z*****n 发帖数: 444 | 1 一个蛋白的一个位点磷酸化被激活,文献都说这个位点是T100,但是我去查蛋白序列,
怎么这个位点根本就是个S,不是T? |
d****7 发帖数: 109 | 2 数据库里的序列不对?去看看IMGAGE clone,看看里面的plasmid,你的蛋白到底是S还
是T
我们组曾经研究过一个蛋白,我们买的IMAGE clone里的cds编码出来的蛋白有一个AA和
Entrenz/ensemble里的不一样,然后我们blast了一下,发现IMAGE clone的那个AA是
evolutionarily conserved,Entrez/ensemble里的并不保守,所以可能是数据库错了 |
f*****f 发帖数: 195 | 3 再有可能一个蛋白不同的isoform,作者用的跟你查的不是一个。我就碰到过。
【在 d****7 的大作中提到】 : 数据库里的序列不对?去看看IMGAGE clone,看看里面的plasmid,你的蛋白到底是S还 : 是T : 我们组曾经研究过一个蛋白,我们买的IMAGE clone里的cds编码出来的蛋白有一个AA和 : Entrenz/ensemble里的不一样,然后我们blast了一下,发现IMAGE clone的那个AA是 : evolutionarily conserved,Entrez/ensemble里的并不保守,所以可能是数据库错了
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l******g 发帖数: 1623 | 4 有的人算信号序列,有的人不算
【在 z*****n 的大作中提到】 : 一个蛋白的一个位点磷酸化被激活,文献都说这个位点是T100,但是我去查蛋白序列, : 怎么这个位点根本就是个S,不是T?
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z*****n 发帖数: 444 | 5 解决了,不同的物种,不同的isoform,要以周边的保守序列为准。但是大家还都用最
找发现时候的名字,所以会有误解。 |