x********e
发帖数: 35261 | 1 有认识的人做，用CRIPSR改一个SNP，影响目的基因表达。不过人家的SNP在DNA
binding motif上。 |
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r**********e
发帖数: 587 | 3 1. 我刚才没仔细看你的帖子，你提到了TFBS的“预测”和“鉴定”
这两个完全不同。
我刚才以为你说的是“鉴定”-identify，比如用ChIP-seq；这个应该叫
identification，而不是prediction吧？我相信MACS这样的软件
open to all species吧？只要你提供Sea Urchin的genome就可以了吧？
但如果你说的是“预测”-prediction，坦白说我觉得很不靠谱；但是也有很多类似的
research，基本逻辑估计也是基于一堆ChIP-seq的“鉴定”出来的TFBS，算出motif (
比如-TAAA-), 这个是training data；然后拿到新的感兴趣的数据里去test？
2. 关于神经系统的genetic variation；其实我只是工作中遇到过，并没有系统去研究
，虽然也觉得有意思。
我做neurology的（但坦白说neurology的人其实不太懂neuroscience，两个不同行当）
，我过去的工作之一就是研究我们这种神经疾病一些GWAS noncoding SNP是否有功能。
这种研究很多时候非常frustra... 阅读全帖 |
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G***G
发帖数: 16778 | 4 我想问您一个生物问题。什么叫allele？
是不是这样理解allele？
chromosome有一对。如果对应位置上的gene不一样。
他们就是allele
所以我们有AA，Aa，aA， aa
我还有以下问题：
1）SNP是不是只有AT变换和GC变换？
一个allele，可能存在多个snp吗？
5
孔。 |
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r**********e
发帖数: 587 | 5 在用psicheck2这个dual luciferase研究我的5‘UTR的SNP对于基因表达的影响；
Renilla和Firefly都是在一个plasmid上的，但被两个不同的promoter驱动。5’UTR放
在Renilla前面，而Firefly作为internal control可以控制sample amount之类的因素
Plasmid1: PromoterA---5'UTR-SNP1---Renilla---PromoterB---Firefly
Plasmid2: PromoterA---5'UTR-SNP2---Renilla---PromoterB---Firefly
现在的问题是，我用“同样量”的Plasmid1和Plasmid2来转染，也是大致“同样数量”
的细胞，可总是发现Plasmid1的Firefly level总是Plasmid2的两倍多；换句话说，我
觉得我作为internal control的Firefly也受到SNP的影响。
另外，其实我的这个5'UTR是类似G-quadruplex的区域，大概2KB（占了整个plasmid的1
/4），我很肯定... 阅读全帖 |
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k******d
发帖数: 76 | 6 这个reference SNP
rs1800858 NM_020975.4:c.135G>A
在135的位置G变成了A。
在我的VCF文件中
REF=A
ALT=G
为什么我的VCF文件中的REF和上面的reference SNP不一致？ |
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s******s
发帖数: 13035 | 7 gwas现在的理论是无数作用微小的SNP，太多predictor会overfitting
你要有兴趣的话去看看Nancy Cox在Vanderbilt的工作，用prediXcan把
SNP translate到表达，然后用表达看比较容易点 |
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c*********r
发帖数: 1312 | 8 膜拜一下大牛~
前年有幸在Broad Aviv实验室做了一个月数据分析，感觉Broad真是做事情的好地方，
各种硬件、软件、合作、资源都是太好了！羡慕~
顺便请教一个问题，如果我的reads和reference的variation > 5%，建议用什么
aligner或参数？我做海胆，野生的，genetic variation很大。2006 genome测序的文
章里提到：
It was known that single-copy DNA in the sea urchin varied by as much as 4
to 5% [single nucleotide polymorphism (SNP) plus insertion/deletion (indel)]
, which is much greater than human (～0.5%) (3). Moreover, alignment of WGS
reads to the early v 0.1 WGS assembly revealed at least one SNP per 100
bases, as we... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 9 首先，训练样本几十个？？？？？那么这个问题就over了。
现在的GWAS，都是几千个的
第二，GWAS主要的对象是common variants；我个人的观点是，部分common variants有
明确的功能，比如对promoter的影响，但影响甚微，比如2-fold差别对于基因表达
第三，就算你 有几千个样本，每个样本几万个SNP， 最后依然不会对治病有啥帮助。
这种研究，就是现代版的算命
GWAS难以重复，大量artifact，计算得到重要SNP，功能研究也是头疼。
个人认为，遗传学的金标准，依然是family linkage study的那些有重大致病作用的
rare mutation。至于GWAS/common variants这一套，我们目前的人类文明水平难以企及 |
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z***i
发帖数: 166 | 10 有兴趣的可以尝试一下发我邮箱， [email protected], 可以留个微信或者支付宝账号，
前10都有50人民币红包，24号前有效。全文不少于每千字汉字100刀。
中译英：
利用EMMAX来鉴定关联信号。EMMAX在估计每个QTL效应时，不需要重复估计多基因方差
和误差方差，可有效降低计算时间38。从两年收集到的21个表型性状中我们都关联到了
显著位点（P＜10-6），但由于2015年部分性状的结果受背景噪音影响较大，我们最终
选择刚毛长、叶鞘色、谷色、米色、穗码数和穗型等6个性状来作为分析对象（Figure
S3）。2015年关联到前4个性状共486个显著SNPs，2016年关联到这6个性状共667个显著
SNPs，其中前4个性状的多数主要显著位点能被重复检测到（Table 1 and Table S3） |
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发帖数: 1 | 11 没你想的复杂 就是生物信息general 用词
就是跑软件得到snp信息的意思。
比如你跑一跑gatk pipeline，得到1000个snp variant，这就是一次call
所以make variant call better，就是优化pipeline，得到更符合标准的variant |
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w*****1
发帖数: 473 | 12 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: wz99331 (dotti), 信区: Statistics
标 题: ask for help for R programming
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 16 15:25:16 2014, 美东)
I need to transpose a file to example.txt
the final dataset should be sorted by chr first then by position. Could
anyone help me to write the R code? Thank you very much!
raw data:
snp Chr pos Sample.ID Allele1 Allele2
rs6269442 1 1.614 517 A B
rs13475701 1 1.744 517 ... 阅读全帖 |
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G**S
发帖数: 1108 | 13 用array
arrar snp(*) snp1--snp1000;
do i=1 to dim(snp);
......;
......;
end; |
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a***r
发帖数: 420 | 14 需要生产一个格式为
FAMID IID F M Sex SNP1 SNP2 SNP3...的text file，
用作一个软件（MACH，版上搞生统的牛人应该知道）的input file
SNP的个数为2.5 million，IID有100个
原来的数据是以每个IID的每个SNP为一个observation存储在很长的dataset里的（250
million observation）
为了生成上述的文件，最直接的方法可能是对原dataset做proc transpose及其它相应操
作，生成一个上述格式的dataset然后export；
可是我仅仅是对原dataset的两个变量进行了一点改变，就从早上到现在还没跑完（服务
器上），服务器是32位的linux
我不知道要做完我计划的proc sql和proc transpose，会花多长时间
我完全没有处理这么大数据库的经验，实在有点了无头绪
要生成这样的text file，用SAS是合适的选择么？如果用SAS,有没有更好的方法呢？或
者，应该选择其他的软件和方法？
诚心求教，望大家指点！
先谢过~bow |
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x******0
发帖数: 1490 | 15 面试了一个software职位，本以为很有戏，但考我的题基本上全是job description上
没有的R 编程，希望这里的大侠帮助解惑答疑，在下感恩不尽。
1）
An analytical technique used in a molecular biology lab involves dispensing
solutions of DNA in very
low concentration into 384-well plates. Consider the perfectly random
distribution of N=30 molecules
onto this device
a) What is the probability that two molecules fall in the same well? Derive
the closed-form
equation for this probability.
b) Plot the above expression for the probability as a function of the numbe... 阅读全帖 |
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w*****1
发帖数: 473 | 16 请问用PROC GLM 做拟合，对很多个SNP，
每个SNP有一个P值，请问如何把所有的P-值从结果中取出来写到一个文件里面去？谢谢
！ |
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e*****i
发帖数: 149 | 17 不是全基因组
不是外显子
是基因片段测序，是针对SNP位点做的测序，100bp一段一个SNP |
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w*****1
发帖数: 473 | 18 I need to transpose a file to example.txt
the final dataset should be sorted by chr first then by position. Could
anyone help me to write the R code? Thank you very much!
raw data:
snp Chr pos Sample.ID Allele1 Allele2
rs6269442 1 1.614 517 A B
rs13475701 1 1.744 517 A B
rs13475706 1 1.889 517 A B
rs3684358 1 2.06 517 A B
r... 阅读全帖 |
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h*****o
发帖数: 1476 | 19 【 以下文字转载自 DC 俱乐部 】
发信人: Ghost6 (鬼子六), 信区: DC
标 题: 长周末有人想去神难倒（shenandoah） hiking 吗？Old Rag or W
发信站: BBS 未名空间站 (Fri May 27 09:23:43 2011, 美东)
吱一声？
Old Rag :
http://www.hikingupward.com/SNP/OldRag/
--- Circled trail. Great views along the uptrend of trail; the second part is well-maintained country road in the woods.
White Oaks:
http://www.hikingupward.com/SNP/WhiteOakCedarRun/
--- The whole trail is in the woods (no sunny views), many water falls. Circled trail, but could turn back at 1/3 poin... 阅读全帖 |
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w*****1
发帖数: 473 | 20 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: wz99331 (dotti), 信区: Statistics
标 题: ask for help for R programming
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 16 15:25:16 2014, 美东)
I need to transpose a file to example.txt
the final dataset should be sorted by chr first then by position. Could
anyone help me to write the R code? Thank you very much!
raw data:
snp Chr pos Sample.ID Allele1 Allele2
rs6269442 1 1.614 517 A B
rs13475701 1 1.744 517 ... 阅读全帖 |
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w*****1
发帖数: 473 | 21 this is only to order the data, did not transpose the snp id so that each
column is for one sample id, currently each sample has many snps. |
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q****i
发帖数: 1395 | 23 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: twinlight198 (雙灯), 信区: Military
标 题: 黑人的问题不仅仅是智商低
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 19 20:33:37 2013, 美东)
问题多了去了，是全面的问题，不是局部的问题。
过去20年的研究主要集中于三个主要种族之间的差异，这三个种族是东方人（东亚
人），白人（欧洲人）以及黑人（非洲人）。在这篇论文中我集中讨论这三个种族。
在通过对於脑体积，智力，性格，性行为，繁殖，成长率，生命周期，犯罪以及家
庭稳定等研究，东方人作为一个整体在这个谱线的一端，黑人在另一端，白人在中间。
整体上，东方人显示了较慢的成熟期，较低的繁殖率，较低性活动率，较大的脑体积以
及较高的智商。黑人则完全相反。白人在中间（但更靠近东方人）。
正文：
黑人，白人，东方人的平均差异：
脑体积
头颅容积： 黑人（1267）、白人（1347）、 东方人（1364）
cortical神经元（单位百万）：黑人（13185），白人（13665）、东方人（13767
）
智力
智商：黑人（85）、白人... 阅读全帖 |
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i*q
发帖数: 2288 | 25 活动：Old Rag Mountain hiking
==============================
时间：2010.03.20 10:30~16:00 (如果下雨，则推迟；日期再定)
地点：Old Rag Mountain hike, Shenandoah National Park
天气：19C, Sunny
这个trail比较大，推荐给有经常运动，身体状况处于良好的马甲们。
午餐在山上吃，可以自带一些简易的午餐：三明治、蔬果、点心之类。
Hiking Trail简介
==============================
Shenandoah国家公园中的Old Rag Mountain hike是mid-Atlantic地区中
最受欢迎的一个。http://www.hikingupward.com/评价它是最难登的但也是
最美的一个登山去处。Old Rag风景秀丽，景色怡人，在初春的明媚阳光里，更让
人心旷神怡。登山路线是个环线，按图上的路线走顺时针，总共大概5个小时。更加
详细的信息可以在下面连接中找到：
http://www.localhikes.com... 阅读全帖 |
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s***n
发帖数: 392 | 26 Sorry no Chinese input at work.
I did a quick search on hikeupward.com and these three trails look appealing
to me (hello and others: you can pick one) :
Duncan Knob
8.7mi 2200ft elevation gain/loss
Offers a little bit rock scramble, a sweeping view and two steep ascends.
http://www.hikingupward.com/GWNF/DuncanKnob/
Stony Mountain
10.1mi 1840ft
Close to Old Rag and White Oak. Longer but much less steep. Offers both view
and streams (with a swimming hole)
http://www.hikingupward.com/SNP/StonyMoun... 阅读全帖 |
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b***1
发帖数: 668 | 33 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bixu1 (2-39), 信区: Military
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:20:09 2011, 美东)
◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者：知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene，为了取得投资，他通过北大女教师魏丽萍，找
到她老公、巨有钱的张帆（红杉资本中国基金创始人）。
王晓东做所长的研究所是国家研究所（National Institute），王晓东聘魏
丽萍担任北京生命科学研究所资深研究员，给予高薪和上千万研究经费。
王晓东没有经过北京生命科学研究所公开演讲和选拔的正常途径，私自聘请
魏丽萍。
魏丽萍根本达不到北京生命科学研究员的资格，更不要说资深研究员。研究
员要通过两次国际评审，经过高级研究员、资深研究员。
北京生命科学研究所... 阅读全帖 |
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s**********t
发帖数: 1846 | 34 雄文必读 (转载)
http://club.6park.com/military/messages/77126.html
一位海外兔的吐槽(对JY的神回复)(转载)
送交者: 等于三 [♂知县★♂] 于 February 24, 2013 07:36:34 已读 1115 次 @等于
三@的微博
1、我只是个普通人，只是喜欢读书、写东西而已。我所知道的大多只是些很肤浅的
皮毛而已，没有什么大不了的。只不过我比较擅长把适当的知识以适当的形式组织起来
用到适当的地方而已。一天读两三万字，写三千字，坚持几年大部分人都能达到。没有
什么大不了的。
2、我家的祖训不许子孙赌博。我一生只赌过一次钱，不过那是帮朋友的 弟弟戒掉
赌隐，我卷走了他所有财产交给了他的母亲（因为我们家的 孩子不能由赌博而获利）
。我虽然做过炒股、FX的系统，但我自己不到万不得已，从来不炒。我最后一次炒FX是
为了向一个对我很重 要的人证明我的理论的正确性和有效性。我用她的帐号炒，盈利
都归 她了，我自己并没有得到什么金钱上的好处。如果我好赌，我或许会比现在有钱
，但我绝对不会比现在充实，而且 会影响我的后代。我很幸运，我很... 阅读全帖 |
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o***s
发帖数: 42149 | 35 2009年12月27日，河南安阳宣布发现了曹操墓，但因墓穴面目全非、骸骨残破不全，真假之辨愈演愈烈。正当曹操墓陷入真假迷局之时，2010 年1 月 26 日，复旦大学历史学系和现代人类学教育部重点实验室联合宣布，“向全国征集曹姓男性参与Y染色体检测”，用DNA技术解答“曹操墓”真伪之争。消息一出，各方质疑声不断，复旦大学该项目的课题组一下子被推到了舆论的风口浪尖。
课题组的两名专家——复旦大学历史系教授、中国魏晋南北朝史学会副会长韩昇和复旦生命科学学院副教授、复旦大学现代人类学教育部重点实验室项目负责人李辉透露，DNA样本采集7月15日便将截止。之后，将进行集中检测。他透露，结果预计将在两个月内公布。
争议一：DNA能查出曹操？
回应：家族都有独特基因密码
《广州日报》报道，“姓曹的，复旦大学喊你回去验DNA！”——有网友如此戏谑道。对于课题组的做法，人们最直接的质疑便是，DNA检测是否靠谱？
对此，李辉解释了其中的科学原理。简单来说，就是男性有着与父系祖先相同的基因密码，每个家族都可以找到一个独特的SNP(单核苷酸多态)。在人类繁殖过程中，Y染色体永远是父子相传的，子代能完整地继承父 |
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c***s
发帖数: 70028 | 36 曹祖义展示曹氏族谱
辽宁省东港市的曹祖义异常高兴，“复旦大学DNA检测结果出来了!我是曹操唯一辈分清楚的正宗后裔! ”
11月3日，复旦大学现代人类学教育部重点实验室指，通过对全国有代表性的曹姓族群进行的取样检测分析，确定了曹操的Y染色体类型是O2*。而曹祖义的Y染色体检测类型也是O2*。
辽宁曹姓男子滴血验亲
2009年12月27日，河南省安阳县安丰乡西高穴村西高穴墓，经考古学者挖掘认定为曹操高陵墓。一时间，有关陵墓的真伪，有关学者、专家各持己见，众说纷纭。
2010年1月22日，复旦大学现代人类学教育部重点实验室发出征集令，面向全国征集现代曹姓男子DNA以验证墓中男性遗骨身份到底是不是曹操，从而验证出该墓真伪。
曹操墓的问题，同样也吸引了远在辽宁省东港市的曹祖义关注。今年60岁的曹祖义，出生于东港市大孤山镇，是中国红学研究学会成员。经多年对红学和对曹氏族谱的研究，曹祖义认为自己是曹髦的后代，而曹髦又是曹操的曾孙。按照族谱推算，自己则是曹操第七十代孙。
看到复旦大学征集令后，3月2日上午。曹祖义乘坐飞机飞抵上海进行滴血验亲。曹祖义回忆，“当时，是严实博士接待了我们，还认真地询问我们曹... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 37 曹祖义展示曹氏族谱
辽宁省东港市的曹祖义异常高兴，“复旦大学DNA检测结果出来了!我是曹操唯一辈分清楚的正宗后裔!”
11月3日，复旦大学现代人类学教育部重点实验室指，通过对全国有代表性的曹姓族群进行的取样检测分析，确定了曹操的Y染色体类型是O2*。而曹祖义的Y染色体检测类型也是O2*。
辽宁曹姓男子滴血验亲
2009年12月27日，河南省安阳县安丰乡西高穴村西高穴墓，经考古学者挖掘认定为曹操高陵墓。一时间，有关陵墓的真伪，有关学者、专家各持己见，众说纷纭。
2010年1月22日，复旦大学现代人类学教育部重点实验室发出征集令，面向全国征集现代曹姓男子DNA以验证墓中男性遗骨身份到底是不是曹操，从而验证出该墓真伪。
曹操墓的问题，同样也吸引了远在辽宁省东港市的曹祖义关注。今年60岁的曹祖义，出生于东港市大孤山镇，是中国红学研究学会成员。经多年对红学和对曹氏族谱的研究，曹祖义认为自己是曹髦的后代，而曹髦又是曹操的曾孙。按照族谱推算，自己则是曹操第七十代孙。
看到复旦大学征集令后，3月2日上午。曹祖义乘坐飞机飞抵上海进行滴血验亲。曹祖义回忆，“当时，是严实博士接待了我们，还认真地询问我们曹家... 阅读全帖 |
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o***s
发帖数: 42149 | 38 由于家族基因间没有关系，“曹操是汉代丞相曹参后人”这一说法有误；而现有的夏侯氏基因与曹操家族基因也不一致，因此曹操从夏侯氏抱养的说法也不准确。
论文在国际学术杂志发表
11日，复旦大学历史学和人类学联合课题组发布了关于曹操家族DNA研究的最新成果。专家表示，通过现代基因反推和古DNA检测的双重验证，认为曹操家族DNA的Y染色体SNP突变类型为O2＊-M268。
该课题组由复旦大学历史系教授、中国魏晋南北朝史学会副会长韩昇和复旦大学现代人类学教育部重点实验室李辉教授领衔。相关论文发表在国际学术杂志《人类遗传学报》上。
可借DNA验证曹操墓真伪
有基因学家表示，此前引发强烈争议的河南安阳曹操墓真伪，可以借助曹操后人的现代DNA来进行验证。
2009年12月27日，河南省文物局公布，河南省安阳市安丰乡西高穴村南，最终得到确认就是曹操墓。
之后，国家文物局认定河南安阳东汉大墓墓主为曹操，但民间质疑墓穴造假之声一直未绝。
中科院北京基因组研究所副所长于军表示，古人化石如牙齿等虽然可能出现DNA破损等情况，但还是可以通过其中一段DNA进行测序，如果要验证河南安阳发现的到底是不是曹操本人，理论上是可... 阅读全帖 |
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d*********t
发帖数: 4393 | 39 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: davidwright (davidwright), 信区: Military
标 题: Science: 中国人祖先源自东南亚
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 11 04:46:31 2009, 美东)
http://www.zaobao.com/sp/sp091211_003.shtml
新加坡与亚洲科学家联合研究发现
中国人祖先源自东南亚
● 王珏琪
来自亚洲国家的90多名科学家合作拟出亚洲人的基因图谱发现，现代亚洲人的祖先是从印度大陆迁徙而来，而东南亚则是东亚和北亚人口的主要发源地。
参与研究的科学家来自“人类基因组组织泛亚单核苷酸多态性小组”（Human Genome Organisation Pan-Asian SNP Consortium），五年前根据1928名来自73个东南亚和东亚人的基因，进行基因定型分析。
研究刊登在《科学》杂志
新科研属下的新加坡基因组研究院院长刘德斌教授、研究员塞厄斯塔博士（Mark Seielstad）以及中国复旦大学的研究员，最后根据资料进行分析和撰稿。这项研究报告 |
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s******g
发帖数: 1014 | 40 大东亚共荣。
先是从印度大陆迁徙而来，而东南亚则是东亚和北亚人口的主要发源地。
Genome Organisation Pan-Asian SNP Consortium），五年前根据1928名来自73个东南
亚和东亚人的基因，进行基因定型分析。 |
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b*******k
发帖数: 1761 | 41 发现现在科学真是什么忽悠都有，一个CONCLUSIVE的结果，不像60年代那会儿，一步一
个脚印
先是从印度大陆迁徙而来，而东南亚则是东亚和北亚人口的主要发源地。
Genome Organisation Pan-Asian SNP Consortium），五年前根据1928名来自73个东南
亚和东亚人的基因，进行基因定型分析。 |
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i***z
发帖数: 7508 | 42 我考，都是东南亚的猴子么？
难道不是雅立安人迁移过来的？
先是从印度大陆迁徙而来，而东南亚则是东亚和北亚人口的主要发源地。
Genome Organisation Pan-Asian SNP Consortium），五年前根据1928名来自73个东南
亚和东亚人的基因，进行基因定型分析。 |
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d*****u
发帖数: 17243 | 43 亚洲人群的起源在哪里？他们的迁徙路线是怎样的？今天出版的国际顶级科学杂志《科
学》发表的“亚洲人群遗传多样性研究”最新成果，对这些问题做了解答。全基因组基
因分型研究表明，距今3万至4万年前，亚洲人沿着从南往北的路线迁徙，才形成了如今
的东亚人群。这也意味着，我国北方人的“老家”在南方。这一结论，颠覆了学术界认
为史前亚洲人由北往南迁徙的主流观点。
收集了70多个民族的样本
据项目组负责人之一、中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所所长、复旦大学副
校长金力教授介绍，亚洲人群的迁徙、融合历时悠久且复杂。为了弄清“我们从哪里来
”，从2005年起，“泛亚SNP计划”正式启动。该项目由中国、印度、日本、韩国等11
个国家和地区的科研人员共同参与，旨在利用基因技术，从遗传学角度揭示亚洲人、特
别是东亚人祖先的迁徙路线。
在4年时间里，项目组收集了东亚、南亚、东南亚各区域的70多个代表人群的DNA样
本，每个人群都代表一个民族。比如，科研人员抽取了北京人、上海人的血样，用来做
汉族的样本。金力告诉记者，该项目样本收集之广泛，是其他项目无法比拟的。特别在
东南亚，他们收集了40多个代表 |
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wm
发帖数: 28 | 44 如果能测得Y DNA全序列，则可以排除是否是曹操兄弟的遗骨。
至于是不是曹操儿子，理论上应该也能鉴别，（SNP的变异速度是非常恒定的）。但这
个可以结合考古学的专业知识，根据墓葬的规格和形制下手，应该不难判断。 |
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m********y
发帖数: 21909 | 46 这个我头次听说，孤陋寡闻。
你能给说说如果从人类学的角度，洛阳的那些自认为是犹太人的回回们，算不算是犹太
人？从分子人类学的角度，他们的DNA怎么样？有犹太人的DNA吗？
雇佣军的后裔。为了检验这一传说，在短串联重复序列(STR)以及单核苷酸多态性(SNP)
的层面上，我们检验了代表着四组中国人群的227名男性的Y染色体。
度结构分析(MDS)表明，骊靬村民同中国的其他人群，特别是汉族，存在着密切的亲缘
关系；同时却同中亚人群以及欧亚大陆西部人群关系十分疏远。
信佛教，不信伊斯兰教，固有语言属于突厥语族，通用汉语，某些习俗接近甘青藏族，
很可能源自回鹘的一支同甘肃本地汉人吐蕃人的混合体）被看作是存在着共同起源的亲
属人群，但Median-joining network（这个词不知道怎么翻译）分析表明二者之间仍然
存在根本的差异。 |
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v**e
发帖数: 8422 | 47 多谢澄清，这事又炒起来，大概是丝绸之路又要热了。还以为有啥新的证据呢。
雇佣军的后裔。为了检验这一传说，在短串联重复序列(STR)以及单核苷酸多态性(SNP)
的层面上，我们检验了代表着四组中国人群的227名男性的Y染色体。
度结构分析(MDS)表明，骊靬村民同中国的其他人群，特别是汉族，存在着密切的亲缘
关系；同时却同中亚人群以及欧亚大陆西部人群关系十分疏远。
信佛教，不信伊斯兰教，固有语言属于突厥语族，通用汉语，某些习俗接近甘青藏族，
很可能源自回鹘的一支同甘肃本地汉人吐蕃人的混合体）被看作是存在着共同起源的亲
属人群，但Median-joining network（这个词不知道怎么翻译）分析表明二者之间仍然
存在根本的差异。 |
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R*****d
发帖数: 1148 | 49 是的。目前对于长城以南，新石器-青铜时代的中国古人的基因检测，已经有所结果，
虽然并不十分全面。这是2007年发表在Human Genetics上的复旦的论文（就是国内“分
子人类学”爱好者们熟知的金力李辉等人），Y chromosomes of prehistoric people
along the Yangtze River：
http://www.springerlink.com/content/f1234473n7261m8w/
全文可在此处下载，不过这个网站貌似是非官方的，呵呵：
http://comonca.org.cn/lh/Doc/A37.pdf
研究者们检测了中国境内，特别是长江中下游地区，在现有的古人类文化遗址上挖掘到
的，56件分属不同个体的古人类遗骨的Y染色体谱系。附图可以说是对此论文成果的简
洁概括。从图中我们可以看出，位于山西境内的，属于龙山文化范畴，距今约为四千年
的陶寺遗址，其被分析样品全部属于东亚本土的O系，而且均为当今中国密度最高的O3
。对于长江流域的古人类（其实不能叫“古人类”了，应该叫“古人”，他们很可能就
是我们的祖先，你看吴城文化已经位于... 阅读全帖 |
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