z********8
发帖数: 818 | |
s*******e
发帖数: 1010 | 2 药物所要文章大爆炸了，还有比这更重量级的在后面呢。 |
m*****7
发帖数: 366 | |
c**********n
发帖数: 177 | 4 P2Y12，GPCR。又不是第一次见到同期发两篇GPCR了。四篇都见过。。 |
c*****u
发帖数: 439 | |
p*****m
发帖数: 31 | 6 看看里面挂谁的名字，再看看PDB数据库里这些结构都挂着GPCR Network的标识，不禁
感叹天朝果然雄起了，美国人都要拿着美国的东西来巴结了~
PS，GPCR network是美国的一个大的科学计划Protein Initiative资助的structural
genomics一部分，就是刚被停掉的那个，这个计划只资助了美国的几个center。 |
y***o
发帖数: 1853 | 7 这个PI也太年轻了，牛逼啊
【在 z********8 的大作中提到】
: 如题！
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i*********0
发帖数: 915 | |
S***J
发帖数: 1210 | 9 别看不上结构，你觉得好发你也发两篇玩玩？
一群眼高手低的。。。
【在 c*****u 的大作中提到】
: 结构。。。。。。
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c*****u
发帖数: 439 | 10 我发过啊.
还有 你这个理论就是，不是大厨没资格当美食评论。
注意你的逻辑。。。。。
不是我瞧不起做结构的，做结构的自己都看不上自己
【在 S***J 的大作中提到】
: 别看不上结构，你觉得好发你也发两篇玩玩？
: 一群眼高手低的。。。
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S***J
发帖数: 1210 | 11 不想讨论生物各领域之间的差别，虽然我对很多只定性非定量的领域很有看法，但是我
觉得任何领域发cns都是非常困难，原创性和难度都很大。
看到别人发cns就觉得这是运气和学科的原因，只能显得自己异常的功利和自负。
【在 c*****u 的大作中提到】
: 我发过啊.
: 还有 你这个理论就是，不是大厨没资格当美食评论。
: 注意你的逻辑。。。。。
: 不是我瞧不起做结构的，做结构的自己都看不上自己
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f***4
发帖数: 886 | |
F*Q
发帖数: 3259 | 13 如果他也在本版混，算不算本版最牛？还有比他更牛的么？同一期来三篇？
哈哈 |
s******9
发帖数: 283 | 14 GPCR晶体结构自从解决稳定膜内loops的方法，就出现了井喷。问一问，这几年这么多
GPCR结构，有没发在Nature和Science的新结构吗？
Ray Stevens常驻上海，带着一群弟子搞826计划，准备把人的826个GPCR结构都解出来
，这得有多少篇Nature Science啊。
个人认为，结构推进得这么快，功能分析也要赶快跟上才好。 |
p*****m
发帖数: 31 | 15 井喷的原因就像你说的这种方法的普适性，然后美国政府的大量投钱做GPCR的结构基因
组，支持5，60号人工厂式的用这种方法去大量的筛GPCR的结构，基本能这样筛出来的
结构都差不多发了（甚至长晶体的条件都差不多），上海发的这些也是stevens实验室
他们这样筛出来的，因为用的美国结构基因组的钱，他们要在一个公开的网站上更新工
作的进展，上面都可以查到几年前这些蛋白的结构工作的进展。不知道他们为什么拿去
中国继续做发文章，不在美国做，可能因为stevens想全职回中国，希望培养自己的势
力，需要paper。另外这两篇nature，同样一个蛋白，结合了3个ligands，结构差不多
，ligangs结合位点有不同，这点其它GPCR里都看到过，很正常，而且不一定跟活性有
关系，就这样硬生生拆成两篇发，唯一可能的原因是purigergic receptor的药物靶点
重要性，即便这样，no idea how they got the second one published, mush have
bargained with Nature.
826个GPCR结构在业内一看就是个笑话，首先这800多个GPCR有300多个是嗅觉受体，没
什么开发药物的潜质，甚至很多都没有很好的鉴定出来，然后很重要的就是现在GPCR的
表达纯化长晶体，极其依赖小分子去稳定蛋白，需要high affinity，slow
dissociation rate的小分子，Stevens实验室做出来的都是这样的GPCR，这些GPCR都是
因为功能已经被做了几十年，有人有公司已经develop了很多这样的小分子，满足这样
条件的GPCR不会超过50个，还有GPCR是有很多活性状态的，一个结构，尤其是inactive
的结构，根本不能解释功能或活性上的问题，Stevens实验室在Nature Science上发表
的大多GPCR结构（大多inactive结构），亮点是在于药物小分子的结合，对于
pharmacology的重要性，而不是对于gpcr功能的解释，这点也是他们跟brian kobilka
实验室的最大区别，一个重要GPCR不同状态的结构，工作的难度和重要性可能远超解几
个不同GPCR的inactive结构。
不过我可以理解他们为什么提826个GPCR结构，因为看起来很fancy，非常迎合国内的标
准，就像新闻里对yan ning工作的评价是5年解了5个膜蛋白结构，而不是她的这些结构
对于transporter/ion channel领域的价值和意义。
【在 s******9 的大作中提到】
: GPCR晶体结构自从解决稳定膜内loops的方法，就出现了井喷。问一问，这几年这么多
: GPCR结构，有没发在Nature和Science的新结构吗？
: Ray Stevens常驻上海，带着一群弟子搞826计划，准备把人的826个GPCR结构都解出来
: ，这得有多少篇Nature Science啊。
: 个人认为，结构推进得这么快，功能分析也要赶快跟上才好。
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S***J
发帖数: 1210 | 16 这个评价要mark！
对raymond等的工作，我有同样的看法。难度上来说他们和Brian Kobilka的套路不可同
日而语。更重要的是，这个融合蛋白稳定loop的方法也是人家Kobilka发明的。
不过客观上Raymond等确实也贡献了很多重要的药物靶点，典型的比如前段时间药物所
Beili Wu发的那篇CXCR4，这个难度应该也不低，我知道的就有好几家知名实验室在做
，但是做了好几年就是没做出来。
大家可能都不知道Beili Wu和这两篇的Qiang Zhao是师姐弟（博士和博后都是），而且
也是夫妻，哈哈。恭喜他们！
【在 p*****m 的大作中提到】
: 井喷的原因就像你说的这种方法的普适性，然后美国政府的大量投钱做GPCR的结构基因
: 组，支持5，60号人工厂式的用这种方法去大量的筛GPCR的结构，基本能这样筛出来的
: 结构都差不多发了（甚至长晶体的条件都差不多），上海发的这些也是stevens实验室
: 他们这样筛出来的，因为用的美国结构基因组的钱，他们要在一个公开的网站上更新工
: 作的进展，上面都可以查到几年前这些蛋白的结构工作的进展。不知道他们为什么拿去
: 中国继续做发文章，不在美国做，可能因为stevens想全职回中国，希望培养自己的势
: 力，需要paper。另外这两篇nature，同样一个蛋白，结合了3个ligands，结构差不多
: ，ligangs结合位点有不同，这点其它GPCR里都看到过，很正常，而且不一定跟活性有
: 关系，就这样硬生生拆成两篇发，唯一可能的原因是purigergic receptor的药物靶点
: 重要性，即便这样，no idea how they got the second one published, mush have
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b*******H
发帖数: 830 | |
S***J
发帖数: 1210 | 18 子和的学生好多好多。。。虽然也有几位争气的，但无奈比例实在太低。
【在 b*******H 的大作中提到】
: 子和的学生。
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c**********n
发帖数: 177 | 19 Mark！太赞了！
Raymond近几年来开始着手搞Class B，C & Frizzle的GPCR，虽然因为不能拿到完整WT
结构对于这些GPCR的功能理解还是帮助不大。还是比较看好，Brian Koblika去攻打最
难的GPCR。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 井喷的原因就像你说的这种方法的普适性，然后美国政府的大量投钱做GPCR的结构基因
: 组，支持5，60号人工厂式的用这种方法去大量的筛GPCR的结构，基本能这样筛出来的
: 结构都差不多发了（甚至长晶体的条件都差不多），上海发的这些也是stevens实验室
: 他们这样筛出来的，因为用的美国结构基因组的钱，他们要在一个公开的网站上更新工
: 作的进展，上面都可以查到几年前这些蛋白的结构工作的进展。不知道他们为什么拿去
: 中国继续做发文章，不在美国做，可能因为stevens想全职回中国，希望培养自己的势
: 力，需要paper。另外这两篇nature，同样一个蛋白，结合了3个ligands，结构差不多
: ，ligangs结合位点有不同，这点其它GPCR里都看到过，很正常，而且不一定跟活性有
: 关系，就这样硬生生拆成两篇发，唯一可能的原因是purigergic receptor的药物靶点
: 重要性，即便这样，no idea how they got the second one published, mush have
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d********0
发帖数: 534 | 20 没吃过屎就不能嫌弃吃屎的人
【在 c*****u 的大作中提到】
: 我发过啊.
: 还有 你这个理论就是，不是大厨没资格当美食评论。
: 注意你的逻辑。。。。。
: 不是我瞧不起做结构的，做结构的自己都看不上自己
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e****s
发帖数: 1125 | 21 这个要顶，内行啊。
今年Keystone GPCR的会议，好像也见到了这两位，确实年轻。GPCRs的结构我是有些审
美疲劳了。今年GPCR最大的结构突破是Rh-Arr复合体的结构，大会的重头报告，文章应
该近期会出来，也是华人科学家Eric Xu的突破！
其他GPCR结构的报告，感觉都是重复的套路，我这个外行，是有些不太感冒了。
GPCR的问题在于，所有的结构，除了Rh，都被类似的套路改造过，什么时候能有Full-
length的结构出来，会是巨大的突破。比如已知的结构里C-端基本没有见过。
除了Kobilka和Stevens的方法，英国的Christ的通过筛选热力学稳定的突变，也成功的
解了很多的GPCR结构。同样的问题，不同受体的结构筛选出的突变，最后结构都和Rh很
类似。
Kobilka把Stevens早甩几条街了。和Ray致力于一个一个结构不同，Kobilka关心的一直
是GPCR 如何被Activated，Activated GPCR的构像是如何的，所以，他在挑战一个一个
新的领域，结晶只是工具之一。他近年来在用EPR、NMR、荧光来探寻GPCR构像变化上，
有很多新的突破。
结构的门外汉，可能错误比较多。
GPCR结构的井喷有多厉害呢，有位药厂负责结构的牛人闲聊的时候说，他们一年解出了
十几个，只是都不发而已。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 井喷的原因就像你说的这种方法的普适性，然后美国政府的大量投钱做GPCR的结构基因
: 组，支持5，60号人工厂式的用这种方法去大量的筛GPCR的结构，基本能这样筛出来的
: 结构都差不多发了（甚至长晶体的条件都差不多），上海发的这些也是stevens实验室
: 他们这样筛出来的，因为用的美国结构基因组的钱，他们要在一个公开的网站上更新工
: 作的进展，上面都可以查到几年前这些蛋白的结构工作的进展。不知道他们为什么拿去
: 中国继续做发文章，不在美国做，可能因为stevens想全职回中国，希望培养自己的势
: 力，需要paper。另外这两篇nature，同样一个蛋白，结合了3个ligands，结构差不多
: ，ligangs结合位点有不同，这点其它GPCR里都看到过，很正常，而且不一定跟活性有
: 关系，就这样硬生生拆成两篇发，唯一可能的原因是purigergic receptor的药物靶点
: 重要性，即便这样，no idea how they got the second one published, mush have
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e****s
发帖数: 1125 | 22 Rh-Arr结构？
【在 s*******e 的大作中提到】
: 药物所要文章大爆炸了，还有比这更重量级的在后面呢。
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p*****m
发帖数: 31 | 23 一年解出十几个？估计吹嘘的成分居多吧，如果他们没有什么重大结晶方法学的突破，
用的还是stevens或kobilka的方法套路，就算能长十几个蛋白的晶体，数据也收不了啊
，据我所知目前可以收这种GPCR晶体衍射数据的美国就芝加哥的那个国家实验室，世界
上能收的也不多，公司还相对更难申到时间。而且几个大公司，pfizer，amgen都在自
己做GPCR的结构，没听说他们有自己做出来的。
还有，用什么套路改造过真的关系不大，即便搞个没改造过的native蛋白，结构上也不
会有太多惊喜，还是不同状态的GPCR的结构，或者更多GPCR和其它蛋白复合物的结构能
带来的信息量大。
【在 e****s 的大作中提到】
: 这个要顶，内行啊。
: 今年Keystone GPCR的会议，好像也见到了这两位，确实年轻。GPCRs的结构我是有些审
: 美疲劳了。今年GPCR最大的结构突破是Rh-Arr复合体的结构，大会的重头报告，文章应
: 该近期会出来，也是华人科学家Eric Xu的突破！
: 其他GPCR结构的报告，感觉都是重复的套路，我这个外行，是有些不太感冒了。
: GPCR的问题在于，所有的结构，除了Rh，都被类似的套路改造过，什么时候能有Full-
: length的结构出来，会是巨大的突破。比如已知的结构里C-端基本没有见过。
: 除了Kobilka和Stevens的方法，英国的Christ的通过筛选热力学稳定的突变，也成功的
: 解了很多的GPCR结构。同样的问题，不同受体的结构筛选出的突变，最后结构都和Rh很
: 类似。
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e****s
发帖数: 1125 | 24 我不是做结构的。好像现在femtosecond X-ray也很强大了，ASU等地有设备。 我听这
么说他们解了十来个，也是嘴张老大。
非常同意你说的，不同状态的GPCR更有价值。我本人非常关心那几个复合物的结构。所
以我说今年最大的成就是Eric Xu的Rh-arrestin复合物结构。这个是非常难的。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 一年解出十几个？估计吹嘘的成分居多吧，如果他们没有什么重大结晶方法学的突破，
: 用的还是stevens或kobilka的方法套路，就算能长十几个蛋白的晶体，数据也收不了啊
: ，据我所知目前可以收这种GPCR晶体衍射数据的美国就芝加哥的那个国家实验室，世界
: 上能收的也不多，公司还相对更难申到时间。而且几个大公司，pfizer，amgen都在自
: 己做GPCR的结构，没听说他们有自己做出来的。
: 还有，用什么套路改造过真的关系不大，即便搞个没改造过的native蛋白，结构上也不
: 会有太多惊喜，还是不同状态的GPCR的结构，或者更多GPCR和其它蛋白复合物的结构能
: 带来的信息量大。
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d**m
发帖数: 536 | 25 他从回国到现在一共培养了不到90个博士
【在 S***J 的大作中提到】
: 子和的学生好多好多。。。虽然也有几位争气的，但无奈比例实在太低。
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S***J
发帖数: 1210 | 26 我靠！不到90还不叫多？
【在 d**m 的大作中提到】
: 他从回国到现在一共培养了不到90个博士
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p*****a
发帖数: 3634 | |
