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Joke版 - 内行看看这个对贺同学的三代测序技术的评价是客观的么
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Re: 我横穿美国回来了。。。。 (转载)生物博士后姐姐,我错了 (转载)
银河系有多大?一个比喻海归博士养鼠一对售价18万 销遍近百家实验室(图) (转载)
加州理工助理教授钱璐璐发明可分拣运输的DNA机器人,每走一步6(转载)要让我这么喂奶,非吓死不可
[zz]某位同学套UIUC的教授Re: 11公,何梁何利奖 (转载)
北京的就是中国的,中国的就是世界的。第三代测序技术简介
你们已经被包围了zznext generation sequencing technology
想跟这个科大GG分手 (转载)深圳市瀚海基因招聘测序应用科学家
科大教授在校医院被殴打,校医院不闻不问 (转载)PacBio or SOLiD
相关话题的讨论汇总
话题: 测序话题: helicos话题: 碱基话题: pacbio话题: 区分
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d********f
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1
作者:匿名用户
链接:https://www.zhihu.com/question/63333982/answer/214638976
来源:知乎
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。
澄清一下,这个技术已经被淘汰了,而且是伪三代。卖力捧场的辛苦了,个人觉得这个
技术活不了多久。 我就批判些说吧,这个技术是来自Jiankui He的(博士还是博后,
不记得了)老板Dr. Suhaib Siddiqi,他发明了这个技术并且在2003年成立了Helicos
BioSciences Corp公司,然而,这个公司在2012年宣布破产!然后,这个技术居然5年
后特么在中国复活了???原来是Siddiqi的中国弟子从美国引进的“先进三代测序技
术”!我们来仔细看一下这个技术:单分子直接测序是不错,但读长为200bp?excuse
me?现在的三代测序读长不超过5k都不好意思拿出来说事,其实看到读长我们也就知道
这其实是二代测序的水准,只是原理不同而已;但是,测序深度是三代的特点——低深
度,高error,所以发表的非同行评议paper中只能测测细菌,十几倍的深度居然还敢和
Illumina对比(见下图),勇气可嘉!就这种测序深度的数据敢拿到临床上用?人家可
是至少要>95%的区域平均20x depth!懂行的人都去看看原文和技术细节吧,不懂的人
就别跟风起哄了。华大买过来的技术比这成熟不知多少都没法降低成本市场化。更正,
目前BGIseq已经上市,华大好样的!吹得响是资本市场的狂欢而已,以上
作者:匿名用户
链接:https://www.zhihu.com/question/63333982/answer/373943991
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瀚海基因走的是先融资,然后用融资的钱来招人来进行研发的路子,技术是有的(经过
加州理工专利授权),不过没有任何优势,原来的母公司Helicos已经破产,因为测序
读长短(30bp),仪器又贵,没人用(售出不超过10台)。但是这种测序技术仍然被有些
人坚持着,国外公司叫SEQHLL,国内的就是瀚海基因。相比较illumina和Pacbio的四色
荧光碱基区分,Helicos技术采用是按照一定的顺序依次渗入红色荧光标记ATCG四种碱
基,illumina和Pacbio一轮就可以区分一个碱基类型,而Helicos技术需要经过4轮才可
以区分一个碱基类型,时间大大延长,但是从贺老师发表的最新文章上,是否可以推测
贺老师也改用多色荧光标记来区分碱基(图片上可以看出最少用了三色,如果绿色作为
锚定,那么最少用黄和红两种颜色来区分,这种形式可能类似illumina最新的iseq100
双标记区分四种碱基系统)?https://pic4.zhimg.com/v2-
47bdb7cb9e2ac5bd7526e6ffcb0da2ab_b.jpg" data-caption="" data-size="normal"
data-rawwidth="894" data-rawheight="562" class="origin_image zh-lightbox-
thumb" width="894" data-original="https://pic4.zhimg.com/v2-
47bdb7cb9e2ac5bd7526e6ffcb0da2ab_r.jpg">目前来说,Helicos技术优势在于建库简
单,可以马上上机测序,这个是优于illumina、pacbio、oxford,而且贺老师将测序仪
定位在临床,速度是很快的,但是测序读长太短,只能检测一些突变位点,对于结构变
异等检测是无能为力的。再说一下本人对3代测序仪市场预测Pacbio是主流,针对工业
级客户;牛津纳米孔会被淘汰;瀚海基因可能会发布小型测序仪,用于单基因遗传病的
检测,占领我国部分医院检验科市场。为什么对牛津纳米孔不看好,大家可以参考下面
一些新闻(包括中国买家的评价、牛津纳米孔员工的评价):
x****u
发帖数: 44466
2
知乎上有任何客观的东西么?除了营销号就是编故事的,说的不是特定领域是全部领域。
麻痹传销雇个团队上知乎刷贴都能发横财

Helicos
excuse

【在 d********f 的大作中提到】
: 作者:匿名用户
: 链接:https://www.zhihu.com/question/63333982/answer/214638976
: 来源:知乎
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: 澄清一下,这个技术已经被淘汰了,而且是伪三代。卖力捧场的辛苦了,个人觉得这个
: 技术活不了多久。 我就批判些说吧,这个技术是来自Jiankui He的(博士还是博后,
: 不记得了)老板Dr. Suhaib Siddiqi,他发明了这个技术并且在2003年成立了Helicos
: BioSciences Corp公司,然而,这个公司在2012年宣布破产!然后,这个技术居然5年
: 后特么在中国复活了???原来是Siddiqi的中国弟子从美国引进的“先进三代测序技
: 术”!我们来仔细看一下这个技术:单分子直接测序是不错,但读长为200bp?excuse

m*******h
发帖数: 2005
3
目前应该是一路米娜最厉害吧
y****i
发帖数: 12114
4
你这个评论和你批判的知乎也是一个水平哦。

域。

【在 x****u 的大作中提到】
: 知乎上有任何客观的东西么?除了营销号就是编故事的,说的不是特定领域是全部领域。
: 麻痹传销雇个团队上知乎刷贴都能发横财
:
: Helicos
: excuse

d****o
发帖数: 32610
5
知乎id杀生丸的系列文章如何

域。

【在 x****u 的大作中提到】
: 知乎上有任何客观的东西么?除了营销号就是编故事的,说的不是特定领域是全部领域。
: 麻痹传销雇个团队上知乎刷贴都能发横财
:
: Helicos
: excuse

d********f
发帖数: 43471
6
吹牛b可以理解,有利益在驱动,那你说那些揭露真相或者持批评态度的有什么利益驱
使么

域。

【在 x****u 的大作中提到】
: 知乎上有任何客观的东西么?除了营销号就是编故事的,说的不是特定领域是全部领域。
: 麻痹传销雇个团队上知乎刷贴都能发横财
:
: Helicos
: excuse

x****u
发帖数: 44466
7
知乎上都是职业营销号写东西,你这点都不知道的话属于中文问题

【在 y****i 的大作中提到】
: 你这个评论和你批判的知乎也是一个水平哦。
:
: 域。

x****u
发帖数: 44466
8
他是最近一两天写的,这个人以前到处征集基因疗法试验者并且和同行打嘴仗
你说有人自费在美国用中文搞癌症研究我肯定不信

【在 d****o 的大作中提到】
: 知乎id杀生丸的系列文章如何
:
: 域。

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NGS,到底谁会赢得这个市场?北京的就是中国的,中国的就是世界的。
next generation sequencing technology (转载)你们已经被包围了zz
基因编辑宝宝的暗黑逻辑,你们看出来了吗?想跟这个科大GG分手 (转载)
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