
#0001, A , 44.6000
#0002, AA , 7.9010
#0003, AAGIY , 17.1600
#0004, AAMRQ , 4.7300
#0005, AAN , 28.9700
#0006, AAON , 24.7400
#0007, AAP , 83.2000
#0008, AAUKY , 9.5300
#0009, ABAX , 50.2800
#0010, AB... 阅读全帖 |
|
E*********r
发帖数: 4984 | 16 问题是根本不需要用到下一代测序，用现有的桑格测序法就可以解决。拉个PCR，去测
一下序列。在诊断领域下一代测序只是做胎儿的Inborn Errors有一些，其它方面我还
真没听说过多少。我和Ion Torrent的Product Manager还有Illumina的都很熟，谈起临
床的问题，他们也承认目前应用不多。
Luminex现在有专门做SNP的试剂盒。不需要测序也可以很快找到SNP。 |
|
X****i
发帖数: 1877 | 17 $【2018年8月23日最新的600个股票的短期谷底和高峰价的预测】$
【顶到99楼，就发更多得多最新并且更好机会的预测。】
【本想提供一千五百个预测，最后决定只提供一大部分。】
【原因是，股版XMJDH的居多，忌才，典型劣币驱逐良币。】
对比预测，如果股价越极端，散户获暴利的机会和风险其实反而越佳。
花街的捣蛋，挤空或砸价，其实是制造极端价供精明的散户收割暴利。
花街这么做绝非善意，而是要吓唬散户在其人为的极端价割肉出局。
花街有用之不尽的代理基金和资金充炮灰，可以任性的挤高峰砸谷底。
花街有别人的代理钱来任性，用大量炮灰钱可以买出涨价，砸出跌价。
股票最不定因素，就是花街每天对散户的捣蛋，尤其挤高峰和砸谷底。
以下是为蝌蚪们提供的最基本，炒股绝对须要遵守，的注意事项：
1. 预备大量(>=50%)现金，准备用来收割花街人为制造的捣蛋极端价。
2. 只用50%的现金做买卖的预算，分散风险在10到20个不同的股票里。
3. 一旦价格接近预测的谷底或高峰，就开始用短期的趋势线跟踪。
4. 如果价格比预测极端，意味花街可能在捣蛋，即挤空或砸价。
5. 既然花街意在制造极端价，那就耐心的避其... 阅读全帖 |
|
X****i
发帖数: 1877 | 18 $【2018年8月23日最新的600个股票的短期谷底和高峰价的预测】$
【顶到99楼，就发更多得多最新并且更好机会的预测。】
【本想提供一千五百个预测，最后决定只提供一大部分。】
【原因是，股版XMJDH的居多，忌才，典型劣币驱逐良币。】
对比预测，如果股价越极端，散户获暴利的机会和风险其实反而越佳。
花街的捣蛋，挤空或砸价，其实是制造极端价供精明的散户收割暴利。
花街这么做绝非善意，而是要吓唬散户在其人为的极端价割肉出局。
花街有用之不尽的代理基金和资金充炮灰，可以任性的挤高峰砸谷底。
花街有别人的代理钱来任性，用大量炮灰钱可以买出涨价，砸出跌价。
股票最不定因素，就是花街每天对散户的捣蛋，尤其挤高峰和砸谷底。
以下是为蝌蚪们提供的最基本，炒股绝对须要遵守，的注意事项：
1. 预备大量(>=50%)现金，准备用来收割花街人为制造的捣蛋极端价。
2. 只用50%的现金做买卖的预算，分散风险在10到20个不同的股票里。
3. 一旦价格接近预测的谷底或高峰，就开始用短期的趋势线跟踪。
4. 如果价格比预测极端，意味花街可能在捣蛋，即挤空或砸价。
5. 既然花街意在制造极端价，那就耐心的避其... 阅读全帖 |
|
X****i
发帖数: 1877 | 19 【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
熊市策略是逢高峰就卖空，谷底补空平仓，如此周而复始。要少做多。
熊市性质是多数日子前盘价位高，后盘价位低，如此制造下跌的趋势。
对比预测，如果股价越极端，散户获暴利的机会和风险其实反而越佳。
花街的捣蛋，挤空或砸价，其实是制造极端价供精明的散户收割暴利。
花街这么做绝非善意，而是要吓唬散户在其人为的极端价割肉出局。
花街有用之不尽的代理基金和资金充炮灰，可以任性的挤高峰砸谷底。
花街有别人的代理钱来任性，用大量炮灰钱可以买出涨价，砸出跌价。
股票最不定因素，就是花街每天对散户的捣蛋，尤其挤高峰和砸谷底。
以下是为蝌蚪们提供的最基本，炒股绝对须要遵守，的注意事项：
1. 预备大量(>=50%)现金，准备用来收割花街人为制造的捣蛋极端价。
2. 只用50%的现金做买卖的预算，分散风险在10到20个不同的股票里。
3. 一旦价格接近预测的谷底或高峰，就开始用短期的趋势线跟踪。
4. 如果价格比预测极端，意味花街可能在捣蛋，即挤空或砸价。
5. 既然花街意在制造极端价，那就耐心的避其锐气，袭其惰归。
6. 所以只要短期趋势线没... 阅读全帖 |
|
X****i
发帖数: 1877 | 20 【猾恶街私人账户11月27日前就已出货卖空】
然后高高兴兴的过感恩节为之后暴跌庆祝。
正因此11月27日看跌的股票是平时的两倍。
【这里的信息仅供海内外华人间的共享，严禁翻译，严禁违规散布】
【但绝对欢迎和鼓励转发信息至海内外的中文华人论坛，多多益善】
【金融手段超级犀利高效之处，正是不动一兵一卒立即能达到目的】
【米国熊市跌1/2是少，跌2/3正常，逢高峰价卖空，可迅速致暴富】
【猾恶街绝密的私人家族账户卖空高峰做多谷底，其代理基金常相反】
【散户，企业，机构把钱上缴猾恶街供其"全权代理"，无异割肉喂虎】
【散户在自然谷底买进，猾恶街就来砸价，高峰卖空，猾恶街就来挤空】
【股价起跌90%是猾恶街特意与散户捣蛋的结果，事后用新闻做掩护】
【散户熟悉猾恶街的诡计和伎俩后，能每天轻松收割其捣蛋的极端价】
【这里的信息是对准猾恶街的照妖镜，帮助散户透视猾恶街的各种诡计】
【坚决，积极，精益求精的为海内外华人的金融安全和利益做贡献】
读者也可用以下的链接，搜索其它和最近的预测贴：
http://www.mitbbs.com/mitbbs_bbsbfind.php?board=Stock
【20... 阅读全帖 |
|
M*****8
发帖数: 17722 | 21 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: MB80528 (肥猫(Contrarian)[食MM而肥]), 信区: Military
标 题: Re: 2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jul 9 22:18:23 2013, 美东)
2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
多数到顶。墙街已深入插管，吸血在即。
排列依次为，号码，股票符号，收市价。
#0001, A , 44.6000
#0002, AA , 7.9010
#0003, AAGIY , 17.1600
#0004, AAMRQ , 4.7300
#0005, AAN , 28.9700
#0006, AAON , 24.7400
#0007, AAP , 83.2000
#0008, AAUKY , 9.5300
#0009, ABAX , 50.2800
#0010, AB... 阅读全帖 |
|
r*****l
发帖数: 457 | 22 这职位要求挺狠
职位描述
岗位职责：
1、 建设分子生物学公共服务基础实验室，建设SNP基因组分型Array Tape平台，为通
州国际种业科技园区内外众多种子企业、科研机构提供基础服务，并为最终建成中国领
先、世界一流的分子育种实验室及分子育种平台。
2、 在平台搭建成功后，使该平台具备年分析能力达到10000个样品以上，能够初步具
备进行SNP基因标记的开发，高通量基因组分型、构建遗传连锁图谱、基因定位、ELISA
分析等的主要功能。
3、 以国际化的视野，根据市场需要，为平台引进先进的设备和技术，且不断研究和改
进相应技术，不断提高为种业企业及科研院所服务的能力和水平。
任职要求：
1、 作物遗传育种专业，博士学位，华裔；
2、 从事过至少10年以上的育种研发工作，有美国一流种业公司研发工作经历，个人业
绩及声望在世界排名前十，每年至少能在国内工作10个月；
3、 具有国际化的视野，在育种研发方面有很深的造诣，对国内种业行业的现状有深刻
理解，在实验室管理方面有丰富的经验。
4、 很好的组织协调能力。
个人发展平台：除了平台运营所产生的社会效益及经济效益以外，园区将会为核心团队
... 阅读全帖 |
|
M*****8
发帖数: 17722 | 23 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: MB80528 (肥猫(Contrarian)[食MM而肥]), 信区: Military
标 题: Re: 2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jul 9 22:18:23 2013, 美东)
2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
多数到顶。墙街已深入插管，吸血在即。
排列依次为，号码，股票符号，收市价。
#0001, A , 44.6000
#0002, AA , 7.9010
#0003, AAGIY , 17.1600
#0004, AAMRQ , 4.7300
#0005, AAN , 28.9700
#0006, AAON , 24.7400
#0007, AAP , 83.2000
#0008, AAUKY , 9.5300
#0009, ABAX , 50.2800
#0010, AB... 阅读全帖 |
|
s****g
发帖数: 1028 | 24 Old rag mountain is the most popular and best trail avail in SNP.
As far as 住宿 is concerned, most trail does not offer good camping are in
SNP, you can try corbin cabine trail if you want to camp.
旅馆 or bed and break fast is plenty around, depending which trail you end
up going. If everything else is booked, you can always try Front Royal, they
have plenty of nice 旅馆 for you to stay one night. |
|
|
|
h*******0
发帖数: 3598 | 27 根据以前的经验，因为持续的雨水，会让石头非常滑，没有经验的朋友们非常容易崴脚
。所以决定取消这次活动。咱们下次再见。
欢迎大家周末去毛毛妹子和JIAWA老歌组织的吃饭和打牌活动。吃饭打牌都在室内，不
会受天气的影响。祝大家玩得开心！
下周末的泳池活动，在室内，断无取消之可能。欢迎大家和EVEN兄弟，YJJ师兄联系或
直接报名。
HELLO
////////////////////////////////
本次HIKING特点：两路大军分进合击，会师山顶，适合10-55岁所有的朋友们。体力好
的走石头，体力不够的美女们走缓坡
报名网页： http://goo.gl/U2MgN
Old Rag Trail介绍： http://www.hikingupward.com/snp/oldrag/ 8 Miles & Difficulty 4.0
拼车地点：VA VIENNA 地铁站，如果不需要，大家分头单车前往。也可以与司机商量其
他pick up地点。
集合地点：State Route 600/Nethers Rd, Sperryville, VA 22740
GPS 坐标：38.570 -... 阅读全帖 |
|
|
s******y
发帖数: 28562 | 29 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: ronbell (我是小诸), 信区: Biology
标 题: 世界排名前十
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Feb 19 21:37:39 2014, 美东)
职位描述
岗位职责：
1、 建设分子生物学公共服务基础实验室，建设SNP基因组分型Array Tape平台，为通
州国际种业科技园区内外众多种子企业、科研机构提供基础服务，并为最终建成中国领
先、世界一流的分子育种实验室及分子育种平台。
2、 在平台搭建成功后，使该平台具备年分析能力达到10000个样品以上，能够初步具
备进行SNP基因标记的开发，高通量基因组分型、构建遗传连锁图谱、基因定位、ELISA
分析等的主要功能。
3、 以国际化的视野，根据市场需要，为平台引进先进的设备和技术，且不断研究和改
进相应技术，不断提高为种业企业及科研院所服务的能力和水平。
任职要求：
1、 作物遗传育种专业，博士学位，华裔；
2、 从事过至少10年以上的育种研发工作，有美国一流种业公司研发工作经历，个人业
绩及声望在世界排名前十，每年至少能在国内工作10个月；
3、 具... 阅读全帖 |
|
n********n
发帖数: 8336 | 30 http://www.bydnacoding.org/WHY.html
客观地说，进化论诞生一百多年来，经历了无数的争辩，每次都以进化论的胜利告终。
因此，进化论在生物科学界，被认为是无可争辩的真理。
人们不禁要问，你们凭什么可以倾覆进化论？
我们的回答是：仅仅凭着两件简单的武器，这就是DNA编码和中学级别的数学。DNA编码
来自基因银行（美国NBIC GenBank）；数学是指数、对数运算和骰子理论。
就人类而言，DNA编码包含着人类全部的遗传信息。是DNA编码承载的“物质的遗传信息
”决定了人体和人体生理特征；“非物质的遗传信息”表达出人的聪明、智慧等特征。
DNA编码表达的事实，和进化论完全对立。而数学是DNA解码的有力武器，因为数学能最
深刻、最直接地表明哪些是不可能产生的假说，哪些是必然发生的事实。
“数学不是理论的构建者，也不是假说，但是，它却是理论和假说的法官、是理论和假
说必须服从的裁判者。没有数学的认可，既没有规律可以遵守，理论也得不到解释。”
( 美国数学家、天文学家，本杰明·皮尔斯Benjamin Peirce ,1809 – 1880）
“neither is ... 阅读全帖 |
|
q****a
发帖数: 21 | 31 上一节中我们提到了食品中的各种有毒物质，这是一个巨大的幻象，如果人们不能
纵览各种事件的全貌，就无法理解事件中的要点。幕后势力表面上看似在为人们研发解
药，另一边在喂人们吃更多的毒药。人们都知道毒药和垃圾是不能吃的，因为它们不但
味道不好而且还有害，但是幕后势力却在毒药中加入化学物质使其在味觉上口感贻人，
同时用好看的图片、劲爆的音乐和明星制造出来的流行跟风来播放广告去包装这些毒药
，在宣传之下，毒药从此变得如此诱人，成为一种为了满足虚荣心和口腹之欲需要的生
活必需品。
光照派使用现代科技对人脑和肌体进行“兽的封印”主要通过以下几种手段：（1）转
基因食品、（2）农药、（3）食品添加剂、（4）化学制剂、（5）重金属、（6）饥荒
、（7）研制新型致病病毒、（8）免费播种疫苗、（9）特定人群基因炸弹、（10）电
磁微波干扰。本节我们讨论后五个。
(6)【饥荒】：人们已经找不到西方世界5000前之前的历史了，而东方文明的各种古代
典籍和民间的口耳相传则完整记录远古时期的各种事件，压制真相的最好方式就是压制
了解真相的那些人，破坏他们名声，让了解真相的人遭到人民的唾弃，从而背离真相。
... 阅读全帖 |
|
a***y
发帖数: 19743 | 32 专业学生物的表示你这个理论完全没有证据支持同性恋是变异出来的。
生物里的变异体也不一定是『不正常』。
人群里SNP之多数不胜数，每个SNP都可以被称作变异体，照你这个逻辑这个世界上没人
是『野生型』全是不正常变异体。 |
|
n*******e
发帖数: 27 | 33 窃以为生物学发展至今,随着各个基因组测序的相继完工,生物技术的发展,尤其
是转基因动物(包含基因删除与基因重建, KO&KI)技术的成熟,以及在计算机的
辅助下蓬勃发展起来的生物信息学的相助,在近二十年内将出现一个极大的飞越.
在这个领域中,最引人注目的当是SNP(SingleNucleotidePolymorphism)的搜寻.
从任何一个角度看,它都是一本万利的.生物技术公司必定要投入大量的人力,财力
以寻找并设法垄断有意义,特别是与疾病相关的SNP.虽然是个漫长并且不是十分
高效的过程,但是却是无法抵抗的诱惑,就象潘多拉之盒,既然已经打开了,就再
难关上.从学术上出发,一个重大的突破可以解决困扰了人们几十年的难题,甚至
可以给仍然悬而未决的问题提供启示.中国人应当借助样本容量巨大,遗传疾病
纷杂的优势,开展此领域的研究,只是资金的馈乏是当务之急. |
|
y****i
发帖数: 2194 | 34 居然是01年的文章。。。
SNP也算红过一阵了
NGS的时代以后 SNP这个领域已经基本死了 |
|
n*******e
发帖数: 27 | 35 信手拈来,谈谈我的看法,兼且答复大奔.还是坚持我的看法,做基因组的将是风险
最大,但是潜力最大,回报最丰厚,而且持续开发力最强的.Celera的CEO Winter是
个极聪明而且极有野心的人,他坚持对SNP的版权可以说明一些问题.随着基因的
预测,克隆,功能研究的开展,SNP作为普通的Marker用于基因的定位也好,还是在
疾病的诊断,风险的评估,以及新药的开发中都是极有价值的.一个实验的副产品
sidenfil竟然可以成为炙手可热的Viagra,相信所有的制药公司的头子们都红着
眼睛在盯着各种与疾病有关的基因.估且不论其可信度,只要版权申请到手,做起
来后顾之忧就小得多.举个例子,我知道有个中国教授,此人极善投机,在Arabidopsis
基因组出来之前,用最普通的mutagenesis方法,雇佣廉价的中国技术员,筛选大批
突变株.一旦基因组测序完成,很多教授还在看自己研究的基因是什么的时候,他
已经在研究这些突变的意义了.我可以想见,近十年内他将有大量的NATURE,SCIENCE
文章发表,但是不会是CELL.人体46条染色体上的这些基因,哪个不是重要的呢.或
者更准确的说,从 |
|
d****e
发帖数: 10 | 36 ［文献俱乐部 2007－2－7］
SNP可能位于基因编码区内，也可能出现在非编码区。位于编码区内的SNP(称为cSNP)较
少。但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义，尤其是非同义cSNP(non-synonymous
cSNP),单个核苷酸的改变使得其指令翻译的蛋白质序列发生改变，从而可能直接影响蛋
白质的功能。
同义cSNP(synonymous cSNP),不影响蛋白质的氨基酸序列，所以一般认为突变碱基与未
突变碱基的含义相同。
今天，我向大家推荐一篇研究文章，讲述了一个很罕见的故事：同义cSNP改变了蛋白质
结构。
摘要请阅 http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/315/5811/525
明天文献俱乐部后再向大家汇报大牛们是如何评价的。欢迎问题和点评。 |
|
p*****n
发帖数: 981 | 37 ☆─────────────────────────────────────☆
danube (Astro Boy ~~ 木桶阿碧铁) 于 (Wed Feb 7 20:01:14 2007) 提到:
［文献俱乐部 2007－2－7］
SNP可能位于基因编码区内，也可能出现在非编码区。位于编码区内的SNP(称为cSNP)较
少。但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义，尤其是非同义cSNP(non-synonymous
cSNP),单个核苷酸的改变使得其指令翻译的蛋白质序列发生改变，从而可能直接影响蛋
白质的功能。
同义cSNP(synonymous cSNP),不影响蛋白质的氨基酸序列，所以一般认为突变碱基与未
突变碱基的含义相同。
今天，我向大家推荐一篇研究文章，讲述了一个很罕见的故事：同义cSNP改变了蛋白质
结构。
摘要请阅 http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/315/5811/525
明天文献俱乐部后再向大家汇报大牛们是如何评价的。欢迎问题和点评。
☆─────────────────────────────── |
|
k***x
发帖数: 34 | 38 看了Nature上那篇Inuk的原始人genome的paper，整个genome sequence出来之后，也只找到几个特征性的SNP，比如眼睛的颜色，earwax，门牙什么的。
是不是可以找很多种特征基因，只是这篇paper没专注这方面？还是特征性SNP就是不好找？
读了一下full genome sequencing的wiki，现在有这么多家公司都在开发，而且眼看成本就要到$1000以下了。 即使不提sequence出来的depth和false positive rate，就是质量极高的sequence，如果不知道怎么解释data，还是没有什么意义吧。有没有朋友了解的给介绍一下，谢谢了。 |
|
c******d
发帖数: 306 | 39 one more question. Can the sequencing results be used for QTL mapping? we
could know the SNPs then the genotype of certain area of chromosome. it
could be used for mapping. the only issue should be all the snps come from
coding region. |
|
c******d
发帖数: 306 | 40 did ur use mRNA seq for gene expression investigation? have u ever try to
use SNP also. seems it is biased, because all SNPs come from coding region.
make |
|
v*******a
发帖数: 759 | 41 毛先生的SNP chip？其实也不像很多人说得是骗人的，毕竟那些SNP的疾病相关性都有
人做过，再说也不是很贵吧？ 做一个万把块钱，不算啥 |
|
D*a
发帖数: 6830 | 42 你这种情况是+/0， +/-是非常错误的写法。
没必要测背景情况，你测一堆snp又能说明什么？你又不是要写哪个snp跟哪个
phenotype有关系。20只不少了，没有phenotype就是没有phenotype了，不会是背景的
问题。就算是背景的问题你也不能把一顿有tendency的数据都归结到背景上，基本上就
可以换project了。否则只要significant，就算reviewer非要说背景问题，你也可以回
答得了。
我知道很多做转基因的想要换背景，也是backcross两到三代就开始实验的，之后重复
重复看看吧，没有人等到20代才正式开始做实验的。 |
|
x******m
发帖数: 736 | 43 the problem is the computer programs cannot completely tell it's snp or seq
difference. Some seq is not alignable because there are so many snps,
compared with reference genome. |
|
|
o********r
发帖数: 775 | 45 LD is the basic for GWAS. Essentially the disease loci won't be typed
directly. However, usually there will be typed SNPs on an array that are
physically close to the disease loci and in strong LD. You can think those
typed SNPs in strong LD as surrogate markers for disease loci. |
|
f*******g
发帖数: 35 | 46 Those authors are affiliated with 218 organizations. You can guess how many
authors there are.
With Genome-wide association studies, they identified 313 SNPs associated
with HIV control. Further they ascribed these SNP associations to specific
aminio acids, mostly within HLA-B, which affect HLA-peptide conformation.
But these amino acids are just assoicated with the HIV control, which does
not necessarily mean one would be elite controller if they contain one or
all the above amino acids in the ... 阅读全帖 |
|
b****r
发帖数: 17995 | 47 那是当然，光出paper的领域强不起来的
根据现在的model对于SNP based Whole genome linkage study的power，我觉得等全基
因组测序的成本降到和SNP array差不多的时候，稍微常见一点的多基因疾病的致病相
关突变都可能被解析出来。按照现在的降价速度，应该不超过5年
可以想象一下，有多少人死于多基因病，有多少种较为常见的多基因病，而且不同的人
群多基因病的遗传因素又不一样，加上环境因素的参与。这些model全部要靠bioinfor
的手段才能解决 |
|
A*******e
发帖数: 284 | 48 对于一个job而言，或许bioinfo现在有一个好的market, 比做实验的有高的salary。
但对于一个行业而言，我并不认为这是一个还在扩展的行业，相反应该它的前途应该是
萎缩，因为我认为会有越来越多的人对bioinfo的认识会越来越真实，越来越实际,越来
越理性。现在好的job market和整个行业前途的收缩并不矛盾。 bioinfo就是提供一些
平台，工具，以供处理实验数据，并不能解决实际的biology问题，因而决定了其用处
的有限性。即使现在流行的全基因组snp测序，它实际是一个genetics问题。其基本原
理就是做genotype和phenotype的连锁分析。做genetics的都知道，这是一个最基本的
道理，只是现在可以大规模测序，可以发掘很多的genome marker，甚至可以直接在一
个species里面分析不同个体基因的natural variation，再去他们的phenotype
variation做连锁分析，这是一个遗传学问题。很早前作qtl的就这么做了，只是那时候
marker难找。所以归结起来这是一个用bioinfo来辅助分析genetics ... 阅读全帖 |
|
g*********d
发帖数: 233 | 49 use dense SNP chips
e.g. ILMN 1M SNP panel
and hope to find the loci first |
|
j****x
发帖数: 1704 | 50 看目的了，如果是细菌基因组resequencing，有参考序列，那么coverage有10x可能
就够了，如果是denovo seq，没有参考序列，那么考虑到拼接问题，一般30x以上，
当然还要看基因组复杂度有没有重复序列。如果你想in-deep找SNP，那么取决于你
需要的敏感度，要想找1%左右的SNP或者mutation，那么理论上也是至少100x，考虑
到防止测序错误造成的假阳性，一般1000x是比较理想的。
适？ |
|
