t******y 发帖数: 716 | 1 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问
题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况?
1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。
2)蛋白降解抑制。
为什么细胞需要做这样的调整?
用的细胞是上皮细胞。 |
s******s 发帖数: 13035 | 2 首先你要确定确实原来的mRNA升高了10倍,而不是alternative splicing一类的
【在 t******y 的大作中提到】 : 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问 : 题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况? : 1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。 : 2)蛋白降解抑制。 : 为什么细胞需要做这样的调整? : 用的细胞是上皮细胞。
|
a*******g 发帖数: 33 | 3 会不会是体内的siRNA导致的转录后抑制?有做siRNA的可以出来讲讲 |
p****p 发帖数: 3360 | 4 1. 前面有一个人说得好,要仔细查看是否有alternative splicing导致其他isoform
增多,而你检查的isoform随之下降了。也就是说,看看你检查的mRNA和protein是否来
自同一个isoform。
2. 另外看看你的蛋白是否有转录后调控的功能。看看它是否能反馈调节自己。
3. 你的蛋白是生物钟调控的。你的mRNA,蛋白取样的时间不一样,所以丰度高低也就
不同了。
【在 t******y 的大作中提到】 : 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问 : 题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况? : 1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。 : 2)蛋白降解抑制。 : 为什么细胞需要做这样的调整? : 用的细胞是上皮细胞。
|
t******y 发帖数: 716 | 5 1. 目前看到的2个isoforom的蛋白量都下降。
2. 你是指转录后反向抑制蛋白合成?
3. 应该和生物钟没有关系。
【在 p****p 的大作中提到】 : 1. 前面有一个人说得好,要仔细查看是否有alternative splicing导致其他isoform : 增多,而你检查的isoform随之下降了。也就是说,看看你检查的mRNA和protein是否来 : 自同一个isoform。 : 2. 另外看看你的蛋白是否有转录后调控的功能。看看它是否能反馈调节自己。 : 3. 你的蛋白是生物钟调控的。你的mRNA,蛋白取样的时间不一样,所以丰度高低也就 : 不同了。
|
f******o 发帖数: 427 | 6 蛋白降解加快,而RNA代偿性升高,可以比较一下处理前后蛋白ubiquitin化的水平。
【在 t******y 的大作中提到】 : 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问 : 题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况? : 1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。 : 2)蛋白降解抑制。 : 为什么细胞需要做这样的调整? : 用的细胞是上皮细胞。
|
n**8 发帖数: 221 | 7 你用什么方法检测mRNA水平的? qRT-PCR 还是northern。
如果是我,我会去检测是否存在anti-sense RNA(noncoding RNA)。
会不会只是anti-sense RNA水平上升? |
t******y 发帖数: 716 | |
i*****g 发帖数: 11893 | 9 你的RNA extract里面DNA去干净没有?
另外,RNA的事情和蛋白可以差很远 |
n**8 发帖数: 221 | 10 qRT-PCR引物一般跨intron吧...
【在 i*****g 的大作中提到】 : 你的RNA extract里面DNA去干净没有? : 另外,RNA的事情和蛋白可以差很远
|