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Biology版 - 关于磷酸化的学术问题
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请教关于蛋白发生ubiquitin降解再求篇paper, thanks
请推荐个 In Vitro Ubiquitin Assay Kit帮忙找一下这篇文章的pdf版本,谢谢
ubiquitination in vitro 用什么公司的kits好,求推荐MDM2 antibody
问一个问题:熟悉老鼠cyclin D1 的同学为什么有些基因只有mRNA表达而没有蛋白表达呢?
求文章两篇请教一下Ub E3 ligase
请教一下Ubiquitination私活干不下去了
再问泛素化问题question about protein size
请教:cyclin D1关于质粒去磷处理,问个比较弱的问题
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话题: ubiquitin话题: 磷酸化话题: 降解话题: 活性话题: 蛋白
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1 (共1页)
s******y
发帖数: 28562
1
有没有人知道有什么例子里,一个蛋白的磷酸化既能改变它的活性(比方说对
下游靶蛋白的磷酸化增强,或者对其他蛋白结合里增强),同时又加快它的
降解速度的?
这种例子理论上应该是有的,比方说一个蛋白不磷酸化的时候分子是合起来的,没有活
性,但是一旦磷酸化后把蛋白展开来了,活性基团暴露出来的同时也就招来Ubiquitin
ligase所以降解变快,等等,似乎上学的时候再在生化课还听过。但是我一下子实在想
不起什么事例来了。哪位同学知道的来指点一下?先谢过了!
x******e
发帖数: 1428
2
不懂帮顶!
小声说一句,我觉得大家好像都对八卦或者非学术的问题兴趣更高哎……
g******1
发帖数: 244
3
只知道增加蛋白稳定性的。
理论上,即增强活性,又加快降解,有点矛盾啊
g*********3
发帖数: 177
4
我google了你的问题:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10082518
Cyclin CTK2P
为什么问这个问题...
g*********3
发帖数: 177
5

貌似又不矛盾,增加了活性,起了作用之后,得降解才行啊。(类似于feedback
mechanims)不过你说的也有道理。。。

【在 g******1 的大作中提到】
: 只知道增加蛋白稳定性的。
: 理论上,即增强活性,又加快降解,有点矛盾啊

s******y
发帖数: 28562
6
应该不奇怪啊,比方说有很多signal pathway的中间成分在激活之后都必须很快被
清理掉的,否则就会因系统信号放大过渡而造成正反馈让系统崩溃。

【在 g******1 的大作中提到】
: 只知道增加蛋白稳定性的。
: 理论上,即增强活性,又加快降解,有点矛盾啊

s******y
发帖数: 28562
7
你举的这个例子貌似不太符合我的要求,虽然 Cyclin CTK2P磷酸化后迅速降解,
但是文章里好像没有说它的磷酸化对它的活性有什么影响。

【在 g*********3 的大作中提到】
: 我google了你的问题:
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10082518
: Cyclin CTK2P
: 为什么问这个问题...

z********8
发帖数: 818
8
我觉得增强活性又降解才有生物学意义
可以使反应短期进行,而对细胞没有长期害处,gegative feedback?
c********b
发帖数: 363
9
1 phosphatase, instead of degradation, could regulate the function.
2 could u define activity specifically? It is hard to imagine functioning
while degrading. If u mean protein binding as activity, binding to ubiquitin
e3 ligase counts

Ubiquitin

【在 s******y 的大作中提到】
: 有没有人知道有什么例子里,一个蛋白的磷酸化既能改变它的活性(比方说对
: 下游靶蛋白的磷酸化增强,或者对其他蛋白结合里增强),同时又加快它的
: 降解速度的?
: 这种例子理论上应该是有的,比方说一个蛋白不磷酸化的时候分子是合起来的,没有活
: 性,但是一旦磷酸化后把蛋白展开来了,活性基团暴露出来的同时也就招来Ubiquitin
: ligase所以降解变快,等等,似乎上学的时候再在生化课还听过。但是我一下子实在想
: 不起什么事例来了。哪位同学知道的来指点一下?先谢过了!

I*****y
发帖数: 6402
10
Rb ?
BRCA1?

Ubiquitin

【在 s******y 的大作中提到】
: 有没有人知道有什么例子里,一个蛋白的磷酸化既能改变它的活性(比方说对
: 下游靶蛋白的磷酸化增强,或者对其他蛋白结合里增强),同时又加快它的
: 降解速度的?
: 这种例子理论上应该是有的,比方说一个蛋白不磷酸化的时候分子是合起来的,没有活
: 性,但是一旦磷酸化后把蛋白展开来了,活性基团暴露出来的同时也就招来Ubiquitin
: ligase所以降解变快,等等,似乎上学的时候再在生化课还听过。但是我一下子实在想
: 不起什么事例来了。哪位同学知道的来指点一下?先谢过了!

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请教一下Ubiquitination再求篇paper, thanks
再问泛素化问题帮忙找一下这篇文章的pdf版本,谢谢
请教:cyclin D1MDM2 antibody
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s******y
发帖数: 28562
11

ubiquitin
比方说啊(我随便胡乱举一个栗子)。某蛋白在核里面磷酸化之后就增强了它
结合DNA的能力,然后它一旦被释放回到细胞质里面立刻就被降解了。

【在 c********b 的大作中提到】
: 1 phosphatase, instead of degradation, could regulate the function.
: 2 could u define activity specifically? It is hard to imagine functioning
: while degrading. If u mean protein binding as activity, binding to ubiquitin
: e3 ligase counts
:
: Ubiquitin

s******y
发帖数: 28562
12
BRCA1 那个是怎么样的?能不能讲讲?
Rb是哪一个Rb? retinoblastoma? 如果是这个的话那么其实是和我说的意思正好相反了。因为retinoblastoma的磷酸化会使得它失去结合E2F的活性。而我希望找一个
磷酸化后获得活性的例子。

【在 I*****y 的大作中提到】
: Rb ?
: BRCA1?
:
: Ubiquitin

c********b
发帖数: 363
13
The example is still not clear: how could a phosphorylated protein with DNA
binding capacity transported to cytoplasm for degradation without further
modifications?
Second, if it is so difficult to find some examples, what is the general
significance of the potential example(s).

【在 s******y 的大作中提到】
: BRCA1 那个是怎么样的?能不能讲讲?
: Rb是哪一个Rb? retinoblastoma? 如果是这个的话那么其实是和我说的意思正好相反了。因为retinoblastoma的磷酸化会使得它失去结合E2F的活性。而我希望找一个
: 磷酸化后获得活性的例子。

s******y
发帖数: 28562
14

DNA
我也就是随便捏造了一个例子而已。不要太较真啊。
这个挺重要的呀,因为如果有这种情况的话就是一个天生的negative feedback
来防止某个信号过于放大啦。

【在 c********b 的大作中提到】
: The example is still not clear: how could a phosphorylated protein with DNA
: binding capacity transported to cytoplasm for degradation without further
: modifications?
: Second, if it is so difficult to find some examples, what is the general
: significance of the potential example(s).

b*****e
发帖数: 85
15
我刚好知道一个: Akt phosphorylation at S473.
http://www.jbc.org/content/286/16/14190.abstract?sid=9ddbdd6d-7
s******y
发帖数: 28562
16
谢谢! 太棒了,这个正符合我想要的例子!

【在 b*****e 的大作中提到】
: 我刚好知道一个: Akt phosphorylation at S473.
: http://www.jbc.org/content/286/16/14190.abstract?sid=9ddbdd6d-7

h**********8
发帖数: 650
17
借人气问一下,版上是否有朋友做sumoylation?
总是有文献说这个修饰是抑制的,促降解的。
可我们发现似乎不是这样。

Ubiquitin

【在 s******y 的大作中提到】
: 有没有人知道有什么例子里,一个蛋白的磷酸化既能改变它的活性(比方说对
: 下游靶蛋白的磷酸化增强,或者对其他蛋白结合里增强),同时又加快它的
: 降解速度的?
: 这种例子理论上应该是有的,比方说一个蛋白不磷酸化的时候分子是合起来的,没有活
: 性,但是一旦磷酸化后把蛋白展开来了,活性基团暴露出来的同时也就招来Ubiquitin
: ligase所以降解变快,等等,似乎上学的时候再在生化课还听过。但是我一下子实在想
: 不起什么事例来了。哪位同学知道的来指点一下?先谢过了!

h**********8
发帖数: 650
18
Elimination of C/EBPα through the ubiquitin-proteasome system promotes the
development of liver cancer in mice
补一个例子 s193 磷酸化促肿瘤抑制作用,也促降解

Ubiquitin

【在 s******y 的大作中提到】
: 有没有人知道有什么例子里,一个蛋白的磷酸化既能改变它的活性(比方说对
: 下游靶蛋白的磷酸化增强,或者对其他蛋白结合里增强),同时又加快它的
: 降解速度的?
: 这种例子理论上应该是有的,比方说一个蛋白不磷酸化的时候分子是合起来的,没有活
: 性,但是一旦磷酸化后把蛋白展开来了,活性基团暴露出来的同时也就招来Ubiquitin
: ligase所以降解变快,等等,似乎上学的时候再在生化课还听过。但是我一下子实在想
: 不起什么事例来了。哪位同学知道的来指点一下?先谢过了!

s******y
发帖数: 28562
19
一般而言如果是mono- or di- sumoylation 的话,和降解没有关系,
尤其是膜蛋白和核蛋白。
这个原则对于ubiquitin 也成立。

【在 h**********8 的大作中提到】
: 借人气问一下,版上是否有朋友做sumoylation?
: 总是有文献说这个修饰是抑制的,促降解的。
: 可我们发现似乎不是这样。
:
: Ubiquitin

s******u
发帖数: 81
20
check Pten phosphorylation at c-terminal tail out:
Mol Cell Biol. 2000 Jul;20(14):5010-8.

【在 s******y 的大作中提到】
: 谢谢! 太棒了,这个正符合我想要的例子!
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为什么有些基因只有mRNA表达而没有蛋白表达呢?question about protein size
请教一下Ub E3 ligase关于质粒去磷处理,问个比较弱的问题
私活干不下去了蛋白降解
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s******y
发帖数: 28562
21
谢谢!

【在 s******u 的大作中提到】
: check Pten phosphorylation at c-terminal tail out:
: Mol Cell Biol. 2000 Jul;20(14):5010-8.

m******5
发帖数: 1383
22
NFkB?磷酸化后暴露NLS入核
同时attract E2
s******y
发帖数: 28562
23
哦。这个好像被磷酸化和降解的是iKBa 吧?

【在 m******5 的大作中提到】
: NFkB?磷酸化后暴露NLS入核
: 同时attract E2

s****l
发帖数: 395
24
CHK1:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16137618

Ubiquitin

【在 s******y 的大作中提到】
: 有没有人知道有什么例子里,一个蛋白的磷酸化既能改变它的活性(比方说对
: 下游靶蛋白的磷酸化增强,或者对其他蛋白结合里增强),同时又加快它的
: 降解速度的?
: 这种例子理论上应该是有的,比方说一个蛋白不磷酸化的时候分子是合起来的,没有活
: 性,但是一旦磷酸化后把蛋白展开来了,活性基团暴露出来的同时也就招来Ubiquitin
: ligase所以降解变快,等等,似乎上学的时候再在生化课还听过。但是我一下子实在想
: 不起什么事例来了。哪位同学知道的来指点一下?先谢过了!

s******y
发帖数: 28562
25
谢谢!

【在 s****l 的大作中提到】
: CHK1:
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16137618
:
: Ubiquitin

m******5
发帖数: 1383
26
一直记成NFkb本身被磷酸化后和ikba结合力下降-_-

【在 s******y 的大作中提到】
: 哦。这个好像被磷酸化和降解的是iKBa 吧?
1 (共1页)
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蛋白降解请教一下Ubiquitination
完全依赖proteasome降解的蛋白,谁给介绍几个?再问泛素化问题
如何解释请教:cyclin D1
请教关于蛋白发生ubiquitin降解再求篇paper, thanks
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话题: ubiquitin话题: 磷酸化话题: 降解话题: 活性话题: 蛋白