o******w
发帖数: 842 | 1 4KB随机读/写性能 从G2的最高35K/8.6K IOPS 到最高50K/40K IOPS ，写的性能提高了
4/5倍 啊，怎么没人讨论这个啊？ |
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s****c
发帖数: 11300 | 2 这哥们的结论是对的 但是原理说的不是很准确
他所说的什么“文件区块”实际上就是簇吧 怎么可能有两个文件共享一个簇的情况发
生 一个簇明确来讲只能同时被一个文件占据 如果簇的大小是4096B，那么这个文件的
尾链哪怕只有一个byte写到这个簇了，这个4096B的空间算是都被这个文件占据了
这也就是为什么ntfs一开始要采用可变簇大小来进行格式化，簇的大小由分区大小决定
。在非ssd时代是一个聪明的做法，比较小的簇可以减少这种浪费，增加存储的效率。
但是事实上当代的硬盘就算是ssd容量也是很大的，考虑到trim的应用，所以都统一到
最大值4096B了 也就是4kB的簇。trim的工作原理实际上就是将硬件和软件簇的划分对
齐，这样在进行写操作之前flash的清除是严格根据簇来的 不会发生一个簇要进行两个
区块flash的清除这种费操作，也就是说trim只影响操作效率，并不会影响数据恢复。
但是为什么ssd的数据恢复更难一些？因为现代的ssd固件为了flash的寿命和读写速度
都倾向于将文件尽量打散存在ssd的各个不同的位置，这样如果不幸的将文件误删除又
更不幸的对硬盘进行了写操作（在当代操作... 阅读全帖 |
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f****a
发帖数: 4708 | 3 4KB random 5GB/s，对硬盘是不可能的事。 |
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m**c
发帖数: 2103 | 4 三爽的ssd看上去很烂？
http://www.51nb.com/viewnews-87792.html
TechReport坚持进行的固态硬盘耐用性马拉松试验再次达到关键节点，数据写入量已经
走过300TB，现在各位参赛选手的情况又是如何呢？
最先出现问题的三星840 250GB情况正在持续恶化。100TB的写入后就出现了11个重
新分配扇区，200TB后增至370个，300TB后则达到了833个。三星依然拒绝透露每个扇区
的具体尺寸，如果按照1.5MB的猜测计算那就是1.2GB。
看上去不少，但幸运的是，因为冗余容量更多，用户实际可用的仍未发生变化。
840是唯一一个使用TLC闪存颗粒的，其耐久性存在天然缺陷，因此这一切都并不意
外。
写入不可压缩数据的金士顿HyperX 240GB之前出现了4个重新分配扇区，但此后表
现稳健，没有进一步增多。另一款写入的是可压缩数据，感谢SandForce主控的数据压
缩，实际写入量仅有215TB。
除此之外，Intel SSD 335 240GB也加入了这一行列，出现了1个重新分配扇区。
健康度方... 阅读全帖 |
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b***i
发帖数: 3043 | 5 【 以下文字转载自 StartUp 讨论区 】
发信人: bihai (学得不好), 信区: StartUp
标 题: java网站写好，如何提速？ (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Dec 23 00:53:45 2012, 美东)
发信人: bihai (学得不好), 信区: BuildingWeb
标 题: java网站写好，如何提速？
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Dec 23 00:53:28 2012, 美东)
首页是动态生成，4kB左右，服务器大约50毫秒返回文件，首页文件包括8个资源，其中
jQuery一个库，Raphael一个库，一个背景图150K，一个网站logo，两个小图标，两段
音乐。音乐搞成后期jQuery的load()之后读入。
清除ie的cache后，发现大约需要2秒多钟网页才能出现。我的背景是黑色，ie会先画出
白色，然后2秒后转换成黑色。这个时间是否合理？能否改进？谢谢！
对了，是不是javascript的库可以压缩？ |
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y*h
发帖数: 107 | 6 I used SFTP to download a file from linux server to local PC. It's
like following. However, I couldn't find PSCM_RptStd.pl on my PC after it
is done. It is not under C:\. Any idea ?
sftp> get PSCM_RptStd.pl C:\
Fetching /home/p2000/rxd15/devel/icp/r55/bin/PSCM_RptStd.pl to C:\
/home/p2000/rxd15/devel/icp/r55/bin/PSCM_RptStd.pl 100% 5498
5.4KB/s 00:00 |
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j******n
发帖数: 271 | 7 What is the concern here? In each iteration, at most 4 pointers are
referenced: two pointers to the current and the two pointer to next elements
of them. Even if they are all in different pages, in each iteration we
reference at most 4 pages, which is 4*4KB and can fit in today's L1 cache.
Below is my solution without advancing each pointer twice. Please comment.
1: #include
2: #include
3: #include
4: using namespace std;
5:
6: template阅读全帖
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c****p
发帖数: 6474 | 8 Even if they are all in different pages, in each iteration we reference at m
ost 4 pages, which is 4*4KB and can fit in today's L1 cache.
上面这话没错但是cache不是这么搞的吧？
elements |
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z****e
发帖数: 54598 | 9 谁有英文原文和演示网站？
正文我来说两句(2人参与)
2013年03月04日09:25来源：搜狐IT 作者：搜狐IT
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( 5 )
【搜狐IT消息】3月4日消息，据国外媒体报道，HTML5是新一代的网页应用开发技
术，一些人认为其将会取代iOS和安卓客户端开发技术。不过，美国一名22岁的WEB开发
工程师最近发现HTML5在浏览器厂商的实施中发生一个大漏洞，大量的Cookie文件可以
在很短时间里通吃掉用户的硬盘空间。
斯坦福大学的开发者Feross Aboukhadijeh发现了这一漏洞，据称，存在HTML5漏洞
的浏览器包括谷歌Chrome、微软IE和苹果Safari。他为这一漏洞提供了概念性攻击模型
，此外还提供了演示网页。
这位开发者解释说，HTML5网页技术标准中，可以允许网页在用户电脑中保存比过
去多的自定义数据（方式为Cookie）。过去每一个网站可以保留4KB的数据，不过HTML5
网站根据规范可以保存的数据量从5到10MB不等。因为如今的硬盘空间都很大，这点数
据量不算什么。
据称，Chrome每次登录会保留2.5MB数据，火狐和Op... 阅读全帖 |
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b*******s
发帖数: 5216 | 10 现在一般的ssd，保证4kb随机写延迟基本可以做到500us以下
不需要特别好的
L2 |
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n*****t
发帖数: 22014 | 11 每个车次、每个座位、每两个站点之间设为一个 unit，不会重叠。
优化一下可以保证每张车票在一个 4kb disk block 里，北京到广州途径 20 个站，就
是加锁、写 20 个 byte，msync 到 disk，然后 unlock。需要写操作的情况很少，基
本是每秒出票速度相关(173/s)，峰值不会超过 x 100 吧？
电信级的东西就是加各种 flag，设各种 timeout，不保证你 work，保证我能 work |
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n*****t
发帖数: 22014 | 12 屁话，比例最大的是 read request，查哪条线有票哪条没票，出票的比例远远低于这
个。没有 lock 的需要，只是 read skt, read mem, write skt，1M/s 还做不到？你
还有没有常识了啊？？？
16k/s 只是受 disk 影响的最保守情况，每次写 4kb，而且写完马上 sync。我开几个
raid 马上速度上去了。你要不要自己测一下？ |
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b*****r
发帖数: 321 | 13 Posted by digable_meltdown on October 05, 2000 at 20:06:17:
You can download StreamBox VCR from here
http://w1.463.telia.com/~u46307158/extfaq/software/sbvcr.zip
This program lets you download RA files from PNM servers.
It is very easy to use.
1. Download the initial RA file, this should be on 3-4kb and
have and extension of RAM. Just right click the RA link and
do a "Save Targat As".
2. Highlight the RAM file, hold down the SHIFT key and right
click. Find OPEN WITH and then select NOTEPAD from |
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r******m
发帖数: 173 | 15 I am trying to clone a 300 bp gene into pTYB2 vector (7.4kb)for later
protein purification method by IMPACT-CN. NdeI (producing sticky end) and
SmaI (blunt end) restriction sites were constructed into primers
corresponding to the N- and C- termini of the gene and incorporated by PCR
amplification. The PCR product and the vector were both double digested with
SmaI and NdeI respectively. After gel purification, the digested insert (
gene) and the vector were used to perform ligation with T4 DNA li |
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d*****r
发帖数: 2583 | 16 ☆─────────────────────────────────────☆
Genemo (猜猜) 于 (Tue Feb 17 12:37:29 2009) 提到:
整个目标是把2个3.4kb的片段连在一个8kb的载体上
现在第一个已经连上去 是双酶切的
第二个怎么也连不上去了
这个是单酶切 为了避免过多污染 我直接PCR产物酶切 酶切位点旁边留了4个碱基给酶
bind
虽然PCR的模板是质粒 但我做了割胶回收
现在insert自连很多 和正常的连接差不多 很奇怪为什么自连了还能有抗性呢
这个问题不知道有么有高人见过而且解决过？
还有就是现在这个载体太大了 怎么才能提高连接效率呢
☆─────────────────────────────────────☆
albertsmwk (Stay in Bio) 于 (Tue Feb 17 12:52:48 2009) 提到:
载体用SAP处理，过夜酶切，过夜SAP，基本可以做到没有自连
insert自连。。。。你为啥知道啊？！难不成跑胶测序？
不行用takara的long ligase kit，做10K肯定没问题 |
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n********k
发帖数: 2818 | 17 yes and no, without knowing the details of your problems. once u can get it
very robust, it shall be very
reliable..u likely need a good PCR machine since the annealing time is so
short...I always do it with our best
cycler...if ever I had to do with the older ones, I would compensate for the
time say setting as 1-3 sec rather
than 5-10 sec...because the ramp time would just kill the specificity...BTw, it is becoming challenging if the
fragment is bigger than 3k esp over 4kb...(with genomic DNA |
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b******e
发帖数: 61 | 18 多谢楼上的回复。
因为我的目的是想把4kb片断弄到pLenti7.3里边去，没有合适的酶切位点，只好用TA
cloning. 我也试过不用kit里边带的topo, 自己用T4 Ligase做TA连接，也失败了。 |
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r*****m
发帖数: 231 | 19 把需要的位点设计在PCR引物的两端，PCR后用酶切然后连上vector。你的Lenti vector
应该至少有7，8kb吧，连个4kb的一般不会出问题。一般人做PCR cloning都是这么做的
，做不出来的才用TOPO。但你是TOPO都做不出来，就不知道为什么了。。。检查下你的
Taq是不是有问题吧。。。 |
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i*********t
发帖数: 78 | 20 用Invitrogen Gateway system: pLenti7.3⁄V5-DEST™ Gateway®
Vector Kit, 4kb 插入对pLenti7.3/V5 Topo 太大了。 |
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b******r
发帖数: 111 | 21 I need PCR 5-flanking of mouse APOE genomic DNA(9kb upstrean of exon 1),and
human APOE3,4 genomic DNA(4kb). I have tested 10 primer pairs and their
combinations.But till now,can not get the target PCR product.Maximum is non-
specific 2-4 kb Anyone knows any vectors and their vendors contain the
mouse and human APOE full length genomic DNA ? |
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t******r
发帖数: 8600 | 22 要克隆一基因locus,30-50 kb. Genbank没有sequence.大量repetitive segments, PCR
基本不work.好不容易PCR出一4kb片段，TA-cloning总被重组掉80-90%。试用过不同菌
种，30C培养等等。求高人指点。 |
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c*********u
发帖数: 3128 | 23 要求能跑出4kb左右，突变尽量少，最好没有。
对于GC含量高的，大家用什么？
最近在钓基因，用TAKARA的LA和NEB的phusion，但最终得到的序列突变太多，没法用。
老板脸色越来越不好看了 |
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s******y
发帖数: 28562 | 24 4kb is not too long ah.
I used to Pfu Turbo (Strategen) for a gene at that length with GC% =65% and
it works fine. I added 0.1% DMSO in the buffer.
Another suggestion is, you can try to amplify two fragments in the same gene
seperately and then ligate them together later. I found it easier for
tricky sequences. |
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n***w
发帖数: 2405 | 25 最近做克隆，2.4kb的片段已经出来了，现在要做的就是加酶切位点，然后插到vector
里去。但是跑了几次胶，结果不算理想，想进一步optimize，不太清楚怎么做。。。
见图。。。
两个引物的Tm分别是63.8和63.3。
我第一次PCR的条件是94度3min, 94度30s, 65度45s, 72度60s,72度5min，35个循环。
结果见图1。隐约可以在2.5kb左右见到带，但是很faint。曝光2s。
我第二次PCR的条件是94度3min，94度30s, 66度30s, 72度30s，72度5min，仍然是35个
循环。结果见图2，比第一个是要好多了。貌似有些拖尾。。。
我第三次PCR的条件是94度4min, 94度30s, 66度40s，72度40，72度5min, 35个循环。
结果见图3。目的带是强了不少，但是有些弥散，还有些杂带。
我觉得还需要进一步去优化条件。
请大家给我出出主意。。。
谢谢。。
ps，第二次和第三次的引物比第一次多加了0.1ul。。。模版的浓度大概30ng/ul，上了
1ul。
谢谢。 |
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g*****y
发帖数: 6325 | 26 72oc 延伸，1kb=1min. 你扩增2.4kb 起码也要2分30秒。 最后延伸用7min. 94度2min
, 94度40s, 66度50s, 72度
3min,35个循环, 72度7min，
vector |
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s******r
发帖数: 2876 | 27 试试hot start, 加touchdown，有时候有奇效。
最近做克隆，2.4kb的片段已经出来了，现在要做的就是加酶切位点，然后插到vector
里去。但是跑了几次胶，结果不算理想，想进一步optimize，不太清楚怎么做。。。
见图。。。
两个引物的Tm分别是63.8和63.3。
我第一次PCR的条件是94度3min, 94度30s, 65度45s, 72度60s,72度5min，35个循环。
结果见图1。隐约可以在2.5kb左右见到带，但是很faint。曝光2s。
我第二次PCR的条件是94度3min，94度30s, 66度30s, 72度30s，72度5min，仍然是35个
循环。结果见图2，比第一个是要好多了。貌似有些拖尾。。。
我第三次PCR的条件是94度4min, 94度30s, 66度40s，72度40，72度5min, 35个循环。
结果见图3。目的带是强了不少，但是有些弥散，还有些杂带。
我觉得还需要进一步去优化条件。
请大家给我出出主意。。。
谢谢。。
ps，第二次和第三次的引物比第一次多加了0.1ul。。。模版的浓度大概30ng/ul，上了
1ul。
谢谢 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 28 如题
Phusion Hot Start II和Herculase II该选哪个？
还是PCR的问题
Pfu Ultra II、Taq一开始都扩不出来
后来发现是模板的序列跟我们手上的序列不一致
现在根据测序结果设计了引物
Pfu Ultra II只有非特异产物出来
目的片段不算多大，4kb不到
GC含量也没有特别高，60%而已
一般的优化都试过了
现在老板支持买别的酶试试
大家说选哪个？ |
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h******e
发帖数: 897 | 29 4kb的话用Platinum PCR Supermix (Invitrogen)应该没问题 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 30 有个4kb的片段比较难amplify
好不容易折腾得可以P出来了
然后放到TOPO-II里面去测序（blunt end）
5'端好几次都给我奇怪的结果：
amplification序列如果是这样（从PCR的primer开始，测序是在insert位点上下游比较远的地方，
所以能看到back bone）：
5'TTAGGCCGGCC.....
我得到的就是这样：
5'GCCGGCC......
本该是PCR forward primer 5'的四个碱基不见了
直接导致一个限制性酶切位点不完全
primer是IDT定的
从IDT订过可能有上千的primer，从来没有遇到过这样的情况
现在我不知道是primer的问题还是有什么别的原因
版上有人遇到过么？
当然我准备定新的primer看看有没有帮助
不过还是百思不得其解这是怎么回事啊 |
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z****g
发帖数: 3340 | 31 你这个是什么原理？ 我现在是大片段连不上（>4kb)，小的没问题。 |
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x**x
发帖数: 92 | 32 Mutagenesis help：请问如何插入一段 ~20bp的片段 （large vector+insert）？
Vector: 5kb
Insert: 4kb
total: 9kb
用Stratagene (agilent)的程序设计的引物。
试着用QuikChange XL kit, 不同的polymerase (PFU ultra, PrimeStar supermix, HF
PCR supermix), DMSO浓度。全都不行。
请大家给些建议， 谢谢。 |
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j****x
发帖数: 1704 | 33 同事之前收到别人给寄过来的质粒，已经是大提好了的。送测序公司简单测了一个反应
，匹配。
后来同事基于这个质粒又构建了其他几个衍生，测序据说也都啥没问题。后来再做酶切
时，顺便点了个质粒对照，结果问题来了。
单酶切，双酶切，片段大小都正确。单单这个未酶切的质粒对照，不是正常超螺旋质粒
应有的迁移速率快于线形片段的情形，反而显示条带还显著大于单酶切后的线形片段。
（质粒大小6.5kb，正常的超螺旋结构约3.5-4kb,而该未切质粒显示8kb）
同事今天找我讨论，想了半天没法解释。从来没遇到这种情况，确切地说很少做质粒对
照，单双酶切正确就完了。没想到还有这种情况，怎么解释？ |
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n***w
发帖数: 2405 | 34 嘿，是你。
转录因子，连上fusion的部分，就2.4kb。
我就连在了pGEX-2T系列上，因为要做表达用，当然还用过TA vector。。。
培养基一开始用LB，后来照manual里用了YTA，其实和LB差不多。。。
我大概知道是什么原因了，我想换真核表达系统试试。。。
谢谢。 |
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s*****t
发帖数: 107 | 35 正在做一个很有趣的基因的上游控制元件的ChIP assay。 发现这个基因ATG上游从14kb
的地方有一段3-4kb的地方没有Histon H3的binding。请问各位大虾该怎么解释？ |
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S******e
发帖数: 393 | 36 我以前用pfu也碰到过同样的问题, 当时是扩4kb的片断，测了几个克隆，
其中一个克隆中间少了大约五六十个碱基, 很奇怪，也不知道是什么原因 |
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t*****z
发帖数: 1598 | 37 谢谢楼上各位，尤其是Chamgrape的方法，如果真的管用那太好了。我今天试了下一个
total RNA。一条亮带在0.8kb，一条暗带在1.4kb，乘以2之后勉强接近18S和28S的大小
了。粗略定量也许可以吧。 |
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e****p
发帖数: 354 | 38 Northern 已经看到基因的大小在11kb左右（用RNA LADDER)。
但但转录后 LONGRANGE PCR，扩增中间一段应该是8KB，用PFU扩出来只有最清晰的6KB
左右，重复了一次还是这样，百思不得其解。。。
此外如果CLONE 长练PCR产物，基因中如果有>4KB重复序列如何测序啊，每次只能测个
600-800, 引物设计也是问题。。。
请教各位大侠。 |
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S******e
发帖数: 393 | 39 我是这样做的：从公司买的cDNA（这样可以保证质量），好像也不贵，
然后用pfu（pfu from invitrogen or NEB，记不清了，两家都用过），
扩了两个4kb,测序，然后拼接为8kb的片段。 |
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t*****z
发帖数: 1598 | 40 我也遇到过，某个常见的4kb左右的小质粒，大抽出来，总共100ul，浓度是150ng/ul。
抽了两次都是这样。看看质粒本身没什么特别的，不知道怎么回事。我觉得这事情和质
粒大小关系不大。你的也才大了一些些而已啊。 |
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A****A
发帖数: 16 | 41 实际上，目前大部分证据表明TALEN的off target效应要小于ZFN. TALEN现在的主要缺
点在于size太大，一个TALEN coding sequecne 至少要4kb, 而ZFN则只要1kb左右。而
且从目前以发表的和我们自己的数据来看，TALEN的剪切活性可能要低于ZFN。现在一些
实验室都在进一步优化TALEN的size以及活性，希望以后能有大幅度的提高。TALEN相对
于ZFN目前最大的优势是位点的选择范围更大。基本上每5-10bp就可以找到一个好的
TALEN位点。ZFN目前是200bp-500bp. 另外TALEN的出现打破了ZFN在genome
engineering领域的垄断地位。将大大降低reagent的价格。现在法国的Cellectis就提
供$5000TALEN的订制服务。Sigma的ZFN价格也会跟着降下来。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 42 //nod.
刚查了一下PiCH的protocol, ms确实不强，大概2-4kb,那么中间就应该有很多bind
ing site了 |
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f*******e
发帖数: 628 | 43 你的 plasmid 确定是 4kb? 还是 insert + vector 其实更大？
ScaI 是个 blunt end 的酶，没有 sticky end 啊。几乎没有可能连一块儿。 |
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l*******g
发帖数: 118 | 44 是在promega买的
客服说的4kb
这里面没有insert的
如果没可能连在一起，很可能是客服弄错了，我再问问
谢谢! |
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s********r
发帖数: 312 | 45 在做一个targeting vector，总长17kb多。现在做到最后一步克隆了，把一个4.4kb的
片段用BamHI切下来，装到BclI线性化的12kb backbone里。已经反复做了几次，每次8-
12miniprep里面90%都是一个大小3kb的奇怪质粒,偶尔出来的几个大小正确的测序发现
全部都是反向。先前怀疑是由于质粒太大在E.coli里发生重组，这次换成了stbl3的感
受态，还是一样的结果。求有经验的给点建议... |
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