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Chemistry版 - 问个electronic coupling的问题吧
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b****n
发帖数: 379
1
版上牛人多,帮下忙哈!尤其是dragon, spades, SEM等诸多牛人原来指点过的
我想计算两个激发态的electronic coupling matrix element。好久以前请教过用DFT
的问题(http://www.mitbbs.com/article_t1/Chemistry/31330535_0_1.html),后来由于很多limitation算不出具体结果。现在有了很多实验结果,又想用quantum chemistry来定性理解一下。
想要先把展开成分子轨道加和,然后由于正交,希望简化到
很少几个相关的分子轨道。再用DFT算出来的轨道形状来定性地解释实验结果。但是我
计算化学不过关,第一步展开就遇到困难,谁能帮我写下?或者相关文献?小弟叩谢!
d****n
发帖数: 397
2
首先申明不是大牛,只是对这方面感兴趣,基本没有实战经验。如果说错,还请版上大
牛斧正。
你要展开分子轨道,这个太难了。确实按定义应该这么算,但是要自己分析结果写程序
,为什么不用现有的软件算这个呢。
如果你有Molpro,我不知到怎么用Molpro,也没有权限,不过大致是这样的:里面有个
non-adiabatic coupling element calculation,就能算你要的 psie(r,Rref)>.psi(r,Rref)是diabatic wavefunction,g和e是正交的,但是不是H(r,R
)的本征函数(因为R!=Rref),所以coupling不为0,只有R=Rref的时候,g和e才是正交的
,这个时候coupling 为0。
如果你没有Molpro,有Gaussian,一般都能用Gaussian.但是Gaussian只能算adiabatic
states, 你能用adiabatic和diabatic之间转换来算这个coupling.这个coupling在
avoided crossing的时候最大。
所以可以用avoid crossing这个时候的构型,然后用CASSCF算两个avoided crossing
level之间的能量差Delta,那个Delta/2就是 >.
Diabatic Hamiltonian Matrix
(E Delta/2)
(Delta/2 E)
Adiabatic Hamiltonian Matrix
(E+Delta/2 0)
(0 E-Delta/2)
Gaussian 09,里面opt 不仅可以optimize到minium, TS,还可以optimize到conical
intersection/avoided crossing.这个你看看manual.
你可以先用简单的体系,如NaCl来试试,我就算了NaCl的avoided crossing bond
distance,跟文献挺接近的,这个时候的能量差就是coupling。能量差越小,adiabatic
crossing就越大。

DFT

【在 b****n 的大作中提到】
: 版上牛人多,帮下忙哈!尤其是dragon, spades, SEM等诸多牛人原来指点过的
: 我想计算两个激发态的electronic coupling matrix element。好久以前请教过用DFT
: 算的问题(http://www.mitbbs.com/article_t1/Chemistry/31330535_0_1.html),后来由于很多limitation算不出具体结果。现在有了很多实验结果,又想用quantum chemistry来定性理解一下。
: 想要先把展开成分子轨道加和,然后由于正交,希望简化到
: 很少几个相关的分子轨道。再用DFT算出来的轨道形状来定性地解释实验结果。但是我
: 计算化学不过关,第一步展开就遇到困难,谁能帮我写下?或者相关文献?小弟叩谢!

a****o
发帖数: 6612
3
别的不知道,但是展开分子轨道并不难。量化软件里面的积分都是基于原子轨道的,要
算任何期望值都要把分子轨道展开成原子轨道。

)|
,R

【在 d****n 的大作中提到】
: 首先申明不是大牛,只是对这方面感兴趣,基本没有实战经验。如果说错,还请版上大
: 牛斧正。
: 你要展开分子轨道,这个太难了。确实按定义应该这么算,但是要自己分析结果写程序
: ,为什么不用现有的软件算这个呢。
: 如果你有Molpro,我不知到怎么用Molpro,也没有权限,不过大致是这样的:里面有个
: non-adiabatic coupling element calculation,就能算你要的: psie(r,Rref)>.psi(r,Rref)是diabatic wavefunction,g和e是正交的,但是不是H(r,R
: )的本征函数(因为R!=Rref),所以coupling不为0,只有R=Rref的时候,g和e才是正交的
: ,这个时候coupling 为0。
: 如果你没有Molpro,有Gaussian,一般都能用Gaussian.但是Gaussian只能算adiabatic

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