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Chemistry版 - 为什么量子化学的大部分进展都是数学和物理背景的人做的?
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F****I
发帖数: 270
1
好像化学家主要从事一些engineer类型的工作,比如开发一个大型程序包;或者Gauss
函数,Davidson对角化这种技术性而不是框架性的工作。再比如时下流行的DFT,Becke
是原子核物理背景。Perdew也是物理背景,LYP的普遍更多的是因为当时高斯里有LYP而
没有PW91,他们直接把Becke对B3PW91的参数搬到了B3LYP。而实际上B3PW91和B3LYP的
表现似乎相差不大。B3PW91又主要是物理学家的产品了。
Kutzelnigg曾经有一个观点,理论化学的教育并没有成熟,化学家疏忽过什么吗?
f**********e
发帖数: 1994
2
我来给一个不太受欢迎的老实答案:化学家脑子没物理学家好使。
F****I
发帖数: 270
3
有一个反例,Longuet-Higgins首先发现了Berry phase,他认为Boys的工作不重要。他
当然有这个资格鄙视Boys...不过...

【在 f**********e 的大作中提到】
: 我来给一个不太受欢迎的老实答案:化学家脑子没物理学家好使。
f**********e
发帖数: 1994
4
Boys 当时被鄙视是因为他老是口齿不清。我 1995 年在剑桥听 Pople 讲的。

【在 F****I 的大作中提到】
: 有一个反例,Longuet-Higgins首先发现了Berry phase,他认为Boys的工作不重要。他
: 当然有这个资格鄙视Boys...不过...

c*****m
发帖数: 2191
5
我觉得学化学的数学基础太弱了
看到那么多公式就头大
h********r
发帖数: 821
6
gaussian并没有在文章中明确公开b3lyp的参数。
我个人认为纠结于谁是物理学家谁是化学家没多少意思,重要的是把问题解决。
理论化学还只有几十年历史,教育框架当然没有理论物理那么成熟。

Gauss
Becke

【在 F****I 的大作中提到】
: 好像化学家主要从事一些engineer类型的工作,比如开发一个大型程序包;或者Gauss
: 函数,Davidson对角化这种技术性而不是框架性的工作。再比如时下流行的DFT,Becke
: 是原子核物理背景。Perdew也是物理背景,LYP的普遍更多的是因为当时高斯里有LYP而
: 没有PW91,他们直接把Becke对B3PW91的参数搬到了B3LYP。而实际上B3PW91和B3LYP的
: 表现似乎相差不大。B3PW91又主要是物理学家的产品了。
: Kutzelnigg曾经有一个观点,理论化学的教育并没有成熟,化学家疏忽过什么吗?

s****s
发帖数: 66
7
因为做量子化学的本来就是物理学家或者数学家分出来的。
化学家本来不用薛定谔方程,只不过到近代很多研究都可以用量子理论的结论来解释,
所以才有了量子化学。
做实验的化学家不关心那些方程式是怎么来的,只关心能解释他们的实验现象。
做计算的化学家不关心你实验难度多大,只希望你能提供数据来验证理论模型的正确。
两者相互依赖,但研究问题的方式不同。

Gauss
Becke

【在 F****I 的大作中提到】
: 好像化学家主要从事一些engineer类型的工作,比如开发一个大型程序包;或者Gauss
: 函数,Davidson对角化这种技术性而不是框架性的工作。再比如时下流行的DFT,Becke
: 是原子核物理背景。Perdew也是物理背景,LYP的普遍更多的是因为当时高斯里有LYP而
: 没有PW91,他们直接把Becke对B3PW91的参数搬到了B3LYP。而实际上B3PW91和B3LYP的
: 表现似乎相差不大。B3PW91又主要是物理学家的产品了。
: Kutzelnigg曾经有一个观点,理论化学的教育并没有成熟,化学家疏忽过什么吗?

F****I
发帖数: 270
8
gaussian没公开用的哪种VWN,b3lyp各泛函的权重公开了

【在 h********r 的大作中提到】
: gaussian并没有在文章中明确公开b3lyp的参数。
: 我个人认为纠结于谁是物理学家谁是化学家没多少意思,重要的是把问题解决。
: 理论化学还只有几十年历史,教育框架当然没有理论物理那么成熟。
:
: Gauss
: Becke

F****I
发帖数: 270
9
我觉得除非和Kato,Lieb那类人比,其他的都还差不多吧

【在 c*****m 的大作中提到】
: 我觉得学化学的数学基础太弱了
: 看到那么多公式就头大

F****I
发帖数: 270
10
举个指导性的例子? thx
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F****I
发帖数: 270
11
thx
j****t
发帖数: 2996
12
因为现在量子化学的大部分进展都是理论计算产生的, 就算涉及到实验也是需要用很多
model, 这方面学化学的很少能比的上学物理和数学的, 想当初本科化学系的高数也比
物理和数学(他们应该不叫高数)低一级
f**********e
发帖数: 1994
13
Kubo?

【在 F****I 的大作中提到】
: 我觉得除非和Kato,Lieb那类人比,其他的都还差不多吧
f**********e
发帖数: 1994
14
只有做实验的化学家和做计算的化学家彼此依赖,那些物理/数学家
根本不用依赖化学,还可以来抢化学炸药奖,抢化学系的发考题位置。
1998 年的两个得奖的一个是 applied math PhD (Pople),
一个是 physics PhD (Kohn). 悲催啊。

【在 s****s 的大作中提到】
: 因为做量子化学的本来就是物理学家或者数学家分出来的。
: 化学家本来不用薛定谔方程,只不过到近代很多研究都可以用量子理论的结论来解释,
: 所以才有了量子化学。
: 做实验的化学家不关心那些方程式是怎么来的,只关心能解释他们的实验现象。
: 做计算的化学家不关心你实验难度多大,只希望你能提供数据来验证理论模型的正确。
: 两者相互依赖,但研究问题的方式不同。
:
: Gauss
: Becke

F****I
发帖数: 270
15
Ryogo Kubo? 好像他的风格没那么数学化,也可能是我缺乏了解

【在 f**********e 的大作中提到】
: Kubo?
f**********e
发帖数: 1994
16
啊,那是统计力学的人。老糊涂了。
m*******a
发帖数: 245
17
化学实际应用更注重的是原子到分子的组合和分子之间的相互作用了,这些个问题计算
化学往往力不从心,做为一门实用科学,化学家们只好搞出诸多简化理论,来指导实际
工作,要不然就没法混饭吃了
h********r
发帖数: 821
18
在Mike Frisch的94年paper中只写了公式,列出了Becke的值,没直接说是否重新优化
了参数。当然,在别的开源软件中(如NWChem)b3lyp也就用的是becke的参数值。我想
这些参数值应该由优化过程决定,大致差不多就行了。各种VWN的差异应该比较小。

【在 F****I 的大作中提到】
: gaussian没公开用的哪种VWN,b3lyp各泛函的权重公开了
h********r
发帖数: 821
19
杨82说他的理论物理中都没多少数学。
不是说数学越多就越牛×,重点是解决问题。理论越深,屠龙技就越多。

【在 j****t 的大作中提到】
: 因为现在量子化学的大部分进展都是理论计算产生的, 就算涉及到实验也是需要用很多
: model, 这方面学化学的很少能比的上学物理和数学的, 想当初本科化学系的高数也比
: 物理和数学(他们应该不叫高数)低一级

h********r
发帖数: 821
20
Kato和Lieb都应该属于数学物理界的人。当然,他们的工作被理论化学家钻研不够。

【在 F****I 的大作中提到】
: 我觉得除非和Kato,Lieb那类人比,其他的都还差不多吧
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s****s
发帖数: 66
21
那化学家应该去抢哪个的发考题位置?生物、医药学之类?

【在 f**********e 的大作中提到】
: 只有做实验的化学家和做计算的化学家彼此依赖,那些物理/数学家
: 根本不用依赖化学,还可以来抢化学炸药奖,抢化学系的发考题位置。
: 1998 年的两个得奖的一个是 applied math PhD (Pople),
: 一个是 physics PhD (Kohn). 悲催啊。

F****I
发帖数: 270
22
化学家抢走了Pauli的老婆...

【在 s****s 的大作中提到】
: 那化学家应该去抢哪个的发考题位置?生物、医药学之类?
F****I
发帖数: 270
23
"Becke suggested coefficients
a_0 = 0.2, a_x, = 0.72, and a_c, = 0.81
...
The Becke3LYP functional in Gaussian 92 uses the
values of a_0, a_x, and a_c, suggested by Becke but uses LYP for
the correlation functional."
P. J. Stephens, F. J. Devlin, C. F. Chabalowski, M. J. Frisch
J. Phys. Chem., 1994, 98 (45), pp 11623–11627
核对一下Gaussian网站上的参数
http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_dft.htm
****************
User-Defined Models. Gaussian 09 can use any model of the general form:
P2EXHF + P1(P4EXSlater + P3ΔExnon-local) + P6EClocal + P5ΔECnon-local
Here is a route section specifying the functional corresponding to the B3LYP
keyword:
#P BLYP IOp(3/76=1000002000) IOp(3/77=0720008000) IOp(3/78=0810010000)
The output file displays the values that are in use:
IExCor= 402 DFT=T Ex=B+HF Corr=LYP ExCW=0 ScaHFX= 0.200000
ScaDFX= 0.800000 0.720000 1.000000 0.810000
where the value of ScaHFX is P2, and the sequence of values given for ScaDFX
are P4, P3, P6 and P5.
******************
P1=1.0, P2=0.2 -> a_0 =0.2 HF exchange
P1*P4=1.0*0.8=0.8 -> 1-a_0 =0.8, Slater exchange
P1*P3=1.0*0.72=0.72 -> a_x =0.72, B88 exchange
P6=1.0 -> local correlation, 1.0 LSDA or a_c LYP + (1-a_c) VWN -> 1.0 LYP里
的LDA部分没有单独定义
P5=0.81 -> a_c =0.81 -> PW91 or LYP的GGA部分
所以Frisch文章和高斯官网一致
再比较一下Turbomole手册的数值, P74
http://www.cosmologic.de/data/DOK.pdf
b3-lyp | HYB | 0.8S+0.72B88 | 0.19VWN(V) | 1-3,5,6,10
| | +0.2HF | +0.81LYP |
b3-lyp_Gaussian | HYB | 0.8S+0.72B88 | 0.19VWN(III) | 1-3,5,6,10
| | +0.2HF | +0.81LYP
同样的参数。
再不行查源代码吧

【在 h********r 的大作中提到】
: 在Mike Frisch的94年paper中只写了公式,列出了Becke的值,没直接说是否重新优化
: 了参数。当然,在别的开源软件中(如NWChem)b3lyp也就用的是becke的参数值。我想
: 这些参数值应该由优化过程决定,大致差不多就行了。各种VWN的差异应该比较小。

h********r
发帖数: 821
24
是我自己考究不深,在这个问题上认识错了,多谢指正!
Gaussian未公布b3lyp的系数的说法是10多年前听某人说的(那时候正是gaussian ban
这个ban那个最厉害的时候),当时也就随便翻了翻94年文章,没细看,导致一直存在
错误认识。
不过很神奇的是b3lpy在很多地方都很好用,某位喜欢讲上帝的教授说它就是一个magic。

【在 F****I 的大作中提到】
: "Becke suggested coefficients
: a_0 = 0.2, a_x, = 0.72, and a_c, = 0.81
: ...
: The Becke3LYP functional in Gaussian 92 uses the
: values of a_0, a_x, and a_c, suggested by Becke but uses LYP for
: the correlation functional."
: P. J. Stephens, F. J. Devlin, C. F. Chabalowski, M. J. Frisch
: J. Phys. Chem., 1994, 98 (45), pp 11623–11627
: 核对一下Gaussian网站上的参数
: http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_dft.htm

F****I
发帖数: 270
25
不客气,我觉得这个学科离上帝还是挺远的。如果有上帝,他大概会有无穷大的
计算能力瞬间解决任何数值问题,或者只要解是存在的,他就可以知道,算积分,对角
化矩阵之类东西也太不上层次了;他也可以完成QED manifesto
或者分子轨道对称守恒这种东西更接近上帝的-.-

ban
magic。

【在 h********r 的大作中提到】
: 是我自己考究不深,在这个问题上认识错了,多谢指正!
: Gaussian未公布b3lyp的系数的说法是10多年前听某人说的(那时候正是gaussian ban
: 这个ban那个最厉害的时候),当时也就随便翻了翻94年文章,没细看,导致一直存在
: 错误认识。
: 不过很神奇的是b3lpy在很多地方都很好用,某位喜欢讲上帝的教授说它就是一个magic。

f**********e
发帖数: 1994
26
上帝说:
所有的东西用 cc-PV6Z 做 Full CI 就好了。
我说:
上帝你懂不懂算法啊。
(我被雷打到)

【在 F****I 的大作中提到】
: 不客气,我觉得这个学科离上帝还是挺远的。如果有上帝,他大概会有无穷大的
: 计算能力瞬间解决任何数值问题,或者只要解是存在的,他就可以知道,算积分,对角
: 化矩阵之类东西也太不上层次了;他也可以完成QED manifesto
: 或者分子轨道对称守恒这种东西更接近上帝的-.-
:
: ban
: magic。

F****I
发帖数: 270
27
上帝至少可以使用无穷大的完备基吧

【在 f**********e 的大作中提到】
: 上帝说:
: 所有的东西用 cc-PV6Z 做 Full CI 就好了。
: 我说:
: 上帝你懂不懂算法啊。
: (我被雷打到)

S*M
发帖数: 10832
28
量化现在前沿在什么地方?
是不是就指望quantum computer了

Gauss
Becke

【在 F****I 的大作中提到】
: 好像化学家主要从事一些engineer类型的工作,比如开发一个大型程序包;或者Gauss
: 函数,Davidson对角化这种技术性而不是框架性的工作。再比如时下流行的DFT,Becke
: 是原子核物理背景。Perdew也是物理背景,LYP的普遍更多的是因为当时高斯里有LYP而
: 没有PW91,他们直接把Becke对B3PW91的参数搬到了B3LYP。而实际上B3PW91和B3LYP的
: 表现似乎相差不大。B3PW91又主要是物理学家的产品了。
: Kutzelnigg曾经有一个观点,理论化学的教育并没有成熟,化学家疏忽过什么吗?

F****I
发帖数: 270
29
我觉得任何一个前人没做过没做出没做的无法改进的课题都是前沿,只是关注程度不同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等等等等

【在 S*M 的大作中提到】
: 量化现在前沿在什么地方?
: 是不是就指望quantum computer了
:
: Gauss
: Becke

h********r
发帖数: 821
30
我狂ft,你说的好几点我都做过(事先声明我很烂,文章又少又差)。。。

同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,
当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的
transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等
等等等

【在 F****I 的大作中提到】
: 我觉得任何一个前人没做过没做出没做的无法改进的课题都是前沿,只是关注程度不同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等等等等
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请教这次去了ACS开会找工作的大人
进入Chemistry版参与讨论
h********r
发帖数: 821
31
这个喜欢讲上帝的教授四处惹麻烦。

【在 F****I 的大作中提到】
: 不客气,我觉得这个学科离上帝还是挺远的。如果有上帝,他大概会有无穷大的
: 计算能力瞬间解决任何数值问题,或者只要解是存在的,他就可以知道,算积分,对角
: 化矩阵之类东西也太不上层次了;他也可以完成QED manifesto
: 或者分子轨道对称守恒这种东西更接近上帝的-.-
:
: ban
: magic。

S*M
发帖数: 10832
32
别的不知道,这个decoherence好像又是物理学家搞得玩意儿,hehe
能拾人牙慧混口饭吃也算不错,哈哈

同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,
当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的
transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等
等等等

【在 F****I 的大作中提到】
: 我觉得任何一个前人没做过没做出没做的无法改进的课题都是前沿,只是关注程度不同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等等等等
F****I
发帖数: 270
33
那人不会是Schaefer吧...

【在 h********r 的大作中提到】
: 这个喜欢讲上帝的教授四处惹麻烦。
h********r
发帖数: 821
34
小声,小声。。。。。。

【在 F****I 的大作中提到】
: 那人不会是Schaefer吧...
F****I
发帖数: 270
35
wikipedia上好劲爆啊
f**********e
发帖数: 1994
36
这人在 1996 年和我吃饭时还跟我挂保证美国一定会协防台湾。
非常非常非常无趣的人,除了用 25 个方法算一体系发一堆 JCP
以外我不知道他还干了什么。现代的量化中人最敏锐的的是 Todd
Martinez。

【在 F****I 的大作中提到】
: 那人不会是Schaefer吧...
S*M
发帖数: 10832
37
好奇你为什么这么欣赏Martinez
我只知道他搞multiple spawning发家,现在又在做GPU

【在 f**********e 的大作中提到】
: 这人在 1996 年和我吃饭时还跟我挂保证美国一定会协防台湾。
: 非常非常非常无趣的人,除了用 25 个方法算一体系发一堆 JCP
: 以外我不知道他还干了什么。现代的量化中人最敏锐的的是 Todd
: Martinez。

f**********e
发帖数: 1994
38
此公思考极其敏捷,你跟他讲话时他会永远先你一步到位。讲起他的 wave packet
dynamics 基本不必用任何大脑想。个人觉得他做 GPGPU 纯粹是消磨时间,
(那是百分之两百的 engineering)

【在 S*M 的大作中提到】
: 好奇你为什么这么欣赏Martinez
: 我只知道他搞multiple spawning发家,现在又在做GPU

h********r
发帖数: 821
39
我觉得他地位上来以后学术上没那么aggressive了。

【在 f**********e 的大作中提到】
: 此公思考极其敏捷,你跟他讲话时他会永远先你一步到位。讲起他的 wave packet
: dynamics 基本不必用任何大脑想。个人觉得他做 GPGPU 纯粹是消磨时间,
: (那是百分之两百的 engineering)

h********r
发帖数: 821
40
爆个料,此人对一名来自第三世界国家的教授说是不是你们国家就你一个搞量子化学的。
他还有一名很怪的学生,明明是美国人,可是似乎尽量避免进入美国国境。。。完全没
法理解。

【在 f**********e 的大作中提到】
: 这人在 1996 年和我吃饭时还跟我挂保证美国一定会协防台湾。
: 非常非常非常无趣的人,除了用 25 个方法算一体系发一堆 JCP
: 以外我不知道他还干了什么。现代的量化中人最敏锐的的是 Todd
: Martinez。

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s****s
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41
没有像他那样的人在算小分子性质的话,你让做分子光谱学研究的物理化学家情何以堪
啊……
话说回来他给你说美国协防台湾干什么呀?炫耀美国想欺负谁就欺负谁,想照哪个小弟
就照哪个小弟?

【在 f**********e 的大作中提到】
: 这人在 1996 年和我吃饭时还跟我挂保证美国一定会协防台湾。
: 非常非常非常无趣的人,除了用 25 个方法算一体系发一堆 JCP
: 以外我不知道他还干了什么。现代的量化中人最敏锐的的是 Todd
: Martinez。

s****s
发帖数: 66
42
呼唤更多八卦哈哈,听八卦比读paper好玩多了!

的。

【在 h********r 的大作中提到】
: 爆个料,此人对一名来自第三世界国家的教授说是不是你们国家就你一个搞量子化学的。
: 他还有一名很怪的学生,明明是美国人,可是似乎尽量避免进入美国国境。。。完全没
: 法理解。

f**********e
发帖数: 1994
43
提示:李登辉,康奈尔,飞弹,海峡,1996。
那时是两岸在近二十年最接近开战的一刻。

【在 s****s 的大作中提到】
: 没有像他那样的人在算小分子性质的话,你让做分子光谱学研究的物理化学家情何以堪
: 啊……
: 话说回来他给你说美国协防台湾干什么呀?炫耀美国想欺负谁就欺负谁,想照哪个小弟
: 就照哪个小弟?

l*l
发帖数: 149
44
他就是因为宗教的原因才从伯克利去georgia的吧?说是加州那边宗教观念比较开放,
他受不了,然后南方那边比较保守一些,所以就去georgia了
嘿嘿,刚刚又上他主页偷窥了一下,文章总数已经到1273了。。。

【在 h********r 的大作中提到】
: 这个喜欢讲上帝的教授四处惹麻烦。
t******t
发帖数: 3045
45
量子化学不是用物理和数学来解释化学吗?
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