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Biology版 - 请教一个测序的问题
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d******8
发帖数: 1972
1
刚刚拿到了表达质粒的序列结果,发现起始密码ATG 变成了ATC,而且这个起始密码是
引物的一部分,其他所有序列都完全符合。觉得这个测序结果很诡异,基因是用高保真
的PFU扩增的,里面基因无一变异,所以怀疑是引物合成的问题,仔细查看了OPRON的单
子,也没有错。
正好这个起始密码是NCO I 的酶切点,酶切也能线性化,现在我有个疑问,酶切的识别
序列CCATGG(测序是CCATCG)是应该完全符合才能切吧?那测序结果又怎么解释?
r***e
发帖数: 2539
2
看看测序的chrome图,有没有G的信号。

【在 d******8 的大作中提到】
: 刚刚拿到了表达质粒的序列结果,发现起始密码ATG 变成了ATC,而且这个起始密码是
: 引物的一部分,其他所有序列都完全符合。觉得这个测序结果很诡异,基因是用高保真
: 的PFU扩增的,里面基因无一变异,所以怀疑是引物合成的问题,仔细查看了OPRON的单
: 子,也没有错。
: 正好这个起始密码是NCO I 的酶切点,酶切也能线性化,现在我有个疑问,酶切的识别
: 序列CCATGG(测序是CCATCG)是应该完全符合才能切吧?那测序结果又怎么解释?

d******8
发帖数: 1972
3
看了,C很明显,没有G

【在 r***e 的大作中提到】
: 看看测序的chrome图,有没有G的信号。
j****x
发帖数: 1704
4
这个位点在测序结果中的什么位置?不是在首尾两端吧?

【在 d******8 的大作中提到】
: 看了,C很明显,没有G
d******8
发帖数: 1972
5
谢谢,不是两端,是中间。刚才又看了NCO I酶切结果,非常明显线性化。 准备正向重
测,再加反向引物

【在 j****x 的大作中提到】
: 这个位点在测序结果中的什么位置?不是在首尾两端吧?
j****x
发帖数: 1704
6
呵呵,合成引物时出错酶切位点发生突变,PCR时又出错在序列中引入了另一个NcoI位
点。。。
你可以去买彩票先

【在 d******8 的大作中提到】
: 谢谢,不是两端,是中间。刚才又看了NCO I酶切结果,非常明显线性化。 准备正向重
: 测,再加反向引物

d******8
发帖数: 1972
7
呵呵。看来的去买彩票了,这手气也太背了。

【在 j****x 的大作中提到】
: 呵呵,合成引物时出错酶切位点发生突变,PCR时又出错在序列中引入了另一个NcoI位
: 点。。。
: 你可以去买彩票先

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