G********e 发帖数: 528 | 1 DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么
chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不
同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以
然。
RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西
还有啥?
胚胎测序是我见过最有用的了 |
s*********y 发帖数: 292 | 2 所有的组学都有这问题
看着一坨坨的大数据,不知道该干什么
【在 G********e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么 : chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不 : 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以 : 然。 : RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西 : 还有啥? : 胚胎测序是我见过最有用的了
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l********8 发帖数: 197 | 3 大家都是混口饭吃,何必那么直接了?以后这些data会被智慧的人类发现更多用处的。 |
e*******n 发帖数: 2178 | 4 这个问题挺难回答了。也许没什么意义。也许意义重大,就像第谷在等待开普勒。 |
s******s 发帖数: 13035 | 5 大医院所有癌症病人,有条件的都开始测序了。这玩意儿已经从实验室进入临床了,你
还在这里问对生物学有多少现实意义, 我服了
【在 G********e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么 : chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不 : 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以 : 然。 : RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西 : 还有啥? : 胚胎测序是我见过最有用的了
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c*****u 发帖数: 439 | |
j****n 发帖数: 3370 | 7 这玩意最大好处就是不管得到啥结果
都能分析出点东西 可以灌水
当然也有高手能整出大paper的
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7
【在 G********e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么 : chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不 : 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以 : 然。 : RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西 : 还有啥? : 胚胎测序是我见过最有用的了
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m***T 发帖数: 11058 | |
w**k 发帖数: 6722 | 9 每年两百亿美刀的市场,被你们说成了:没什么意义,有可能发好文章。
口气还能再大一点么? |
n******7 发帖数: 12463 | 10 我也服了
满口大话的真多
【在 s******s 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 大医院所有癌症病人,有条件的都开始测序了。这玩意儿已经从实验室进入临床了,你 : 还在这里问对生物学有多少现实意义, 我服了
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c**o 发帖数: 56 | 11 我们group有病人,分析家族数据,找到致病的位点。已经作了好多个病人了。有个人
专门和病人联系,打电话,跟他们讲分析的结果。不过一般都是whole exon seq
【在 G********e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : DNA-seq 大家都知道,测序完了不知道做什么 : chip-seq,bisulfite-seq 无非就是发现转录因子的一些结合位点,或者不同条件下不 : 同结合位点,其实说到底也没啥奇怪的,而且太多的secondary效果,经常说不出所以 : 然。 : RNA-seq 用处稍大点,可能能找出来东西 : 还有啥? : 胚胎测序是我见过最有用的了
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s******s 发帖数: 13035 | 12 现实就是这样, 你不服也没用.
这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。
现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医
院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就
差最后一脚lobby让insurance公司进入了。
【在 n******7 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我也服了 : 满口大话的真多
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G********e 发帖数: 528 | 13 我是外行
所以有些搞不明白
我觉得基因组数据基本上就是表型基因型的问题
可能可以调出来一些特殊遗传病
只是真正的普遍的生物学医学问题都相当复杂,衰老,再生,糖尿病,癌症等等
测序都不能很好解决
个体化治疗成功也不是很普遍吧
【在 s******s 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 现实就是这样, 你不服也没用. : 这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。 : 现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医 : 院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就 : 差最后一脚lobby让insurance公司进入了。
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w**k 发帖数: 6722 | 14 要是医疗保险能保测序的话,哇,那ILMN股票第二天就会翻番
【在 s******s 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 现实就是这样, 你不服也没用. : 这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。 : 现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医 : 院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就 : 差最后一脚lobby让insurance公司进入了。
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n******7 发帖数: 12463 | 15 靠,我说lz
我就做这个的,我当然知道
【在 s******s 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 现实就是这样, 你不服也没用. : 这玩意儿发展太快,前两年还都几百几百的测,现在的program都是成千上万的测了。 : 现在30x全基因组最低成本已经$1000了,更别说医院一般都是做exon。现在支持医 : 院里面NGS的funding/contract/trial多如牛毛, 你看看几家大的癌症中心吧。现在就 : 差最后一脚lobby让insurance公司进入了。
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n******7 发帖数: 12463 | 16 这一年参加了几次会议
怎么把测序整到保险里面去是个专门session
【在 w**k 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 要是医疗保险能保测序的话,哇,那ILMN股票第二天就会翻番
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n******7 发帖数: 12463 | 17 癌症的个性化医疗目前主要是根据一些关键mutation选择治疗方案以及检测癌症复发
【在 G********e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我是外行 : 所以有些搞不明白 : 我觉得基因组数据基本上就是表型基因型的问题 : 可能可以调出来一些特殊遗传病 : 只是真正的普遍的生物学医学问题都相当复杂,衰老,再生,糖尿病,癌症等等 : 测序都不能很好解决 : 个体化治疗成功也不是很普遍吧
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s******s 发帖数: 13035 | 18 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
现在全是往个体化治疗走了。新药难搞,太慢太贵,现在药厂都先搞mutation
specific
的药出来批了,然后再慢慢做trial看看其他population的效果,一点点扩大。FDA也支持
这么搞,推出的fast track,然这种要测marker的高效药快上。说实话,这玩意暂时不用
NGS,不过既然做了,不管是医院还是药厂都愿意搞ngs,反正一个marker也是测,还
不如都测了,反正便宜,以后做分析也方便。
另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里面
的效果,这都是宝啊。
唯一阻碍大爆发的就是保险了。现在测序还都是依靠NCI的funding/contract,还有
药厂/biotech给钱,也只要大的consortium /corporate group或者大医院能分到大
饼。其实上游illumina,下游各种数据分析的公司都准备好了,就等保险公司进入了。 |
w**k 发帖数: 6722 | 19 另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里
面的效果,这都是宝啊。
~~~~~~~~~~~~~~~~~~这个的确是宝。想想看,以前三期失败的但还是有点效果的药物,
很多都可以选定特定病人群来重新做三期。以前的一期二期可以不用做了,等于直接三
期然后新药。不过,目前好像研究还没有到位,没有这样的申请出来 --- 也许我错过
了。
支持
不用
里面
【在 s******s 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ : 现在全是往个体化治疗走了。新药难搞,太慢太贵,现在药厂都先搞mutation : specific : 的药出来批了,然后再慢慢做trial看看其他population的效果,一点点扩大。FDA也支持 : 这么搞,推出的fast track,然这种要测marker的高效药快上。说实话,这玩意暂时不用 : NGS,不过既然做了,不管是医院还是药厂都愿意搞ngs,反正一个marker也是测,还 : 不如都测了,反正便宜,以后做分析也方便。 : 另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里面 : 的效果,这都是宝啊。 : 唯一阻碍大爆发的就是保险了。现在测序还都是依靠NCI的funding/contract,还有
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m******5 发帖数: 1383 | 20 ngs对生物医学所有方向的作用都是革命性的。
以前在molecular machanism上还需要strong hypothesis 来drive
现在又回归到descriptive的阶段了,很快会有大突破。
医学方面的作用就不说了
至于你说的 测序完不知道做什么
其实正是学科发展的体现
一是线性化的story telling再大量data面前已经不太管用了
二是没有广泛知识再难以以偏概全地说故事了 |
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s****i 发帖数: 5469 | 21 用失败的老家伙直接三期然后出新药,这老家伙的专利怎么办?之前的一二期算上
,加上中间失败后的时间,再来个三期,超过20年都不奇怪。专利失效了药厂怕是没兴
趣继续弄了
【在 w**k 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 另外,还有以前failed掉的药物candidate,现在也可以挖出来看看特定population里 : 面的效果,这都是宝啊。 : ~~~~~~~~~~~~~~~~~~这个的确是宝。想想看,以前三期失败的但还是有点效果的药物, : 很多都可以选定特定病人群来重新做三期。以前的一期二期可以不用做了,等于直接三 : 期然后新药。不过,目前好像研究还没有到位,没有这样的申请出来 --- 也许我错过 : 了。 : : 支持 : 不用 : 里面
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G********e 发帖数: 528 | 22 说的比较靠谱 ngs会是一个载入史册的技术
但是仍然解决不了很多问题
没有许多人吹的那么神奇
市场大并不等同科学意义
做市场并不是做科学
就是画圈圈的故事
信息量越大,圈也越大,圈外不懂的东西也越来越多
期待下个革命的到来
【在 m******5 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : ngs对生物医学所有方向的作用都是革命性的。 : 以前在molecular machanism上还需要strong hypothesis 来drive : 现在又回归到descriptive的阶段了,很快会有大突破。 : 医学方面的作用就不说了 : 至于你说的 测序完不知道做什么 : 其实正是学科发展的体现 : 一是线性化的story telling再大量data面前已经不太管用了 : 二是没有广泛知识再难以以偏概全地说故事了
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w**k 发帖数: 6722 | 23 只能说这个世界上sb太多了
【在 G********e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 说的比较靠谱 ngs会是一个载入史册的技术 : 但是仍然解决不了很多问题 : 没有许多人吹的那么神奇 : 市场大并不等同科学意义 : 做市场并不是做科学 : 就是画圈圈的故事 : 信息量越大,圈也越大,圈外不懂的东西也越来越多 : 期待下个革命的到来
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s******s 发帖数: 13035 | 24 具体不知道。不过专利都是一层一层的,而且还可以开发衍生药物,药厂这么做总是
知道有好处的
【在 s****i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 用失败的老家伙直接三期然后出新药,这老家伙的专利怎么办?之前的一二期算上 : ,加上中间失败后的时间,再来个三期,超过20年都不奇怪。专利失效了药厂怕是没兴 : 趣继续弄了
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s******s 发帖数: 13035 | 25 不过illumina这技术实在是落伍,通量再高,分析结构变化还是
一塌糊涂。能一统江湖还是竞争对手不争气
【在 m******5 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : ngs对生物医学所有方向的作用都是革命性的。 : 以前在molecular machanism上还需要strong hypothesis 来drive : 现在又回归到descriptive的阶段了,很快会有大突破。 : 医学方面的作用就不说了 : 至于你说的 测序完不知道做什么 : 其实正是学科发展的体现 : 一是线性化的story telling再大量data面前已经不太管用了 : 二是没有广泛知识再难以以偏概全地说故事了
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