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Biology版 - 【求助】RNA分子的大小怎么从电泳图谱上看?
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t*****z
发帖数: 1598
1
我用一般的琼脂糖凝胶跑RNA电泳,跑出来看着不错的,但是条带的大小和边上的DNA分
子量标准对不起来。我想可能是因为RNA分子的迁移率和DNA不一样,所以不能直接对照
。那么有没有公式可以把DNA分子量标准的条带换算成RNA的分子量呢?如果没有的话,
我是不是非得去买专为RNA设计的分子量标准呢?
另外,用反转录酶(Invitrogen SuperScript III)合成出来的cDNA,用OD260怎样定
量?是像DNA一样乘以50,还是乘以33或者别的什么因子吗?
多谢大家!
m**z
发帖数: 787
2
is the DNA marker double stranded?

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我用一般的琼脂糖凝胶跑RNA电泳,跑出来看着不错的,但是条带的大小和边上的DNA分
: 子量标准对不起来。我想可能是因为RNA分子的迁移率和DNA不一样,所以不能直接对照
: 。那么有没有公式可以把DNA分子量标准的条带换算成RNA的分子量呢?如果没有的话,
: 我是不是非得去买专为RNA设计的分子量标准呢?
: 另外,用反转录酶(Invitrogen SuperScript III)合成出来的cDNA,用OD260怎样定
: 量?是像DNA一样乘以50,还是乘以33或者别的什么因子吗?
: 多谢大家!

o********y
发帖数: 87
3
Run denaturing agarose gel

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我用一般的琼脂糖凝胶跑RNA电泳,跑出来看着不错的,但是条带的大小和边上的DNA分
: 子量标准对不起来。我想可能是因为RNA分子的迁移率和DNA不一样,所以不能直接对照
: 。那么有没有公式可以把DNA分子量标准的条带换算成RNA的分子量呢?如果没有的话,
: 我是不是非得去买专为RNA设计的分子量标准呢?
: 另外,用反转录酶(Invitrogen SuperScript III)合成出来的cDNA,用OD260怎样定
: 量?是像DNA一样乘以50,还是乘以33或者别的什么因子吗?
: 多谢大家!

C*******e
发帖数: 4348
4
如果只是差不多看看的话,DNA marker分子量乘以二咯
DNA marker是ds
RNA是ss
脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸的单个分子量有差别但是跑琼脂糖电泳的话你这么粗略比
较一下没什么问


【在 t*****z 的大作中提到】
: 我用一般的琼脂糖凝胶跑RNA电泳,跑出来看着不错的,但是条带的大小和边上的DNA分
: 子量标准对不起来。我想可能是因为RNA分子的迁移率和DNA不一样,所以不能直接对照
: 。那么有没有公式可以把DNA分子量标准的条带换算成RNA的分子量呢?如果没有的话,
: 我是不是非得去买专为RNA设计的分子量标准呢?
: 另外,用反转录酶(Invitrogen SuperScript III)合成出来的cDNA,用OD260怎样定
: 量?是像DNA一样乘以50,还是乘以33或者别的什么因子吗?
: 多谢大家!

s******s
发帖数: 13035
5
cDNA没法测。只能测起始RNA浓度。

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我用一般的琼脂糖凝胶跑RNA电泳,跑出来看着不错的,但是条带的大小和边上的DNA分
: 子量标准对不起来。我想可能是因为RNA分子的迁移率和DNA不一样,所以不能直接对照
: 。那么有没有公式可以把DNA分子量标准的条带换算成RNA的分子量呢?如果没有的话,
: 我是不是非得去买专为RNA设计的分子量标准呢?
: 另外,用反转录酶(Invitrogen SuperScript III)合成出来的cDNA,用OD260怎样定
: 量?是像DNA一样乘以50,还是乘以33或者别的什么因子吗?
: 多谢大家!

p****e
发帖数: 1336
6
formaldehyde gel
t*****z
发帖数: 1598
7
谢谢楼上各位,尤其是Chamgrape的方法,如果真的管用那太好了。我今天试了下一个
total RNA。一条亮带在0.8kb,一条暗带在1.4kb,乘以2之后勉强接近18S和28S的大小
了。粗略定量也许可以吧。
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