O**********a
发帖数: 317 | 1 Cancer里面突变的epigenetics因子，跟catalytic activity有关的不多。多是蛋白本
身的。所以histone修饰更多的是fine tuning
epigenetics里面，BRD4 DOT1L的inhibitor可以治疗。 |
|
O**********a
发帖数: 317 | 2 Cancer里面突变的epigenetics因子，跟catalytic activity有关的不多。多是蛋白本
身的。所以histone修饰更多的是fine tuning
epigenetics里面，BRD4 DOT1L的inhibitor可以治疗。 |
|
发帖数: 1 | 3 TF binding属于epigenetics的一部分。既然是epigenetics，和timing，context很有
关系。你换个cell line，或者不同组织，在不同发育阶段，环境下，都会变化。
而这些所谓的database，包括ENCODE，就算都是真的，最多也就代表人家那个timing&
context的情况，换做你自己做的完全不同。所以哪怕是ENCODE project，我相信它的
accuracy，但是作为database对我们研究的帮助，其实不大。
总之，我个人完全不太相信这些online database；还是要相信自己的data。当然了，
正好碰到overlap的可以提出来，编编故事。仅此而已。 |
|
c******e
发帖数: 101 | 4 【 以下文字转载自 Physics 讨论区 】
发信人: comingme (sea), 信区: Physics
标 题: 急求博后兼两篇文章第一作者
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 7 19:18:04 2014, 美东)
本人物理系博士现在是生物信息教授
独立不久，正在建立实验室，有两篇小文章，一篇几乎写好，一篇只有数据和图。但是
现在作者只有我一人。就这样发，有点浪费了。先来先得。
招聘广告如下
Postdoctoral position in Bioinformatics or Biostatistics: Houston, TX,
United States
The Institute off Biosciences and Technology (IBT) at Texas A&M Health
Science Center, http://ibt.tamhsc.edu/, is an internationally recognized leader in biomedical and health science research located a... 阅读全帖 |
|
c******e
发帖数: 101 | 5 【 以下文字转载自 Physics 讨论区 】
发信人: comingme (sea), 信区: Physics
标 题: 急求博后兼两篇文章第一作者
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 7 19:18:04 2014, 美东)
本人物理系博士现在是生物信息教授
独立不久，正在建立实验室，有两篇小文章，一篇几乎写好，一篇只有数据和图。但是
现在作者只有我一人。就这样发，有点浪费了。先来先得。
招聘广告如下
Postdoctoral position in Bioinformatics or Biostatistics: Houston, TX,
United States
The Institute off Biosciences and Technology (IBT) at Texas A&M Health
Science Center, http://ibt.tamhsc.edu/, is an internationally recognized leader in biomedical and health science research located a... 阅读全帖 |
|
c******e
发帖数: 101 | 6 【 以下文字转载自 Physics 讨论区 】
发信人: comingme (sea), 信区: Physics
标 题: 急求博后兼两篇文章第一作者
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 7 19:18:04 2014, 美东)
本人物理系博士现在是生物信息教授
独立不久，正在建立实验室，有两篇小文章，一篇几乎写好，一篇只有数据和图。但是
现在作者只有我一人。就这样发，有点浪费了。先来先得。
招聘广告如下
Postdoctoral position in Bioinformatics or Biostatistics: Houston, TX,
United States
The Institute off Biosciences and Technology (IBT) at Texas A&M Health
Science Center, http://ibt.tamhsc.edu/, is an internationally recognized leader in biomedical and health science research located a... 阅读全帖 |
|
c******e
发帖数: 101 | 7 【 以下文字转载自 Physics 讨论区 】
发信人: comingme (sea), 信区: Physics
标 题: 急求博后兼两篇文章第一作者
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 7 19:18:04 2014, 美东)
本人物理系博士现在是生物信息教授
独立不久，正在建立实验室，有两篇小文章，一篇几乎写好，一篇只有数据和图。但是
现在作者只有我一人。就这样发，有点浪费了。先来先得。
招聘广告如下
Postdoctoral position in Bioinformatics or Biostatistics: Houston, TX,
United States
The Institute off Biosciences and Technology (IBT) at Texas A&M Health
Science Center, http://ibt.tamhsc.edu/, is an internationally recognized leader in biomedical and health science research located a... 阅读全帖 |
|
c******e
发帖数: 101 | 8 本人物理系博士现在是生物信息教授
独立不久，正在建立实验室，有两篇小文章，一篇几乎写好，一篇只有数据和图。但是
现在作者只有我一人。就这样发，有点浪费了。先来先得。
招聘广告如下
Postdoctoral position in Bioinformatics or Biostatistics: Houston, TX,
United States
The Institute off Biosciences and Technology (IBT) at Texas A&M Health
Science Center, http://ibt.tamhsc.edu/, is an internationally recognized leader in biomedical and health science research located at the Texas Medical Center (TMC) in Houston, TX, with existing strengths in Epigenetics, Cancer/Stem Cell Biology, Infectio... 阅读全帖 |
|
c******e
发帖数: 101 | 9 本人物理系博士现在是生物信息教授
独立不久，正在建立实验室，有两篇小文章，一篇几乎写好，一篇只有数据和图。但是
现在作者只有我一人。就这样发，有点浪费了。先来先得。
招聘广告如下
Postdoctoral position in Bioinformatics or Biostatistics: Houston, TX,
United States
The Institute off Biosciences and Technology (IBT) at Texas A&M Health
Science Center, http://ibt.tamhsc.edu/, is an internationally recognized leader in biomedical and health science research located at the Texas Medical Center (TMC) in Houston, TX, with existing strengths in Epigenetics, Cancer/Stem Cell Biology, Infectio... 阅读全帖 |
|
R***c
发帖数: 13 | 10 Position Title: Scientist I, Bioinformatics
Job Description:
Novartis Institute for Biomedical Research (NIBR)
is a world leader in pharmaceutical research with
a widely recognized culture for nurturing innovation
and scientific excellence to address unmet medical needs.
China NIBR based in Shanghai is dedicated to the
research and development of products addressing
diseases prevalent to China, and providing innovation
in the understanding and curing of Epigenetic causes
of diseases.
We are now ... 阅读全帖 |
|
d**o
发帖数: 618 | 11 我不是研究这个的，所以只是作为外行讨论。
epigenetics就是为了解释不同。相同的部分很简单，DNA甲基化的情况也相同呗。
就你的原文理解，我以为你的＂物质决定意识＂中的物质指的是genetic material. 这
才牵涉到epigenetics的问题。广义来说，意识很大程度上是由环境(environment)和经
历(experience)决定的，这点应该没有疑义吧。你的monozygotic悖论的核心就在于，
环境和经历是否能改变genetic material。但monozygotic实验，甚至clone实验，本身
都无法区分这一点，除非你能保证twins或clones打从受精卵开始就接受了完全一样的
环境和经历。没有这个实验条件的话，你既不能证明物质决定意识，也不能证明物质
不决定意识。
brother |
|
d**o
发帖数: 618 | 12 我不是研究这个的，所以只是作为外行讨论。
epigenetics就是为了解释不同。相同的部分很简单，DNA甲基化的情况也相同呗。
就你的原文理解，我以为你的＂物质决定意识＂中的物质指的是genetic material. 这
才牵涉到epigenetics的问题。广义来说，意识很大程度上是由环境(environment)和经
历(experience)决定的，这点应该没有疑义吧。你的monozygotic悖论的核心就在于，
环境和经历是否能改变genetic material。但monozygotic实验，甚至clone实验，本身
都无法区分这一点，除非你能保证twins或clones打从受精卵开始就接受了完全一样的
环境和经历。没有这个实验条件的话，你既不能证明物质决定意识，也不能证明物质
不决定意识。
brother |
|
l*******r
发帖数: 39279 | 13 epigenetic，所以不是突变
突变是mutation, dna序列改变
epigenetic modification不改变序列，genetic code不改，但是改变表达水平 |
|
v**********m
发帖数: 5516 | 14 楼上文章的comments
Not yet but stay tuned. But a definite fact and you can review it in the FDA
's analysis in the briefing document is that there was no SS of astrocytomas
in male rats or female rats.
Dr. Alavi had concerns about how Arena calculated the exposure margin for
Lorcaserin, that is why it appeared in the CRL. When Arena met directly with
the FDA on December 15th and 16th at the FDA, both Arena and the FDA agreed
on the CSF methodology and the number of participants that would be
acceptab... 阅读全帖 |
|
m*********k
发帖数: 10521 | 15 =====================================================================
=========================Nature质疑叶诗文事件========================
=============================网友支招抗议============================
http://www.mitbbs.com/mitbbs_article_t.php?board=Biology&gid=31
发信人: zfwang (爱国老将), 信区: Biology
标 题: 对Nature 文章的反驳，作为千老，看不下去了。
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Aug 3 10:24:23 2012, 美东)
原文是发在 Olympics 班 对给编辑写信的回复。但现在觉得这还是该生物班的责任。
作为一个科学家，一个中国人，有这么个争议性大的热门课题，放过可惜了。90% 的工
作量是收集数据，但人多力量大，如果后来的收集数据多了，可以裁开发，力度更大。
－－－－－... 阅读全帖 |
|
|
c***s
发帖数: 70028 | 17 左为上一任欧洲农业专员达契安·乔罗什，右为本尼·海林。
当我们谈农业现代化时我们谈些什么？我们好像常谈欧洲。欧洲农业大规模、集约化、高科技、重监管，在获得高产值的时候却又不失良好的环境和景观……这里面一半是现实，一半是我们心中的那个“现代化农业”的投射。在地面上看欧洲农业，情况会复杂许多。
澎湃新闻今日起刊发一组德国农业观察，试图鲜活地捕捉到那里正在发生的关于农业模式的争议。本文是其中第二篇。此一专题试图呈现当地民间社会对可持续农业的理解，话题涉及工业化动物养殖、生物能源、转基因、农业补贴等等，提供国内对相关问题的探讨中仍比较欠缺的视角。
本尼·海林（Benny Haerlin）1957年出生于德国斯图加特，前记者、前德国绿党成员，前国际绿色和平反转基因项目发起人，是欧洲最早采取政治行动反对转基因的个人之一。早在1986年，他在代表德国绿党担任欧洲议会议员期间，就从美国了解到转基因技术，随后在欧洲议会开展反对转基因的政治活动， 并在1990年促成了关于故意向环境释放转基因生物的欧共体理事会“90/220EEC指令”的颁布。该指令的意义在于，在欧洲出现转基因之前，就将其作为一种“风险”加... 阅读全帖 |
|
b******n
发帖数: 4225 | 18 有些可能归功于表观遗传学（epigenetics）吧
来的小
可能所有的进化都是微观尺度的无规变异造成的，我觉得生物体可以在更高的尺度上选
择。这个能让进化论更REASONABLE一定 |
|
s******s
发帖数: 13035 | 19 qie. 我什么说过这个理论很完美了. 看到我通篇没用"达尔文"三个字吧,
进化学一直在自己进化, 现在的理论和达尔文的认识也有很大区别.
btw, epigenetics也是DNA基础上的进化, 表象和拉马克很想, 实际上
完全不是"用进废退". |
|
|
B*****t
发帖数: 3012 | 21 拉马克主义的最大问题是，逻辑上说不清楚。
比如最简单的长颈鹿的例子，母代长颈鹿的脖子长，这个性状怎么能够通过任何手段，
genetic或者epigenetic的传给子代呢？
在现有的分子生物学和细胞生物学的框架下，是无法想象一个宏观的性状能够有一套机
制将其编码成为微观的序列，除非有造物主的参与。
用奥卡姆剃刀的原理来解释，拉马克主义的问题就在于需要假设太多的东西，理论整体
上来说不简洁。用达尔文主义的理论来解释就自然得多。
如果说在200年前，人类对遗传学和细胞生物学的了解还是一无所知时，拉马克主义的
理论看上去有一定的道理的话，在现在对生物学的透彻理解的基础上，拉马克主义的理
论需要假设成立的条件太多，而且毫无任何实验结果的支持。世事无绝对，不能说拉马
克主义100%错误，但是说其99.999999999999999999999999999999999%以上的可能性是
错误的还是没啥问题的。 |
|
o*****a
发帖数: 2335 | 22 序列没变，都是epigenetics层次的改变 |
|
c*******7
发帖数: 3763 | 23 那你查一查，雌激素的半衰期（或者半减期）是多少？究竟是以小时计的还是以天计算
的？你自己查一查。
按照E2 half-life只有13小时的话，你如何在一个月之后倒推出原有的雌激素含量？这
还不包括女婴每天还在新合成分泌不定量的雌激素。你拿出一个数学模型出来。看能不
能仅仅通过测定一个月后的雌激素含量，通过半衰期来倒推出来一个月前的血液雌激素
含量。你看能不能够。
别说什么生物钱老，你就是把这个帖子转到生物办，估计也没有人可以仅仅通过现在血
液中的雌激素含量来到推一个月前的雌激素含量。
不过，俺说了，现在如果通过测定相关脏器细胞的细胞膜雌激素受体蛋白含量（荧光免
疫标记或者Mass Spectremetry）或者是相关受体蛋白的基因表达量（RT或者相关基因
的EPIGENETIC 标记），倒还是有可能倒推出来这个女婴是不是有过雌激素超标。毕竟
细胞内的受体蛋白及其表达的调控是一个比较缓慢的过程，有的还可能是不可逆的过程
，这样有可能还可以倒推出来。 |
|
c****g
发帖数: 37081 | 24 俺不反对转基因作物用于发酵成燃料烧，造纸之类的非直接消化的工业用图。吃到人肚子的还是要慎重，尤其是主食。本来想提议当宠物口粮的，好象不少宠物都被中性化了，对后代影响不好判断。
总之，转基因作物对 genetics/epigenetics 影响没搞清前，慎重为宜。况且大规模种植转基因作物，很可能影响非转基因作物，要限制/严格控制大范围推广。尤其是TB国奸商，目无法纪、唯利是图。 |
|
w*********s
发帖数: 2136 | 25 【 以下文字转载自 Complain 讨论区 】
发信人: whiteclouds (/ 参考消息 /), 信区: Complain
标 题: 投诉我爱宝宝版主mitbbx及版副catdoudou大搞新闻网禁误导广大
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Mar 22 18:47:29 2011, 美东)
事关每个人身心健康。你们凭什么封禁医药界的负面消息和非主流消息？
发信人: whiteclouds (/ 参考消息 /), 信区: Parenting
标 题: CDC to Study Vaccines and Autism
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Mar 22 18:44:33 2011, 美东)
CDC to Study Vaccines and Autism
HuffingtonPost.com
David Kirby
Author/Journalist
Posted: March 18, 2011 05:46 PM
The Centers for Disease Control and Prevention wants to study autism ... 阅读全帖 |
|
c*******7
发帖数: 3763 | 26 方舟子现在也几乎就是一王八蛋了。
90年代的生化博士，毕业后长期不搞科研，科学技术发展日新月异，这家伙10多年没进
实验室没搞科研了，已经落伍了。估计连什么是microarray, proteomics, genomics,
epigenetics， chip-on-chip, next generation seq，RNA-Seq，fluorences
microscopy, fret，single molecular dynamics等都不知道，还有意思现在还继续搞
科普，还所谓科研打假？？？
估计这次菊花论文抄袭事件，差不多要把方舟子完全打爬了。以后，这家伙的人品几乎
就完全没了。
死缠烂打的搞了那么多人，这下，哈哈，玩火自焚啊，被别人搞到屁股了。。。
十多年没进实验室没搞科研了，十多年没进实验室没搞科研了 |
|
h******1
发帖数: 16295 | 27 突变可能是随时发生的吧，还有所谓epigenetics的变化可能更常见一些。 |
|
|
s*******u
发帖数: 9508 | 29 下面是所有editor的信息，但是没有email地址。 应该能查出来。
大家给这些editor发信吧，comments的作用不是很大。
ABOUT THE EDITORS
Editor-in-Chief
Philip Campbell
London
Education: BSc, aeronautical engineering, University of Bristol; MSc,
astrophysics, Queen Mary and Westfield College, University of London; PhD
and postdoctoral fellowship, upper atmospheric physics, University of
Leicester. Areas of responsibility include: Co-Editor of Editorials,
editorial content and management of Nature, long-term quality of all Nature
Publications.
Ex... 阅读全帖 |
|
t****o
发帖数: 154 | 30 没文化真可怕。
不懂生物就不要卖弄你浅薄的高中生物知识了。
你听说过epigenetics吗？听说过基因表达的调控吗？听说过gene silencing吗？你当
真以为基因的表达仅仅就是你有或没有这个基因这么简单？
不要把无知当个性。 |
|
x*****8
发帖数: 10683 | 31 我虽然是学生化的，读现在的epigenetics的paper也读不懂，主要是化学和统计基础不
够。
太空辐射和微重力究竟怎么影响种子基因组和以后的发育过程是一个非常重大的课题。 |
|
d*******3
发帖数: 8598 | 32 发信人: Organoelf (King), 信区: Pharmaceutical
标 题: Re: 邀请业界前辈谈一谈生物制药公司未来20的发展吧
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jan 2 17:49:40 2014, 美东)
水便说说我能想到的技术层面吧。
chemical entity:
小分子药物，集中在癌症、感染、CNS、细菌/病毒等方面，还是有的可做，同时不断有
新的target出来，不断有nature prod出来，但受专利的影响（过期和剩余的chemical
space），大多都是在维持生计。在临床阶段对于试验病人的筛选，以后必将维持下去
。相应的试剂诊断盒业务，大公司为了利润和专利，倾向于自主研发或者收购这些诊断
盒，所以会有大的发展，类似invitrogen的公司。
大分子药物（theraputic toxin），应该在未来有大发展，基于专利和市场的考虑。只
是其价格、稳定性和进入人体的方式，不如小分子方便。至于personalisation，就是
根据病人自身的情况通过克隆和筛选得到最好的个人用药，我觉得需要等待技术上的突
破，降低成本和缩短筛选时间... 阅读全帖 |
|
w********t
发帖数: 12853 | 33 转载一篇文章，和我们的讨论非常相似：
推荐引用
“If the argument is that starch is not safe for healthy people, I would say
there’s little to no scientific or anthropological evidence to support
that idea, and overwhelming evidence opposing it.” 翻译：如果论点是淀粉对于
健康人群也不安全，我认为基本上没有科学及人类学的根据支持这种观点，而且压倒性
的证据反对这个立场。
链接：
http://chriskresser.com/is-starch-a-beneficial-nutrient-or-a-to
题目：
Is starch a beneficial nutrient or a toxin? You be the judge.
作者 ：
CHRIS KRESSER
作者简介：作者被誉为在健康健美领域最有影响的全球 50 人之一
Chris Kresser, LAc, is a licen... 阅读全帖 |
|
K********A
发帖数: 917 | 34 DNA 到染色体 需要包裹到组蛋白上，还有各种epigenetic的遗传/调控,现在并不完全
清楚
我不知道现在人工合成（从无机物）个病毒出来是不是可行，别提更复杂的原核/真核
细胞了。 |
|
l*******1
发帖数: 16217 | 35 那为什么后来张的那么壮，故欧洲人也太高，难道是工业革命后营养结构改变了
epigenetics，
维京战士也就1.75m,结果杀遍全欧洲 |
|
m*b
发帖数: 1421 | 36 epigenetics
：比如说，你后天搞计算机，练钢琴，天天去练篮球，这些技能很熟练了，会把这个特
长遗传给自己后代吗？ |
|
l*******1
发帖数: 16217 | 37 这个我认为要从 epigenetics 中找答案 |
|
l********k
发帖数: 14844 | 38 关键字：epigenetics也是遗传。再进一步，后天被掰弯，也是弯，你能怎么着吧？ |
|
w*********e
发帖数: 6093 | 39 其实很多中国女人自打娘胎里出来就抑郁了，这叫产后抑郁，抑郁一辈子都很正常，一
般得轮回多次才有可能消解得了。
epigenetics决定的，没法治。 |
|
x********e
发帖数: 35261 | 40 呵呵 我要说差不多一百年前就有人提出epigenetics，你是不是要惊掉下巴？还是那句
话，不知者无畏 |
|
l*******1
发帖数: 16217 | 41 有一个学科叫做 nutritional epigenetics |
|
m**u
发帖数: 3348 | 42 epigenetics
改进没有什么实际意义吧？
iPS流行以后 就没人那么在乎克隆了 |
|
c*********e
发帖数: 16335 | 43 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: mitbbsrobot (机器人), 信区: Biology
标 题: 感叹生物科技最近进步更快
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Apr 7 00:43:51 2017, 美东)
最近做个seminar类似的东西，要给系里完全CS出身教授讲我的研究，做一些文献调研
了解一下大背景，真是感叹生物技术发展真快。
在不到10年前，我们对基因的non coding region一无所知，对为什么细胞会从同一个
染色体出来不同的性质，完全不了解。
现在，随着Chip-Seq，Hi-C等技术的发展，整个DNA上的三维结构，各种蛋白质的结合
，现在都基本有个大概的了解了，下一步，随着这批数据进一步的积累，可能突破就在
未来几年。
看看Toronto的Frey， UW的Noble或者Stanford的Anshul做的各种东西，尽管现在大部
分在Epigenetics上还是比较初级，但是还是很令人激动的。最近又有互联网泡沫的刺
激，各种信息的研究工具，尤其是deep learning的发展，非常迅速，可能未来几年会
有大的突破，大家一... 阅读全帖 |
|
发帖数: 1 | 44 自己也明白生物就是搞笑的，所以时不时灌两篇epigenetics导致老鼠同性恋的高级生
物黑文章
不像屎一恭，王小东，天天他妈的忽悠，良心大大的坏了。 |
|
x*****8
发帖数: 10683 | 45 作为生化专家，我给您解释。
遗传DNA的ATCG序列是一方面，而表观遗传（epigenetics）的甲基化和乙酰化等修饰是
另一方面，都携带了大量信息！
动物学习的过程可能对表观遗传的影响更大，也会传给自己的后代。
美国这边近年来对表观遗传的研究表明，吸毒或酗酒的妈妈生的孩子很多也吸毒或酗酒
，即使他们不是由亲生母亲带大。 |
|
发帖数: 1 | 46 有个伪科学Epigenetics说类似情况可能会影响后代。 |
|
w********2
发帖数: 632 | 47 问题是EPIGENETICS的调控作用呢？好像比REGULATOR SEQUENCE更有效？ |
|
w********2
发帖数: 632 | 48 难怪。我老记得SCIENCE曾经有专辑讲到EPIGENETICS可以解释MOLECULAR GENETICS解决
不了的问题。难怪你在这个问题上这么牛，原来是自己的专业。我老到时候找个和你同
专业的和你辩辩。小牛。不错。LOL。 |
|
w********2
发帖数: 632 | 49 crispr?
whole genome sequencing?
epigenetics? |
|
|
